Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 89,436 (bp)   Positions: 423
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.003
.136
.789
.005
.0
.015
.112
--
.003
.0
.001
.157
.928
.0
.2
.013
.0
.002
.015
.6
.02
.044
.024
.0
.0
.004
.223
.01
.012
.016
.02
.008
.002
.043
.002
.001
.014
.0
.025
.003
.003
.73
.29
.012
.053
.003
.074
.011
.0
.938
.006
.035
.001
.119
.075
.037
.0
.032
.002
.0
.052
.134
.003
.015
.005
.0
.004
.001
.009
.014
.136
.002
--
.004
.233
.28
.068
.003
.001
.021
.011
.018
--
--
--
--
.089
.01
.0
.0
.001
.014
.0
.0
.002
.002
--
.165
.034
.089
.013
.005
.004
.0
.021
.0
.0
.0
.061
.002
.042
.0
.008
.001
--
--
--
.058
.022
.005
.003
.249
.001
.039
.009
.017
.191
.03
.021
.003
.005
.002
.0
.0
.112
.0
.017
.013
.009
.029
.0
.015
.016
.002
.181
.0
.045
.001
.031
.001
.033
.0
.021
.0
.0
.003
.139
.0
.582
.023
.016
.022
.001
.003
.048
.023
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.009
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.006
.01
.029
.053
.008
.077
.013
.001
.003
.004
.866
.284
.001
.019
.009
--
--
--
--
--
.037
.031
.0
.014
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.001
.001
.001
.012
.066
.023
.021
.0
.002
.001
.615
.025
.009
.024
.001
.004
.007
--
--
--
--
--
.091
.121
.119
.112
.022
.022
.002
.075
.084
.001
.072
.0
.0
.113
.002
.006
.005
.014
.019
.089
.001
.001
.01
.002
.083
.004
--
--
--
.004
.009
.511
.087
.029
.012
.003
--
--
--
--
.005
.001
.004
.004
.013
--
.023
.006
--
.051
.04
.011
.362
.009
.002
.023
.049
.01
.003
--
--
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.007
.004
.01
.127
.011
.004
.008
.004
.081
.001
.0
.013
.0
.001
.086
.101
.001
.002
.013
.002
.0
.008
.009
.0
.005
.0
.002
.0
.0
.001
.0
.001
.032
.013
--
.001
.004
.003
.168
.683
.004
.004
.001
--
--
--
.087
.004
--
--
--
.001
.001
.057
.002
.017
.01
.013
.029
.001
.003
.17
.002
.021
.005
.025
.005
.017
.028
.033
.002
.001
.002
.001
.034
.002
.001
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
Cfap43
A
A
T
G
C
T
T
A
C
G
A
T
G
T
T
T
A
A
G
A
C
T
C
T
C
T
T
T
6
2
G
G
A
T
A
A
T
C
C
A
T
A
C
G
A
T
T
T
A
T
G
C
C
T
C
G
G
A
A
G
A
A
T
T
A
A
A
G
G
2
4
10
T
T
7
A
A
T
C
T
G
C
G
G
T
T
T
T
3
A
T
T
A
C
T
A
3
C
C
C
C
2
C
G
A
T
T
A
G
A
G
G
A
G
A
A
G
C
T
A
G
C
T
T
C
G
A
C
A
G
A
A
C
G
T
A
C
T
6
A
C
T
A
T
T
G
T
4
T
G
A
G
3
C
C
C
C
C
T
T
T
T
G
A
G
A
C
C
C
T
C
2
G
A
C
T
A
G
C
G
T
C
G
A
G
G
T
C
C
C
2
C
G
C
G
G
T
A
C
C
T
G
T
A
C
T
A
T
T
T
2
T
6
T
C
2
T
4
C
4
C
A
A
T
G
G
G
C
G
G
T
C
A
A
C
G
G
T
G
4
T
A
T
G
C
C
A
T
A
T
G
A
A
C
G
T
C
C
C
T
A
T
T
G
A
C
C
A
2
A
T
C
G
T
G
G
G
A
T
C
C
C
G
C
A
A
T
T
T
2
A
T
T
T
A
C
A
A
C
C
C
G
T
T
4
2
A
G
A
A
6
C
C
C
T
T
C
T
G
A
C
T
G
G
A
G
C
T
A
G
T
4
A
T
4
2
G
G
G
A
G
T
T
T
T
G
A
C
A
T
G
G
G
T
C
2
C
A
A
A
A
C
C
C
A
C
G
C
C
C
C
C
A
T
G
G
5
G
T
T
C
C
2
A
C
C
G
T
A
G
2
C
A
G
T
T
T
C
A
C
T
3
2
T
T
A
G
G
A
T
T
C
C
C
G
A
A
C
C
C
C
C
C
  274,943,370
  274,943,384
  274,943,852
  274,945,191
  274,945,454
  274,946,927
  274,947,354
  274,949,786
  274,950,687
  274,950,720
  274,950,732
  274,950,745
  274,950,811
  274,950,963
  274,951,211
  274,951,325
  274,951,410
  274,951,448
  274,951,468
  274,951,510
  274,951,616
  274,951,638
  274,951,662
  274,951,693
  274,951,702
  274,951,781
  274,951,843
  274,951,857
  274,951,874
