Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 205,850 (bp)   Positions: 606
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.002
.032
.0
.023
.004
.879
.007
.001
.003
.002
.984
.015
.036
.627
.001
.006
.0
.0
.002
.902
.0
.001
.001
.002
.019
.018
.001
.048
.174
.0
.048
.003
.773
.037
.025
.005
.003
.023
.034
.001
.0
.004
.006
.004
.008
.004
.003
.064
.005
.007
.091
.012
.025
.026
.008
.024
.021
.032
.267
.305
.012
.017
.109
.085
.01
.557
.0
.005
.652
.692
.699
.057
.0
.001
.015
.0
.326
.002
.0
.009
.019
.004
.003
.068
.025
.016
.022
.008
.005
.248
.0
--
.0
.002
.893
.002
.005
.002
.001
.003
--
--
--
--
.01
.01
.002
.001
.002
.002
.318
.0
.013
.003
.001
.012
.065
.045
.046
.011
.0
.55
.539
.118
.001
.002
.144
.082
.042
.007
.001
.107
.999
.005
.959
.016
.055
.03
.003
.049
.257
.65
.182
.032
.006
--
--
--
.425
.634
.001
.001
.023
.008
.005
.005
.025
.042
.003
.01
.008
.009
.067
.444
.465
.475
.414
.438
.0
.002
.0
.008
.002
.001
.008
.009
.163
.048
.195
.052
.023
.013
.001
.431
.001
.183
.215
.004
.223
.034
.016
.038
.003
.002
.001
.0
.003
.261
.006
.064
.004
.001
.02
.0
.197
.002
.059
.022
.239
.044
.001
.109
.006
.001
.0
.006
.03
.001
.014
.004
.002
.005
.0
.0
.001
.0
.335
.012
.027
.008
.001
.0
.003
.0
.007
.002
.482
.004
.056
.111
.002
.004
.024
.237
.154
.206
.138
.045
--
.017
.095
.019
.026
.088
.011
--
--
.004
.121
.013
.004
.01
.01
.045
.09
.047
.002
.013
.002
.007
.05
.005
.002
.002
.003
.101
.002
.001
.011
.012
.974
.11
.034
.012
.004
.0
.004
.0
.003
.001
.0
.004
.003
.002
--
--
.006
.007
.022
.077
.457
.001
.008
.001
.001
--
--
.039
.148
.001
.0
.0
.004
.245
.09
.001
.004
.001
.025
.02
.003
.268
.021
.003
.003
.006
.009
.294
.006
.172
.057
.013
.033
.01
.001
.001
.001
.046
.998
.004
.009
--
.001
.0
.001
.001
.004
.014
.001
.017
1.0
.361
.324
.306
.008
.029
.002
.018
.002
.201
.003
.04
.315
.152
.032
.017
.202
.001
.041
.0
--
.048
.005
.0
.004
.0
.0
.369
.028
.0
.002
.002
.002
.079
.014
.0
.008
.01
.068
.007
.019
.033
--
--
--
.0
.012
.922
.986
.048
.0
.01
.003
.021
.0
.013
--
--
--
--
--
.002
.076
.1
.112
.112
.003
.01
.014
.006
--
--
--
--
.995
.003
.004
.0
.001
.006
.088
.03
.009
.0
.002
.0
.002
.083
.023
.753
.078
.0
.029
.026
.011
.002
--
.057
.0
.001
.029
.001
.004
.001
.182
.001
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.002
.003
.005
.994
.012
.0
.893
.0
.448
.0
.008
.003
.004
.003
.149
.024
.023
.069
.023
.013
.025
.001
.001
.0
.0
.001
.085
.009
.045
.19
.01
.068
.035
.021
--
.002
.015
.013
.076
.003
.009
.012
.044
.675
.636
.972
.95
.002
.0
.002
.415
.006
.025
.001
.01
.063
.001
.002
.09
.012
.009
.002
.015
.032
.0
.001
.259
.004
.048
.0
.009
.267
.003
.001
.001
.001
.004
.0
.0
.001
.001
.001
.001
.001
.002
.002
.004
.139
.008
.004
.05
.001
.005
.001
.001
.011
.002
.0
.031
.125
.001
.006
.003
.001
.055
--
--
--
--
--
--
.015
