Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 91,438 (bp)   Positions: 301
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.154
.016
--
.024
.094
.073
--
.433
.067
.019
.038
.032
.017
.815
.827
.816
.383
.206
.133
.029
.017
.008
.09
.022
.021
.517
--
--
--
--
.156
.013
.279
.033
--
.018
.01
.924
.121
.053
.019
.008
.005
.0
.003
.013
.023
.005
.002
.077
.003
.058
.011
.049
.007
.008
.022
.716
.014
.014
.181
.103
1.0
.004
.116
.004
.021
.398
.741
.026
.009
.0
.048
.024
.031
.002
.019
.058
.014
.188
.121
.011
.0
.007
.004
.0
--
--
--
--
--
--
.05
.021
.009
.001
.0
.032
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.934
.656
.137
.005
.115
.036
.008
.002
.977
--
--
--
.02
.017
.086
.051
.314
.008
.212
--
--
.004
.242
.004
.002
.007
.071
.001
.107
.008
.998
.902
.921
--
--
--
--
--
--
.012
.004
--
.041
.294
.013
.006
--
.061
.053
.065
.002
.004
.017
.001
.214
.878
.0
--
.001
.0
.034
.01
.013
.155
.148
.01
.047
.016
.002
.012
.01
.006
.003
.015
.01
.064
.031
.546
.011
.107
.06
.948
.011
.001
.033
.326
.107
.136
.063
.048
.134
.014
.001
.3
.009
.001
.216
.171
.066
.02
.02
.017
.001
.196
.09
.0
--
--
--
--
.075
.001
.014
.133
.037
.98
.104
.098
.015
.007
.009
.009
.019
.007
.003
.001
.01
.002
.001
.006
.002
.068
--
.001
.196
.014
.021
.072
.097
.048
.001
.002
.223
.004
.003
.031
.008
.103
.038
.001
.0
.007
.897
.001
.012
.004
.036
.0
.002
.996
.996
.008
.009
.003
.033
.074
.003
.0
.005
.009
.0
.057
.001
.006
.001
.033
.048
.025
.024
.001
--
.023
.848
--
--
.006
.019
.027
.082
.002
.001
.997
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
Atg5
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
G
A
T
G
G
A
C
C
G
G
A
T
T
A
C
T
A
A
A
A
T
A
G
C
C
G
C
G
C
A
T
G
T
A
A
C
T
T
A
4
G
G
T
T
A
C
T
C
G
T
A
G
A
A
G
T
A
G
A
T
C
8
T
G
G
T
G
G
A
C
G
A
G
C
T
G
C
5
T
A
T
C
C
A
G
10
7
T
G
T
T
C
G
T
G
T
T
C
C
A
G
C
A
4
T
A
G
C
G
G
T
G
A
C
T
G
C
G
T
G
G
A
C
G
G
T
A
G
G
T
C
T
A
A
C
A
T
2
A
G
G
A
A
A
C
T
T
G
C
9
G
2
4
T
C
C
A
A
G
3
A
C
A
G
T
G
A
T
C
A
C
A
A
G
G
T
T
G
5
C
A
T
C
C
T
C
C
G
T
A
A
A
T
T
C
A
G
G
T
T
C
C
A
A
A
A
C
T
T
T
A
G
G
A
G
G
C
A
C
A
A
T
A
G
C
A
A
A
A
A
G
G
G
A
G
T
G
C
T
T
A
2
T
T
A
T
A
G
A
C
G
G
G
C
T
T
A
G
T
A
T
C
C
T
A
G
C
A
G
A
T
G
T
G
G
T
A
2
C
T
G
A
A
C
G
T
T
A
A
T
C
A
C
A
3
G
G
A
G
  50,935,099
  50,936,078
  50,936,323
  50,937,288
  50,937,372
  50,937,689
  50,938,753
  50,939,048
  50,939,233
  50,939,283
  50,940,301
  50,941,714
  50,942,402
  50,942,510
  50,942,524
  50,942,526
  50,942,574
  50,942,826
  50,942,853
  50,942,901
  50,943,147
  50,943,172
  50,943,296
  50,943,505
  50,944,475
  50,944,547
  50,945,131
  50,945,321
  50,945,357
  50,945,499
  50,946,040
  50,946,081
  50,946,274
  50,946,515
  50,946,825
  50,947,294
  50,947,694
  50,949,405
  50,949,835
  50,952,794
  50,952,829
  50,953,092
  50,953,141
  50,953,194
  50,953,196
  50,953,198
  50,953,202
  50,953,211
  50,953,217
  50,953,622
  50,954,287
  50,955,393
  50,955,405
  50,955,617
  50,955,819
  50,956,039
  50,956,108
  50,956,377
  50,957,497
  50,957,521
  50,957,877
  50,958,247
  50,958,375
  50,958,424
  50,959,681
  50,959,767
  50,959,830
  50,959,997
  50,960,069
  50,961,092
  50,961,101
  50,962,056
  50,962,320
  50,962,722
  50,962,727
  50,963,256
  50,963,618
  50,963,715
  50,964,645
  50,965,024
  50,965,029
  50,965,053
  50,965,441
  50,965,485
  50,965,556
  50,965,629
  50,966,043
  50,966,562
  50,966,574
  50,966,774
