Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 138,748 (bp)   Positions: 387
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.469
.531
.0
.004
.015
.001
.086
.09
.0
.001
.986
.361
.02
.098
.036
.025
.0
.0
.001
.0
.013
--
.098
.044
.002
.805
.024
.128
.075
.076
.001
.219
.065
.312
.229
.994
.05
.011
.515
.001
.032
.007
.001
.032
.066
.303
.897
--
--
--
--
--
--
--
--
.799
.093
.383
.001
.0
.027
.055
--
.058
.015
.023
.013
.007
.001
.048
--
.231
.0
.417
.006
.0
.016
.199
.0
.237
.29
.323
.118
.099
.196
.026
.007
.095
.332
.255
.442
--
.023
.127
.008
.011
.11
.249
.059
.127
.019
.104
.424
.415
.087
.03
.0
.005
.003
.005
.0
.008
.407
.148
.022
.231
.007
.533
.916
.011
.001
.016
.015
.029
.007
.01
.092
.092
.004
.017
.004
.11
.008
.001
.023
.044
.024
.002
.024
.534
.736
--
.19
.016
.026
.001
.003
.053
.78
.022
.002
.001
.001
.005
.006
.002
.056
.002
.008
.825
.136
.163
.051
.051
.286
.264
.21
.137
.028
.021
.021
.003
.044
.063
.428
.345
.176
.38
.249
.019
--
--
--
--
.007
.007
.026
.016
.005
.002
.001
.0
.0
.001
.002
.0
.131
.561
.475
.001
.0
.0
.001
.003
.0
.001
.014
.0
.008
.0
.008
.666
.781
.406
.208
.066
.004
.001
.002
.0
.001
.003
.001
.007
.002
.007
.004
.146
.0
.019
.003
.006
.004
.004
.178
.21
.225
.292
.337
.012
.018
.025
.06
.01
.012
.008
.016
.017
.005
.087
.1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.019
.581
.005
.021
.011
.006
.016
.055
.225
.162
.012
.0
.015
--
.018
.028
.0
.007
.04
.0
.017
.016
.0
.0
.0
.911
.093
.002
.003
.154
.038
.018
.003
.014
--
--
.003
.064
.055
.008
.0
.006
.003
.002
.171
.029
.732
.001
.001
.002
.001
.008
.08
.0
.092
.246
.007
.025
.131
.219
.0
.0
.0
.002
.0
.003
.096
.139
.197
.835
.089
--
.614
.16
.158
.155
.073
.0
.065
.307
.001
.0
.001
.003
.002
.0
.18
.028
.002
.005
.014
.001
.003
.007
.585
.011
.0
.006
.178
.002
.001
.095
.166
.166
.075
.003
.0
.0
.034
.013
.021
.302
--
.336
--
--
.004
.523
.012
.003
.016
.046
.127
.169
.004
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
Atp8b1
T
A
A
A
C
C
6
4
C
T
A
A
T
G
T
G
G
C
C
G
T
C
G
T
T
T
15
G
A
T
T
G
T
T
C
C
A
A
G
T
A
T
C
A
G
G
T
G
A
G
A
A
A
8
6
C
A
4
A
A
G
2
C
G
C
G
G
C
G
G
A
C
4
2
G
T
3
A
2
2
G
A
T
T
A
T
A
A
A
T
A
G
G
T
C
T
A
3
A
G
A
G
10
8
A
3
T
C
T
C
C
T
G
A
T
C
G
G
T
A
G
4
2
T
A
T
G
T
T
C
A
A
C
T
C
G
G
A
A
G
T
G
C
G
G
C
T
T
C
T
C
T
C
G
G
T
A
T
C
G
T
T
T
G
A
A
A
T
T
G
T
G
C
C
G
A
C
6
T
13
G
C
G
G
A
C
7
6
G
T
9
A
C
C
A
A
A
T
A
A
T
T
G
A
G
T
T
C
C
A
G
G
G
G
G
A
T
G
G
A
G
C
G
T
G
A
2
T
T
C
A
A
A
G
A
A
A
2
4
G
C
G
A
C
G
G
C
T
G
C
C
A
2
T
C
C
T
81
G
T
A
T
G
C
A
T
A
C
G
G
5
G
T
A
G
C
C
A
A
G
T
C
C
C
G
G
A
C
C
A
T
C
A
G
A
18
C
C
C
G
C
C
C
T
T
T
C
T
T
C
T
C
G
A
T
A
T
A
T
G
C
C
T
G
C
C
T
A
C
A
T
C
A
2
3
2
A
3
A
T
T
G
C
A
5
C
A
A
T
22
A
G
C
T
G
A
G
A
A
6
T
T
C
A
A
C
G
C
G
G
2
G
T
6
C
A
T
G
T
C
A
C
T
8
4
C
C
  59,223,710
  59,223,713
  59,223,901
  59,223,955
  59,224,004
  59,224,377
  59,224,417
  59,224,419
  59,225,387