.003
.002
.211
--
--
--
--
--
.005
.099
.017
.008
.005
.002
.004
.058
.034
.002
.001
.06
.461
.014
.0
.053
.08
.572
--
--
--
--
--
.003
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
Chl1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rpl4-ps2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
C
A
A
A
A
G
C
T
A
G
A
A
G
3
T
A
A
A
T
G
A
G
C
G
T
G
C
G
10
A
A
G
A
G
T
T
T
G
T
C
C
C
A
T
A
T
T
8
T
C
A
A
A
A
C
C
A
G
C
G
T
A
A
T
C
T
C
A
C
A
G
A
A
T
A
A
T
T
T
G
5
130
T
A
T
A
2
A
C
T
A
T
4
G
T
G
T
G
A
T
G
C
2
G
G
G
T
G
G
A
T
T
C
5
T
A
2
G
T
A
C
A
T
A
A
T
A
G
G
A
A
C
C
C
T
A
C
G
G
T
A
C
T
T
T
T
C
A
T
T
C
C
C
C
A
A
G
T
A
2
G
A
T
G
8
2
G
C
G
12
G
G
C
2
A
T
G
T
A
T
A
C
G
A
C
A
T
A
T
T
T
A
G
C
C
G
C
G
C
T
G
C
G
A
C
A
G
20
G
G
G
T
A
T
G
T
T
C
C
A
G
A
T
G
A
A
A
4
G
6
A
T
T
G
C
A
T
G
C
A
G
G
C
T
G
A
T
A
T
G
A
G
G
A
T
C
G
2
G
A
A
G
G
102
T
G
T
C
T
T
T
G
A
C
G
C
G
G
A
G
T
C
G
T
T
G
G
C
T
A
G
G
G
G
C
C
A
9
A
C
T
T
T
G
A
C
T
A
A
C
C
T
A
2
C
G
A
G
G
T
T
G
T
G
T
A
C
C
4
T
C
A
T
C
G
T
G
T
T
A
T
C
G
C
A
A
C
2
C
G
G
T
C
G
G
G
A
G
A
A
G
T
C
C
G
C
A
C
A
35
A
A
C
C
C
2
T
C
G
A
G
T
A
C
C
A
T
T
C
T
T
A
2
89
T
3
C
T
C
A
A
A
T
G
A
2
G
C
C
T
A
3
C
A
T
A
G
G
C
C
C
G
T
C
A
T
A
C
20
A
C
T
C
C
C
T
G
2
A
C
T
C
A
G
C
T
3
10
A
A
C
G
T
T
A
T
2
G
C
T
G
A
T
A
C
T
T
T
G
G
C
C
A
G
A
G
G
A
A
T
T
A
C
C
T
A
T
T
G
G
24
T
G
A
T
G
A
A
G
G
A
G
G
G
G
G
G
A
G
A
T
8
C
G
T
3
C
G
A
T
C
A
A
T
G
T
T
A
4
C
C
G
C
C
C
G
C
C
C
G
C
C
C
C
G
C
C
C
G
G
G
T
T
T
C
G
A
G
G
A
C
A
T
C
T
C
C
A
2
C
C
C
C
A
C
A
G
T
G
T
A
A
A
G
T
T
A
T
A
G
A
A
C
G
A
A
C
T
G
G
4
A
G
C
G
  134,915,289
  134,915,397
  134,915,572
  134,916,333
  134,916,450
  134,916,485
  134,916,664
  134,918,054
  134,918,062
  134,918,329
  134,919,260
  134,920,235
  134,920,248
  134,920,330
  134,920,663
  134,921,438
  134,921,811
  134,922,172
  134,923,647
  134,924,701
  134,925,316
  134,925,412
  134,925,933
  134,926,351
  134,926,561
  134,926,786
  134,926,859
  134,927,475
  134,928,703
  134,929,372
  134,930,131
  134,930,874
  134,931,014
  134,931,784
  134,931,848
  134,931,900
  134,931,973
  134,932,104
  134,932,393
  134,932,400
  134,932,898
  134,933,537
  134,933,551
  134,933,562
  134,933,637
  134,933,746
  134,933,852
  134,934,198
  134,934,237
  134,934,263
  134,934,353
  134,934,383
  134,934,622
  134,934,702
  134,934,743
  134,934,759
  134,934,771
  134,934,820
  134,934,960
  134,934,968
  134,935,263
  134,935,288
  134,935,470
  134,935,472
  134,935,740
  134,935,827
  134,936,116
  134,936,127
  134,936,207
  134,936,221
  134,936,222
  134,936,396
  134,936,418
  134,936,790
  134,936,821
  134,937,125
  134,937,272
  134,937,420
  134,937,439
  134,937,457
  134,937,897
  134,938,185
  134,938,191
  134,938,665
  134,938,863
  134,939,149
  134,939,405
  134,940,190
  134,940,293
  134,941,491
  134,941,509
  134,944,204
