Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 181,964 (bp)   Positions: 420
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.027
.017
.029
.006
.378
.441
.013
.218
.005
.006
.0
.032
.0
.0
.009
.272
--
--
--
--
.015
.002
.003
.0
.005
.004
.004
.003
.998
.0
.002
.001
.001
.027
.001
--
--
.002
.01
.998
.071
.004
.079
.115
.002
.117
.169
.983
.0
--
.007
.001
.994
.996
.001
.48
.39
.155
.092
.002
.002
.134
.071
.0
.134
.001
.001
--
--
.13
.001
.993
--
.008
.004
.001
.054
.057
.011
.001
.003
.925
.0
.001
.002
.076
--
.035
.003
.013
.026
.078
.312
.036
.091
.028
.012
.0
.001
.0
.978
.006
.025
.224
.003
.043
.32
--
--
--
--
.036
.001
.002
.053
.178
.052
.013
.105
.342
.004
--
.005
.001
.011
.006
.003
.001
.082
.03
.0
.003
.002
.001
.0
.048
.025
.0
.0
.0
.001
.0
.003
.001
.001
.007
.556
.0
.003
.002
.328
.005
.021
.011
.121
.002
.001
.012
.003
.11
.005
.017
.024
.013
.156
.022
.0
.088
.089
.003
.034
.0
.015
.001
.137
.074
.002
.025
.015
--
--
--
.0
.032
.003
.001
.005
.0
.001
.007
.001
--
--
--
--
--
--
--
.043
.045
.54
.043
.457
.313
.001
.001
.029
.002
.006
.084
.0
.0
.105
.001
.0
.004
.012
.0
.596
.242
.211
.011
.0
.001
.33
.103
.019
.014
.0
.503
.007
.066
.062
.018
.002
.014
--
--
--
--
--
--
.012
.023
.331
.017
.002
.078
.242
.024
.08
.027
.0
.052
.049
.014
.007
.0
.005
.425
.033
.0
.027
.006
.012
.016
.016
.001
.205
--
.0
.0
.001
.159
.077
.062
.047
.036
.037
.005
.011
.001
--
--
--
--
--
.007
.038
.0
.0
.0
.02
.033
.009
.001
.0
.0
.022
.017
.015
.001
.013
.001
.246
.05
.001
.002
.008
.586
--
--
--
--
--
.003
.0
.014
.006
.002
.104
.101
.023
.011
.006
.005
.0
.002
.007
--
--
.072
.004
.002
.002
.0
.212
.021
.004
.002
.003
.24
.002
.015
.018
.001
.02
--
.001
.358
.009
.024
.107
.005
.298
.055
.005
.033
--
--
--
--
--
.048
.044
.015
.029
.003
.017
.038
.003
.002
.104
.023
.011
.003
.001
.001
.0
.014
.119
.117
.183
.322
.076
.012
.001
.001
.0
.05
.007
.003
.002
.001
.075
.072
.004
.029
.001
.012
.02
.032
.001
.017
.002
.243
.032
.061
.164
.164
.068
.054
.003
.014
.011
.001
.002
.0
.0
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
Ak5
G
A
T
A
G
T
C
C
T
C
T
T
G
2
G
T
A
C
G
T
G
A
T
T
T
C
C
A
2
A
A
23
T
T
G
A
T
A
T
A
T
G
T
C
A
T
G
A
T
A
T
G
A
T
A
C
C
T
C
T
A
T
A
G
G
T
T
G
T
G
G
C
G
G
C
T
T
C
C
C
A
C
A
G
G
A
T
T
A
A
C
C
T
C
C
T
2
G
A
T
A
C
A
A
G
G
T
A
C
A
T
T
G
C
C
A
T
C
4
A
T
T
G
T
T
C
A
C
A
G
A
G
C
C
G
T
C
A
A
T
T
T
T
T
T
C
C
A
T
T
G
T
A
T
C
A
C
T
G
A
A
C
C
4
A
A
C
C
A
T
T
C
C
G
G
A
A
T
G
20
G
G
G
A
A
G
3
7
T
T
A
3
7
G
T
T
10
A
A
G
C
T
A
C
C
A
G
G
A
G
C
A
T
A
C
T
G
T
T
C
A
G
A
G
G
T
A
G
A
T
G
A
C
G
G
C
A
A
G
C
C
C
8
A
A
8
A
G
A
G
T
G
T
T
T
A
A
C
G
C
G
G
C
T
T
A
A
G
A
C
T
G
A
G
T
T
T
T
T
A
G
A
A
G
A
G
A
G
T
C
G
C
T
T
G
G
C
T
T
G
C
C
T
A
C
C
C
A
C
C
C
G
2
C
C
C
C
T
C
T
A
2
G
T
C
3
2
C
T
A
G
T
T
C
G
C
A
A
T
C
T
G
T
G
A
T
A
T
G
A
G
C
G
A
A
A
G
2
A
G
T
T
T
G
T
T
G
G
G
G
T
C
C
T
C
T
T
G
A
T
T
A
A
T
G
G
G
C
C
G
A
G
A
C
C
C
G
C
T
T
A
C
T
T
G
T
A
T
A
C
G
33
A
C
C
T
G
A
C
G
  276,351,106
  276,351,488
  276,352,034
  276,352,319
  276,352,428
  276,353,012
  276,353,889
  276,355,144
  276,356,288
  276,356,690
  276,356,854
  276,358,035
  276,358,659
  276,358,777
  276,358,780
  276,359,316
  276,361,770
  276,362,387
  276,365,236
  276,366,627
  276,369,213
  276,371,536
  276,371,546
  276,371,772
