Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 89,436 (bp)   Positions: 448
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.006
.005
.471
.001
.112
.94
.025
.009
.129
--
--
.019
.003
.0
.001
.157
.928
.0
.013
.002
.6
.03
.004
.01
.008
.004
.001
.0
.014
.003
.003
.002
.032
.564
.29
.072
.012
.007
.002
.001
.004
.002
.015
--
.262
.01
.048
.002
.208
.011
.0
.002
.083
.001
.17
.938
.006
.064
.119
.037
.0
.055
.001
.032
.01
.0
.0
.002
.007
.002
.001
.052
.134
.003
.007
.014
--
.015
.019
.015
.005
.0
.008
.006
.002
.012
.146
.003
--
--
.001
.039
--
--
.001
.0
.003
.089
.0
.0
.003
.001
.001
.0
.0
.241
.0
.0
.001
.0
.001
.019
.001
.001
.045
.001
.002
.001
.0
.014
.001
.003
.001
.0
.002
.393
.294
.029
.001
.001
.002
--
--
.009
.321
.012
.001
.135
.006
.0
.001
--
.987
.47
.167
.015
.015
.456
.008
.88
.086
.036
.039
.088
.011
.0
.093
.577
.001
.001
.001
.006
.0
.001
.005
.002
.007
.018
.038
.013
.001
.005
.003
.0
.142
.002
.01
.0
.004
.0
.07
.007
.001
.0
.005
.303
.001
.019
.049
.022
.005
.001
.039
.0
.0
.017
--
--
.013
.029
.0
.016
.002
.033
.181
.014
.91
.0
.045
.007
.0
.021
.001
.0
.0
.003
.083
.111
.154
.139
.0
.582
.002
.048
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.011
.001
--
--
--
--
.0
.001
.012
.114
.119
.084
.017
.05
.009
.002
.005
.02
.103
.015
.004
.004
.018
--
--
--
--
.084
.026
.35
.169
.007
.02
--
.042
.029
.127
.115
--
.004
.01
.003
.016
.841
--
.69
.194
.152
.087
.029
.012
.169
.16
.063
.01
.007
.019
.0
.0
.036
--
--
--
--
--
.012
.005
.044
.047
.089
.023
.088
.051
.001
.558
.0
.004
.021
.004
.023
--
.396
.011
.0
.012
.004
.049
--
--
--
.001
.069
.049
.018
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.007
.004
.01
.011
.0
.004
.081
.001
.005
.001
.003
.002
.009
.001
.002
.101
.114
.002
.5
.035
.013
.0
.0
.001
.002
.004
.001
.001
.002
.0
.001
.082
.998
.0
.017
.012
.045
.01
.022
.027
.022
.163
.174
.178
--
--
--
--
--
.015
.102
.409
.203
.171
.005
--
--
--
--
.017
.005
.003
.009
.683
.004
.001
--
--
.26
.436
.626
--
.009
.001
.0
.01
.087
.004
.177
.002
--
.001
.001
.057
.01
.013
.029
.001
.003
.17
.002
.021
.019
.004
.002
.005
.028
.002
.001
.002
.001
.002
.016
.034
.0
.0
.0
.002
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
T
G
T
G
T
T
G
G
C
C
A
G
C
G
A
T
G
T
T
A
A
T
T
T
G
G
A
T
T
A
T
G
G
T
C
T
G
G
T
C
G
A
T
G
G
C
G
A
T
T
A
C
A
A
G
T
G
G
T
G
G
G
G
A
A
T
G
A
C
C
C
A
A
T
T
C
C
T
C
T
A
A
7
T
A
C
A
T
A
T
G
T
C
G
A
G
T
T
C
C
T
G
C
4
3
T
A
T
T
A
C
G
A
G
G
A
G
A
T
T
A
T
G
A
T
C
C
A
78
A
A
G
T
T
A
139
T
G
C
T
A
C
T
G
A
C
A
T
C
G
T
C
A
A
T
40
T
G
G
A
A
A
G
T
T
G
A
3
A
G
T
T
A
G
C
A
T
C
T
G
A
G
A
