Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 319,798 (bp)   Positions: 514
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.996
.994
.08
.996
.002
.001
.002
.003
.008
.002
.12
.0
.0
.01
.001
.002
.289
.001
.029
.99
.003
.0
.015
.006
.684
.662
1.0
.029
.876
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.008
.0
.002
.004
.0
.0
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
.009
.002
.001
.003
.492
.0
.002
.113
--
.734
.771
.728
.094
.159
.394
.021
.007
.257
--
.008
.001
.009
.193
.022
.892
.177
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.056
.088
.274
.081
.731
.262
.052
.031
.007
.27
.025
.054
.006
.051
.077
.018
.011
.024
.067
.01
.073
.068
.059
.018
.007
.043
.009
.002
.001
.033
.0
.004
.001
.003
.017
.577
.126
.162
.17
.002
.009
.017
.03
--
--
--
--
--
.001
.002
.012
.0
.001
.0
.373
.0
.038
.069
.828
.065
.011
.008
.262
.02
--
.007
.07
.195
.12
.005
.004
.678
.17
.104
.065
.006
.02
--
--
.288
.117
.118
--
.001
.002
.993
.011
.54
--
.002
.0
.004
.005
.001
.001
.015
.065
.001
.14
.712
.001
.002
.004
.001
.0
.0
.422
.0
.004
.037
.011
.056
.001
.0
.0
.004
.001
.002
.048
.017
.011
.001
.814
.15
.2
.296
.396
.0
.189
.086
.144
.045
.012
.046
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.078
.997
.003
.573
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.264
.003
.871
.256
.401
.014
.434
.003
.001
.002
.008
.005
.259
.0
.069
.0
.0
.57
.005
.081
.014
.027
.003
.001
.015
.001
.018
.037
.053
.002
.0
.0
.003
.015
.044
.272
.0
.002
.122
.009
.006
.062
.001
.009
.163
.004
.001
.002
.457
.595
.234
.003
.007
.004
.0
.16
.005
.096
.004
.046
.069
.021
.013
.002
.0
.08
.014
.003
.0
.007
.017
.0
.063
.007
.002
.009
.003
.458
.0
.01
.568
.028
.002
.005
.046
.026
.0
.0
.007
.118
.2
.936
.002
.002
.009
.003
.03
.174
.423
.014
.006
.021
--
--
.074
.028
.013
.003
.002
.0
.0
.005
.091
.094
.003
.369
.001
.961
.787
.015
.001
.034
.0
.0
.221
.009
.406
.0
.059
.217
.358
.066
.219
.005
.043
.351
.012
.781
--
.003
.046
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.013
.001
.041
.001
.132
.052
.053
.226
.082
.478
.004
.0
.133
.056
.002
.007
.001
.002
.001
.001
.001
.001
.03
.009
.001
.002
.016
.035
.003
.0
.002
.004
.018
.134
.45
.091
.069
.1
.123
.128
.075
.039
.098
.156
.192
.206
.002
.012
.006
.001
.001
.042
.0
.681
.976
.002
.078
.082
.068
.002
.0
.009
.009
.241
.001
.0
--
--
--
--
--
--
--
.011
.076
.275
.188
.34
--
.006
.002
.002
.008
.109
.003
--
.15
.121
.437
.47
--
.045
.0
.069
.153
.148
.398
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
Ccdc148
2
A
A
G
G
A
T
C
C
C
2
2
G
A
C
A
A
C
A
C
4
C
G
A
A
3
T
T
A
G
G
G
T
A
2
A
G
T
G
3
2
G
C
C
G
T
T
G
T
T
G
A
A
A
A
A
T
T
C
C
A
A
A
C
A
T
A
T
A
G
C
C
A
G
A
A
G
A
T
C
C
C
T
G
G
T
11
C
T
4
4
G
C
G
A
C
3
G
A
A
G
T
A
A
A
A
A
A
C
C
A
A
G
C
3
A
T
2
A
T
T
C
A
G
G
C
G
T
C
T
G
T
T
C
G
C
T
G
G
T
A
T
A
T
G
A
G
C
C
A
G
T
G
A