  134,944,995
  134,945,225
  134,946,183
  134,947,296
  134,947,906
  134,948,021
  134,948,101
  134,948,367
  134,948,885
  134,949,172
  134,949,185
  134,949,241
  134,949,752
  134,949,840
  134,950,154
  134,950,194
  134,950,261
  134,950,632
  134,950,891
  134,951,391
  134,951,420
  134,951,456
  134,951,514
  134,951,597
  134,951,607
  134,951,612
  134,951,614
  134,951,714
  134,951,863
  134,952,147
  134,952,148
  134,952,475
  134,952,954
  134,953,110
  134,953,240
  134,953,339
  134,953,405
  134,953,622
  134,953,834
  134,953,877
  134,954,452
  134,954,632
  134,954,824
  134,955,327
  134,955,395
  134,957,107
  134,957,154
  134,957,379
  134,957,438
  134,957,492
  134,957,539
  134,957,570
  134,957,658
  134,957,753
  134,957,768
  134,957,805
  134,957,992
  134,958,015
  134,958,383
  134,958,458
  134,958,609
  134,958,613
  134,958,895
  134,958,919
  134,958,925
  134,958,952
  134,959,247
  134,959,291
  134,959,496
  134,959,497
  134,959,540
  134,959,614
  134,959,622
  134,959,625
  134,959,652
  134,960,166
  134,961,260
  134,962,235
  134,962,389
  134,962,488
  134,962,701
  134,964,823
  134,964,855
  134,965,649
  134,966,386
  134,968,049
  134,968,716
  134,969,098
  134,969,757
  134,970,839
  134,971,096
  134,972,495
  134,972,970
  134,973,210
  134,973,475
  134,973,560
  134,973,609
  134,974,583
  134,974,640
  134,974,866
  134,974,933
  134,975,526
  134,975,966
  134,976,655
  134,977,103
  134,977,412
  134,978,028
  134,978,070
  134,978,298
  134,978,409
  134,978,609
  134,979,064
  134,979,126
  134,979,289
  134,982,706
  134,982,730
  134,982,841
  134,982,926
  134,983,436
  134,984,219
  134,984,499
  134,984,677
  134,985,105
  134,985,445
  134,985,459
  134,985,465
  134,985,508
  134,985,514
  134,985,518
  134,985,555
  134,985,594
  134,986,825
  134,987,032
  134,988,310
  134,988,596
  134,989,269
  134,989,798
  134,989,803
  134,989,820
  134,990,536
  134,990,615
  134,990,831
  134,991,488
  134,991,961
  134,992,215
  134,995,417
  134,995,496
  134,995,723
  134,995,736
  134,995,912
  134,995,919
  134,996,426
  134,996,516
  134,996,522
  134,996,639
  134,996,991
  134,997,470
  134,997,606
  134,997,684
  134,997,722
  134,997,915
  134,998,063
  134,998,211
  134,998,643
  134,998,672
  134,999,927
  135,000,100
  135,000,677
  135,000,766
  135,000,783
  135,000,795
  135,000,912
  135,001,054
  135,001,394
  135,001,464
  135,001,533
  135,001,545
  135,001,577
  135,001,619
  135,001,701
  135,002,123
  135,002,161
  135,002,408
  135,002,495
  135,002,504
  135,002,585
  135,002,617
  135,002,733
  135,002,752
  135,002,799
  135,002,833
  135,003,087
  135,003,265
  135,003,295
  135,003,336
  135,003,340
  135,003,454
  135,003,543
  135,003,630
  135,003,695
  135,003,802