  276,372,696
  276,373,548
  276,373,775
  276,373,941
  276,374,098
  276,374,925
  276,375,065
  276,375,069
  276,375,502
  276,375,577
  276,376,277
  276,378,081
  276,378,355
  276,379,042
  276,380,127
  276,380,875
  276,384,510
  276,384,949
  276,385,125
  276,385,498
  276,388,650
  276,400,971
  276,400,988
  276,401,832
  276,405,152
  276,405,528
  276,406,775
  276,407,249
  276,407,373
  276,407,413
  276,408,387
  276,408,444
  276,408,453
  276,408,477
  276,408,491
  276,408,509
  276,408,514
  276,408,709
  276,409,054
  276,410,137
  276,411,346
  276,411,862
  276,413,626
  276,413,990
  276,413,995
  276,414,891
  276,415,074
  276,415,195
  276,416,474
  276,416,865
  276,417,457
  276,417,685
  276,418,921
  276,419,425
  276,420,530
  276,423,713
  276,423,951
  276,424,220
  276,424,799
  276,425,534
  276,425,653
  276,425,676
  276,426,788
  276,427,113
  276,427,363
  276,427,487
  276,427,499
  276,428,080
  276,428,122
  276,428,221
  276,428,472
  276,428,724
  276,428,746
  276,429,409
  276,429,925
  276,430,978
  276,431,088
  276,431,751
  276,432,959
  276,433,091
  276,433,325
  276,434,147
  276,434,181
  276,435,673
  276,437,104
  276,437,692
  276,439,008
  276,439,834
  276,440,444
  276,440,656
  276,440,897
  276,440,912
  276,441,191
  276,442,359
  276,443,186
  276,443,234
  276,444,329
  276,444,436
  276,444,710
  276,444,901
  276,445,801
  276,447,892
  276,448,622
  276,449,222
  276,449,272
  276,449,376
  276,449,515
  276,449,531
  276,449,548
  276,449,560
  276,449,622
  276,449,717
  276,449,759
  276,449,794
  276,449,842
  276,449,980
  276,450,042
  276,450,099
  276,450,203
  276,450,330
  276,450,338
  276,450,360
  276,450,626
  276,450,667
  276,451,181
  276,452,038
  276,452,242
  276,452,424
  276,452,693
  276,452,800
  276,452,857
  276,453,517
  276,453,659
  276,453,730
  276,454,270
  276,454,452
  276,454,863
  276,454,881
  276,455,113
  276,455,114
  276,456,257
  276,456,816
  276,456,904
  276,457,200
  276,457,201
  276,457,365
  276,457,570
  276,457,725
  276,457,739
  276,457,797
  276,458,046
  276,458,198
  276,458,515
  276,459,102
  276,459,563
  276,460,048
  276,460,169
  276,460,345
  276,460,403
  276,460,662
  276,460,832
  276,460,897
  276,461,020
  276,461,624
  276,461,860
  276,461,863
  276,461,937
  276,462,176
  276,462,181
  276,462,227
  276,462,298
  276,462,306
  276,462,320
  276,462,336
  276,462,522
  276,463,054
  276,463,115
  276,463,199
  276,463,216
  276,463,219
  276,463,228
  276,463,231
  276,463,293
  276,463,423
  276,463,432
  276,463,497
  276,463,762
  276,463,773
  276,464,031
  276,464,156
  276,464,194
  276,464,243
  276,464,452
  276,464,539
  276,464,624
  276,464,913
  276,464,923
  276,464,939
  276,465,056
  276,465,065
  276,465,360
  276,465,964
  276,466,261
  276,467,824
  276,467,974
  276,468,330
  276,468,492
  276,468,555
  276,469,317
  276,469,780
  276,470,082
  276,470,105
  276,470,763
  276,470,923
  276,470,932
  276,470,994
  276,471,003
  276,471,526
  276,471,840
  276,471,932
  276,471,959
  276,472,013
  276,472,170
  276,472,324
  276,472,575
  276,472,711
  276,472,882
  276,473,009
  276,473,239
  276,473,339
  276,473,547
  276,473,598
  276,473,669
