Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 138,748 (bp)   Positions: 510
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.349
.0
.084
.086
.032
.0
.001
.986
--
--
.013
--
.704
.805
.128
.075
.076
.001
.219
.312
--
--
--
.05
.001
.004
.0
.515
.001
.032
.0
.066
.234
.661
--
--
.197
.001
.023
.018
--
.198
.005
.0
.24
.001
.017
.013
.021
.263
.001
.003
.049
.01
--
--
.166
.434
.119
.0
.008
.015
.023
.013
.007
.011
.045
.005
.0
.002
.0
.081
.013
.005
.002
.003
.006
.025
.002
.07
.207
.04
.0
.0
.424
--
.018
.013
.005
.002
.007
.0
.904
.015
.113
.046
.015
.015
--
--
.005
.0
.0
.556
.02
.005
.003
.228
.359
.148
.177
.098
.097
.034
.003
.05
.004
.11
--
--
--
--
.012
.005
.003
--
--
--
.002
.003
.003
.0
.086
.0
.0
.468
.086
.008
.002
.0
.137
.02
.972
.012
.037
.028
.001
.008
.283
.702
.002
.001
.001
.656
.061
.032
.066
.093
.002
.004
.0
.07
.027
.009
.014
.11
.108
.155
.204
.362
.052
.492
.0
.0
.002
.001
.0
.009
.0
.0
.01
.001
.008
.009
.0
.0
.0
.0
.0
.077
.0
.0
.0
.003
.001
.007
.015
.045
.08
--
--
--
.002
.036
.305
.833
.87
.861
.067
.122
.162
.199
.009
.011
.016
.007
.006
.006
.125
.03
.072
.007
.017
.29
.196
.026
.095
.333
.442
--
.023
.127
.008
.011
.11
.059
.127
.019
.104
.424
.415
.087
.03
.001
.005
.003
.0
.008
.407
.148
.022
.231
.007
.916
.011
.001
.029
.007
.01
.092
.021
.092
.004
.017
.004
.11
.008
.001
.023
.044
.024
.002
.024
.534
.736
--
.19
.016
.026
.001
.003
.053
.78
.022
.002
.001
.001
.005
.006
.002
.056
.002
.008
.825
.136
.163
.051
.051
.286
.264
.21
.137
.028
.021
.021
.003
.044
.063
.428
.345
.176
.38
.249
.019
--
--
--
--
.007
.007
.026
.016
.005
.002
.001
.0
.0
.001
.002
.0
.131
.561
.475
.001
.0
.0
.001
.003
.0
.001
.014
.0
.008
.0
.008
.666
.781
.406
.208
.066
.004
.001
.002
.0
.001
.003
.001
.007
.002
.007
.146
.0
.019
.003
.006
.004
.004
.178
.21
.225
.292
.012
.018
.025
.06
.01
.012
.008
.016
.017
.005
.087
.1
--
--
--
--
--
--
--
--
.019
.581
.005
.021
.011
.006
.016
.055
.225
.162
.012
.0
.015
--
.018
.028
.0
.007
.04
.0
.017
.016
.0
.0
.093
.173
.002
.003
.154
.038
.018
.003
.014
--
--
.003
.064
.055
.008
.0
.006
.003
.002
.171
.029
.732
.001
.001
.002
.001
.008
.08
.0
.092
.246
.007
.025
.131
.219
.0
.0
.0
.002
.0
.003
.096
.139
.197
.835
.089
--
.614
.158
.155
.073
.0
.065
.307
.001
.0
.001
.003
.002
.0
.18
.028
.002
.003
.005
.014
.001
.003
.007
.585
.011
.0
.006
.001
.103
.095
.166
.075
.003
.0
.0
.034
.021
.302
--
--
.336
--
--
.004
.523
.012
.003
.016
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
T
A
A
6
C
C
T
2
4
14
T
3
C
T
G
A
T
T
G
T
6
2
2
A
T
A
C
G
T
A
G
G
3
G
C
2
14
A
G
2
C
T
T
C
G
C
A
A
A
17
T
A
A
A
T
C
2
G
7
A
T
C
G
G
C
A
A
A
C
G
G
G
C
A
14
T
G
C
G
A
G
G
4
2
10
T
A
G
A
G
T
T
A
C
C
C
G
G
A
G
T
T
G
T
9
2
C
G
A
T
T
A
A
G
G
T
C
G
G
A
A
G
A
C
T
G
C
T
A
T
C
C
C
C
A
T
T
3
C
C
C
T
2
A
G
C
T
C
A
C
C
G
A
A
G