G
G
G
57
G
T
T
A
T
T
G
A
C
10
6
14
A
C
A
T
G
T
T
G
G
T
4
G
3
G
C
C
C
2
G
C
C
G
T
T
G
A
A
T
G
G
T
A
T
C
2
4
A
T
C
T
G
4
2
A
A
G
T
T
T
8
C
G
T
C
G
C
G
A
C
G
C
T
T
C
A
T
A
T
T
A
73
A
G
G
C
G
A
T
T
G
C
T
16
C
A
2
A
G
A
C
T
T
A
C
T
A
A
6
A
6
6
C
C
C
T
2
A
G
C
18
T
C
G
T
C
C
A
T
A
A
C
G
C
G
A
T
10
10
T
C
G
5
G
G
G
A
G
T
T
T
T
G
A
A
T
T
G
T
G
A
G
A
G
A
C
A
C
C
G
G
C
A
A
T
C
G
C
G
T
T
4
C
G
T
13
G
G
C
T
C
C
T
T
A
T
G
G
A
G
A
C
A
T
G
T
T
G
T
2
T
C
C
G
A
C
G
T
A
10
C
T
G
G
A
T
A
2
C
2
G
T
T
T
C
T
3
2
T
T
A
G
G
T
T
C
T
C
G
A
A
C
C
T
A
C
C
G
T
T
  274,944,182
  274,945,191
  274,945,602
  274,945,732
  274,947,354
  274,947,763
  274,948,031
  274,948,122
  274,949,202
  274,949,579
  274,949,786
  274,950,024
  274,950,687
  274,950,720
  274,950,732
  274,950,745
  274,950,811
  274,950,963
  274,951,325
  274,951,448
  274,951,510
  274,951,663
  274,951,781
  274,951,857
  274,951,996
  274,952,028
  274,952,166
  274,952,200
  274,952,202
  274,952,292
  274,952,296
  274,952,401
  274,952,613
  274,952,688
  274,952,841
  274,952,885
  274,952,892
  274,952,942
  274,953,154
  274,953,226
  274,953,446
  274,953,532
  274,953,644
  274,953,912
  274,953,959
  274,954,218
  274,954,285
  274,954,430
  274,954,507
  274,954,647
  274,954,795
  274,954,900
  274,954,942
  274,954,949
  274,955,203
  274,955,253
  274,955,529
  274,956,009
  274,956,235
  274,956,396
  274,956,878
  274,956,906
  274,957,210
  274,957,375
  274,957,409
  274,957,499
  274,957,675
  274,957,868
  274,957,978
  274,958,034
  274,958,118
  274,958,245
  274,958,265
  274,958,428
  274,958,446
  274,958,576
  274,958,620
  274,958,760
  274,958,805
  274,958,833
  274,958,951
  274,959,000
  274,959,059
  274,959,559
  274,959,629
  274,959,670
  274,959,990
  274,960,033
  274,960,819
  274,961,524
  274,961,693
  274,961,784
  274,961,892
  274,961,893
  274,961,940
  274,962,005
  274,962,232
  274,962,270
  274,962,592
  274,962,615
  274,962,706
  274,962,839
  274,963,178
  274,963,408
  274,963,409
  274,963,641
  274,963,838
  274,963,881
  274,963,929
  274,963,932
  274,963,972
  274,964,036
  274,964,058
  274,964,082
  274,964,230
  274,964,235
  274,964,337
  274,964,340
  274,964,396
  274,964,505
  274,964,664
  274,964,698
  274,964,766
  274,964,850
  274,964,911
  274,965,655
  274,965,664
  274,965,679
  274,966,189
  274,966,206
  274,966,212
  274,966,459
  274,966,586
  274,966,642
  274,966,848
  274,966,937
  274,967,097
  274,967,206
  274,967,266
  274,967,399
  274,967,439
  274,967,597
  274,968,202
  274,968,378
  274,968,452
  274,968,463