  59,225,709
  59,225,737
  59,226,408
  59,226,463
  59,226,545
  59,226,552
  59,226,655
  59,227,292
  59,227,362
  59,228,039
  59,228,040
  59,228,219
  59,228,817
  59,228,936
  59,229,349
  59,229,389
  59,229,591
  59,230,079
  59,230,211
  59,230,471
  59,230,481
  59,230,733
  59,230,769
  59,231,195
  59,231,287
  59,231,377
  59,233,008
  59,233,046
  59,233,955
  59,234,185
  59,234,546
  59,234,875
  59,235,159
  59,235,851
  59,235,873
  59,237,013
  59,237,694
  59,237,704
  59,238,028
  59,238,236
  59,238,480
  59,238,485
  59,238,489
  59,238,492
  59,241,776
  59,241,778
  59,242,075
  59,242,403
  59,242,442
  59,242,628
  59,242,778
  59,242,993
  59,245,526
  59,245,968
  59,249,819
  59,255,173
  59,255,177
  59,255,180
  59,255,187
  59,257,669
  59,257,892
  59,258,239
  59,262,088
  59,264,309
  59,265,290
  59,266,173
  59,266,747
  59,268,922
  59,289,220
  59,290,143
  59,291,248
  59,292,893
  59,292,919
  59,292,964
  59,292,966
  59,293,019
  59,293,050
  59,293,166
  59,293,215
  59,293,236
  59,293,376
  59,293,692
  59,293,976
  59,294,289
  59,294,301
  59,294,637
  59,294,855
  59,295,032
  59,295,048
  59,295,109
  59,296,073
  59,296,203
  59,299,252
  59,299,415
  59,299,417
  59,299,844
  59,300,298
  59,300,528
  59,301,276
  59,301,314
  59,302,087
  59,302,554
  59,303,116
  59,303,278
  59,303,592
  59,303,813
  59,304,771
  59,305,658
  59,306,844
  59,307,196
  59,307,688
  59,308,101
  59,309,715
  59,309,717
  59,309,963
  59,310,225
  59,310,283
  59,310,397
  59,310,550
  59,310,587
  59,310,715
  59,310,896
  59,310,921
  59,310,943
  59,311,040
  59,311,327
  59,311,357
  59,311,376
  59,311,602
  59,311,618
  59,311,735
  59,312,010
  59,312,393
  59,312,725
  59,313,035
  59,313,173
  59,313,295
  59,313,309
  59,313,341
  59,313,442
  59,313,600
  59,313,608
  59,313,614
  59,313,640
  59,313,707
  59,313,851
  59,313,875
  59,314,017
  59,314,111
  59,314,132
  59,314,268
  59,314,298
  59,314,351
  59,314,366
  59,314,367
  59,314,460
  59,314,461
  59,314,463
  59,314,469
  59,314,488
  59,314,514
  59,314,515
  59,314,539
  59,314,572
  59,314,577
  59,314,612
  59,314,623
  59,314,666
  59,314,701
  59,314,760
  59,314,783
  59,314,909
  59,314,927
  59,314,940
  59,314,952
  59,315,380
  59,315,494
  59,315,498
  59,315,506
  59,315,546
  59,315,658
  59,315,666
  59,315,814
  59,315,844
  59,315,848
  59,315,943
  59,315,948
  59,316,073
  59,316,165
  59,316,186
  59,316,256
  59,316,314
  59,316,453
  59,316,575
  59,316,580
  59,316,714
  59,316,716
  59,316,718
  59,316,730
  59,316,737
  59,316,869
  59,316,877
  59,316,939
  59,316,944
  59,317,113
  59,317,126
  59,317,221
  59,317,239
  59,317,256
  59,317,283
  59,317,353
  59,317,420
  59,317,445
  59,317,469
  59,317,515
  59,317,573
  59,317,632
  59,317,633
  59,317,748
  59,317,805
  59,317,814
  59,317,878
