Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 305,413 (bp)   Positions: 390
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.56
.335
--
--
--
.097
.082
.155
.068
.274
.006
.03
.116
.0
.282
.015
.118
.126
.142
.383
.547
.717
--
.314
.001
.023
.632
.442
.129
.054
.001
.003
.018
.035
.032
.042
.024
.032
.025
.081
.012
.007
.023
.0
.568
.057
.203
.277
.246
.016
.119
.179
.0
.179
.069
.077
.016
.009
.004
.003
.002
.016
.022
.005
.141
.012
.001
.202
.468
.217
.008
.001
.076
.963
.012
.017
.008
.089
.816
--
.144
.0
.02
.047
.001
.097
--
.766
.005
.001
.001
.001
.195
.041
.001
.972
.0
.004
--
--
--
--
--
.006
.306
.001
.654
.0
.0
.103
.005
.002
.006
.007
.114
.097
.018
.004
.067
.006
.002
.053
--
.685
.108
.001
.0
.225
.001
--
--
.001
.001
.005
.001
.01
.01
.034
.003
.015
.018
.015
.01
.42
.017
.001
.389
.169
.446
.001
.002
.014
.006
.181
.002
.018
.067
.114
.132
.016
.003
.011
.001
.001
.001
.077
.006
.0
.055
.001
.108
.0
.002
.001
.053
.015
.001
.0
.336
.09
.0
.001
.029
.001
.001
.257
.049
.0
.011
.023
.006
.197
.057
.234
.017
.998
.025
.003
.508
.054
.099
.003
.006
.306
.0
.026
.001
.07
.002
.007
.009
.075
.001
.003
.0
.0
.0
.001
.0
.002
.0
.178
.001
.986
.096
.009
.0
.027
.004
.0
.024
.0
.052
.98
.0
.0
.002
.0
--
--
.017
.007
.0
.01
.004
.05
.241
.005
.906
.0
.013
.001
--
.078
.242
.169
.032
.044
.085
.343
.136
.21
--
--
.003
.001
.001
.003
.003
.015
.523
.004
.143
.003
--
.041
.073
.088
.243
.09
.004
--
.079
.088
.001
.0
.0
.0
.75
.002
.896
.968
.369
.0
.009
.876
.289
.005
.076
.294
.18
.085
.608
.002
.539
.026
.0
.0
.032
.044
.021
.02
.01
.153
.013
--
--
--
.009
.012
.0
.001
.003
.0
.001
.961
.001
.002
.002
.001
.052
.003
.003
.0
.174
.055
--
--
--
--
.022
.621
.002
.004
--
.015
.127
.105
.01
.139
.031
.001
.023
.001
.006
--
--
.006
.007
.0
.092
.001
.009
.003
.019
.079
.011
--
.0
.003
.998
.303
.001
.003
.023
.05
.049
.029
.009
.0
.999
.0
.001
.001
.0
.921
.207
.001
.007
.0
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
32
C
C
G
T
A
A
T
2
T
C
A
A
T
A
A
A
T
C
G
C
G
A
C
G
G
A
T
A
G
G
C
T
G
A
A
A
T
G
C
C
G
T
C
T
G
G
A
C
C
G
G
A
T
G
G
C
T
C
G
G
A
T
C
A
2
A
T
C
C
C
G
T
G
T
T
12
G
T
T
G
A
G
A
T
C
A
A
G
C
A
G
T
A
A
A
G
T
A
G
G
G
G
G
29
G
C
T
G
T
G
A
T
G
G
T
A
T
C
C
G
T
A
A
C
A
A
G
T
T
C
2
A
C
G
G
A
A
G
C
T
T
3
C
A
3
G
A
A
C
G
C
T
T
2
T
T
A
G
C
A
T
A
G
T
C
T
G
G
G
A
C
G
G
G
9
G
T
T
G
A
G
C
T
G
C
T
T
A
C
A
A
C
C
G
G
C
A
A
4
A
A
A
A
T
G
G
A
T
T
4
A
G
C
G
G
C
A
A
T
G
G
T
A
G
T
T
C
C
A
C
A
C
G
T
T
G
A
G
T
G
T
G
T
T
C
A
T
A
G
C
T
A
G
C
G
T
C
G
A
C
C
G
A
C
A
C
C
T
T
2
T
C
G
C
T
A
T
3
A
C
A
A
C
G
A
G
T
G
2
A
G
T
T
T
14
T
G
A
A
T
C
C
G
A
G
C
T
C
G
G
T
T
A
T
T
T
T
A
T
T
A
A
G
A
A
C
G
C
G
G
T
T
T
A
C
6
T
G
C
C
A
T
A
A
G
C
A
A
C
A
G
G
A
C
6
C
G
C
G
C
A
T
A
T
G
G
G
G
A
T
A
4
G
A
G
A
G
G
A
T
G
G
G
G
G
A
G
A
  138,014,870
  138,015,118
  138,026,292
  138,026,297
  138,026,299
  138,029,295
  138,038,024
  138,038,049
  138,038,218
  138,038,502
  138,038,513
  138,038,643
  138,038,961
  138,040,284
  138,043,334
  138,043,343
  138,045,887
  138,045,888
  138,047,035
  138,047,076
