Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 142,417 (bp)   Positions: 374
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.822
.001
.012
.001
.001
.0
.022
.027
.008
.096
.012
.008
.826
.84
.001
.0
.119
.305
.205
.028
.996
.003
.025
.002
.011
.943
.146
.013
.183
.491
.266
.0
.002
.008
.002
.001
.019
.094
.0
.69
.158
.986
.451
.003
.029
.008
.012
.0
.005
.0
.002
.023
.003
.0
.002
.005
.004
.002
.003
.0
.003
.0
.127
.324
.319
.571
.061
.978
.152
.429
.034
.01
.004
.002
.0
.624
.648
.19
.087
.009
.99
.0
.131
.274
.006
.001
.01
.025
.009
.01
.007
.004
.001
--
.047
.03
.005
.009
.286
.098
.005
.176
.036
.049
.02
.001
.01
.02
--
--
--
--
--
--
--
.023
.019
.011
--
--
--
--
.013
.075
.206
.006
.015
.157
.186
.999
.004
.001
.0
.001
.001
.0
.0
.003
.001
.035
.052
.645
.993
.155
.997
.809
.737
.74
.745
.75
.994
.0
.12
.013
.001
.978
.984
.001
.002
.103
.482
.074
.695
.47
.009
.009
.003
.164
.075
.025
.021
.001
.002
.007
.002
.004
.0
.001
--
.139
--
.001
.002
.002
--
.0
.003
.0
.001
.0
1.0
.001
.0
.001
1.0
.002
.007
.011
.005
.0
.004
.006
.0
.105
.006
.001
.087
.002
.225
.0
.002
.001
.03
--
.248
.253
.045
.051
.012
.003
.384
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.4
.017
.003
--
.997
.994
.025
.298
.49
.999
.965
.002
.001
.005
.028
.014
.047
.009
.368
.0
.033
.0
.183
--
.001
.003
.002
.0
.003
.006
.004
.256
.0
.0
.001
.0
.012
.001
.145
.163
.174
.001
.906
.0
.001
.003
.008
.1
--
.092
.016
.005
.704
.001
.001
.015
.147
.005
.026
.006
.006
.004
.005
.042
.008
.172
.008
.0
.03
.0
.006
.001
.002
.007
--
.179
.383
.037
.001
.017
--
.001
.023
.001
.008
.001
.016
--
--
.027
.986
.001
.003
.006
--
--
--
--
--
--
--
.005
.001
.001
.003
.006
.015
.122
.004
.303
.03
.001
.065
1.0
.998
.203
.001
.998
.001
.009
.0
.051
.036
.208
.011
.013
.855
.801
.783
.778
.892
.897
.966
.94
.943
.0
.372
.264
.001
.028
.03
.009
.999
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
C
A
A
A
T
T
3
C
G
A
G
G
C
A
C
T
A
A
A
G
G
G
C
G
A
C
T
22
C
T
A
T
T
G
T
T
A
8
T
C
A
A
A
10
G
G
T
G
G
C
T
T
G
A
T
T
A
C
T
A
T
A
A
T
T
T
C
T
T
C
T
C
A
2
T
A
T
T
C
G
G
C
T
G
T
T
C
T
C
T
T
116
C
C
C
A
A
T
G
C
C
A
T
T
C
T
A
A
A
C
G
A
G
A
A
A
A
G
G
T
G
C
A
G
C
A
G
T
G
C
T
T
C
A
G
T
G
T
G
T
G
A
T
4
G
C
C
4
G
T
G
G
C
T
T
G
G
C
14
A
T
T
G
T
G
A
C
G
A
A
C
A
G
A
G
A
G
G
C
C
A
24
T
C
G
G
T
A
C
T
C
G
G
T
2
G
C
5
C
C
T
G
C
C
A
T
A
G
A
C
C
A
A
A
A
T
C
A
72
4
4
2
2
4
4
2
C
2
18
A
A
C
A
A
2
T
T
T
A
G
C
C
14
T
G
T
C
G
A
A
G
3
T
G
A
G
T
A
2
G
T
T
T
T
A
T
T
8
4
A
C
T
T
G
G
4
G
T
G
T
T
A
4
2
C
A
T
T
2
A
A
C
T
A
G
C
T
A
3
T
5
A
A
C
G
G
C
24
T
T
12
G
T
6
2
G
9
6
G
A
T
7
T
G
T
T
C
C
G
T
C
C
A
G
C
T
T
A
A
T
C
G
T
T
C
C
T
G
A
T
A
6
12
T
T
T
C
C
C
T
T
T
C
T
G
3
A
T
T
T
C
A
  13,137,120
  13,137,162
  13,137,659
  13,137,816
  13,137,969
  13,138,225
  13,138,244
  13,138,348
