Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 125,509 (bp)   Positions: 233
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.393
.426
.045
.263
.001
.949
.056
--
.012
.135
.351
.001
.035
.031
.19
.022
.028
.008
.323
.757
.024
.894
--
.364
.049
--
--
.134
.104
.0
.0
.994
.463
.461
.032
.0
.0
.006
.002
.456
.002
.184
.046
.301
.036
.005
.0
.535
.005
.037
.001
.012
.0
.041
.001
.016
.0
.0
.0
.0
.007
.0
.017
.007
.0
.001
.06
.031
--
--
.196
.0
.012
.0
.001
.001
.0
.024
.001
.001
.001
.0
.0
.001
.035
--
--
--
--
--
--
--
--
.946
.001
.271
.01
.161
.0
.001
--
--
.01
.604
.002
.065
.035
.03
.028
.009
.001
.0
--
--
--
.003
--
.043
.013
.004
.036
--
.004
--
--
.002
.001
--
--
--
--
--
.367
.007
.025
.049
--
--
.199
.029
.065
.01
.02
.002
.002
.049
.037
.002
.004
.006
.001
.019
.001
.42
.003
.0
.007
.051
.002
.434
.055
.436
.253
.115
.081
.081
.096
.524
.23
.192
.018
.213
.02
.066
.003
.012
.05
.051
.0
.001
.001
.006
.001
.014
.0
.065
.169
.183
.181
.123
.001
.002
.054
.001
.012
.001
.144
.003
.0
.0
.007
.074
.013
.0
.0
.001
.05
.0
.026
--
--
--
.001
.002
.017
.001
--
--
--
--
.061
.001
.001
.035
.015
.017
.011
.001
.042
.0
.098
--
.0
--
--
--
--
--
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
Cabin1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102556116
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
T
C
A
A
A
C
G
C
G
T
A
C
A
G
G
C
G
G
G
C
A
G
G
C
T
G
T
T
C
A
G
G
C
G
C
C
C
C
G
A
2
C
A
C
G
A
C
C
G
G
G
A
C
C
C
A
C
A
A
C
T
C
G
T
C
G
A
3
C
A
C
T
T
A
G
G
G
C
A
T
G
C
C
C
C
C
2
2
T
C
T
T
G
9
C
A
T
G
G
A
G
T
19
G
A
C
C
G
2
G
A
C
C
C
A
A
C
C
G
A
C
T
A
T
A
T
G
2
C
T
G
T
C
G
C
T
T
2
C
2
10
C
G
G
4
G
C
A
C
G
G
G
C
T
A
A
A
G
G
C
C
T
C
G
T
A
T
A
G
C
C
C
T
C
G
T
G
A
C
T
C
G
A
T
16
2
T
T
2
C
G
T
G
T
G
C
T
G
T
A
C
A
C
T
A
A
T
C
3
T
T
C
T
G
G
2
G
2
G
T
C
C
A
C
G
C
T
A
T
G
T
  15,924,065
  15,924,080
  15,924,325
  15,925,011
  15,925,070
  16,025,967
  16,026,039
  16,026,379
  16,026,570
  16,027,085
  16,028,504
  16,028,565
  16,028,574
  16,028,592
  16,028,596
  16,028,614
  16,028,618
  16,028,630
  16,028,971
  16,029,003
  16,029,037
  16,029,268
  16,030,738
  16,030,965
  16,031,991
  16,033,326
  16,033,358
  16,035,301
  16,035,555
  16,035,683
  16,035,929
  16,036,334
  16,036,566
  16,036,567
  16,036,854
  16,036,969
  16,037,095
  16,037,157
  16,037,387
  16,037,467
  16,037,630
  16,037,848
  16,038,002
  16,038,085
  16,038,569
  16,039,154
  16,039,201
  16,039,310
  16,039,455
  16,039,465
  16,039,601
  16,039,781
  16,039,812
  16,040,052
  16,040,168
  16,040,195
  16,040,403
  16,040,655
  16,040,659
  16,040,671
  16,040,795
  16,040,894
  16,040,924
  16,040,981
  16,041,003
  16,041,019
  16,041,179
  16,041,364
  16,042,784