G
T
T
A
C
C
A
G
A
C
4
A
C
A
5
A
A
T
A
A
A
C
G
T
G
C
G
G
C
G
6
4
T
2
T
G
C
C
G
A
A
C
C
A
T
A
A
G
C
G
T
T
G
T
C
A
T
G
2
A
C
T
G
G
T
C
A
G
T
4
2
G
A
3
17
12
A
C
C
C
G
G
C
A
C
T
C
A
G
C
G
A
T
T
C
A
T
A
G
T
T
T
T
A
T
T
C
T
T
T
C
T
T
T
G
T
C
12
G
A
C
C
G
C
G
A
C
4
A
C
10
A
A
A
A
T
A
2
T
A
A
T
G
C
T
A
A
C
A
C
G
T
G
A
T
T
A
G
T
G
G
A
T
A
G
A
G
C
G
T
T
T
A
C
A
A
T
G
C
11
A
A
G
A
A
C
C
T
A
G
A
2
C
A
T
T
C
T
T
G
T
T
C
T
A
T
A
C
C
C
C
A
C
T
G
G
G
C
A
T
A
G
G
2
C
C
A
C
A
A
A
G
G
C
A
C
G
G
G
A
C
T
C
G
T
G
A
C
G
A
G
C
T
12
6
A
C
A
G
G
9
A
T
G
T
C
C
A
G
G
T
C
A
A
T
G
G
G
T
T
G
C
A
A
C
T
A
C
T
A
G
C
A
12
G
2
G
2
G
C
G
G
A
7
C
T
G
A
A
3
C
T
T
C
G
T
A
C
T
T
G
16
6
C
T
C
T
G
A
A
C
A
G
5
A
T
2
C
2
G
C
T
G
T
6
2
T
G
A
A
2
A
C
2
T
2
G
C
T
A
  50,007,689
  50,007,690
  50,007,948
  50,008,916
  50,009,619
  50,009,796
  50,010,390
  50,010,425
  50,010,523
  50,013,029
  50,013,153
  50,013,160
  50,013,162
  50,013,194
  50,014,359
  50,014,364
  50,014,413
  50,018,459
  50,018,488
  50,018,917
  50,019,468
  50,019,639
  50,019,791
  50,020,222
  50,020,674
  50,020,677
  50,020,783
  50,020,950
  50,021,093
  50,021,210
  50,021,306
  50,021,466
  50,021,552
  50,021,553
  50,021,853
  50,022,259
  50,022,313
  50,022,615
  50,022,616
  50,022,827
  50,022,828
  50,022,866
  50,023,022
  50,023,085
  50,023,140
  50,023,307
  50,023,482
  50,023,502
  50,025,210
  50,025,263
  50,025,419
  50,025,474
  50,025,475
  50,025,958
  50,025,988
  50,026,083
  50,026,221
  50,026,408
  50,026,466
  50,026,524
  50,027,247
  50,027,275
  50,027,910
  50,028,238
  50,028,896
  50,029,481
  50,032,874
  50,033,312
  50,033,331
  50,033,551
  50,034,255
  50,035,242
  50,036,796
  50,037,268
  50,037,313
  50,037,959
  50,044,885
  50,048,442
  50,049,638
  50,053,520
  50,053,580
  50,053,798
  50,053,834
  50,053,947
  50,053,959
  50,053,964
  50,053,966
  50,054,085
  50,054,143
  50,054,165
  50,054,220
  50,054,252
  50,054,424
  50,054,441
  50,054,463
  50,054,694
  50,054,710
  50,055,231
  50,055,241
  50,055,256
  50,056,598
  50,056,670
  50,056,838
  50,056,953
  50,058,630
  50,058,975
  50,059,012
  50,059,145
  50,059,296
  50,059,384
  50,059,522
  50,059,556
  50,059,619
  50,059,659
  50,059,774
  50,059,885
  50,060,145
  50,060,232
  50,060,238
  50,060,258
  50,060,318
  50,060,344
  50,060,556
  50,060,565
  50,060,572
  50,060,893
  50,061,204
  50,061,709
  50,061,882
  50,061,945
  50,062,142
  50,062,480
  50,062,561
  50,062,675
  50,062,710
  50,062,756
  50,062,763
  50,062,905
  50,062,912
  50,062,987
  50,063,065
  50,063,073
  50,063,075
  50,063,431
  50,063,459
  50,063,609
  50,063,629
  50,064,189
  50,064,489
  50,064,502
  50,064,586
  50,064,747
  50,065,764
  50,065,791
  50,065,827
  50,066,117
  50,066,145
  50,066,297
  50,066,666
  50,066,952
  50,067,240
  50,068,303
  50,068,606