  13,138,664
  13,138,928
  13,139,707
  13,140,048
  13,140,789
  13,140,819
  13,141,054
  13,141,547
  13,143,126
  13,143,235
  13,143,346
  13,143,548
  13,143,723
  13,144,070
  13,144,152
  13,144,459
  13,144,600
  13,145,193
  13,145,498
  13,145,905
  13,145,959
  13,146,039
  13,147,405
  13,147,734
  13,148,032
  13,148,700
  13,149,607
  13,150,198
  13,150,347
  13,150,590
  13,151,190
  13,151,698
  13,151,719
  13,153,988
  13,155,670
  13,155,988
  13,156,141
  13,156,973
  13,159,171
  13,159,455
  13,161,012
  13,161,742
  13,163,025
  13,163,584
  13,163,931
  13,165,083
  13,165,590
  13,165,873
  13,165,892
  13,166,268
  13,167,356
  13,168,266
  13,168,410
  13,168,441
  13,168,630
  13,168,702
  13,168,766
  13,168,820
  13,169,053
  13,169,209
  13,169,231
  13,169,365
  13,169,530
  13,169,628
  13,169,974
  13,170,041
  13,170,136
  13,170,484
  13,170,486
  13,170,773
  13,170,792
  13,171,073
  13,171,108
  13,171,259
  13,171,270
  13,171,284
  13,171,355
  13,171,534
  13,171,589
  13,171,743
  13,172,155
  13,172,327
  13,172,598
  13,172,649
  13,172,825
  13,173,029
  13,173,281
  13,173,289
  13,173,448
  13,173,456
  13,173,593
  13,173,602
  13,173,673
  13,173,847
  13,173,918
  13,173,928
  13,173,987
  13,174,003
  13,174,027
  13,174,210
  13,174,313
  13,174,320
  13,174,796
  13,174,992
  13,175,060
  13,175,176
  13,175,349
  13,175,625
  13,175,626
  13,175,630
  13,175,926
  13,176,112
  13,176,129
  13,176,171
  13,176,191
  13,176,454
  13,176,464
  13,176,538
  13,176,606
  13,176,674
  13,176,937
  13,177,279
  13,177,369
  13,177,409
  13,177,486
  13,177,497
  13,177,549
  13,177,648
  13,178,005
  13,178,036
  13,178,319
  13,178,437
  13,178,941
  13,178,952
  13,178,959
  13,179,110
  13,179,284
  13,179,353
  13,179,374
  13,179,377
  13,179,379
  13,179,381
  13,179,490
  13,179,552
  13,179,725
  13,179,958
  13,180,575
  13,180,888
  13,180,894
  13,181,285
  13,181,287
  13,181,317
  13,181,768
  13,182,337
  13,182,505
  13,182,549
  13,182,665
  13,182,792
  13,183,139
  13,184,215
  13,184,254
  13,184,706
  13,185,030
  13,185,110
  13,185,283
  13,185,385
  13,185,481
  13,185,792
  13,185,853
  13,185,925
  13,186,111
  13,186,209
  13,186,296
  13,186,611
  13,186,949
  13,187,071
  13,187,401
  13,187,792
  13,188,372
  13,188,435
  13,188,449
  13,188,801
  13,189,203
  13,189,342
  13,189,470
  13,189,607
  13,190,177
  13,191,138
  13,191,209
  13,191,263
  13,191,509
  13,191,647
  13,192,169
  13,192,523
  13,192,725
  13,193,272
  13,193,558
  13,193,582
  13,193,632
  13,193,955
  13,194,291
  13,194,366
  13,194,521
  13,194,525
  13,194,963
  13,195,908
  13,196,047
  13,196,048
  13,196,197
  13,196,577
  13,196,799
  13,196,824
  13,197,209
