Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 131,173 (bp)   Positions: 252
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.999
.02
.109
.105
.0
.995
.001
.116
.761
.015
.002
.063
.001
.002
.005
.001
.113
.077
.066
.05
.001
.0
.003
.014
.003
.004
.044
--
--
--
--
.967
.99
.117
.039
.119
.753
.098
.807
.001
.0
.073
.027
.0
.002
.001
.005
.004
.002
.003
--
.301
.129
.099
.009
.004
.387
--
--
.037
.155
.093
--
--
.017
.002
--
.008
.004
.001
.023
.0
.003
1.0
--
--
--
--
--
--
.025
.004
.007
.006
.302
.006
--
.028
.003
.994
.007
.99
.99
.001
.004
.0
.0
--
.005
.047
.054
.262
.006
.007
.062
.371
.036
--
.379
.207
.048
.047
.046
.006
.003
.209
.069
.051
.03
.001
.0
.001
.998
.0
.045
.245
.015
1.0
.038
--
.582
.006
.019
.022
--
--
--
--
.007
.001
.002
--
--
.328
.384
.014
.019
.209
.145
.001
.747
.402
.229
.012
.0
.223
.731
--
--
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.064
.009
.584
.002
.012
--
--
--
--
--
.45
--
.053
.139
.053
--
.857
.061
--
--
--
--
--
.141
.04
.051
.123
.467
.523
.142
--
--
--
--
.007
.04
--
.005
.01
.01
.013
.011
.119
.939
.396
.405
--
.139
--
--
--
--
--
--
--
.813
.706
.003
.155
.187
--
.274
.027
.012
.002
.004
.022
.15
.301
.002
.02
.001
.007
.001
.046
.927
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
Braf
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
4
3
A
A
T
C
T
A
A
C
G
2
G
C
2
2
T
T
A
C
C
A
A
4
A
C
T
C
T
T
G
G
G
T
T
C
G
A
A
A
T
A
T
2
C
T
G
C
T
T
C
G
C
6
A
3
G
A
T
4
T
C
T
C
C
T
C
G
C
T
A
G
C
10
T
C
G
A
G
A
A
T
C
A
G
A
T
3
T
2
A
T
T
C
G
C
C
2
T
A
G
T
G
C
A
T
C
G
T
5
4
2
A
T
A
T
T
C
A
T
A
A
C
7
T
T
2
4
A
A
T
A
2
T
A
A
A
T
C
2
A
T
T
T
A
C
G
G
4
T
C
C
C
C
A
A
3
23
G
A
C
A
G
C
A
C
T
G
A
T
T
A
12
T
A
C
9
A
G
T
G
A
A
T
C
T
T
C
C
A
C
A
A
T
A
G
C
T
T
G
C
C
G
A
G
2
G
A
T
C
T
G
G
G
G
T
A
C
G
A
C
G
A
12
A
A
A
A
G
G
C
A
G
C
12
A
8
C
7
T
T
C
C
A
T
T
A
G
C
4
  67,196,559
  67,197,916
  67,198,262
  67,198,263
  67,198,279
  67,199,219
  67,200,346
  67,200,855
  67,200,925
  67,201,848
  67,204,220
  67,204,418
  67,204,988
  67,205,152
  67,205,607
  67,205,771
  67,206,470
  67,206,846
  67,206,847
  67,206,860
  67,207,488
  67,208,748
  67,209,128
  67,210,094
  67,210,189
  67,210,987
  67,211,066
  67,211,365
  67,211,577
  67,211,591
  67,211,634
  67,212,728
  67,212,814
  67,213,284
  67,213,365
  67,213,517
  67,213,526
  67,213,603
  67,213,692
  67,213,996
  67,214,028
  67,214,048
  67,214,053
  67,214,067
  67,214,111
  67,214,143
  67,214,819
  67,215,239
  67,215,780
  67,215,939
  67,215,957
  67,218,090
  67,218,132
  67,218,755
  67,219,117
  67,220,449
  67,221,600
  67,222,985
  67,223,658
  67,226,645
  67,227,115
  67,227,134
  67,227,300
  67,227,314
  67,228,817
  67,228,950
  67,229,978
  67,232,693
  67,233,015
  67,233,130
  67,234,277
  67,234,990
  67,235,073
  67,235,412
  67,235,733
  67,235,843
  67,236,366