A
C
A
A
C
C
A
G
C
C
A
A
T
3
T
C
T
T
T
T
C
T
A
G
A
T
A
G
A
C
C
C
C
C
A
G
G
A
G
G
G
T
A
2
G
A
G
G
4
T
18
G
T
A
T
G
G
C
C
C
C
A
A
C
A
G
C
A
G
A
T
A
A
A
G
G
T
C
T
A
A
G
A
G
10
8
A
3
G
C
T
C
T
G
A
T
C
G
T
A
G
T
A
T
G
G
T
T
C
A
A
C
T
C
G
G
A
A
G
T
G
C
G
G
C
T
T
C
T
C
T
C
G
G
T
A
T
C
G
T
T
T
G
A
A
A
T
T
G
T
G
C
C
G
A
C
6
T
13
G
C
G
G
A
C
7
6
G
T
9
A
C
C
A
A
A
T
A
A
T
T
G
A
G
T
T
C
C
A
G
G
G
G
G
A
T
G
G
A
G
C
G
T
G
A
T
T
C
A
A
A
G
A
A
A
2
G
C
G
A
C
G
G
C
T
G
C
C
A
2
C
C
T
81
G
T
T
G
C
A
T
A
C
G
G
5
G
T
A
G
C
C
A
A
G
T
C
C
C
G
C
C
C
A
T
C
A
G
A
18
C
C
C
G
C
C
C
T
T
T
C
T
T
C
T
C
G
A
T
A
T
A
T
G
C
C
T
G
C
C
T
A
C
A
T
C
A
2
2
A
3
A
T
T
G
C
A
5
C
A
A
T
22
20
A
G
C
T
G
A
G
A
A
T
T
C
A
C
G
C
G
G
G
T
T
6
C
A
T
G
T
C
A
C
C
  59,223,752
  59,223,901
  59,224,416
  59,224,417
  59,224,796
  59,225,526
  59,225,709
  59,225,736
  59,226,804
  59,226,840
  59,228,219
  59,228,774
  59,229,548
  59,229,591
  59,230,211
  59,230,471
  59,230,481
  59,230,733
  59,230,769
  59,231,287
  59,232,226
  59,232,392
  59,232,412
  59,233,046
  59,233,300
  59,233,901
  59,233,976
  59,234,185
  59,234,546
  59,234,875
  59,236,680
  59,237,013
  59,237,498
  59,237,634
  59,238,491
  59,241,782
  59,242,432
  59,242,628
  59,242,989
  59,245,344
  59,245,968
  59,247,065
  59,247,595
  59,247,839
  59,248,641
  59,248,758
  59,248,955
  59,249,493
  59,249,781
  59,249,845
  59,250,330
  59,250,523
  59,251,105
  59,251,475
  59,251,774
  59,252,186
  59,252,659
  59,253,294
  59,253,491
  59,253,950
  59,254,985
  59,255,173
  59,255,177
  59,255,180
  59,255,187
  59,255,358
  59,255,850
  59,256,036
  59,256,160
  59,256,352
  59,257,386
  59,257,522
  59,258,080
  59,258,091
  59,258,505
  59,260,862
  59,260,871
  59,261,300
  59,261,608
  59,263,219
  59,263,292
  59,263,892
  59,264,309
  59,264,311
  59,265,282
  59,265,763
  59,265,802
  59,265,984
  59,266,360
  59,266,620
  59,266,665
  59,266,747
  59,266,823
  59,266,869
  59,267,334
  59,267,457
  59,267,473
  59,267,493
  59,267,512
  59,267,631
  59,267,692
  59,267,835
  59,267,846
  59,268,900
  59,268,921
  59,268,957
  59,268,966
  59,269,121
  59,269,147
  59,269,539
  59,269,555
  59,269,667
  59,269,668
  59,269,712
  59,270,148
  59,270,186
  59,270,253
  59,270,297
  59,270,381
  59,270,407
  59,270,463
  59,270,500
  59,270,654
  59,270,822
  59,270,910
  59,271,117
  59,271,187
  59,271,194
  59,271,579
  59,271,635
  59,271,639
  59,272,565
  59,272,594
  59,272,916
  59,273,204
  59,274,982
  59,275,693
  59,276,697
  59,276,942
  59,277,180
  59,278,157
  59,279,271
  59,280,325
  59,282,690
  59,282,716
  59,283,157
  59,283,566
  59,283,751
  59,283,956
  59,284,923
  59,286,078
  59,286,451
  59,286,712
  59,287,081
  59,287,851
  59,288,059
  59,288,313
  59,288,315
  59,288,356
  59,288,829
  59,288,861