  274,951,878
  274,951,930
  274,951,996
  274,952,020
  274,952,042
  274,952,047
  274,952,166
  274,952,202
  274,952,214
  274,952,266
  274,952,292
  274,952,296
  274,952,715
  274,952,841
  274,952,892
  274,952,918
  274,954,178
  274,954,397
  274,954,647
  274,954,795
  274,955,253
  274,955,529
  274,955,795
  274,956,036
  274,956,235
  274,956,267
  274,956,396
  274,956,878
  274,957,375
  274,957,868
  274,957,939
  274,958,245
  274,958,265
  274,958,428
  274,958,833
  274,958,951
  274,959,000
  274,959,236
  274,959,461
  274,959,569
  274,959,586
  274,959,620
  274,959,630
  274,959,660
  274,959,662
  274,959,912
  274,959,914
  274,960,018
  274,960,033
  274,960,049
  274,960,312
  274,960,449
  274,960,630
  274,960,768
  274,960,968
  274,961,062
  274,961,524
  274,962,270
  274,963,109
  274,963,408
  274,963,838
  274,963,929
  274,964,505
  274,964,850
  274,964,999
  274,965,603
  274,966,212
  274,966,243
  274,966,784
  274,967,034
  274,967,039
  274,967,050
  274,967,060
  274,967,061
  274,970,280
  274,970,770
  274,971,051
  274,971,127
  274,971,144
  274,971,163
  274,971,182
  274,971,391
  274,972,822
  274,973,682
  274,973,698
  274,973,753
  274,973,754
  274,973,795
  274,974,305
  274,974,581
  274,974,750
  274,975,484
  274,976,227
  274,976,914
  274,977,234
  274,977,318
  274,977,737
  274,978,725
  274,978,764
  274,978,849
  274,978,875
  274,979,173
  274,979,202
  274,979,269
  274,979,517
  274,979,995
  274,980,198
  274,980,387
  274,980,856
  274,980,857
  274,981,206
  274,981,635
  274,981,971
  274,982,158
  274,982,199
  274,983,243
  274,983,838
  274,984,420
  274,986,062
  274,986,201
  274,986,369
  274,986,381
  274,986,503
  274,986,581
  274,986,751
  274,986,867
  274,987,025
  274,987,351
  274,987,920
  274,988,078
  274,988,186
  274,988,272
  274,988,276
  274,988,286
  274,988,429
  274,988,773
  274,988,777
  274,988,967
  274,988,979
  274,988,995
  274,989,082
  274,989,088
  274,989,262
  274,989,333
  274,989,529
  274,989,530
  274,989,559
  274,989,678
  274,989,744
  274,989,905
  274,989,922
  274,990,065
  274,990,224
  274,990,348
  274,990,506
  274,990,522
  274,990,642
  274,990,644
  274,990,666
  274,990,699
  274,990,713
  274,990,762
  274,990,778
  274,990,822
  274,990,912
  274,991,014
  274,991,113
  274,991,295
  274,991,529
  274,991,540
  274,991,636
  274,991,741
  274,991,913
  274,991,948
  274,992,020
  274,992,043
  274,992,071
  274,992,168
  274,992,169
  274,992,208
  274,992,292
  274,992,463
  274,992,487
  274,992,492
  274,992,509
  274,992,517
  274,992,573
  274,992,575
  274,992,585
  274,992,633
  274,992,698
  274,993,197
  274,993,217
  274,993,219
  274,993,395
  274,993,502
  274,993,567
  274,993,608
  274,993,733
  274,993,986
  274,994,016
  274,994,154
  274,994,172
  274,994,189
  274,994,197
  274,994,333
  274,994,450
  274,994,557
  274,994,611
  274,994,646
  274,994,838
  274,994,920
  274,995,063
  274,995,092
  274,995,108
  274,995,122
  274,995,133
  274,995,134
  274,995,157
  274,995,204
  274,995,295
  274,995,298
  274,995,381
  274,995,533
  274,995,577
  274,995,644
  274,995,684
  274,995,742
  274,995,809
  274,995,841
  274,995,867