  274,968,563
  274,968,596
  274,968,875
  274,969,028
  274,969,094
  274,969,103
  274,969,104
  274,969,108
  274,969,243
  274,969,842
  274,969,974
  274,969,977
  274,970,133
  274,970,206
  274,970,231
  274,970,340
  274,970,406
  274,970,458
  274,970,537
  274,970,544
  274,970,596
  274,970,654
  274,970,768
  274,970,855
  274,970,859
  274,970,883
  274,971,873
  274,971,891
  274,972,156
  274,972,233
  274,972,311
  274,972,343
  274,972,348
  274,972,469
  274,972,522
  274,972,671
  274,972,819
  274,972,822
  274,973,367
  274,973,461
  274,973,698
  274,974,013
  274,974,089
  274,974,581
  274,974,750
  274,976,914
  274,977,234
  274,979,917
  274,980,198
  274,980,387
  274,980,529
  274,980,533
  274,980,856
  274,981,206
  274,981,376
  274,982,158
  274,982,199
  274,982,266
  274,983,243
  274,983,566
  274,983,700
  274,983,838
  274,984,420
  274,986,070
  274,986,503
  274,986,581
  274,986,708
  274,986,751
  274,986,867
  274,987,025
  274,987,248
  274,987,332
  274,987,344
  274,987,351
  274,987,942
  274,988,078
  274,988,287
  274,988,773
  274,989,263
  274,989,529
  274,989,559
  274,990,822
  274,992,448
  274,992,487
  274,992,497
  274,992,505
  274,992,517
  274,992,573
  274,992,698
  274,992,734
  274,993,951
  274,993,985
  274,994,611
  274,994,614
  274,994,838
  274,994,840
  274,995,134
  274,995,381
  274,995,644
  274,996,562
  274,996,566
  274,996,589
  274,996,806
  274,996,922
  274,997,645
  274,997,666
  274,998,118
  274,998,138
  274,998,233
  274,998,412
  274,998,480
  274,998,655
  274,998,672
  274,998,783
  274,998,784
  274,999,344
  274,999,366
  274,999,627
  274,999,648
  274,999,703
  274,999,725
  274,999,745
  274,999,761
  274,999,811
  274,999,913
  274,999,928
  275,000,022
  275,000,027
  275,000,098
  275,000,205
  275,000,208
  275,000,215
  275,000,311
  275,000,390
  275,000,497
  275,000,742
  275,000,783
  275,000,788
  275,000,813
  275,000,821
  275,000,828
  275,000,882
  275,000,888
  275,001,050
  275,001,113
  275,001,224
  275,001,236
  275,001,750
  275,001,771
  275,001,833
  275,002,238
  275,002,385
  275,002,428
  275,002,506
  275,002,543
  275,002,579
  275,002,751
  275,002,831
  275,002,832
  275,003,035
  275,003,263
  275,003,539
  275,003,621
  275,004,223
  275,005,304
  275,005,679
  275,005,851
  275,006,023
  275,006,145
  275,006,839
  275,007,458
  275,007,975
  275,008,620
  275,008,751
  275,009,580
  275,010,037
  275,010,171
  275,010,666
  275,010,815
  275,010,826
  275,010,864
  275,010,980
  275,010,987
  275,011,002