  50,069,004
  50,069,128
  50,069,231
  50,069,261
  50,071,670
  50,072,050
  50,072,268
  50,072,348
  50,072,722
  50,072,737
  50,072,816
  50,072,817
  50,073,385
  50,073,635
  50,074,139
  50,074,147
  50,074,358
  50,074,487
  50,079,625
  50,081,123
  50,081,526
  50,081,824
  50,081,826
  50,082,478
  50,084,119
  50,084,259
  50,084,912
  50,085,074
  50,086,040
  50,089,786
  50,091,645
  50,091,647
  50,091,652
  50,091,655
  50,091,661
  50,093,009
  50,094,932
  50,095,014
  50,095,281
  50,095,331
  50,096,382
  50,096,749
  50,097,732
  50,097,811
  50,098,374
  50,099,633
  50,099,634
  50,099,787
  50,099,882
  50,100,176
  50,100,406
  50,100,716
  50,100,857
  50,102,079
  50,102,390
  50,102,510
  50,102,876
  50,103,269
  50,103,401
  50,104,048
  50,104,080
  50,104,082
  50,104,811
  50,105,289
  50,105,355
  50,105,359
  50,105,530
  50,105,564
  50,106,452
  50,107,215
  50,108,107
  50,108,352
  50,108,499
  50,109,118
  50,109,205
  50,109,425
  50,109,552
  50,110,465
  50,110,571
  50,110,622
  50,110,856
  50,111,420
  50,111,523
  50,111,825
  50,111,931
  50,112,142
  50,117,217
  50,117,921
  50,118,276
  50,118,878
  50,119,023
  50,120,280
  50,120,283
  50,120,284
  50,120,789
  50,120,792
  50,120,795
  50,120,802
  50,120,842
  50,122,119
  50,122,120
  50,122,399
  50,122,483
  50,122,703
  50,122,706
  50,124,278
  50,126,314
  50,126,377
  50,126,735
  50,127,462
  50,127,648
  50,129,105
  50,130,145
  50,131,456
  50,131,527
  50,131,607
  50,131,639
  50,132,457
  50,133,146
  50,135,766
  50,135,808
  50,135,867
  50,136,095
  50,136,193
  50,136,391
  50,136,533
  50,137,427
  50,137,539
  50,137,796
  50,137,839
  50,138,278
  50,139,065
  50,139,066
  50,139,284
  50,139,294
  50,140,133
  50,140,480
  50,140,668
  50,141,241
  50,141,370
  50,141,426
  50,141,502
  50,141,512
  50,141,556
  50,141,601
  50,141,773
  50,141,843
  50,142,142
  50,142,241
  50,142,319
  50,142,403
  50,142,409
  50,142,453
  50,142,520
  50,142,540
  50,142,572
  50,142,727
  50,142,787
  50,142,881
  50,142,990
  50,143,065
  50,143,082
  50,143,084
  50,143,405
  50,143,431
  50,143,652
  50,144,045
  50,144,134
  50,144,611
  50,144,685
  50,144,818
  50,144,859
  50,144,944
  50,145,162
  50,145,189
  50,145,408
  50,145,467
  50,146,042
  50,146,577
  50,146,750
  50,146,754
  50,147,081
  50,147,103
  50,147,111
  50,147,599
  50,147,662
  50,147,840
  50,147,969
  50,148,064
  50,148,320
  50,149,000
  50,149,162
  50,149,313
  50,149,334
  50,149,463
  50,150,305
  50,150,357
  50,150,429
  50,150,942
  50,151,121
  50,151,163
  50,151,167
  50,151,293
  50,151,790
  50,151,794
  50,158,098
  50,158,472
  50,158,714
  50,158,958
  50,159,220
  50,159,292
  50,159,740
  50,159,983
  50,160,258
  50,160,309
  50,160,576
  50,160,635
  50,161,576
  50,161,696