  138,047,097
  138,047,621
  138,048,250
  138,050,818
  138,051,130
  138,051,285
  138,051,991
  138,053,028
  138,053,355
  138,056,862
  138,056,873
  138,057,236
  138,057,542
  138,058,122
  138,058,123
  138,058,937
  138,059,385
  138,059,979
  138,060,120
  138,060,777
  138,062,837
  138,063,530
  138,064,502
  138,065,592
  138,065,826
  138,067,860
  138,068,135
  138,068,829
  138,069,275
  138,070,091
  138,070,101
  138,070,403
  138,070,589
  138,071,925
  138,073,287
  138,073,371
  138,073,374
  138,073,383
  138,073,404
  138,073,413
  138,073,415
  138,073,855
  138,074,007
  138,075,070
  138,076,216
  138,078,064
  138,078,990
  138,079,928
  138,080,114
  138,080,562
  138,081,235
  138,081,252
  138,081,638
  138,081,667
  138,081,937
  138,081,941
  138,082,139
  138,087,189
  138,087,422
  138,087,889
  138,089,698
  138,090,509
  138,094,193
  138,094,614
  138,098,084
  138,101,400
  138,104,497
  138,104,793
  138,105,189
  138,110,180
  138,121,924
  138,122,129
  138,128,382
  138,128,505
  138,129,736
  138,129,921
  138,130,333
  138,130,492
  138,132,776
  138,134,364
  138,135,163
  138,137,430
  138,137,996
  138,139,126
  138,140,552
  138,140,748
  138,143,011
  138,145,174
  138,145,328
  138,145,762
  138,145,947
  138,146,426
  138,147,476
  138,148,763
  138,149,779
  138,149,968
  138,150,742
  138,150,839
  138,151,447
  138,151,600
  138,152,430
  138,154,013
  138,154,410
  138,156,063
  138,156,093
  138,156,904
  138,158,250
  138,158,327
  138,159,229
  138,159,853
  138,159,948
  138,160,909
  138,160,912
  138,162,256
  138,162,378
  138,162,399
  138,162,958
  138,163,776
  138,163,874
  138,164,989
  138,165,295
  138,165,314
  138,165,341
  138,167,317
  138,168,759
  138,169,177
  138,171,301
  138,172,290
  138,172,573
  138,173,036
  138,173,114
  138,173,578
  138,173,670
  138,173,785
  138,174,491
  138,174,705
  138,174,708
  138,174,710
  138,174,943
  138,175,049
  138,175,171
  138,175,652
  138,175,684
  138,176,339
  138,176,740
  138,177,027
  138,177,138
  138,181,333
  138,181,469
  138,182,328
  138,182,914
  138,182,989
  138,183,007
  138,183,059
  138,183,080
  138,183,084
  138,183,155
  138,183,348
  138,185,039
  138,185,338
  138,187,340
  138,187,918
  138,189,626
  138,189,834
  138,189,979
  138,190,317
  138,190,705
  138,191,058
  138,191,136
  138,191,215
  138,191,298
  138,191,312
  138,191,691
  138,192,587
  138,192,690
  138,194,211
  138,195,605
  138,195,857
  138,196,137
  138,196,642
  138,197,083
  138,197,156
  138,197,249
  138,197,360
  138,197,584
  138,197,669
  138,198,486
  138,198,698
  138,199,038
  138,200,648
  138,200,650
  138,200,766
  138,200,919
  138,201,874
  138,202,622
  138,203,057
  138,203,385
  138,203,646
  138,203,684
  138,204,741
  138,205,597
  138,206,150
  138,206,543
  138,207,101
  138,207,318
  138,208,152
  138,208,548
  138,209,057
  138,209,253
  138,210,698
  138,211,007
  138,212,666
  138,212,978
  138,213,094
  138,213,710
  138,213,777
  138,214,141
