Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 100,767 (bp)   Positions: 344
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.003
.351
.141
--
--
--
--
.008
.749
.159
.981
.964
1.0
.094
.012
.042
.461
.339
.428
.083
.108
.168
.065
--
.93
.716
.061
.047
.014
.001
.005
.719
--
--
--
.182
.062
--
--
--
.006
.027
--
.901
.09
.008
.14
.008
.011
--
--
.032
.015
.014
.455
.269
.034
.007
.327
.06
--
.005
.001
.01
.0
--
.001
.013
.0
.004
.053
.158
.019
.263
.417
.099
.042
--
--
--
.08
.073
.077
.0
.002
.946
--
.013
.249
.002
.092
.115
.817
.008
.296
.284
.099
.014
.011
.011
.044
.001
.579
.913
.912
.023
.015
.023
.18
.112
.132
.006
.484
.027
.04
.022
.0
.0
.773
.048
.096
.532
--
--
--
.445
.311
.052
--
.42
.124
.041
--
--
--
--
.007
.006
.003
.003
.002
.004
.015
.01
.136
.109
.01
.402
.305
.001
.152
.089
.093
--
--
--
.035
.048
.007
.168
.417
.021
.074
--
--
--
--
--
.255
.002
.02
.01
.005
.013
.078
.041
.019
.023
.008
.004
.0
.004
.0
.107
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.007
.001
.068
.161
.038
.008
.006
.003
.002
--
--
--
--
--
.041
.048
.245
.248
.112
.001
.002
.001
.603
.002
.002
.005
.078
.098
.1
.111
.112
.583
.013
.005
.259
.135
.025
.01
.873
.001
.001
.015
.035
.004
.104
--
--
--
--
--
--
--
.013
.204
.028
.056
.053
.33
.17
.199
.02
.002
.007
.02
.014
.016
.009
.018
.074
.002
.002
.011
.004
.233
.0
.232
.211
.006
.001
.015
.003
.001
.009
.058
.003
.011
.066
--
--
.001
.0
.001
.003
.007
.294
.013
.02
--
--
--
.007
.298
.022
.055
.056
.066
.025
.005
.005
.117
.0
.278
.577
.001
.003
.003
.007
.002
.66
.003
.0
.003
.017
.002
.009
.043
.001
.092
.0
.0
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
12
A
T
16
2
C
2
G
G
T
A
G
T
C
T
C
7
T
G
T
A
G
T
A
T
T
T
T
C
A
T
T
T
G
A
C
T
C
A
G
2
A
G
G
C
C
G
G
C
T
T
T
C
G
C
A
A
T
T
G
T
A
C
C
C
T
T
G
2
G
A
C
G
T
T
C
7
C
G
G
C
G
C
T
A
G
A
T
A
T
T
G
C
C
C
T
G
T
G
A
T
A
T
A
C
3
T
C
138
T
A
T
T
C
G
T
G
A
C
T
C
C
C
C
G
G
A
G
A
G
G
G
7
8
A
A
A
A
A
A
2
T
G
G
C
G
C
G
A
T
T
T
A
C
G
G
C
C
G
T
T
T
G
C
G
C
A
T
C
G
C
C
T
C
C
A
A
T
A
C
G
T
T
C
C
C
C
3
G
T
T
T
C
2
T
T
4
C
C
A
T
T
3
T
T
T
T
T
A
T
T
T
G
A
T
G
G
A
G
T
A
G
C
C
2
2
A
G
G
4
G
A
3
C
T
T
G
C
G
A
C
C
C
C
A
A
C
C
T
T
T
C
A
C
3
G
A
T
G
A
C
T
C
G
C
A
G
T
T
A
A
G
G
T
T
C
T
3
A
A
C
C
T
T
T
C
A
A
T
3
T
A
A
C
G
A
A
2
A
G
3
G
G
G
C
A
T
G
G
A
G
G
C
T
C
A
G
T
A
C
T
A
G
A
T
G
C
A
G
A
A
G
A
C
T
T
C
A
C
A
G
A
  181,947,682
  181,950,779
  181,953,336
  181,953,740
  181,954,203
  181,954,222
  181,954,759
  181,955,011
  181,955,112
  181,955,153
  181,955,835
  181,955,853
  181,956,627
  181,958,511
  181,960,829
  181,960,839
  181,961,089
  181,961,520
  181,961,864
  181,963,148