  59,317,882
  59,317,938
  59,318,022
  59,318,304
  59,318,308
  59,318,310
  59,318,319
  59,318,325
  59,318,389
  59,318,391
  59,318,516
  59,318,532
  59,318,555
  59,318,565
  59,318,668
  59,318,764
  59,318,765
  59,318,816
  59,318,979
  59,319,002
  59,319,182
  59,319,317
  59,319,395
  59,319,456
  59,319,556
  59,319,573
  59,319,606
  59,319,698
  59,319,810
  59,319,834
  59,319,880
  59,319,949
  59,319,988
  59,320,075
  59,320,079
  59,320,942
  59,321,008
  59,321,109
  59,321,191
  59,321,261
  59,321,818
  59,321,870
  59,322,281
  59,323,136
  59,323,293
  59,323,637
  59,324,701
  59,325,633
  59,326,576
  59,326,610
  59,326,730
  59,326,732
  59,327,176
  59,327,963
  59,327,967
  59,328,174
  59,328,287
  59,328,887
  59,328,918
  59,328,970
  59,328,974
  59,329,576
  59,329,644
  59,329,797
  59,330,103
  59,330,303
  59,330,518
  59,330,650
  59,330,704
  59,330,778
  59,330,868
  59,330,890
  59,330,994
  59,330,995
  59,331,097
  59,331,682
  59,331,705
  59,331,839
  59,331,875
  59,331,887
  59,332,041
  59,332,066
  59,332,206
  59,332,747
  59,332,898
  59,332,918
  59,333,127
  59,333,137
  59,333,802
  59,333,838
  59,334,197
  59,334,637
  59,335,017
  59,335,114
  59,335,132
  59,335,374
  59,335,820
  59,335,829
  59,335,858
  59,336,003
  59,336,168
  59,336,321
  59,336,760
  59,336,804
  59,336,805
  59,336,806
  59,336,843
  59,337,840
  59,338,025
  59,338,086
  59,338,162
  59,338,545
  59,339,977
  59,340,590
  59,340,738
  59,340,876
  59,340,955
  59,341,171
  59,341,232
  59,341,293
  59,341,304
  59,341,671
  59,341,676
  59,343,683
  59,344,084
  59,344,154
  59,344,269
  59,344,712
  59,344,785
  59,345,013
  59,345,742
  59,346,320
  59,346,330
  59,346,338
  59,347,529
  59,347,795
  59,348,049
  59,348,244
  59,348,796
  59,348,915
  59,349,711
  59,349,884
  59,351,370
  59,351,436
  59,351,910
  59,352,644
  59,352,697
  59,354,544
  59,355,248
  59,355,325
  59,356,939
  59,358,807
  59,359,780
  59,359,784
  59,359,997
  59,361,839
C
T
G
G
T
A
6/-
4/-
2
2
A/-
C
C
A
A
T
11
T
T
A
C
G
2
A
2
5/7
-
A
G
C
C
A
-
-
T
T
G
G
-
C
5
C
T
G
C
A
C
A
G
A
4
6
16
8/-
6/-
T
C
-
G
G
7
-
5/13
G/3
T
24
4
2
A
C
G
T
-
2/-
A
C
-
-
-
2/-
A
G
4
2
G
C
T
C
-
C
G
A
C
A
G
C
-
-
T
A
5
2
10/-
8/-
2
-
5
T
C
C/11
T
T/11
A
2
C
T
T
2
15
2
A
4/-
2/-
A
T
G
A
17/9
2
T
T
-
T
C
T
A
A
G
T
T
C
C
T
A
A
T
2
4
T
C
A
C
T
C
A
C
C
G
T
A
106
C
C
A
2
G
C
C
C
T
C
A
T
G
C
G
3
-
T/2
-
T
T
T
A
2
-
-
-
-
C
-
G
T
G
G
G
G
C
G
C
C
C
2
G
A
C
A
G
A
G
A
T
2
T
A
2
A
T
T
T
A
A
A
A
A
A/3
2/-
C
C
T
G
G
T
A
G
5/17
A/11
-
4/-
C
T
A
G
T
A
A
A
G
A
T
T
G
-
T/7
G
T
A
-
C
G
A/3
C
A
T
-
C
G
T
C
A
-
A
G
-
4/9
T
T
G
G
4
C
-
11
T
A
6
2
T
T
G
C
T
G
A
G
-
T
G
T
A
T
T
A
C
C
15
T
C
C
T
A
T
A
G
G
C
C
G
A
A
T
T
-
T
T
A
C
G
T
C
C
T
2
-
3/-
2/-
A/-
-
G
C
13
A
T
G
-
T
G
G
9/5
-
G
A
T
G
A
G
T
G
T
-
A
A
5
2
T
A
A
T
A
13
-
A
C
-
T
G
-
T
-
2
-
T
T/3
8/-
-
T
T