Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 46,096 (bp)   Positions: 554
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
1.0
.011
.002
.116
.882
.999
.002
.0
.056
.003
.003
.066
.081
.001
.008
.059
.043
.009
.001
.0
.019
.001
.02
.0
1.0
.008
.021
.923
.972
.0
.003
.002
.002
.741
1.0
.0
.0
.0
.001
--
--
.112
--
--
.001
.058
.004
.001
.001
.131
.429
.009
.018
.962
.0
.0
.0
.003
.0
.887
.991
.75
.01
.015
.015
.037
.001
.0
.005
.0
.001
.004
.001
.015
.0
.019
.023
.006
.237
1.0
.997
1.0
1.0
.913
.0
.048
.0
.001
.985
.001
.118
.156
.055
.214
.005
.056
.027
.113
.968
.845
--
--
--
--
.128
.001
.017
--
.864
--
.018
.001
.001
.001
.0
.052
.05
.006
--
--
--
--
--
.002
.005
.002
.073
.01
.002
.067
.004
.001
.002
.015
.0
.0
.005
--
.072
.006
.29
.118
.204
.001
.003
.312
.202
.001
.009
.046
.104
.114
.658
.0
.027
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.003
.379
.007
.001
.001
.003
.001
.0
.003
.044
.039
.151
.0
.0
.003
.002
.59
.0
.008
.0
.001
.0
.001
.001
--
--
--
--
--
--
.339
.07
.018
.058
.003
.022
.013
.006
.008
.035
.093
.529
.53
.647
.607
.608
.054
.012
.003
.006
.012
.006
.002
.003
.035
.03
.003
.231
.163
.006
.003
.003
.005
.06
.058
.006
.005
.714
.721
.119
.024
--
--
--
--
--
.004
.002
.003
.009
.037
.012
.003
.008
.076
.072
.0
.004
.643
.994
.0
.0
.007
.031
.0
.002
.021
.059
.013
.08
.046
.001
.042
.004
.0
.002
.001
.001
.03
.003
.994
.043
.051
.019
.248
.016
.014
.001
.038
.007
.006
.004
.007
.052
.014
.001
.002
.0
.101
.019
.062
.022
.0
.002
.004
.003
.003
.021
.04
.069
.087
.0
.0
.006
.001
.005
.0
.002
.001
.004
.113
.344
.163
--
--
--
--
--
--
--
.009
.003
.004
.125
.001
.0
.093
.014
.001
.0
.081
.119
.144
.501
.668
.035
.032
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.021
.021
.001
.017
.015
.202
.208
.201
.193
.17
.0
--
.003
.003
.0
.044
.024
.001
.003
.0
.0
.005
.007
.0
.023
.023
.009
.0
.003
--
--
--
.005
.0
.053
.0
.981
.0
.002
.004
.017
.003
.021
.184
.0
.0
.109
.003
.0
.937
.027
.759
.011
.0
.723
.252
.117
.006
.008
.176
.0
.472
.001
.007
.009
.09
.904
.957
.701
1.0
.029
.0
.001
.028
.0
.653
.638
.018
.338
.002
.0
.011
.048
.031
--
.002
.001
.411
.065
--
--
--
.004
.015
.547
.997
.834
.046
.0
.207
.204
.198
.189
.246
.295
.001
.003
.001
.011
.075
.101
.866
1.0
.999
.983
.991
.005
.002
.005
.997
.006
.998
.919
.026
.0
.974
.974
.999
.984
.001
.076
.001
1.0
.459
.064
.016
.0
.0
.501
.99
1.0
.0
.053
.0
.063
.0
.997
.003
.0
.024
.001
.001
.991
.041
.023
.019
.0
.012