  67,237,027
  67,237,121
  67,237,195
  67,237,232
  67,237,299
  67,237,753
  67,238,398
  67,239,179
  67,239,611
  67,240,041
  67,240,247
  67,240,332
  67,240,428
  67,242,023
  67,244,441
  67,244,442
  67,245,947
  67,246,466
  67,247,840
  67,248,521
  67,249,085
  67,249,147
  67,249,511
  67,249,598
  67,249,669
  67,251,258
  67,251,794
  67,253,024
  67,253,149
  67,253,761
  67,253,776
  67,253,867
  67,253,920
  67,254,236
  67,254,237
  67,254,238
  67,254,252
  67,254,253
  67,254,608
  67,254,860
  67,255,592
  67,255,843
  67,256,028
  67,256,314
  67,256,612
  67,256,766
  67,258,344
  67,259,019
  67,259,935
  67,259,958
  67,261,194
  67,261,402
  67,262,716
  67,263,007
  67,263,288
  67,263,407
  67,263,849
  67,264,055
  67,264,056
  67,264,084
  67,264,375
  67,264,855
  67,264,927
  67,264,928
  67,266,775
  67,266,788
  67,266,933
  67,268,036
  67,268,287
  67,268,676
  67,268,894
  67,268,923
  67,269,117
  67,269,771
  67,270,241
  67,270,616
  67,271,153
  67,271,201
  67,271,249
  67,271,319
  67,271,557
  67,271,578
  67,271,682
  67,271,884
  67,271,891
  67,271,993
  67,272,062
  67,272,248
  67,272,730
  67,275,481
  67,276,518
  67,276,681
  67,276,824
  67,277,953
  67,278,496
  67,278,816
  67,278,863
  67,278,883
  67,279,867
  67,281,135
  67,282,640
  67,283,219
  67,284,836
  67,284,980
  67,284,996
  67,285,016
  67,285,304
  67,285,333
  67,286,789
  67,286,929
  67,288,416
  67,288,835
  67,289,758
  67,289,903
  67,291,519
  67,292,055
  67,293,569
  67,295,629
  67,295,698
  67,296,010
  67,296,020
  67,297,374
  67,297,930
  67,298,835
  67,299,213
  67,300,004
  67,300,522
  67,300,881
  67,301,212
  67,301,227
  67,301,881
  67,301,990
  67,302,145
  67,302,334
  67,304,577
  67,305,169
  67,305,457
  67,305,463
  67,305,467
  67,305,473
  67,306,264
  67,307,096
  67,307,114
  67,307,372
  67,307,473
  67,309,578
  67,310,087
  67,310,088
  67,310,357
  67,310,372
  67,310,376
  67,310,380
  67,310,405
  67,313,808
  67,314,507
  67,314,896
  67,315,562
  67,315,874
  67,316,151
  67,316,590
  67,316,866
  67,316,886
  67,316,894
  67,316,896
  67,318,923
  67,319,009
  67,319,143
  67,319,557
  67,319,963
  67,320,431
  67,320,451
  67,322,100
  67,322,157
  67,324,621
  67,326,980
-
G
4/-
-
C
G
C
T
2
G
G
G
A
-
T
A
-
-
T/-
C
G
T
A
G
G
-
T
T
T/-
T
C
A
A
C
A
C
2
T
A
C
G
G
C
G
G
-
T
C
T
T
A
C
C/7
-
2
-
A/2
-
A
A/-
-
-
C
2
2
T
T
9/7
T
C
2
C
G
C
A
-
A
A
A
6
C
T
C
A
2
5
2
A/-
C
-
C
2/-
A/-
C
C
T
A
5/7
T
2/-
C
G
2
2
A
G
-
T/5
T
A
T/-
5/-
4/-
2/-
A/-
C
G
C
C
T
2
2
G
G
T
-
C
C
-
-
G
G
G
G
-
A
C
2
G
G
A
-
-
C
-
C
G
T
A
A
-
C
T
G
G
T
T
C
-
-
A
-
T
C
A
A
-
C/3
A
2
-
3/TA
2
-
-
G
T
A
-
T
3
2
A
T
G
5
C/2
C
G
7
T
T
T
5
3
-
G
A
T
C
11
A
T
4
8
A/2
T
-
A
G
G
-
T/15
3
3
3
C
C
-
5
-
G
A
14
42
-
C
C
C
-
A
A
T
T
7
4
12/-
A/-
8/-
C/-
7/-
A
C
3
7
G
C
2
G
A
T
-