  59,289,052
  59,289,063
  59,289,100
  59,289,103
  59,289,144
  59,289,196
  59,289,199
  59,289,218
  59,289,350
  59,289,372
  59,289,413
  59,289,568
  59,289,623
  59,289,640
  59,289,698
  59,289,700
  59,289,801
  59,289,804
  59,289,846
  59,289,946
  59,289,978
  59,289,993
  59,290,110
  59,290,147
  59,290,149
  59,290,151
  59,290,153
  59,290,202
  59,290,282
  59,290,365
  59,290,383
  59,290,603
  59,290,707
  59,290,708
  59,291,045
  59,291,060
  59,291,263
  59,291,287
  59,291,351
  59,291,375
  59,291,406
  59,291,469
  59,291,704
  59,291,753
  59,291,778
  59,291,824
  59,291,831
  59,291,913
  59,292,003
  59,292,025
  59,292,028
  59,292,091
  59,292,100
  59,292,111
  59,292,116
  59,292,118
  59,292,167
  59,292,264
  59,292,295
  59,292,386
  59,292,418
  59,292,522
  59,292,893
  59,293,019
  59,293,050
  59,293,215
  59,293,237
  59,293,692
  59,293,976
  59,294,289
  59,294,301
  59,294,637
  59,294,855
  59,295,032
  59,295,109
  59,296,073
  59,296,203
  59,299,252
  59,299,415
  59,299,417
  59,299,844
  59,300,298
  59,300,793
  59,301,276
  59,301,314
  59,302,554
  59,303,116
  59,303,278
  59,303,592
  59,303,813
  59,304,771
  59,305,658
  59,307,196
  59,307,688
  59,308,101
  59,309,963
  59,310,225
  59,310,283
  59,310,397
  59,310,432
  59,310,550
  59,310,587
  59,310,715
  59,310,896
  59,310,921
  59,310,943
  59,311,040
  59,311,327
  59,311,357
  59,311,376
  59,311,602
  59,311,618
  59,311,735
  59,312,010
  59,312,393
  59,312,725
  59,313,035
  59,313,173
  59,313,295
  59,313,309
  59,313,341
  59,313,442
  59,313,600
  59,313,608
  59,313,614
  59,313,640
  59,313,707
  59,313,851
  59,313,875
  59,314,017
  59,314,111
  59,314,132
  59,314,268
  59,314,298
  59,314,351
  59,314,366
  59,314,367
  59,314,460
  59,314,461
  59,314,463
  59,314,469
  59,314,488
  59,314,514
  59,314,515
  59,314,539
  59,314,572
  59,314,577
  59,314,612
  59,314,623
  59,314,666
  59,314,701
  59,314,760
  59,314,783
  59,314,909
  59,314,927
  59,314,940
  59,314,952
  59,315,380
  59,315,494
  59,315,498
  59,315,506
  59,315,546
  59,315,658
  59,315,666
  59,315,814
  59,315,844
  59,315,848
  59,315,943
  59,315,948
  59,316,073
  59,316,165
  59,316,186
  59,316,256
  59,316,314
  59,316,453
  59,316,575
  59,316,580
  59,316,714
  59,316,716
  59,316,718
  59,316,730
  59,316,737
  59,316,869
  59,316,877
  59,316,939
  59,316,944
  59,317,113
  59,317,126
  59,317,221
  59,317,239
  59,317,256
  59,317,283
  59,317,353
  59,317,420
  59,317,445
  59,317,469
  59,317,515
  59,317,573
  59,317,632
  59,317,748
  59,317,805
  59,317,814
  59,317,878
  59,317,882
  59,317,938
  59,318,022
  59,318,304
  59,318,308
  59,318,310
  59,318,319
  59,318,389
  59,318,391
  59,318,516
  59,318,532
  59,318,555
  59,318,565