  50,966,839
  50,967,008
  50,967,298
  50,967,314
  50,967,540
  50,967,700
  50,968,268
  50,968,614
  50,968,984
  50,969,168
  50,969,438
  50,969,679
  50,969,754
  50,969,832
  50,969,887
  50,970,542
  50,970,770
  50,971,012
  50,971,068
  50,971,370
  50,971,387
  50,971,406
  50,971,849
  50,972,349
  50,972,377
  50,972,637
  50,972,712
  50,973,586
  50,973,667
  50,973,686
  50,973,748
  50,973,948
  50,973,984
  50,973,998
  50,974,043
  50,974,263
  50,974,652
  50,974,795
  50,974,874
  50,975,059
  50,975,707
  50,975,839
  50,976,410
  50,976,590
  50,976,598
  50,976,838
  50,977,091
  50,977,130
  50,977,388
  50,977,740
  50,978,096
  50,978,121
  50,978,290
  50,978,423
  50,979,351
  50,981,538
  50,981,548
  50,981,646
  50,982,230
  50,982,952
  50,983,073
  50,983,115
  50,983,536
  50,983,630
  50,983,638
  50,983,657
  50,983,902
  50,984,001
  50,984,316
  50,984,804
  50,984,813
  50,985,140
  50,985,620
  50,985,968
  50,987,695
  50,987,767
  50,988,413
  50,988,731
  50,988,893
  50,989,278
  50,989,322
  50,989,378
  50,989,708
  50,989,765
  50,989,841
  50,990,024
  50,990,347
  50,990,383
  50,990,690
  50,991,146
  50,991,326
  50,991,332
  50,991,931
  50,991,958
  50,992,241
  50,993,480
  50,993,744
  50,994,124
  50,995,502
  50,995,514
  50,995,834
  50,996,225
  50,996,562
  50,996,662
  50,997,076
  50,997,199
  50,997,333
  50,997,562
  50,997,567
  50,998,076
  50,998,140
  50,998,674
  50,999,401
  50,999,488
  50,999,537
  50,999,792
  50,999,796
  51,000,035
  51,000,367
  51,000,526
  51,000,669
  51,001,053
  51,001,638
  51,001,817
  51,002,090
  51,002,268
  51,002,286
  51,002,290
  51,002,350
  51,002,366
  51,002,792
  51,003,108
  51,003,278
  51,003,353
  51,004,709
  51,005,530
  51,005,598
  51,005,623
  51,006,074
  51,006,248
  51,006,362
  51,006,573
  51,007,443
  51,007,631
  51,007,803
  51,008,110
  51,008,699
  51,009,417
  51,009,492
  51,009,780
  51,010,175
  51,012,956
  51,013,649
  51,013,710
  51,013,831
  51,014,116
  51,014,262
  51,014,265
  51,014,285
  51,014,311
  51,014,315
  51,014,356
  51,014,531
  51,014,616
  51,014,894
  51,015,071
  51,015,103
  51,015,636
  51,016,128
  51,016,246
  51,016,584
  51,016,682
  51,016,710
  51,016,887
  51,016,930
  51,017,057
  51,017,253
  51,017,257
  51,017,613
  51,017,698
  51,018,117
  51,018,305
  51,018,309
  51,018,339
  51,018,451
  51,018,531
  51,018,766
  51,018,782
  51,018,898
  51,018,952
  51,019,137
  51,019,258
  51,019,311
  51,019,412
  51,019,535
  51,019,561
  51,019,686
  51,019,688
  51,019,757
  51,020,098
  51,020,901
  51,020,942
  51,021,088
  51,021,204
  51,021,934
  51,022,082
  51,022,990
  51,023,044
  51,023,782
  51,024,118
  51,025,091
T
G
4/3
T
A
A
A
G
A
T
G/A
A
C
G
A
G
2
T/2
T
T
G
G
A
G
A
A
A
A
T
73
T
G
5
A
5
G
G
-
A
C
G
4/-
C
-
-
C
G
-
T/C
T
3
C
G
A
A/2
G
A
A
G
T
C
-
6
-
2
-
T
C
A
A
G
8
A
G
G/A
T
T/G
A
G
-
C
G
C
T
T
G
A
-
-
A
A
C
C
G
A
C
A
-
A
A
T
G
A
T
G
-
C
G
A
G
A
-
C
A
G
T
A
A
G
C
C
A
A
G
T
A
A
7
-
A
A
C
A
C
C
G
C/3
T
C
-
G
T
15
G
G
C
T
C
C
A
T
9/-
A
-
-
C
T
T
T
T
A
-
T
T
G
T
A
A
G
C
T
G
T
G
G
2
T
C
C
A
5/-
C/T
T
T/30
T
C/T
C
T
G
A
A
G
G
G
C
C
A
G
A
A
C
-
C/T
G
A/G
A/G
A/G
G
T
G
C
A
G
A
A
C
A
16
-
2
T
G
G
C
G
C
G
C
T
T
G
T
A
C
A
G
C
C
G/A
C/T
C
C
G
-
C
C
G
C
T
A
G
A
A
A
A
T
A
C
G
C
4
T
C
T
T
C
T
C
C/T
G
3
C
T/C
G/A
T/2
T
G/T
T/A
3
2/-
-
C
A
G
G
G
-
6
C
2
G
G
-
C
G
-
3/-
C
A
C
A