  181,963,170
  181,963,943
  181,964,207
  181,965,129
  181,966,229
  181,968,664
  181,969,010
  181,969,147
  181,969,695
  181,970,064
  181,970,335
  181,970,674
  181,971,015
  181,971,019
  181,971,056
  181,971,176
  181,971,358
  181,971,642
  181,971,663
  181,971,671
  181,972,097
  181,972,494
  181,972,678
  181,973,044
  181,973,135
  181,973,394
  181,973,485
  181,973,794
  181,973,996
  181,974,047
  181,974,121
  181,974,443
  181,974,902
  181,974,904
  181,976,229
  181,976,344
  181,976,505
  181,976,531
  181,977,049
  181,977,390
  181,977,858
  181,979,060
  181,980,511
  181,982,123
  181,982,819
  181,983,061
  181,983,600
  181,983,696
  181,983,786
  181,983,839
  181,983,915
  181,983,922
  181,984,221
  181,984,316
  181,984,492
  181,984,579
  181,985,110
  181,985,193
  181,985,203
  181,985,285
  181,985,710
  181,985,930
  181,985,935
  181,986,451
  181,986,770
  181,986,807
  181,988,855
  181,989,410
  181,990,046
  181,990,121
  181,990,134
  181,990,442
  181,991,389
  181,991,871
  181,991,895
  181,992,230
  181,993,133
  181,993,173
  181,993,180
  181,993,185
  181,993,197
  181,993,750
  181,993,977
  181,994,129
  181,994,146
  181,994,312
  181,994,374
  181,995,039
  181,995,835
  181,995,842
  181,996,097
  181,996,344
  181,996,653
  181,996,841
  181,996,944
  181,996,987
  181,997,885
  181,998,044
  181,998,176
  181,998,311
  181,998,643
  181,998,705
  182,000,310
  182,000,475
  182,000,525
  182,000,821
  182,001,580
  182,002,161
  182,002,533
  182,003,071
  182,003,398
  182,004,703
  182,005,068
  182,005,294
  182,005,349
  182,005,395
  182,005,439
  182,005,441
  182,005,443
  182,005,445
  182,005,447
  182,005,449
  182,005,589
  182,005,830
  182,005,890
  182,005,894
  182,005,955
  182,006,091
  182,006,674
  182,006,870
  182,007,730
  182,007,981
  182,007,985
  182,008,001
  182,008,086
  182,008,124
  182,008,280
  182,008,639
  182,009,313
  182,009,659
  182,009,717
  182,009,892
  182,010,253
  182,010,291
  182,010,302
  182,010,333
  182,010,347
  182,010,372
  182,010,463
  182,010,733
  182,010,758
  182,010,770
  182,010,790
  182,010,800
  182,010,805
  182,010,828
  182,010,852
  182,010,941
  182,010,958
  182,011,137
  182,011,651
  182,011,946
  182,012,026
  182,012,267
  182,013,413
  182,013,462
  182,013,648
  182,013,788
  182,014,366
  182,014,436
  182,014,484
  182,014,633
  182,014,675
  182,014,772
  182,014,949
  182,015,006
  182,015,431
  182,015,461
  182,016,381
  182,016,414
  182,016,428
  182,016,431
  182,016,444
  182,016,448
  182,016,451
  182,016,886
  182,016,899
  182,017,005