  138,214,296
  138,214,557
  138,214,972
  138,215,792
  138,215,871
  138,215,880
  138,216,142
  138,216,783
  138,216,858
  138,217,150
  138,217,249
  138,217,879
  138,218,241
  138,218,863
  138,218,951
  138,219,156
  138,219,388
  138,219,748
  138,221,454
  138,221,806
  138,221,835
  138,221,901
  138,222,104
  138,222,655
  138,222,724
  138,223,399
  138,223,493
  138,224,765
  138,224,779
  138,225,207
  138,226,472
  138,229,688
  138,230,834
  138,231,399
  138,231,743
  138,231,994
  138,232,255
  138,232,411
  138,232,786
  138,234,050
  138,234,196
  138,234,558
  138,234,999
  138,235,699
  138,236,187
  138,237,231
  138,237,232
  138,238,552
  138,239,441
  138,239,942
  138,239,943
  138,241,232
  138,241,730
  138,242,443
  138,243,268
  138,246,330
  138,246,608
  138,247,983
  138,248,359
  138,248,411
  138,248,763
  138,249,201
  138,250,214
  138,250,515
  138,250,734
  138,251,213
  138,252,093
  138,253,840
  138,254,397
  138,254,460
  138,254,726
  138,254,949
  138,255,065
  138,255,755
  138,255,756
  138,255,770
  138,256,137
  138,256,174
  138,256,473
  138,256,517
  138,256,566
  138,256,751
  138,257,086
  138,257,364
  138,258,349
  138,258,369
  138,258,534
  138,258,568
  138,259,314
  138,259,562
  138,260,023
  138,260,112
  138,260,510
  138,260,542
  138,260,957
  138,261,138
  138,261,997
  138,263,597
  138,264,780
  138,264,964
  138,265,309
  138,265,635
  138,265,842
  138,265,940
  138,266,739
  138,266,851
  138,267,172
  138,267,474
  138,267,954
  138,268,541
  138,268,547
  138,268,714
  138,269,966
  138,270,992
  138,275,079
  138,276,178
  138,276,774
  138,277,210
  138,280,801
  138,280,808
  138,281,488
  138,281,894
  138,283,269
  138,285,374
  138,288,813
  138,289,008
  138,290,088
  138,290,458
  138,290,794
  138,291,379
  138,292,599
  138,294,198
  138,294,294
  138,294,358
  138,296,027
  138,296,903
  138,302,593
  138,302,682
  138,305,126
  138,305,127
  138,306,329
  138,306,685
  138,306,978
  138,307,538
  138,310,074
  138,310,515
  138,310,591
  138,310,730
  138,311,192
  138,311,206
  138,311,279
  138,311,283
  138,311,393
A
-
C/-
-
T
-
G
A/-
-
-
T/C
A
G
C
C
C
-
C
T/7
A
A
C/2
4
C
T
2
2
2
A
G
T
G/A
T
G
C
2
G
-
2
A
5
G
A
C
T
C
A
A
G
-
-
A
A
G
G
-
T
-
C
A
C
A
G
2
T
G
-
T
C
-
-
-
T
C
-
-
C
-
A
C
C
A
G
A
G
-
C/A
-
G
A
G
A/G
T
A
-
A/G
G
T
T/C
A/G
2
A
C
C
T
29/-
T
G
A
A
7
A
G
2
G/A
A
T/C
G
C
G
T
2
G
G
G
T
T
G
C
-
C
T
-
A/G
C/G
A
A
A/G
G
A
T
-
T/G
-
T
G
-
G/A
G
G
T
T
C/2
A
4
-
C
A
A/-
G/A
A
2
G
2
C
C
C/5
G
A
G/A
A
-
-
-
-
-
-
T
C
C
2
C
A
3
C
A
T
5
C
T
C/2
A/G
G
G
A
2
G/A
T
G
G
-
T
A/G
G
G
C
A
A
G
T/C
T/C
4/-
G
G/2
C/2
2
A
T
C
G
C
A
A
A
A/G
A
T/3
C
T
T
G
-
T
A
A
C
G
A
2
G/2
C
A
-
A
C
T/C
2
G
C
2
G/A
T
C
G
A
T
2
C
T
C
2
T
G
A
T
T
2
T
T
G
2
2/-
A
T
2
3
C
G
G
-
7
T
-
A/T
T
-
2
T
2
A
-
G
A
T/-
C
A
-
C
2
T
T
G
T
A
A
G
A
T
G
G
G/2
G/T
6
C
G
-
T/-
C
-
A/2
C
C
G
C
A
G
A/2
T
C
T
A
A
-
T/C
C
T
T
-
C
A
T
G
5/9
C
G
A/G
A
T
T
T
C/2
G
A
9
T
T
6/-
C/T
T
A
A
C/2
G
C
G
G
T
A
A
T
G
C
G
-
A
C
A
G
A
A
G
T/-
G/C
C
G/A
A
A
G
3
T