.021
.001
.039
--
--
.01
.017
.002
.003
.001
.002
.038
1.0
.995
.011
.022
.006
.001
.0
.003
.113
.137
.051
.002
.037
.001
.916
Cadps
Cadps
Cadps
Cadps
Cadps
Cadps
Cadps
Cadps
Cadps
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
A
T
T
G
A
T
G
G
A
C
T
C
A
T
G
A
G
G
T
A
T
C
G
G
C
C
G
T
A
A
T
C
G
T
A
T
T
G
C
A
A
C
C
2
C
C
T
4
T
A
T
A
T
T
G
T
G
G
G
G
T
G
4
8
G
A
A
4
G
2
C
T
T
A
G
G
A
A
A
T
14
A
A
C
C
T
2
T
6
C
G
A
G
A
A
T
T
T
G
C
C
G
2
C
T
A
A
2
2
T
G
A
A
G
C
T
A
A
A
A
T
A
A
C
A
T
G
C
A
C
A
G
A
G
T
G
G
C
C
C
G
T
G
10
C
A
C
A
G
A
G
14
G
T
G
C
A
A
C
G
G
T
G
T
T
C
T
A
C
A
T
G
C
A
A
T
T
C
T
G
2
C
G
C
T
G
G
3
T
2
A
A
A
G
G
G
C
C
G
A
A
G
C
C
G
A
A
A
A
T
T
G
C
G
T
A
T
G
C
A
4
G
A
3
G
C
C
A
G
2
T
C
T
C
A
G
C
G
10
6
T
C
G
G
C
T
G
7
A
6
C
T
G
T
T
T
C
A
A
G
T
C
T
T
T
T
C
G
G
A
A
A
A
T
T
A
A
T
A
A
G
A
A
G
G
G
A
G
C
G
T
G
C
C
G
T
T
G
23
G
T
G
G
2
G
G
C
4
A
G
C
G
A
C
C
C
G
4
C
T
T
A
T
C
G
A
C
C
A
G
A
6
T
A
4
A
2
A
T
A
C
G
A
T
C
T
A
T
G
C
C
C
G
C
2
16
2
5
A
C
A
A
A
T
G
8
12
A
A
C
G
A
A
A
A
A
A
A
T
T
C
C
T
C
A
A
G
A
T
C
G
T
T
A
C
A
G
G
A
C
C
A
G
G
G
A
G
A
T
G
T
G
G
A
T
G
A
T
T
C
A
G
A
C
C
G
14
T
A
A
T
C
T
5
G
T
A
T
A
A
A
T
6
6
C
T
T
C
T
G
2
2
C
T
T
T
T
T
G
G
A
C
C
T
A
A
G
G
G
G
4
2
A
T
G
A
C
T
G
C
C
2
C
C
A
T
G
C
A
C
T
C
A
T
T
G
T
A
C
T
A
2
A
G
C
A
A
T
G
G
T
2
C
A
C
C
G
T
A
A
T
C
4
G
T
G
T
C
T
T
G
G
G
C
G
C
G
C
G
A
C
G
A
G
A
A
G
A
C
G
G
C
  16,777,615
  16,777,796
  16,777,810
  16,778,038
  16,778,181
  16,778,388
  16,779,231
  16,779,681
  16,780,157
  16,780,554
  16,780,675
  16,780,800
  16,780,813
  16,780,976
  16,781,010
  16,781,023
  16,781,024
  16,781,370
  16,781,498
  16,781,558
  16,781,991
  16,783,295
  16,783,303
  16,783,918
  16,784,256
  16,784,772
  16,784,911
  16,785,707
  16,785,736
  16,785,997
  16,786,494
  16,786,507
  16,786,640
  16,788,324
  16,788,587
  16,789,175
  16,791,700
  16,792,160
  16,792,383
  16,793,980
  16,793,988
  16,794,077
  16,794,162
  16,794,216
  16,794,487
  16,799,739
  16,799,780
  16,799,788
  16,799,858
  16,801,423
  16,802,049
  16,802,053
  16,802,291
  16,802,444
  16,802,661
  16,802,701
  16,802,716
  16,802,789
  16,802,809
  16,803,211
  16,803,846
  16,806,510
  16,808,000
  16,808,334
  16,808,424
  16,808,524
  16,808,755
  16,809,025
  16,809,301
  16,809,375
  16,809,646
  16,810,872
  16,812,159
  16,812,580
  16,813,223
  16,813,547
  16,814,260
  16,814,546
  16,816,723
  16,818,228
  16,818,384
  16,818,899
  16,820,348
  16,820,360
  16,820,619