  276,473,875
  276,474,147
  276,474,288
  276,474,462
  276,474,563
  276,474,801
  276,475,062
  276,475,193
  276,475,304
  276,475,369
  276,475,380
  276,475,536
  276,476,000
  276,476,434
  276,476,461
  276,476,481
  276,476,855
  276,476,870
  276,476,872
  276,476,874
  276,476,876
  276,476,878
  276,476,903
  276,476,922
  276,476,960
  276,476,998
  276,477,094
  276,477,123
  276,477,251
  276,477,336
  276,477,537
  276,477,823
  276,478,015
  276,478,152
  276,478,153
  276,478,165
  276,478,170
  276,478,174
  276,478,265
  276,478,270
  276,478,324
  276,478,529
  276,478,611
  276,478,703
  276,478,759
  276,478,985
  276,479,456
  276,479,521
  276,479,841
  276,479,893
  276,480,408
  276,480,899
  276,481,063
  276,481,427
  276,481,459
  276,481,548
  276,481,631
  276,481,637
  276,483,027
  276,483,117
  276,483,136
  276,483,308
  276,483,310
  276,483,352
  276,483,377
  276,483,393
  276,483,649
  276,483,707
  276,483,903
  276,484,242
  276,484,252
  276,484,350
  276,485,078
  276,485,331
  276,485,845
  276,486,364
  276,486,494
  276,486,630
  276,487,019
  276,487,156
  276,487,577
  276,488,370
  276,488,659
  276,489,134
  276,489,920
  276,491,938
  276,495,726
  276,495,877
  276,496,572
  276,496,837
  276,498,008
  276,498,381
  276,498,510
  276,500,089
  276,503,422
  276,506,329
  276,506,800
  276,507,200
  276,508,082
  276,508,561
  276,510,144
  276,510,318
  276,510,450
  276,510,451
  276,510,489
  276,511,241
  276,511,509
  276,511,818
  276,512,852
  276,512,912
  276,512,989
  276,513,004
  276,513,063
  276,513,232
  276,513,234
  276,513,287
  276,513,308
  276,513,496
  276,513,543
  276,513,552
  276,513,577
  276,513,757
  276,513,949
  276,514,043
  276,514,156
  276,514,433
  276,514,905
  276,515,202
  276,515,352
  276,515,383
  276,515,498
  276,516,209
  276,516,217
  276,516,247
  276,516,301
  276,516,333
  276,516,392
  276,516,636
  276,516,840
  276,517,279
  276,517,512
  276,517,762
  276,518,217
  276,518,744
  276,521,992
  276,523,528
  276,523,556
  276,523,617
  276,523,930
  276,526,033
  276,526,120
  276,526,483
  276,526,496
  276,526,509
  276,526,576
  276,527,502
  276,527,535
  276,528,165
  276,528,916
  276,528,977
  276,529,653
  276,530,243
  276,531,649
G/C
-
-
3
A
G
T
T
-
T
C
C
A
2/-
G/3
A
G
T
A
C
A
C
T/C
C
G
T
T
G
-
G
G
-
C
-
A
G
C
C
T/3
G
T/5
A
C
2
T
C
A
C
C
G
C
A
A/C
-
G
T
T
A
A
2
C
A
G
2
A
C
C
A
C
C
A
T
A
2
T
3
2
C/G
T
T
G
T
G
A
A
G
T/2
A
-
G
G
C/A
C
A
T
A
2/-
G/T
G
C
G
T
G
G
C
A
T/C
A/2
C/-
G
2
T/C
A
T
G
G
-
T
-
2
C
T/C
A
T/-
C
T
C
T
C
A
G
A
T
T
A
C
T
G
G
C
C
C
C
C
G
T
T
T
A
G
G/10
C
G
A
T
-
T
T/C
A
-
C
T
C/2
4/-
G
-
T
C/T
A/G
2
G
G
A
A
A
G
T
C
C
-
19
C
4
G
G
A
-
-
C
A
G
3/-
7/-
G/11
T/C
A
-
T
G
A
G
A
G
T
T
G
A
G/T
G
A
G
C
C
C
T
C
A
T/C
C
T
G
A
G
A
A
A
T
T
A/G
T/C
T
G
C/A
T
A
T
G
A/T
G/T
C/G
C/T
2
-
T
T
-
T
A
-
A
-
A
C
C
C
G
G
T
A
T
A
C
T
C
C
T
G
A
T
A
C
A
G
G/A
T/-
T/-
T/G
T/G
T/G
G
A
C
G
C
G
A
G
T
C
T
G/A
C/T
-
C
A
A
T
C
T/C
C
T
T
G
G
T
T
C/G
G
C/T
C/T
A
A
-
G
T
A
2
C
2
A
A/G
-
A
C
T
3/-
-
T
C
G
A
T/2
C
C/T
A
T
A/G
T
G
T
C
G/A
C
A
G
G
T
G
3
5
3
T
5
G
-
G
A
2/-
G
G/A
T/C
C
C
A
C
C
A
A
A
A
C
G
G
C
C/T
C
C
A
G
T/C
T/C
A/18
-
T/C
A
A
C
A
C/T
G/T
C
G/97
A/C
T
T
C/G
2
T
C
6
-
T
C
C
A
C
G
-
C
2
A
-
T
C/3
C/T
C
C
G
G
G/A