Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 142,417 (bp)   Positions: 311
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.022
.0
.593
.305
.996
.003
.146
.013
.183
.049
.542
.0
.002
.144
.028
.002
.001
.008
.094
.128
.002
.158
.014
.451
.002
.003
.029
.041
.001
.012
.0
.005
.005
.0
.004
.01
.002
.001
.994
.011
.03
.003
.319
.429
.004
.0
.0
.015
.621
.627
.299
.096
.001
.016
--
.899
.009
.001
--
--
.157
.001
.035
.017
.155
.757
.762
.939
.001
.018
.728
.096
.695
.48
.009
.005
.003
.315
.164
.075
.0
.017
.004
--
.001
.611
.267
.002
.0
1.0
.002
.008
.011
.0
.001
.217
.141
.0
.0
.017
.002
.225
.0
.002
.001
.03
--
.248
.253
.045
.051
.012
.003
.356
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.4
.017
.003
--
.997
.994
.025
.298
.49
.999
.965
.002
.001
.218
.018
.003
.028
.011
.014
.091
.009
.368
.0
.226
.523
.033
.081
--
.0
.001
.009
.001
.007
.001
.003
.074
.136
.012
.004
.001
.001
.919
.004
.299
.906
.695
.0
.911
.002
.001
.003
--
.008
.1
.166
--
--
--
.155
.023
.005
.111
.127
--
.051
.022
.077
.001
.001
.015
.989
.001
.009
.012
.0
.001
.011
.061
.064
.062
.0
.005
.0
.004
.0
.0
.0
.002
.053
.141
.019
.04
.035
.008
.006
.928
.999
.199
1.0
.999
1.0
.015
.147
.008
.005
.026
.009
.059
.004
.004
.005
.008
.008
.0
.03
.0
.002
.005
.018
--
.022
.179
.383
.395
.005
.001
--
--
.005
.0
.001
.002
.003
.007
.008
.005
.047
.425
.001
.005
.016
.02
--
--
.027
.192
.986
.001
.0
--
--
--
--
.005
.042
.001
.001
.122
.004
.0
.0
.004
.475
.024
.271
.318
.998
.973
.015
.001
.0
.758
.029
.011
.067
.998
.0
.015
.975
.415
.372
.264
.03
.999
1.0
1.0
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
Asxl3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
T
A
C
T
A
G
A
C
T
2
6
T
G
A
T
T
G
4
T
T
G
T
G
A
G
A
A
2
C
G
G
2
T
G
T
G
T
C
T
C
C
T
A
T
T
C
A
C
G
T
A
2
G
G
G
C
A
G
A
A
A
C
T
C
A
10
A
T
G
C
16
G
T
C
T
T
G
G
A
C
G
A
A
C
4
T
T
C
A
G
T
T
G
C
C
C
C
G
T
A
T
A
G
A
C
C
A
A
A
A
T
C
A
70
4
4
2
2
4
4
2
C
2
18
A
A
C
A
A
2
T
T
T
A
G
C
C
G
36
2
T
4
2
G
C
G
A
T
A
A
A
T
T
T
2
T
C
T
9
A
A
C
C
C
T
G
T
A
T
G
T
T
A
G
G
G
4
G
C
T
T
A
T
T
A
A
G
C
A
A
C
A
G
T
C
G
A
C
G
T
G
C
A
T
G
T
T
A
A
T
C
2
G
T
T
T
T
T
G
G
T
G
G
T
T
C
A
C
T
T
10
A
C
A
C
A
C
T
A
T
2
2
A
T
A
G
G
T
G
4
10
G
7
C
T
A
T
A
14
12
C
T
G
C
G
T
A
6
G
T
A
T
G
T
G
G
T
C
G
C
A
T
A
A
G
T
T
G
A
T
T
T
A
T
C
T
C
G
T
T
T
12
T
4
3
A
T
A
T
T
  13,137,878
  13,138,244
  13,141,547
  13,142,470
  13,143,235
  13,143,723
  13,144,070
  13,145,498
  13,145,905
  13,145,959
  13,146,013
  13,146,055
  13,147,734
  13,148,029
  13,148,268
  13,148,636
  13,149,607
  13,150,198
  13,150,348
  13,150,590
  13,150,592
  13,150,673
  13,151,719
  13,152,823
  13,155,670
  13,155,979
  13,155,988
  13,156,141
  13,156,981
  13,159,047
  13,159,171
  13,159,455
  13,160,783
  13,161,012
  13,161,742
  13,165,892
  13,166,083
  13,166,268
  13,166,804
  13,167,392
  13,167,683
  13,168,144
  13,168,410
  13,168,766
  13,169,365
  13,169,974
  13,170,102
  13,170,136
  13,170,288
  13,170,483
  13,170,485
  13,171,065
  13,171,512
  13,172,223
  13,172,921
  13,173,118
  13,173,164
  13,173,456
  13,173,966
  13,175,926
  13,176,100
  13,176,674
  13,177,549
  13,178,437
  13,178,760
  13,179,110
  13,179,362
  13,179,384
  13,179,480
  13,181,285
  13,181,621
  13,181,805
  13,182,450
  13,182,505
  13,182,548
  13,182,792
  13,183,002
  13,183,139
  13,184,104
  13,184,215
  13,184,254
  13,184,886
  13,185,033
  13,185,792
  13,186,296
  13,187,091
  13,187,219
  13,187,238
  13,188,313
  13,188,801
  13,190,177
  13,191,138
  13,191,210
