Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 167,327 (bp)   Positions: 311
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.539
.006
.028
.105
--
--
.823
.212
--
.027
.006
--
--
--
--
--
.018
.026
.385
.274
.032
.066
.007
.24
.007
.532
.347
.114
.394
--
--
.125
.798
.834
.763
.107
.572
.002
.002
.275
.048
.143
.039
.019
.013
.321
.13
.015
.001
.079
.164
.002
.001
.07
.051
.308
.029
.001
.007
.005
.038
.073
.001
.001
.079
.003
.001
.001
.001
.029
.01
.063
.022
.02
.034
.059
.186
.182
.133
.067
.393
.431
.356
.118
.051
.153
.013
.013
.013
.435
.23
.026
.004
.0
.514
.0
.0
.007
.089
--
--
.092
.097
.259
.039
.342
--
--
.158
.006
.005
.002
.051
.001
.013
.005
.0
.001
.002
.036
.048
.989
.001
.106
.474
.002
.009
.069
.022
.005
.008
.001
.002
.019
.004
.024
.028
.001
.004
.001
.141
.994
.0
.167
.022
.377
.331
.321
.541
.547
.675
.021
.161
.373
.495
.0
.003
.001
.031
.001
.212
.012
.279
.22
.007
.005
.0
.013
.009
.005
.008
.008
.061
.119
.008
--
.011
.013
.687
.001
.055
.0
.003
.022
.076
.046
.013
--
.211
.009
.006
.015
.053
.054
.011
.001
.12
.422
.046
.103
.167
--
--
--
.081
.085
.03
.003
.071
.024
.002
.0
.001
.191
.0
.226
.0
.001
.0
.001
.002
--
--
--
.006
.034
.165
.526
.011
.007
.1
.018
.036
.289
.036
.083
.001
.008
.0
.02
--
--
--
.09
.04
--
--
.005
.001
.0
.003
.003
.003
.029
--
.265
.271
.569
.0
.003
.0
.05
.001
.476
.136
.0
.036
.005
.799
.583
.018
.005
.002
.001
.01
.006
.002
.128
.057
.948
.068
.014
.003
.098
.001
.004
.04
.005
.015
.001
.009
.001
.0
.003
.0
.0
.007
.017
.013
.0
.011
.528
.005
.13
.004
.006
--
.0
.0
.0
.007
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
A
G
G
A
G
T
T
4
T
G
6
T
4
2
G
2
T
12
A
T
C
C
T
2
T
G
C
G
C
A
2
G
C
T
A
C
C
C
A
C
C
G
C
G
G
A
2
T
G
T
A
18
10
G
T
T
T
C
C
T
A
T
A
T
C
C
A
A
C
G
C
T
G
T
C
T
A
A
A
9
A
T
A
T
C
A
T
T
A
2
A
C
G
2
T
G
G
A
T
C
T
T
A
A
C
2
C
G
A
2
T
C
G
C
G
A
T
C
G
G
T
C
C
G
C
G
G
A
A
G
A
T
G
C
G
G
A
C
A
T
A
A
A
2
2
A
2
T
A
A
C
T
T
G
G
G
A
A
A
A
4
2
G
C
T
C
12
A
G
T
A
A
16
C
G
T
C
A
T
G
T
T
A
G
G
3
G
T
T
G
T
C
C
T
A
10
A
C
A
G
12
G
C
C
A
T
G
C
C
G
2
G
T
T
G
G
G
G
C
C
T
C
A
G
4
G
G
T
A
G
C
G
C
A
G
C
G
C
T
C
G
A
A
14
T
G
G
C
10
8
A
T
T
2
T
A
C
A
T
G
A
A
2
T
A
T
G
C
6
A
T
2
3
A
C
T
6
A
A
T
C
C
T
G
G
A
A
C
A
G
C
G
A
C
T
T
2
C
C
T
T
G
C
C
T
C
G
C
T
  117,145,851
  117,146,534
  117,146,680
  117,147,853
  117,150,098
  117,152,246
  117,154,140
  117,154,312
  117,156,072
  117,158,356
  117,158,575
  117,158,740
  117,158,744
  117,158,847
  117,158,849
  117,158,851
  117,158,943
  117,161,288
  117,161,330
  117,161,929
  117,162,473
  117,162,515
  117,163,844
  117,164,625
  117,164,697
  117,165,400
  117,166,535
  117,166,899
  117,167,424
  117,167,633
  117,168,214
  117,168,275
  117,168,698
  117,168,869
  117,170,608
  117,170,774
  117,171,038
  117,171,419
  117,172,091
  117,172,479
  117,173,388
  117,173,978
  117,174,387
  117,175,519
  117,175,830
  117,176,170
  117,176,508
  117,176,915
  117,177,567
  117,177,680
  117,178,921
  117,179,154
  117,179,312
  117,179,623
  117,179,690
  117,179,829
  117,180,212
  117,180,311
  117,180,365
  117,180,403
  117,180,435
  117,180,467
  117,180,565
  117,180,566
  117,180,615
  117,181,006
  117,181,108
  117,181,312
  117,181,407
  117,181,602
  117,181,944
  117,181,979
  117,182,008
  117,182,019
  117,182,148
  117,182,406
  117,182,450
  117,182,594
  117,182,957
  117,183,029
  117,183,059
  117,183,062
  117,183,082
  117,183,137
  117,183,284
  117,183,296
  117,183,452
  117,183,517
  117,183,601
  117,184,399
  117,184,664
  117,185,224
  117,185,774
  117,185,787
  117,185,940
  117,186,020
  117,186,257
  117,186,438
  117,186,702