  16,820,777
  16,821,044
  16,821,140
  16,823,384
  19,281,166
  19,288,221
  19,302,456
  19,320,081
  19,320,084
  19,320,103
  19,320,127
  19,338,182
  19,357,006
  19,360,793
  19,360,956
  19,362,956
  19,362,961
  19,363,005
  19,363,027
  19,378,418
  19,380,626
  19,382,994
  19,384,418
  19,443,112
  19,460,815
  19,472,252
  19,474,904
  19,474,908
  19,474,911
  19,474,912
  19,474,929
  19,474,933
  19,505,520
  19,512,172
  19,512,177
  19,512,195
  19,512,234
  19,512,262
  19,514,431
  19,514,449
  19,514,477
  19,515,030
  19,515,061
  19,515,190
  19,515,440
  19,515,473
  19,516,241
  19,517,444
  19,517,678
  19,518,285
  19,518,322
  19,518,556
  19,518,874
  19,519,153
  19,519,187
  19,519,301
  19,519,611
  19,521,047
  19,521,325
  19,521,939
  19,522,231
  19,522,253
  19,522,569
  19,522,740
  19,523,744
  19,523,758
  19,524,420
  19,524,836
  19,525,611
  19,526,214
  19,526,556
  19,526,581
  19,526,591
  19,526,624
  19,526,749
  19,526,822
  19,526,960
  19,527,072
  19,527,124
  19,527,752
  19,527,838
  19,528,787
  19,529,084
  19,529,465
  19,529,626
  19,529,650
  19,529,693
  19,529,823
  19,530,570
  19,530,722
  19,530,803
  19,531,322
  19,531,461
  19,531,707
  19,531,722
  19,532,339
  19,532,513
  19,532,552
  19,532,695
  19,532,923
  19,533,632
  19,533,843
  19,533,898
  19,534,378
  19,534,783
  19,534,863
  19,534,865
  19,535,034
  19,535,826
  19,536,027
  19,536,212
  19,536,264
  19,536,579
  19,536,657
  19,536,722
  19,536,839
  19,536,876
  19,536,917
  19,537,051
  19,537,298
  19,539,196
  19,539,836
  19,540,499
  19,540,503
  19,540,507
  19,540,511
  19,540,794
  19,540,833
  19,540,842
  19,540,895
  19,540,973
  19,541,012
  19,541,030
  19,541,051
  19,541,054
  19,541,058
  19,541,156
  19,541,292
  19,541,301
  19,541,355
  19,541,371
  19,541,373
  19,541,502
  19,541,518
  19,541,617
  19,541,638
  19,541,644
  19,541,649
  19,541,659
  19,541,836
  19,541,867
  19,541,868
  19,542,073
  19,542,577
  19,542,590
  19,542,722
  19,542,726
  19,542,904
  19,542,955
  19,542,981
  19,542,990
  19,543,028
  19,543,349
  19,543,474
  19,543,476
  19,543,557
  19,543,614
  19,543,829
  19,543,838
  19,543,856
  19,543,903
  19,543,966
  19,544,181
  19,544,363
  19,544,677
  19,544,723
  19,544,725
  19,544,770
  19,544,815
  19,545,061
  19,545,089
  19,545,204
  19,545,376
  19,545,647
  19,545,668
  19,545,830
  19,545,971
  19,546,221
  19,546,352
