Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 81,912 (bp)   Positions: 298
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.001
.001
.49
.004
.048
.039
.038
.287
.331
.209
--
.198
.016
.994
.165
.082
.001
.009
.0
.0
.112
.008
--
.008
.145
.025
.031
.011
.032
.072
.753
.006
.06
.051
.003
.004
.016
.01
.013
.003
.194
.005
.002
.238
.032
.018
.058
.266
.001
.003
.004
.01
.001
.016
.021
.003
.002
.029
.022
--
--
--
--
--
.007
.102
.0
.295
.012
.058
.095
.0
.021
.01
--
--
--
.076
.128
.776
.219
.349
.004
.138
.137
.002
.005
.003
.004
.0
.092
.046
.022
.008
.002
.002
.003
.627
.028
.007
.144
.209
.002
.019
.01
.002
.001
.001
.009
.12
.003
.034
.001
.005
.003
.072
.091
.007
.001
.004
.025
.073
.001
.008
.989
--
.042
.192
--
--
--
--
--
--
--
.122
.283
.979
.007
.032
.026
.049
.001
.214
1.0
.004
.068
.004
.18
.245
.345
.035
.024
.008
.03
.008
.002
.0
.006
.055
.164
.059
.348
.996
.148
.84
.008
.372
.391
.066
.509
.116
.0
.054
.008
.004
.007
.015
.078
.012
.012
--
--
--
.953
.819
--
--
--
--
--
--
--
.014
.05
--
.16
.002
.015
.042
.001
.015
.059
.011
.017
.3
.86
.0
.001
.025
--
--
.007
.056
.032
.1
.049
.002
.088
.019
.019
.059
.05
.011
.061
.181
.045
.234
.022
.0
.023
.079
.012
.011
.003
.37
--
--
--
.257
.304
.022
--
.056
.096
.135
--
.004
.005
.008
--
.096
.017
.003
.199
--
.193
--
.007
.005
--
--
.413
.011
.117
.007
.019
--
--
.724
.271
.315
.003
.0
.027
.023
.008
.322
.391
.057
.276
.164
--
--
--
.019
.499
.988
.422
.972
.191
.002
.005
.001
.0
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
T
A
A
A
A
C
G
69
A
C
A
T
C
C
T
G
A
T
T
C
C
T
2
4
C
10
A
2
T
T
60
G
G
C
T
A
A
A
G
G
C
G
T
C
T
C
G
A
A
4
16
G
T
C
T
C
G
G
T
G
C
G
T
A
A
G
G
G
C
A
T
T
A
G
G
A
55
A
T
C
A
T
A
A
4
2
C
G
C
2
T
A
C
T
A
C
G
A
A
T
C
G
9
C
2
G
A
7
6
T
G
A
A
T
C
G
4
C
G
C
G
T
G
G
C
G
C
2
T
C
A
G
A
A
C
C
C
C
A
A
C
C
A
C
T
A
C
A
C
A
T
A
T
T
2
T
A
C
T
G
T
G
C
G
3
C
T
T
2
2
C
3
C
C
T
A
2
A
T
A
C
G
G
A
A
T
T
45
G
A
A
C
T
T
C
T
G
A
A
12
C
T
A
A
C
A
T
A
T
T
A
G
G
G
A
C
A
T
A
2
A
C
A
C
A
G
2
A
T
C
G
G
T
C
A
G
2
T
T
A
A
T
C
G
T
A
T
2
C
6
A
T
C
A
T
C
2
4
T
A
T
A
7
T
A
C
T
6
A
T
C
5
4
C
G
A
C
G
G
C
G
G
A
A
T
T
2
A
A
C
T
G
C
T
G
T
G
A
  31,792,196
  31,793,852
  31,793,880
  31,794,010
  31,794,426
  31,799,225
  31,799,756
  31,799,758
  31,799,830
  31,799,833
  31,799,865
  31,799,875
  31,800,376
  31,800,431
  31,800,706
  31,800,780
  31,801,149
  31,801,306
  31,801,558
  31,802,121
  31,802,280
  31,802,421
  31,802,465
  31,802,660
  31,803,261
  31,803,407
  31,803,468
  31,804,492
  31,804,698
  31,804,701
  31,804,859
  31,805,070
  31,805,359
  31,805,462
  31,805,516
  31,805,592
  31,805,653
  31,807,364
  31,807,674
  31,807,783
  31,807,787
  31,807,892
  31,808,133
  31,808,410
  31,808,477
  31,808,519
  31,808,649
  31,808,808
  31,808,856
  31,808,890
  31,808,980
  31,811,226
  31,812,497
  31,812,686
  31,812,719
  31,812,725
  31,812,766
  31,813,214
  31,813,241
  31,813,253
  31,813,546
  31,813,549
  31,813,567
  31,813,576
  31,813,627
  31,814,254
  31,814,442
  31,814,848
  31,815,421
  31,815,600
  31,816,083
  31,816,141
  31,816,181
  31,816,222
  31,816,227
  31,816,452
  31,816,454
  31,816,528
  31,816,725
  31,819,662
  31,819,716
  31,819,788
  31,819,838
  31,819,914
  31,819,998
  31,820,000
  31,820,291
  31,820,318
  31,820,346
  31,820,393
  31,820,629
  31,823,790
