Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 22,169 (bp)   Positions: 269
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.107
1.0
.002
.017
--
--
--
.042
.007
.049
.018
.011
.011
.014
.333
.654
.001
.014
.001
.001
.336
.058
.003
.023
.03
.109
.256
.109
.007
.002
.008
.001
.436
.002
.075
.003
.001
.001
.12
.104
.002
.709
.001
.001
.021
.058
.002
.0
--
--
.01
.036
.156
.15
.007
.0
.002
.002
--
--
.945
.011
.003
.008
.112
.123
.286
.006
.025
.007
--
.001
.986
.004
.016
.762
.001
.001
.002
.01
.0
.325
.056
.077
.197
.037
.102
.334
.182
.1
.01
.012
.001
.019
.018
.193
.001
.009
.0
.112
.0
.0
.002
.443
.004
--
--
--
.282
.063
.001
.001
.145
.004
.001
.002
.005
.915
.0
.002
.0
.016
.0
.016
.003
.014
.0
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.478
.0
.097
.017
.002
.775
.352
.016
--
--
.999
.914
.104
.0
.293
.007
.308
.151
.02
.032
.022
.105
.004
.002
.004
.005
.123
.498
.761
.223
.007
.005
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.989
.0
.0
.0
.0
.02
.004
.001
.002
.0
.0
.006
.0
.0
.032
.887
.0
.0
.041
.0
.414
.494
.034
.007
.016
.007
.01
.003
.82
.002
.003
.817
.004
.002
--
--
--
--
--
.002
.002
.0
.007
.903
.002
.007
.003
.056
.01
.39
.001
.03
--
--
--
--
.0
--
.966
.474
.685
.998
.998
.062
--
.021
--
--
--
--
--
.018
.008
.01
.004
.015
.008
.002
.044
.004
.004
.402
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C5
C5
C5
C5
C5
C5
A
T
C
T
T
T
G
A
3
T
A
T
A
T
C
T
12
T
C
A
T
T
C
C
A
C
A
C
T
A
A
T
A
A
16
C
T
T
C
T
G
T
G
C
T
T
C
A
G
A
C
T
C
G
G
C
A
7
C
T
G
C
T
T
G
C
T
G
A
T
C
T
A
2
C
G
C
T
A
G
A
A
G
3
C
C
C
C
G
4
C
C
T
G
T
3
C
A
C
G
T
T
T
T
C
C
C
A
T
T
C
2
C
C
G
A
C
T
T
T
T
T
A
T
A
C
T
C
C
T
A
G
T
T
T
T
C
G
C
T
C
C
C
T
A
C
A
T
T
G
T
C
14
A
G
C
A
G
C
A
T
C
A
A
A
G
A
A
T
C
T
C
C
G
T
C
G
T
G
T
T
C
T
A
A
A
A
A
G
C
A
A
T
C
A
A
G
C
A
G
G
G
C
A
T
C
G
C
T
C
C
G
A
C
T
T
A
T
T
C
2
G
C
T
T
A
G
C
G
C
G
C
A
T
T
C
5
T
A
C
C
26
24
T
C
A
42
5
A
84
G
2
3
A
G
T
A
A
C
T
C
T
G
A
T
T
T
A
T
  19,371,138
  19,371,503
  19,372,159
  19,372,246
  19,373,756
  19,374,053
  19,374,297
  19,374,575
  19,374,778
  19,374,789
  19,374,800
  19,374,827
  19,375,204
  19,375,954
  19,376,235
  19,376,456
  19,377,495
  19,377,587
  19,377,882
  19,377,931
  19,379,013
  19,379,757
  19,380,396
  19,380,406
  19,380,968
  19,380,990
  19,381,023
  19,381,402
  19,381,457
  19,382,826
  19,383,638
  19,384,589
  19,384,854
  19,385,212
  19,386,393
  19,387,032
  19,387,808
  19,387,813
  19,388,741
  19,389,335
  19,390,418
  19,390,489
  19,390,778
  19,391,606
  19,391,849
  19,392,246
  19,393,181
  19,393,542
  19,393,875
  19,394,150
  19,395,249
  19,395,338
  19,395,766
  19,395,944
  19,396,502
  19,396,802
  19,396,861
  19,398,883
  19,399,129
  19,399,225
  19,400,205
  19,400,448
  19,400,547
  19,400,726
  19,401,100
  19,401,261
  19,401,323
  19,401,390
  19,401,972
  19,402,096
  19,402,434
  19,403,228
  19,403,653
  19,403,775
  19,404,299
  19,404,510
  19,404,557
  19,404,561
  19,404,568
  19,404,786
  19,404,950
  19,405,255