  50,161,851
  50,162,137
  50,162,486
  50,162,603
  50,162,865
  50,163,101
  50,163,527
  50,163,625
  50,163,975
  50,164,074
  50,164,342
  50,164,409
  50,164,626
  50,164,937
  50,164,957
  50,165,046
  50,165,517
  50,165,651
  50,165,716
  50,166,445
  50,167,993
  50,168,226
  50,168,266
  50,170,882
  50,170,943
  50,171,914
  50,172,646
  50,172,670
  50,173,076
  50,174,344
  50,174,544
  50,174,726
  50,175,124
  50,175,196
  50,175,294
  50,175,635
  50,175,640
  50,175,704
  50,175,718
  50,175,807
  50,175,903
  50,175,939
  50,176,146
  50,176,177
  50,176,840
  50,178,193
  50,178,379
  50,178,808
  50,178,955
  50,179,315
  50,179,473
  50,179,723
  50,179,760
  50,179,762
  50,179,811
  50,180,170
  50,180,215
  50,180,428
  50,180,481
  50,180,731
  50,180,737
  50,180,755
  50,181,700
  50,181,835
  50,183,036
  50,183,987
  50,184,477
  50,184,589
  50,184,758
  50,185,020
  50,185,737
  50,186,296
  50,187,096
  50,187,460
  50,187,682
  50,188,105
  50,188,137
  50,188,214
  50,188,277
  50,188,598
  50,188,910
  50,189,104
  50,189,228
  50,189,671
  50,189,961
  50,190,470
  50,190,567
  50,190,881
  50,190,984
  50,191,035
  50,191,397
  50,191,670
  50,191,718
  50,191,741
  50,191,799
  50,191,966
  50,192,010
  50,192,050
  50,192,140
  50,204,072
  50,209,431
  50,223,452
  50,223,454
  50,223,457
  50,223,459
  50,223,462
  50,223,472
  50,223,474
  50,224,464
  50,232,349
  50,232,354
  50,239,533
  50,247,182
  50,251,930
  50,253,770
  50,253,775
  50,255,029
  50,255,033
  50,259,337
  50,262,052
  50,269,205
  50,280,584
  50,280,587
  50,283,630
  50,289,367
  50,297,121
  50,298,847
  50,298,858
  50,309,661
  50,317,739
  50,317,740
  50,321,815
2/-
-
-
A
A
G
G
T
T
T
-
-
A
2
T
G
G
G
G
T
-
A
A
-
T
-
C
C
53
A
A
A
C
2
2/-
G
A
A
T
3/-
2/-
A
T
A
C
-
A
C
C
-
-
T
G
G
2
G
C
C
T
T
G
C
G
G
G
2
T
2
-
11/9
T
A
G
G/9
A/G
4
T
G
-
A
T
T
C
A
G/-
A
11/-
T
A
-
-
3
T
A
3
G
-
A
G
C
A
A
C
T
G
T
C
G
3
A
G
G
A
T
-
T
C
-
G
2
C
T
C
A
T
T
A
G
G
C
A
C
A
T
A
A
C
A
C
G
G
-
C
C
C
-
T
T
T
G
A
2
T
C
A
C
C
2
G
4
G
A
C
21
-
T
A
G
-
G
G
C
G
2
6
T
9
A
C
T
T
2
G
A
6/-
4/-
-
-
C
A
A
13
G/3
C
-
A
-
-
C
T
G
A
T
A
C
G
A
T/3
T
G
C
A
-
G
T
G
A
A
C
T
C
A
C
4/-
2/-
A
2
-
-
-
G
T
T
T
T
A
2
G
T
C
G
G
2
A
A
C
C
A
A
G
C
G
A
3
7
-
G
T
C
C
T
A
2
A
5
C
2
3
A
C
T
12/-
C
G
T
T
C
A
A
G
3
4/6
-
T
-
G
G
G
G
A
G
-
C
-
C
A
A
T
C
G
-
T
3
T
T
A
-
G
2
-
G
T
C
A
A
G
C
-
T
G
A
T
A
G
C
C
G
T
G
T
C
T
T
-
C
G
-
G
G
T
G
C
G
A
A/27
2/-
C/28
2
G
TA/3
T
C
A
-
C
C
A
C
G
G
C
T
G
A
11
G
A
55
A
2
T
T
2
C
G
T
3
-
T
T
G
A
G
G
G
-
A
T
C
G
A
A
A
5
T
7
13
A
A
A
G
2
C
18
7
A
2
-
-
5
T
G
A
A
-
G
C
A
G
A
A
G
A
A
G
T
G
G
C
C
T
A
A
C
T
G
C
G
G
4
G
T
C
G
C
T
G
-
A
-
4
-
6
T
A
A
G
-
2
C
A
C
G
-
T
A
C
T
A
C
G
T
G
C
C
-
-
T
C
T
2
G/-
A/-
3
7
G
-
-
2
5
2/-
C/3
2/-
12
3/5
-
C
54
6/-
2/-
T/3
G/2
36
A/7
2/-
A/-
-
2/-
T/7
2/-
T
C/4
T/-
A/-