  274,995,920
  274,995,979
  274,996,025
  274,996,072
  274,996,121
  274,996,268
  274,996,273
  274,996,296
  274,996,384
  274,996,410
  274,996,423
  274,996,434
  274,996,435
  274,996,553
  274,996,570
  274,996,574
  274,996,579
  274,996,594
  274,996,792
  274,996,824
  274,996,864
  274,996,865
  274,997,044
  274,997,097
  274,997,488
  274,997,527
  274,997,631
  274,997,666
  274,997,726
  274,997,753
  274,997,787
  274,997,819
  274,997,959
  274,998,085
  274,998,087
  274,998,261
  274,998,394
  274,998,575
  274,998,655
  274,998,811
  274,998,954
  274,999,847
  275,000,213
  275,000,241
  275,000,754
  275,000,813
  275,000,821
  275,000,828
  275,001,408
  275,002,385
  275,002,428
  275,002,451
  275,002,543
  275,002,751
  275,004,223
  275,005,851
  275,006,145
  275,006,331
  275,006,649
  275,006,839
  275,007,051
  275,007,458
  275,007,638
  275,007,934
  275,008,620
  275,008,813
  275,009,723
  275,009,728
  275,009,930
  275,010,171
  275,010,291
  275,010,613
  275,010,666
  275,010,815
  275,010,836
  275,011,016
  275,011,091
  275,011,097
  275,011,129
  275,011,197
  275,011,250
  275,011,293
  275,011,316
  275,011,420
  275,011,491
  275,011,538
  275,011,548
  275,011,732
  275,011,846
  275,011,873
  275,011,906
  275,011,933
  275,012,314
  275,012,460
  275,012,464
  275,012,898
  275,012,909
  275,013,148
  275,013,200
  275,013,262
  275,013,508
  275,013,537
  275,013,890
  275,014,093
  275,014,134
  275,014,372
  275,014,373
  275,014,736
  275,014,747
  275,014,771
  275,014,784
  275,014,801
  275,014,838
  275,014,874
  275,014,893
  275,015,085
  275,016,263
  275,016,388
  275,016,868
  275,017,622
  275,018,407
  275,018,632
  275,019,326
  275,019,425
  275,019,603
  275,020,746
  275,020,890
  275,021,639
  275,021,824
  275,022,771
  275,023,776
  275,023,803
  275,024,510
  275,024,525
  275,024,580
  275,024,805
  275,025,126
  275,025,735
  275,025,815
  275,025,890
  275,026,406
  275,026,454
  275,026,571
  275,026,842
  275,026,851
  275,026,920
  275,027,167
  275,027,310
  275,027,581
  275,027,583
  275,027,990
  275,028,164
  275,028,168
  275,028,174
  275,028,228
  275,028,506
  275,028,746
  275,028,763
  275,028,896
  275,029,359
  275,030,204
  275,030,225
  275,030,950
C
G
C
C
T
2
C
G
T
A
-
C
3
C
C
3
-
C
A
G
T
C
4/5
C
T
C
C
C
-
-
A
3
G
C
G
C
A
3
T
G
C
G
G
A
5/G
T/C
C
C
G
G
2
T
T
G
9
A
2
T
G
A
G
G
C
C
G
T
G
A
G/C
-
-
-
C
C
-
6
T
C
T
2
GT/5
T
C
A
G
-
2
C
-
G
A
C
G
-
G
G
-
T
-
2
2
-
-
A
T
C
C
A/G
G/A
A/G
G/A
C
G
A
2
G
G/A
T
C
G
A
T
C
C
T
A
T
G
-
A
G
T
T
C
C
G
5
T/2
-
G
T
2
G
C
C
14
C
-
C
A
G
A
-
T
T
T
G
T
-
2
C
C
2
G
A
G
T
T
-
C
G
-
-
G
A
G
G
2
T
A
C
T
C
-
2
A
C
T
T
-
-
T
C
G
A
C
C
G
G
A
A
A
G
G
9
T/C
5
T/A
C
17
2/-
T/A
6/-
T/A
A
2/-
T/A
-
A
-
2
14
6
C
2
C
A
T
A
T
C
G
G
2
G
-
A
C
A
-
G
3
C
C
T
T
G
C
G
C
A
G
G
T
2
-
T
G
T
G
G
C
G
A
G
A
T
G
-
A/C
G
2
3
T/-
GT/-
2
2
-
C
C/T
C/-
C/A
A
G
G
G
A
G
C
-
G
C
C
T/7
3/G
A
G
A/2
5
A
C/G
2
3
A
-
2/-
A/-
A/5
-
5
-
C/A
A
G
G
C
CT/3
C
A
10
T
7
A
A
G
A
13
T/G
10
T
-
-
3
C
-
-
A
T
A
T
A
G
C
2
G
A
G
T
G
G
A
A
C
5
C/A
-
T
G
G
G
G
T
G
G
G
T
A
2
C/2
-
-
C/T
-
C
A
T
5/-
T
C
T/9
T
5/3
-
3
8
T
A
-
G
T
-
T
A/5
G/T
G
C
C
A
G
T
A
-
-
C
C
2
A
C
A/2
T/-
C
C/T
C/3
3
A
C
G
G
G
T
T
14
T