  135,003,805
  135,003,876
  135,004,071
  135,004,423
  135,004,430
  135,005,291
  135,005,507
  135,005,517
  135,005,731
  135,006,947
  135,007,268
  135,007,545
  135,007,691
  135,007,714
  135,007,992
  135,008,040
  135,008,851
  135,009,195
  135,009,196
  135,009,381
  135,009,492
  135,009,497
  135,010,127
  135,010,144
  135,010,243
  135,010,905
  135,011,077
  135,011,183
  135,011,213
  135,011,262
  135,011,299
  135,011,338
  135,011,531
  135,011,561
  135,011,616
  135,011,917
  135,012,133
  135,012,401
  135,012,617
  135,012,677
  135,012,769
  135,013,030
  135,013,275
  135,013,324
  135,013,389
  135,013,444
  135,013,524
  135,013,541
  135,019,563
  135,019,740
  135,020,272
  135,020,274
  135,020,292
  135,020,346
  135,020,348
  135,020,432
  135,020,536
  135,020,918
  135,020,968
  135,020,979
  135,020,985
  135,021,482
  135,021,539
  135,021,719
  135,021,937
  135,022,212
  135,022,996
  135,023,036
  135,023,334
  135,023,350
  135,024,083
  135,024,209
  135,024,701
  135,024,793
  135,025,016
  135,025,423
  135,026,029
  135,026,117
  135,026,210
  135,026,426
  135,026,506
  135,026,868
  135,026,976
  135,026,992
  135,027,435
  135,027,519
  135,027,574
  135,027,594
  135,027,747
  135,027,750
  135,027,987
  135,028,394
  135,028,412
  135,028,582
  135,028,880
  135,029,027
  135,029,275
  135,029,332
  135,029,552
  135,029,665
  135,029,728
  135,029,731
  135,030,109
  135,030,128
  135,030,403
  135,030,629
  135,030,813
  135,030,861
  135,031,175
  135,031,176
  135,031,201
  135,031,356
  135,031,595
  135,031,648
  135,031,664
  135,031,748
  135,031,760
  135,031,946
  135,032,460
  135,033,349
  135,035,097
  135,035,464
  135,035,465
  135,035,793
  135,036,000
  135,036,200
  135,036,964
  135,038,891
  135,039,548
  135,040,121
  135,041,270
  135,041,646
  135,042,160
  135,042,566
  135,043,891
  135,045,320
  135,051,320
  135,051,548
  135,051,833
  135,052,290
  135,052,431
  135,052,532
  135,052,709
  135,052,774
  135,053,632
  135,054,800
  135,055,616
  135,056,007
  135,056,556
  135,056,862
  135,056,938
  135,057,103
  135,057,745
  135,057,914
  135,060,008
  135,062,167
  135,063,569
  135,064,944
  135,068,634
  135,068,800
  135,068,970
  135,068,987
  135,069,131
  135,069,139
  135,069,699
  135,070,252
  135,070,598
  135,070,658
  135,071,061
  135,071,224
  135,071,703
  135,071,984
  135,072,148
  135,073,105
  135,074,647
  135,076,821
  135,077,656
  135,077,798
  135,077,853
  135,077,863
  135,078,047
  135,078,095
  135,078,104
  135,078,246
  135,078,491
  135,078,546
  135,078,733
  135,078,890
  135,078,948
  135,079,289
  135,079,400
  135,079,471
  135,079,479
  135,079,502
  135,079,798
  135,080,024
  135,080,075
  135,080,412
  135,080,463
  135,080,748
  135,080,829