  13,197,315
  13,197,394
  13,197,446
  13,197,456
  13,197,468
  13,197,500
  13,197,570
  13,197,620
  13,197,680
  13,197,812
  13,197,895
  13,198,020
  13,198,153
  13,198,459
  13,198,868
  13,198,870
  13,199,152
  13,199,266
  13,199,394
  13,200,037
  13,200,134
  13,200,589
  13,200,657
  13,201,264
  13,202,128
  13,202,708
  13,204,989
  13,205,141
  13,205,224
  13,206,023
  13,207,799
  13,209,637
  13,209,665
  13,210,318
  13,211,263
  13,212,028
  13,212,086
  13,212,098
  13,214,678
  13,215,278
  13,215,348
  13,215,657
  13,216,763
  13,216,991
  13,217,041
  13,217,051
  13,218,055
  13,220,964
  13,222,360
  13,222,364
  13,223,196
  13,223,837
  13,224,570
  13,225,104
  13,226,126
  13,226,716
  13,227,815
  13,227,850
  13,228,271
  13,229,747
  13,230,614
  13,231,966
  13,232,246
  13,236,199
  13,236,201
  13,237,824
  13,237,868
  13,238,099
  13,238,454
  13,238,772
  13,238,790
  13,239,825
  13,239,892
  13,240,098
  13,240,147
  13,240,525
  13,240,549
  13,241,005
  13,241,101
  13,241,178
  13,241,183
  13,241,186
  13,241,475
  13,241,486
  13,241,921
  13,242,206
  13,242,226
  13,242,601
  13,244,772
  13,244,856
  13,245,705
  13,246,887
  13,246,943
  13,247,301
  13,248,840
  13,248,844
  13,251,572
  13,252,664
  13,253,401
  13,253,533
  13,254,112
  13,254,519
  13,254,743
  13,254,810
  13,255,225
  13,255,348
  13,255,369
  13,255,492
  13,255,743
  13,255,761
  13,255,824
  13,255,900
  13,256,635
  13,256,758
  13,256,789
  13,256,839
  13,257,060
  13,257,206
  13,257,364
  13,257,550
  13,257,647
  13,257,673
  13,257,950
  13,258,976
  13,259,806
  13,263,411
  13,263,769
  13,266,282
  13,267,980
  13,268,225
  13,268,396
  13,270,011
  13,270,617
  13,270,632
  13,270,740
  13,270,742
  13,270,796
  13,270,802
  13,270,804
  13,270,805
  13,270,813
  13,270,814
  13,270,831
  13,270,837
  13,270,840
  13,271,061
  13,275,022
  13,276,503
  13,276,541
  13,276,567
  13,276,741
  13,276,901
  13,278,868
A
C
-
T
G
G
C
C
-
T
A
G
A
A
T
21
4
C
T
G
3
T
A
A
G
A
G
7
3
-
T
G
C
A
C
A
T/3
G
C
-
A
A
G
T
G
-
C
A
A
A
A
T
C
2
A
G
C
A
T
T
C
T
C
2
G
C
C
-
A
C
C
2
A
-
G
-
G
T
G
C
T
A
A
T
A
A
C
C
G
C
T
C
C
-
G
T
T
G
G
A
A
T
T
G
C
C
T
G
C
G
G
G
A
G
C
T
G
G
G
A
A
C
A
T
G
5
T
G
C
A
A
T
C
C
T
G
A
C
A
C
2
C
C
G
C
-
G/A
T
T
-
C
G
T
A
T
C
G
A
A
G
14/-
G
G
G
A
C
2
-
G
A
T
C
T
T
A
G
A
G
A
A
4
T
G
-
C
T
A
A
2
G
T
C
5
A
T
C
-
A
T
-
T
T
C
A
T
T
T
C
G
T
G
3
T
-
2
2
T
G
T
T
72/-
4/-
4/-
2/-
2/-
4/-
4/-
-
T
-
-
G
C
T
C
3
-
2
A
C
G
C
T
T
-
-
G/7
G
T
A
G
C
A
-
-
A
G
T
G
T
2/-
A
-
A
C
C
C
2
A
8/-
-
13
A
C
C
C
A
-
2
A
A
A
C
G
4/-
2/-
T
T
C
C
-
9
G
T
A
G
A
-
C
G
-
C
-
-
-
C/9
T
T
T
-
C
13
-
A
C
6/-
-
A
9/-
-
T
T
C
-
A
A
C
C
G
T
C
C
A
T
C
A
G
C
A
G
T
A
G
A
C
23
A
T
C
A
C
C
2
-
-
4
C
C
T
2
T
C
3
C
T
C
C
-
-
5
-
G
T
G