  19,546,578
  19,546,802
  19,547,091
  19,547,263
  19,547,649
  19,547,784
  19,548,954
  19,549,006
  19,549,350
  19,549,629
  19,550,724
  19,551,124
  19,551,381
  19,551,389
  19,551,541
  19,551,893
  19,551,948
  19,552,414
  19,554,344
  19,554,349
  19,554,578
  19,554,926
  19,555,079
  19,555,374
  19,556,541
  19,556,879
  19,556,908
  19,556,909
  19,556,918
  19,557,335
  19,557,792
  19,557,921
  19,560,265
  19,560,503
  19,560,697
  19,560,863
  19,560,991
  19,561,400
  19,561,527
  19,561,916
  19,562,729
  19,562,745
  19,562,747
  19,562,750
  19,563,492
  19,563,561
  19,563,819
  19,563,862
  19,564,002
  19,564,311
  19,564,535
  19,564,586
  19,564,630
  19,564,888
  19,565,370
  19,565,401
  19,565,502
  19,565,869
  19,565,902
  19,565,922
  19,566,021
  19,566,025
  19,566,036
  19,566,041
  19,566,048
  19,566,071
  19,566,077
  19,566,750
  19,566,835
  19,566,844
  19,567,159
  19,567,179
  19,567,244
  19,567,283
  19,567,674
  19,568,066
  19,568,343
  19,569,582
  19,569,716
  19,569,718
  19,569,792
  19,569,837
  19,570,161
  19,570,162
  19,570,476
  19,570,477
  19,570,610
  19,570,682
  19,570,829
  19,570,846
  19,570,990
  19,571,180
  19,571,745
  19,571,890
  19,571,958
  19,572,579
  19,572,583
  19,572,632
  19,573,060
  19,573,104
  19,573,236
  19,573,240
  19,573,272
  19,573,276
  19,575,774
  19,575,927
  19,576,115
  19,576,446
  19,576,969
  19,577,326
  19,577,937
  19,579,686
  19,579,953
  19,580,401
  19,580,468
  19,580,521
  19,580,741
  19,580,817
  19,580,864
  19,581,055
  19,581,091
  19,581,226
  19,581,639
  19,582,654
  19,582,831
  19,582,837
  19,582,922
  19,583,784
  19,583,903
  19,584,274
  19,584,317
  19,585,057
  19,585,332
  19,587,123
  19,587,258
  19,587,298
  19,587,467
  19,587,484
  19,588,191
  19,589,122
  19,590,258
  19,590,678
  19,593,139
  19,593,961
  19,594,289
  19,595,011
  19,595,577
  19,597,754
  19,598,262
  19,598,933
  19,599,432
  19,599,448
  19,600,104
  19,600,167
  19,600,426
  19,600,513
  19,601,457
  19,601,680
  19,601,725
  19,602,160
  19,602,255
  19,602,393
  19,602,484
  19,602,701
  19,603,248
  19,603,954
  19,604,366
  19,606,691
  19,607,653
  19,607,670
  19,608,502
  19,608,503
  19,610,311
  19,610,429
  19,611,812
  19,612,403
  19,612,471
  19,613,815
  19,614,703
  19,614,704
  19,615,174
  19,615,276
  19,616,404
  19,616,738
  19,616,800
  19,616,828
  19,616,889
  19,616,978
  19,617,254