  182,017,227
  182,017,230
  182,017,282
  182,017,399
  182,017,400
  182,018,124
  182,018,131
  182,018,176
  182,018,433
  182,018,514
  182,019,179
  182,019,358
  182,019,862
  182,020,681
  182,020,683
  182,020,821
  182,020,829
  182,020,854
  182,020,888
  182,020,893
  182,020,958
  182,020,961
  182,021,249
  182,021,526
  182,021,710
  182,021,887
  182,021,917
  182,021,932
  182,022,171
  182,023,037
  182,023,387
  182,023,905
  182,024,031
  182,024,037
  182,024,038
  182,024,045
  182,024,052
  182,024,339
  182,024,448
  182,024,504
  182,024,656
  182,024,691
  182,024,708
  182,024,709
  182,024,848
  182,025,104
  182,025,282
  182,025,421
  182,026,058
  182,026,246
  182,026,515
  182,026,640
  182,028,489
  182,028,875
  182,029,222
  182,029,276
  182,029,401
  182,029,409
  182,029,478
  182,029,693
  182,029,939
  182,029,946
  182,030,008
  182,030,525
  182,030,564
  182,030,568
  182,030,721
  182,030,734
  182,030,738
  182,030,743
  182,030,770
  182,031,101
  182,031,104
  182,031,160
  182,031,257
  182,031,407
  182,031,408
  182,031,605
  182,032,108
  182,032,381
  182,032,485
  182,032,868
  182,032,870
  182,033,399
  182,033,496
  182,033,832
  182,033,861
  182,034,252
  182,034,344
  182,034,468
  182,034,589
  182,034,605
  182,034,784
  182,034,864
  182,034,887
  182,034,902
  182,035,005
  182,035,293
  182,035,709
  182,036,115
  182,036,164
  182,036,224
  182,036,442
  182,036,539
  182,036,637
  182,036,638
  182,036,677
  182,036,811
  182,036,892
  182,037,326
  182,037,603
  182,038,399
  182,038,727
  182,038,791
  182,039,103
  182,039,201
  182,039,750
  182,040,496
  182,040,583
  182,041,310
  182,041,361
  182,041,424
  182,042,129
  182,042,558
  182,043,044
  182,043,296
  182,043,425
  182,043,896
  182,044,101
  182,045,314
  182,046,344
  182,046,848
  182,047,021
  182,047,472
  182,047,877
  182,047,881
G
-
-
C
C
-
2/-
5
-
5
C
C
2
4
4
-
C
C/2
7/-
2
T
-
C
G/3
6
G
C
C
-
C
T
T
3
13
C
A
G
T
C
3
8
A
-
G
T
A
3
G
A
A
2
C
C
C
A
A
T
T
T
-
G
A
C
G
T
T
2
C
C
A
-
T
T
5/8
T
C
C
-
-
T
A
A
T
A
T
C
A/2
A
C
A
G
C
-
A
G
2
T
7/-
G/3
T/3
T
G
C
T
C
-
T
-
C
T
-
C
G
C
C
T
A
-
A
G
T
C
T
2
G
G
T
A
G
T
-
A
A
2
-
-
7
G
G
G
G
G
-
2
15
8
T
A
T
A
-
6
21
C
G
T
A
A
T
T
C
C
C
C
T
2
A
6
G
G
T
A
T
T
A
T
-
G
G
C
-
G
C
C
G
T
T
T
-
-
2
-
A
5
T
-
-
A
-
G
T
G
T/3
T/3
3/-
A
C
A
A
-
G
C
A
C
A
G
C
C
A
G
C
G
11
A
T
8
-
-
G
A
A
-
A
4
-
A
C
2
A
T
A
2
A
A
A
T
G
C
2
T
8
2
T/13
T
G
T
-
A
2
C
A
C
T
G
T
C
T
5
A
4
G
G
G
T
A
G
G
T
C
-
2
G
T
C/2
T/3
2
C
T
G
5
10
-
C
T
G
T
11
T
5
-
T
C
-
T
C
T
T
AT/3
C
C
2
-
4
T
T
G
G
C
T
G
T
T
C
G
A
G
C
A
T
3
A
G
G
T
G
G
C
2
2
G
3
2
A
G