  59,318,668
  59,318,764
  59,318,765
  59,318,816
  59,318,979
  59,319,002
  59,319,182
  59,319,317
  59,319,456
  59,319,556
  59,319,573
  59,319,606
  59,319,698
  59,319,810
  59,319,880
  59,319,949
  59,319,988
  59,320,075
  59,320,079
  59,320,942
  59,321,008
  59,321,109
  59,321,191
  59,321,261
  59,321,818
  59,321,870
  59,322,281
  59,323,136
  59,323,293
  59,323,637
  59,324,701
  59,325,633
  59,326,576
  59,326,610
  59,326,730
  59,326,732
  59,327,176
  59,327,967
  59,328,287
  59,328,381
  59,328,887
  59,328,918
  59,328,970
  59,328,974
  59,329,576
  59,329,644
  59,329,797
  59,330,103
  59,330,303
  59,330,518
  59,330,650
  59,330,704
  59,330,778
  59,330,868
  59,330,890
  59,330,994
  59,330,995
  59,331,097
  59,331,682
  59,331,705
  59,331,839
  59,331,875
  59,331,887
  59,332,041
  59,332,066
  59,332,206
  59,332,747
  59,332,898
  59,332,918
  59,333,127
  59,333,137
  59,333,802
  59,333,838
  59,334,197
  59,334,637
  59,335,017
  59,335,114
  59,335,132
  59,335,374
  59,335,820
  59,335,829
  59,335,858
  59,336,003
  59,336,168
  59,336,321
  59,336,760
  59,336,805
  59,336,806
  59,336,843
  59,337,840
  59,338,025
  59,338,086
  59,338,162
  59,338,545
  59,339,977
  59,340,590
  59,340,738
  59,340,876
  59,340,955
  59,341,171
  59,341,232
  59,341,234
  59,341,293
  59,341,304
  59,341,671
  59,341,676
  59,343,683
  59,344,084
  59,344,154
  59,344,269
  59,344,712
  59,345,742
  59,345,834
  59,346,320
  59,346,330
  59,347,529
  59,347,795
  59,348,049
  59,348,244
  59,348,796
  59,349,711
  59,349,884
  59,351,181
  59,351,370
  59,351,436
  59,351,910
  59,352,644
  59,352,697
  59,354,544
  59,355,248
  59,355,325
  59,356,939
  59,359,997
2
G
A/3
6/-
3
G
2
-
-
-
C
-
T
5
A
G
C
C
A
-
-
-
-
G
A
T
A
-
C
13
A
C
-
T
T
2/-
-
G
11
-
9
5
A
T
T
T
C
-
G
-
C
G
G
T
G
T
-
A
-
G
C
T
24
4
2
C
-
G
A
A
T
A
4
T
-
C
A
T
A
G
T
A
4/-
2/-
-
A
G
T
C
A
C
A
C
T
T
T
T
A
T
T
C
G
A
4
-
-
6
A
G
C
A
3
9
A
A
C
T
A
T
G
C
A
G
T
C
A
T
C
G
C
T
2
T
T
G
C
-
-
T
G
T
C
-
G
C
T
C
T
9
G
T
3
G
G
A
G
2
19
T
T
T
G
C
2
G
C
G
2
-
G
T
2
C
C
C
T
A
C
A
G
C
T
A
G
A
A
A
A
T
-
A
A
G
A
T
A
C
G
-
5
C
7
17
-
C
18/-
A
2
17
A
2
A
T
A
T
A
G
G
T
G
T
G
G
A
G
C
C
C
G
A
C
A
G
C
-
T
A
5
2
10/-
8/-
2
-
T
T
C
T
11
A
2
C
T
T
15
2
A
A
T
G
A
A
17/9
2
T
T
-
T
C
T
A
A
G
T
T
C
C
T
A
A
T
2
4
T
C
A
C
T
C
A
C
C
G
T
A
106
C
C
A
2
G
C
C
C
T
C
A
T
G
C
G
3
-
T/2
-
T
T
T
A
2
-
-
-
-
C
-
G
T
G
G
G
G
C
G
C
C
C
2
G
A
C
A
G
A
G
A
T
2
T
A
2
A
T
T
T
A
A
A
A
A
3
C
C
T
G
G
T
A
G
5/17
A/11
-
C
T
A
G
T
A
A
A
G
A
T
T
G
-
G
T
A
-
C
G
C
A
T
-
C
G
T
C
A
-
A
G
-
9/4
T
T
G
G
4
C
-
11
T
6
T
G
T
G
C
T
G
A
G
-
T
G
T
A
T
T
A
C
C
15/17
T
C
C
T
A
T
A
G
G
C
C
G
A
A
T
T
-
T
T
A
C
G
T
C
C
T
2
-
-
A/-
-
G
C
13
A
T
G
-
T
G
G
17
22/-
-
G
A
T
G
A
G
T
G
T
A
-
5
2
A
A
T
A
21
A
C
T/-
-
T
G
T/-
T
-
2
-
T
T