  19,622,354
  19,622,907
  19,624,326
  19,624,721
  19,624,774
  19,626,253
  19,626,258
  19,626,263
  19,626,268
  19,628,260
  19,628,262
  19,629,784
  19,630,800
  19,631,356
  19,632,267
  19,632,466
  19,632,585
  19,632,736
  19,632,891
  19,632,896
  19,633,076
  19,633,153
  19,633,293
  19,633,596
  19,633,597
  19,633,737
  19,633,969
  19,634,058
  19,634,151
  19,634,599
  19,634,610
  19,634,811
  19,634,862
  19,635,083
  19,635,228
  19,635,455
  19,635,957
  19,636,234
  19,636,707
  19,636,997
  19,637,186
  19,637,465
  19,637,490
  19,637,562
  19,637,639
  19,637,962
  19,637,975
  19,638,275
  19,638,409
  19,639,098
  19,639,584
  19,639,832
  19,640,361
  19,640,707
  19,641,142
  19,641,460
  19,641,571
  19,641,631
  19,641,752
  19,643,300
  19,643,339
  19,643,642
  19,644,890
  19,645,092
  19,645,281
  19,650,593
  19,650,733
  19,650,812
  19,650,824
  19,651,051
  19,653,218
  19,653,251
  19,653,453
  19,653,533
  19,653,534
  19,659,335
  19,660,320
  19,660,945
  19,661,399
  19,661,625
  19,662,936
  19,663,352
  19,663,570
  19,664,873
  19,665,642
  19,667,822
  19,667,825
  19,667,860
  19,668,345
  19,668,444
  19,668,470
G
C
C
C
-
A
G
C
G/A
A
T
2
4
A
C
C
T
G
A
A
C
G
-
A
A
A
-
2
2
C
T
G
2
3/CA
A
C
G
C
9
A
G
-
T
G
T
-
2
-
2
-
T/4
4
-
2
C
C
A
C
C
A
G/3
-
C
2
-
-
A
G
T
-
A
-
T
4
G
3
2
A
-
2
5
-
-
-
C
3
T
C
-
G
-
C/G
G/2
A/-
G/A
A/-
5
T/2
G
T/-
G/A
C/T
C/T
G/A
-
C/2
A
G
A/-
2/-
2/-
A
A
T
G
2
2
T/G
A/G
A/G
A/G
A/G
G
G
G
G
G
C
A
T
2
A
G
T
G
2
3
G/A
5
T
T
T
2
C
A
-
C/T
G
T
G
A
2
2
-
A
C
T
T
G
G
C/T
T
A
G
T
C
C
T
C
G
C/T
A/G
T/-
G/A
C/T
G
C
G
T/C
C/T
C
A
-
T
A
T
G
A
A
-
C
-
T
T
G
2
A
T
A
T
C
G
G
T
T
T
-
A/G
A/G
A/G
G
C
C
A
T
A
G
C
3
A
A
-
-
G/A
A/3
-
G/4
A
T
G
A
-
C
T
C
T
G
C
A
A
-
-
C
A
A
A
G
C
G/-
7/-
3
6/-
T
C
A
C
4
G
T
G
G
A
C
A
C
C
C
C
T
A
A
8
2
C
T
G
C
G
C
C
G
G
C
G
C
A
2
5
G
-
G
A
C
C
T
2
C
C
A
G/A
23/-
G/3
T/2
A
A
-
A
A
G
-
G
C
G
A
A/4
C/2
C/T
C/A
3
-
T
3
C
G
C
-
4
T
T
T
T
A
A/3
-
T/A
A/T
4/-
A/T
-
5
T/A
G
T
A
-
C
G
-
G
C
A
T
C/3
G
A
A
2/-
-
2/-
?
G
T
A/T
A/G
C
C
A
-
-
G
G
A
A
G
A/G
A/G
G
G
G
G
2
C
G
A
2
4
7
G
A
G
C
T
A
C
2
G
T
G
G/C
G/C
5
2
T
G
2
-
T
G
A
G
5
A
3/5
-
A
G
A
A
2
9
-
T
-
C
T
G
A
A
-
C
G
-
-
T
2
-
A
3
G
C
G
-
G
G
6/-
-
3
2
5
T
C
T
-
-
T
C
C
G
7
9
5/3
3
G
2
T
-
G
A/G
G/A
G/A
A
A
4/-
2/-
G
G
2
G
T
C
A
G
T
-
G
T
C
C
2
T
2
T
C
T
C
2
C
A
C
C
T
C
C
-
G
A
T
C
C
C
T
A
G
-
G
G
A
T
GT/3
C
G
G
4
C/T
-
A
A
A
5
T
3
3
A
A
2
3
A
A
C
-
A
G
2
9
C
A
G
2
G/3
G
T
A
T
T