  135,080,991
  135,081,176
  135,081,661
  135,082,488
  135,085,456
  135,085,611
  135,086,575
  135,086,811
  135,086,824
  135,087,212
  135,087,734
  135,087,849
  135,087,851
  135,088,746
  135,089,163
  135,089,623
  135,090,028
  135,090,261
  135,090,482
  135,090,568
  135,090,837
  135,090,945
  135,091,311
  135,091,710
  135,091,879
  135,091,983
  135,092,011
  135,092,127
  135,092,139
  135,092,157
  135,092,320
  135,092,363
  135,092,396
  135,092,555
  135,096,538
  135,096,673
  135,098,238
  135,098,246
  135,098,309
  135,098,320
  135,098,337
  135,098,351
  135,098,354
  135,098,355
  135,098,359
  135,098,365
  135,098,366
  135,098,372
  135,098,375
  135,098,377
  135,098,394
  135,098,395
  135,098,401
  135,098,402
  135,098,910
  135,099,307
  135,099,333
  135,099,335
  135,099,573
  135,099,780
  135,099,900
  135,100,241
  135,100,994
  135,101,062
  135,101,107
  135,101,204
  135,102,486
  135,102,853
  135,102,969
  135,103,141
  135,103,624
  135,104,793
  135,105,117
  135,106,112
  135,106,235
  135,107,239
  135,107,369
  135,107,401
  135,107,550
  135,107,576
  135,107,676
  135,107,928
  135,108,043
  135,108,469
  135,108,916
  135,109,002
  135,109,030
  135,109,148
  135,109,235
  135,109,337
  135,109,569
  135,110,427
  135,110,552
  135,110,636
  135,110,643
  135,110,891
  135,110,925
  135,110,968
  135,111,782
  135,111,935
  135,112,116
  135,112,897
  135,115,783
  135,116,378
  135,116,382
  135,116,734
  135,117,539
  135,118,093
  135,118,866
  135,118,871
  135,118,877
  135,120,155
A
T
G
-
2
G
A
3
C
G
A
C
G
A
-
G
G
G
G
C
C
C
A
T
A
C
A
T
4
-
10
2
A
3
T
G
G
C
T
C
T
T
T
G
A
3
21
-
8/-
G
T
G
C
G
G
A
A
T
A
2
A
A
2
T
C
-
G
T
G
T
C
A
G
G
C
C
T
C
C
109/108
-
-
-
5
G
C
G
-
C
G
C
G
C
-
A
C
T
C
T
-
-
T
2
-
A
C
A
A
T
A
C
A
G
A
-
C
G
-
3
4
G
T
G
A
G
G
A
T
A
A
G
3
T
T
T
G
C
T
A
A
A
G
T
C
A
C
G
T
C
C
G
A
T
A
T
G
7
A
G
G
-
G/-
G
G
-
-
-
2
T
A
-
A
-
T
2/-
-
3
T
G
T
-
C
T
A
C
T
G
C
T
C
G
2
C
T
T
A
A
T
A
T
A
A
T
C
-
A
G
2
-
9
A
15
C
C
C
-
-
2
-
T
T
T
2
C
C
G
2
G
-
C
-
G
C
C
A
7
T
C
A
T
G
A
C
T
-
T
G
-
-
C
T
G
T
T
2
2
2
C
-
A
C
G
2
A
-
-
C
2
-
C
C
C
A
G
-
A
T
C
A
G
A
C
T
A
C
C
T
C
T
14
T
A
A
A
A
A
G
G
-
G
T
A
C
C
A
T
A
A
G
C
T
T
15
C
-
A
A
G
A
2
C
G
T
C
T
A
T
T
T
-
3
T
G
A
T
A
G
A
C
C
2
5
G
A
G
G
-
T
-
T
A
-
G
T
A
A
T
-
T
3
C
C
G
2
A
A
T
T
T
C
-
G
2
3
T
T
-
C
G
A
2
A
A
G
T
T
G
C
A
A
C
C
T
-
-
3
-
T
C
T
G
G
G
G
A
2
-
C
T
G
5
C
-
A
T
A
T
A
A
T
T
T
A
C
9/5
G
-
G
T
-
C
5
C
T
T
T
C
A
-
G
T
C
T
G
A
T
9
-
-
3
T
T
5
C
-
C
C
-
A
T
C
A
G
2
3
T
C
C
C
T
A
G
T
G
3
G
A
A
T
T
G
C
C
T
T
C
T
C
2
A
T
-
C
A
C
C
T
G
C
A
2
G
C
A
A
T
T
A
G
A
G
3
-
A
C
C
-
T
C
G
A
T
5
T
C
T
-
A
G
-
T
T
T
T
G
T
T
T
T
-
T
T
T
G
T
T
T
A
21
3
G/-
G/-
C
C
G
T
A
C
A
T
G
-
G
2
T
C
2
T
3
-
T
T
A
T
T
A
G
T
G
A
A
T
C
G
A
C
C
C
A
G
A
C
G
A
C
-
6
T
21/17
T
A
-
G
A
T
2