  275,011,012
  275,011,091
  275,011,097
  275,011,129
  275,011,197
  275,011,250
  275,011,293
  275,011,316
  275,011,420
  275,011,491
  275,011,538
  275,011,548
  275,011,846
  275,011,868
  275,011,873
  275,012,314
  275,012,460
  275,012,519
  275,012,546
  275,012,808
  275,012,893
  275,012,897
  275,013,148
  275,013,175
  275,013,262
  275,013,281
  275,013,537
  275,013,648
  275,013,797
  275,013,890
  275,014,134
  275,014,173
  275,015,023
  275,015,029
  275,015,034
  275,015,077
  275,015,085
  275,015,133
  275,015,172
  275,015,206
  275,015,543
  275,015,625
  275,015,916
  275,016,255
  275,016,328
  275,016,353
  275,016,497
  275,016,537
  275,016,618
  275,016,619
  275,016,679
  275,016,694
  275,016,712
  275,016,868
  275,016,873
  275,016,914
  275,016,933
  275,016,947
  275,017,018
  275,017,035
  275,017,092
  275,017,118
  275,017,119
  275,017,135
  275,017,413
  275,017,426
  275,017,428
  275,017,603
  275,018,002
  275,018,457
  275,018,632
  275,019,267
  275,019,425
  275,020,746
  275,020,890
  275,021,639
  275,021,824
  275,021,891
  275,021,899
  275,022,123
  275,022,771
  275,023,220
  275,023,244
  275,023,482
  275,023,530
  275,023,776
  275,023,803
  275,024,034
  275,024,219
  275,024,580
  275,024,805
  275,025,126
  275,025,735
  275,026,406
  275,026,454
  275,026,571
  275,026,842
  275,026,851
  275,026,920
  275,027,167
  275,027,310
  275,027,582
  275,027,739
  275,027,740
  275,027,990
  275,028,168
  275,028,228
  275,028,506
  275,028,746
  275,028,763
  275,029,359
  275,029,575
  275,030,051
  275,030,225
  275,030,950
  275,031,178
  275,031,204
  275,031,217
G
C
2
C
C
G
A
A
T
T
G
A
T
A
-
C
3
C
3
C
G
-
C
C
3
C
C
C
A
G
C
A
A
C
G
G
A
17
-
G
A
G
C
2
2
11/7
A
T
C
C
G
T
G
-
A
G
2
A
G
A
GA/3
A
A
T
3
2
A
G
T
T
2
G
G
C
C
T
T
C
G
C
G
T
-
5
3
T
T
C
C
-
A
C
A
A
C
A
C
3
T
T
C
A
T
4/-
3/-
A
G
2
A
G
2
A
G
T
A
G
A
C
A
C
G
C
C
G
C
T
3
G
78/-
G
G
A
C
C
G
-
C
A
T
C
G
A
C
A
G
T
G
C
G
C
C
T
G
G
C
-
C
A
T
G
G
T
A
C
C
A
G
-
3
A
C
C
G
A
T
G
3/4
T
G
A
-
A
C
C
A
A
-
A
2
C
G
C
C
A
G
5
10/-
-
-
G
T
G
C
7
C
2
T
14
C
-
A
-
A
T
T
T
-
A
G
G
A
-
-
A
-
G
G
C
A
A
T
3
A
-
-
3
C
T
C
C
4/-
-
G
G
2
2
G
G
-
T
A
G
T
T
A
A
G
4
2
T
A
2
T
T
C
C
C
C
C
-
C
C
C
T
A
G
-
G
A
A
3
-
A
2
-
-
A
G
T
C
C
G
2
C
G
G
6/-
5
-
-
A
T
G
T/3
2/-
3
A
A
-
G
T
A
C
5
3
10
7
G
G
T
A
2
T
3
C
-
-
A
A
A
-
A
T
A
T
A
G
C
2
G
A
G
G
4
G
C
5
A
2
A
T
3/GA
G
T
G
G
T
C
C
G
G
G
G
T
A
T
T
A
C
-
T
A
A
-
C
A
T
C
T
T
2
C
G
C
3
A
G
C
G
T
G
C
A
C
C
A
C
-
C
T
5
A
7
T
A
-
G
-
T
-
T
3
T
C
C
-
T
2/-
A
G
C
C
A
A
-
-
C
C
2
A
C
-
C
T
C
9
A
C
G
G
T
C
2
14
T
A
G
C