  117,186,745
  117,186,814
  117,187,318
  117,187,439
  117,187,870
  117,188,756
  117,188,924
  117,189,176
  117,189,213
  117,190,240
  117,190,506
  117,190,712
  117,190,910
  117,192,017
  117,192,175
  117,192,203
  117,193,383
  117,194,034
  117,194,781
  117,195,617
  117,195,949
  117,195,985
  117,196,375
  117,196,585
  117,196,826
  117,196,968
  117,197,974
  117,198,220
  117,198,862
  117,198,900
  117,199,324
  117,199,463
  117,199,854
  117,200,053
  117,200,139
  117,200,142
  117,200,201
  117,200,215
  117,200,304
  117,200,546
  117,200,953
  117,201,749
  117,201,815
  117,202,218
  117,202,920
  117,203,598
  117,203,758
  117,203,844
  117,204,014
  117,204,131
  117,204,132
  117,204,240
  117,204,335
  117,204,579
  117,204,674
  117,204,680
  117,205,277
  117,205,606
  117,205,864
  117,206,009
  117,206,104
  117,206,171
  117,206,521
  117,206,798
  117,206,854
  117,207,826
  117,207,912
  117,208,137
  117,208,434
  117,208,691
  117,208,724
  117,208,808
  117,209,434
  117,210,560
  117,211,750
  117,211,989
  117,212,164
  117,212,482
  117,212,485
  117,212,854
  117,213,383
  117,213,410
  117,213,686
  117,213,699
  117,213,787
  117,213,807
  117,213,815
  117,213,928
  117,214,381
  117,214,587
  117,214,626
  117,214,667
  117,214,712
  117,214,759
  117,215,001
  117,215,115
  117,215,744
  117,216,481
  117,217,143
  117,217,897
  117,218,462
  117,219,586
  117,220,373
  117,220,807
  117,221,932
  117,222,805
  117,222,808
  117,223,207
  117,223,250
  117,223,752
  117,224,275
  117,225,110
  117,226,153
  117,226,897
  117,227,739
  117,228,327
  117,228,812
  117,229,797
  117,229,871
  117,229,894
  117,230,125
  117,230,184
  117,234,378
  117,234,721
  117,234,938
  117,236,178
  117,237,748
  117,237,881
  117,239,195
  117,240,144
  117,240,204
  117,240,224
  117,240,672
  117,241,468
  117,241,922
  117,242,262
  117,242,305
  117,243,260
  117,243,653
  117,243,907
  117,244,038
  117,244,273
  117,245,577
  117,246,593
  117,247,233
  117,247,309
  117,247,538
  117,247,697
  117,249,180
  117,250,611
  117,251,006
  117,251,034
  117,251,036
  117,251,166
  117,252,155
  117,252,403
  117,260,994
  117,260,995
  117,263,935
  117,264,859
  117,265,629
  117,265,831
  117,266,900
  117,268,556
  117,271,686
  117,273,714
  117,274,906
  117,275,929
  117,276,482
  117,279,284
  117,279,779
  117,282,833
  117,286,586
  117,286,936
  117,287,740
  117,287,925
  117,288,264
  117,288,408
  117,289,237
  117,289,500
  117,289,898
  117,291,223
  117,291,294
  117,291,341
  117,291,787
  117,292,413
  117,292,842
  117,293,827
  117,294,143
  117,294,602
  117,298,395
  117,298,562
  117,299,969
  117,299,991
  117,300,257
  117,300,385
  117,300,558
  117,300,990
  117,301,059
  117,301,061
  117,301,172
  117,301,795
  117,303,790
  117,303,997
  117,304,004
  117,304,043
  117,306,383
  117,308,559
  117,309,304
  117,311,538
  117,311,625
  117,311,661
2
A
G
A
C
-
3
9
3
-
C
G/3
6/-
T/-
4/-
2/-
A
-
T/3
-
G
C
?
C/3
C
2/-
C
A
-
C
T
G
2/-
11
G
C
3
A
T
T
G
G
T
19
G
A
T
G
-
-
T
C
G
18/-
-
T
C
C
C
G
T
C
G
A
-
A
G
T
G
T
T
A
T
C
7
C
T
C
G
G
-
-
C
C
G
A
T
G
C
3
G
-
-
T
T
-
-
A
3
G
C
T
-
5
C
3
T
-
T
T
C
2/-
2
2
C
G
A
G
G
T
2
C
2
A
T
C
2
T
A
T
2
A
G
C
5
3
2
A
-
T
G
C
2
T
G
-
-
G
2/-
T/-
2
G
T
-
C
A
A
A
T
G
G
-
-
-
A
-
C
8
-
G
A
C
G
G
-
T
A
C
T
G
C
A
C
C
G
A
A
-
A
2
G
A
A
G
T
G
2
-
T
2
C
C
-
C
G
T
C
-
A
G
G
A
2/-
T
C
C
C
A
A
A
A
T
12
T
T
A
-
T
T
3
15/13
A
T
2
T
G
A
G
T
T
T/-
A
C
G
T
14/-
T/7
T
T
-
10/-
8/-
C
C
64
-
T/-
G
G
G
C
T
T
T
-
A
C
C
A
3
-
C
C
-
-
G
A
G
-
G
G
C
2
G
C
A
117
2
G
T
C
C
T
A
C
T
G
A
-
T
G
-
G
A
2
T
C
T
A
T
C