  13,191,263
  13,191,649
  13,191,682
  13,191,976
  13,191,981
  13,192,720
  13,192,725
  13,192,952
  13,193,955
  13,194,291
  13,194,366
  13,194,521
  13,194,525
  13,194,963
  13,195,908
  13,196,047
  13,196,048
  13,196,197
  13,196,577
  13,196,799
  13,196,824
  13,197,211
  13,197,315
  13,197,394
  13,197,446
  13,197,456
  13,197,468
  13,197,500
  13,197,570
  13,197,620
  13,197,680
  13,197,812
  13,197,895
  13,198,020
  13,198,153
  13,198,459
  13,198,868
  13,198,870
  13,199,152
  13,199,266
  13,199,394
  13,200,037
  13,200,134
  13,200,589
  13,200,657
  13,200,780
  13,200,837
  13,201,270
  13,202,128
  13,202,709
  13,202,711
  13,202,812
  13,205,141
  13,205,224
  13,206,023
  13,207,241
  13,207,513
  13,207,799
  13,209,627
  13,210,318
  13,212,098
  13,212,906
  13,215,805
  13,217,041
  13,220,102
  13,220,964
  13,221,759
  13,221,843
  13,222,359
  13,222,838
  13,223,397
  13,223,688
  13,223,706
  13,224,155
  13,224,362
  13,224,394
  13,224,570
  13,224,901
  13,225,104
  13,225,196
  13,225,500
  13,226,126
  13,226,716
  13,227,270
  13,227,815
  13,227,850
  13,227,930
  13,228,084
  13,228,409
  13,228,519
  13,228,641
  13,228,684
  13,229,060
  13,229,247
  13,229,502
  13,229,574
  13,229,755
  13,229,792
  13,229,849
  13,230,332
  13,230,333
  13,230,375
  13,230,502
  13,230,568
  13,230,774
  13,230,817
  13,230,908
  13,231,032
  13,231,487
  13,231,623
  13,231,743
  13,231,807
  13,231,945
  13,231,966
  13,232,037
  13,232,075
  13,232,092
  13,232,329
  13,232,331
  13,232,658
  13,232,717
  13,232,772
  13,234,272
  13,234,340
  13,234,537
  13,234,736
  13,236,153
  13,236,622
  13,236,642
  13,236,753
  13,237,177
  13,237,182
  13,237,184
  13,237,824
  13,237,868
  13,237,988
  13,238,099
  13,238,454
  13,238,773
  13,239,057
  13,239,079
  13,239,825
  13,239,892
  13,240,147
  13,240,549
  13,241,005
  13,241,101
  13,241,122
  13,241,474
  13,241,485
  13,241,624
  13,241,963
  13,242,188
  13,242,206
  13,242,226
  13,243,011
  13,243,356
  13,244,792
  13,245,706
  13,245,985
  13,246,863
  13,246,886
  13,247,301
  13,248,099
  13,248,465
  13,248,827
  13,248,832
  13,248,834
  13,249,105
  13,249,278
  13,249,999
  13,250,170
  13,251,572
  13,252,636
  13,252,763
  13,253,401
  13,253,533
  13,253,584
  13,254,112
  13,254,519
  13,254,569
  13,255,348
  13,255,606
  13,255,807
  13,255,824
  13,255,900
  13,256,085
  13,256,635
  13,256,758
  13,257,206
  13,257,364
  13,258,718
  13,258,846
  13,258,849
  13,259,286
  13,259,300
  13,259,308
  13,259,314
  13,259,806
  13,259,948
  13,260,161
  13,261,173
  13,261,476
  13,261,781
  13,262,791
  13,263,297
  13,263,536
  13,266,282
  13,268,396
  13,270,593
  13,270,852
  13,275,021
  13,275,022
  13,276,503
  13,276,741
  13,278,868
  13,279,025
  13,279,196
A
C
6
T
C
3
T
G
19
3
-
-
G
A
G
C
C
A
-
G
C
A
A
A
G
2
T
G
-
T
C
A
-
A
A
C
A
A
G
C
T
A
C
G
C
A
T
G
T
G/8
T/-
T
-
C
A
G/4
T
G
T
G
C
G
T
C
T
G
-
11/7
A
A
T
16/-
A
G
G
C
C
2
5
-
G
A
G
G
4
4/-
C
-
T
G
T
C
-
A
-
2
T
G
T
C
G
C
G
T
G
3
T
-
2
6
T
G
T
T
70/-
4/-
4/-
2/-
2/-
4/-
4/-
-
T
-
-
G
C
T
C
3
-
2
A
C
G
C
T
T
A
-
2/-
-
4/-
2/-
A
T
A
G
A
2
C
-
-
G
2
-
C
A
A
-
C
5
T
T
T
C
A
-
G
C
A
C
C
G
C
A
C
-
2
T
C
C
T
C
C
G
G
2
T
G
5
T
T
A
-
8
A
C
G
-
C
T
A
2
-
A
C
C
G
C
A
T
-
A
G
G
C
A
C
A
A
C
A
A
C
C
T
T
T
C
C
10/12
T
T
G
T
G
-
C
G
C
-
-
G
7/5
G
T
T
C
A
-
-
A
-
5/7
C
C
C
G
14/-
12/-
T
-
A
T
A
C
T
-
T
C
T
C
A
C
A
A
C
A
A
T
C
A
G
T
A
C
C
A
G
C
11/13
C
T
C
T
-
T
-
A
C
C
12/-
4
-
3/-
-
G
G
A
-