  19,405,476
  19,405,614
  19,405,884
  19,407,205
  19,407,301
  19,407,324
  19,407,445
  19,408,267
  19,408,343
  19,408,990
  19,409,000
  19,409,352
  19,409,388
  19,409,520
  19,409,570
  19,409,972
  19,410,436
  19,410,478
  19,410,669
  19,410,768
  19,411,154
  19,411,274
  19,411,330
  19,411,367
  19,411,408
  19,411,440
  19,411,522
  19,412,395
  19,412,973
  19,412,984
  19,413,003
  19,413,192
  19,413,889
  19,413,894
  19,413,918
  19,414,080
  19,414,271
  19,414,275
  19,414,397
  19,414,426
  19,414,841
  19,415,171
  19,415,430
  19,415,529
  19,415,734
  19,416,036
  19,416,569
  19,416,648
  19,417,007
  19,417,123
  19,417,438
  19,417,600
  19,418,462
  19,418,647
  19,418,884
  19,418,988
  19,419,507
  19,419,580
  19,419,746
  19,420,033
  19,420,305
  19,421,040
  19,422,461
  19,422,511
  19,422,615
  19,422,867
  19,423,085
  19,423,346
  19,424,536
  19,424,709
  19,426,219
  19,426,875
  19,426,915
  19,427,254
  19,427,521
  19,429,362
  19,429,416
  19,429,596
  19,429,713
  19,429,785
  19,429,854
  19,429,928
  19,429,936
  19,429,945
  19,429,958
  19,429,965
  19,430,017
  19,430,047
  19,430,048
  19,430,053
  19,430,055
  19,430,077
  19,430,106
  19,430,120
  19,430,177
  19,430,377
  19,430,470
  19,430,607
  19,430,628
  19,430,664
  19,430,696
  19,430,793
  19,430,932
  19,430,952
  19,430,953
  19,431,089
  19,431,216
  19,431,296
  19,431,323
  19,431,354
  19,431,453
  19,431,474
  19,431,488
  19,431,495
  19,431,501
  19,431,634
  19,431,686
  19,431,714
  19,431,715
  19,431,733
  19,431,757
  19,432,045
  19,432,134
  19,432,302
  19,432,314
  19,432,409
  19,432,476
  19,432,640
  19,432,662
  19,525,512
  19,525,522
  19,525,523
  19,525,539
  19,525,553
  19,525,867
  19,525,927
  19,526,097
  19,526,579
  19,526,788
  19,526,914
  19,526,949
  19,527,064
  19,527,129
  19,527,429
  19,527,848
  19,528,306
  19,528,428
  19,528,481
  19,528,661
  19,529,227
  19,529,640
  19,530,480
  19,531,321
  19,532,056
  19,533,265
  19,533,597
  19,533,937
  19,534,131
  19,534,143
  19,534,675
  19,534,677
  19,535,101
  19,535,919
  19,536,846
  19,536,970
  19,537,033
  19,537,782
  19,537,784
  19,539,376
  19,539,913
  19,540,425
  19,540,740
  19,541,158
  19,541,183
  19,541,237
  19,541,295
  19,541,787
  19,542,247
  19,542,256
  19,542,466
  19,543,579
  19,544,099
  19,545,403
  19,545,760
  19,546,755
  19,547,395
  19,547,500
G
C
T
C
C
-
A
G
-
3
G
C
G
A
T
C
-
25
T
-
2
A
5/4
A
G
T
2
T
C
5
16
T/136
C
2
-
T
C
C
G
-
T
C
C
T
C
C
T
G
A
T
A
C
T
A
A
A
C
-
T
A
A
2
2
C
-
T
C
T
T
C
2
G
C
-
T
A
T
C
G
A
G
-
A
-
T
A
T
T
A
-
G
A
C
121
C
-
A
T
3/5
A
A
G
C
G
T
15
T
G
C
C
T
-
T
A
T
G
2
G
G
A
C
C
G
G
T
C/2
C
5/7
T
C
C
C
C
C
C
A
G
T
T
C
G
2
A
C
C
T
C
C
C
4/GT
-
T
14/-
G
A
T
G
A
T
4
C
A
G
C
5
A
T
T
C
T
G
G
T
A
C
T
A
C
A
C
C
T
G
G
G
2
G
G
A
T
G
T
G
G
G
G
A
T
G
C
A
A
T
T
C
T
A
T
C
A
T
T
C
T
C
C
T
A
A
T
-
A
G
G
C
G
T
G
C
-
A
T
G
-
G
2
-
C
G
2
2
26/-
24/-
9
T
3/5
42/-
-
-
84/-
A
-
3/-
G
A
G
G
-
T
C
2
C
A
-
C
G
G
G
C