  16,042,865
  16,043,104
  16,043,609
  16,045,156
  16,045,565
  16,045,685
  16,046,526
  16,047,941
  16,048,005
  16,050,182
  16,050,203
  16,050,204
  16,050,335
  16,050,341
  16,050,375
  16,051,591
  16,052,146
  16,052,188
  16,052,197
  16,052,206
  16,052,212
  16,052,231
  16,052,250
  16,052,324
  16,053,039
  16,053,204
  16,053,558
  16,053,920
  16,054,219
  16,054,613
  16,056,640
  16,057,362
  16,057,395
  16,057,584
  16,057,657
  16,057,808
  16,058,071
  16,058,113
  16,058,235
  16,058,325
  16,059,096
  16,059,385
  16,059,386
  16,060,380
  16,060,389
  16,060,402
  16,060,783
  16,061,035
  16,061,622
  16,061,932
  16,062,467
  16,062,536
  16,064,033
  16,065,330
  16,065,534
  16,065,565
  16,066,215
  16,067,117
  16,067,387
  16,067,405
  16,067,506
  16,067,629
  16,068,814
  16,088,271
  16,088,322
  16,088,581
  16,088,591
  16,088,815
  16,088,862
  16,089,301
  16,089,327
  16,093,160
  16,093,773
  16,096,084
  16,096,584
  16,097,660
  16,099,424
  16,099,445
  16,099,961
  16,101,715
  16,103,659
  16,105,176
  16,105,678
  16,105,697
  16,106,143
  16,106,789
  16,106,839
  16,107,222
  16,108,757
  16,110,929
  16,114,641
  16,114,674
  16,114,713
  16,114,731
  16,114,835
  16,114,880
  16,114,881
  16,115,029
  16,115,205
  16,115,277
  16,115,361
  16,118,561
  16,120,183
  16,122,961
  16,123,770
  16,125,093
  16,125,380
  16,125,759
  16,125,785
  16,125,803
  16,126,177
  16,126,707
  16,127,174
  16,127,636
  16,127,730
  16,128,046
  16,129,843
  16,130,810
  16,130,824
  16,130,830
  16,130,854
  16,130,888
  16,130,889
  16,131,124
  16,131,244
  16,131,331
  16,131,364
  16,131,618
  16,131,676
  16,132,140
  16,132,141
  16,132,261
  16,132,681
  16,132,795
  16,132,863
  16,132,874
  16,133,187
  16,133,192
  16,133,798
  16,134,478
  16,134,761
  16,134,768
  16,134,788
  16,135,165
  16,135,256
  16,135,687
  16,135,718
  16,135,729
  16,135,730
  16,135,768
  16,135,788
  16,136,349
  16,136,915
  16,137,083
  16,137,556
  16,137,632
  16,137,921
  16,138,497
  16,138,522
  16,142,753
  16,143,062
  16,145,673
  16,147,412
  16,150,153
T/C
TC/5
C
T
G
A/-
C
G
G/T
4
A
T/A
A/G
G/A
G
G/C
G/A
C/2
G/A
G/A
G/A
T
-
3/5
A
T
G
A
C
C
G
G
2
29
T
A
T
T
T
T
A
T
-
A
C
T
C
G
T
T
A
A
T
T
T
G
T
T
T
T
T
T
C
G
A
C
G
2
G
-
A
T
T
C
C
G
C
T
A
G
G
C
A
T
-
C/G
T
T
-
2/-
-
C/T
-
C
T
-
-
3
T/G
A
T
13
T
T/G
-
A
G
T
T
C
2/-
G/-
G
T
G
2
-
-
2
T
A
2
-
C
G
A
G
A
A
2/-
C/T
6
G/2
C
T
A
C/T
G
T/-
-
T
-
-
T
A
-
4/-
-
A
T
G
A
T
A
T
C
G
G
C
G/A
A
C/T
C/T
T/C
C/T
G/A
T/C
A/T
T/C
A/2
A
C/T
A
CA/20
10
G
3/5
T/A
A
G
A
C
T
3
G
A
-
2/-
T/C
T/C
2/-
7
A
C
T
C
A
G
C
A
C
T
T
T
T
G
G
G
-
C/T
-
C
C
G
T/-
-/GT
G/-
2/-
G/-
-
A
3
A
T
G
G
A
-
T/C
G
C
A
C