  31,823,817
  31,823,888
  31,823,892
  31,823,897
  31,823,898
  31,823,899
  31,823,960
  31,824,023
  31,824,092
  31,824,132
  31,824,694
  31,824,784
  31,825,094
  31,825,098
  31,825,474
  31,825,476
  31,825,477
  31,825,505
  31,825,556
  31,825,921
  31,826,187
  31,826,399
  31,826,754
  31,827,121
  31,827,375
  31,827,599
  31,827,793
  31,828,280
  31,828,418
  31,828,419
  31,828,569
  31,828,645
  31,829,421
  31,830,014
  31,833,948
  31,834,194
  31,834,696
  31,835,565
  31,836,029
  31,836,627
  31,837,070
  31,837,887
  31,837,942
  31,837,997
  31,838,410
  31,838,413
  31,838,424
  31,838,890
  31,839,213
  31,839,273
  31,839,403
  31,839,627
  31,840,018
  31,840,287
  31,840,482
  31,840,663
  31,840,674
  31,840,722
  31,841,060
  31,841,281
  31,841,472
  31,841,473
  31,841,476
  31,841,531
  31,841,801
  31,843,038
  31,843,132
  31,843,264
  31,843,368
  31,843,952
  31,843,958
  31,844,234
  31,844,555
  31,844,679
  31,844,706
  31,844,830
  31,844,971
  31,844,975
  31,845,254
  31,846,333
  31,846,357
  31,846,584
  31,846,808
  31,846,986
  31,847,049
  31,847,206
  31,847,316
  31,847,322
  31,847,339
  31,847,344
  31,847,530
  31,847,552
  31,847,590
  31,847,819
  31,847,837
  31,847,911
  31,848,074
  31,848,114
  31,848,147
  31,848,309
  31,848,339
  31,848,517
  31,849,117
  31,849,140
  31,849,280
  31,849,427
  31,849,487
  31,849,758
  31,849,873
  31,850,151
  31,850,157
  31,850,163
  31,850,167
  31,850,260
  31,850,280
  31,851,101
  31,851,372
  31,851,375
  31,851,854
  31,852,134
  31,852,226
  31,853,028
  31,853,186
  31,853,624
  31,853,980
  31,853,991
  31,854,338
  31,854,867
  31,855,157
  31,855,477
  31,856,115
  31,856,186
  31,857,089
  31,857,337
  31,857,382
  31,857,424
  31,857,462
  31,857,549
  31,857,763
  31,857,806
  31,858,459
  31,858,522
  31,858,753
  31,859,189
  31,859,340
  31,859,388
  31,859,421
  31,859,476
  31,859,617
  31,859,652
  31,859,826
  31,860,305
  31,860,391
  31,860,443
  31,860,472
  31,860,584
  31,860,798
  31,860,843
  31,860,914
  31,861,086
  31,861,422
  31,861,486
  31,861,566
  31,861,853
  31,862,186
  31,862,254
  31,862,609
  31,862,667
  31,862,669
  31,862,976
  31,862,992
  31,863,679
  31,863,812
  31,863,902
  31,863,922
  31,863,934
  31,863,994
  31,864,004
  31,864,306
  31,864,469
  31,864,470
  31,864,683
  31,864,821
  31,864,964
  31,864,965
  31,865,052
  31,865,113
  31,866,108
  31,866,910
  31,867,196
  31,868,099
  31,868,206
  31,868,214
  31,868,426
  31,869,475
  31,869,571
  31,870,051
  31,870,436
  31,870,835
  31,871,517
  31,871,811
  31,871,867
  31,871,937
  31,872,326
  31,872,504
  31,872,684
C
2
5/7
G
G
A
-
-
G
T
G
A
-
T
C
C
T
A
-
T
A
4/3
-
-
3
-
G
-
-
-
-
A
A
-
A
25
12
G
C
C
T
A
A
G
4
G
T
T
G
-
-
2
G
A
C
G
A
A
C
C
-
A
G
T
G/C
A
A
T
A
-
C
C
-
A
T
-
-
T
2
T
T
C
11
G
-
2/-
T
5
T
2/-
C
G
A
A
G
T
2
8
C
G
A
T
-
A
-
3
-
7/-
6/-
A
A
C
19/25
C
T
C
-
A
C
A
T
C
A
A
T
T
T
2/-
-
10/4
G
A
9
G
2
3
A
A
C
G
3/CT
T
G
T
C
G
T
-
T
G
C
G
C
5
-
A
G
T
C
A
3/4
A
G
A
-
T
2
C
-
-
A
-
T
C/12
2
G
-
2
2
G
T
A
3
G
G
C
A
-
A
C
T
A
C
C
T
68
A
G
G
-
T
2
C
G
G
5
17
2
A
C
G
-
G/8
A
A/2
T
G
C
T
-
G
T
G
G
G
C
2/-
17
A
T
A
C
C
T
G
3
-
-
A
G
T
C
T
G/2
C
25
3
-
T
-
5
A
T
A/3
8
T
-
-
41
T
A
G
7/-
C
T
T
C
-
G
3
G
5/-
-
T
A
C
T
C
A
T
A
11/8
G
11/13
C
-
-
G
G
2
-
3
3
-
2
C
A
T