Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 156,733 (bp)   Positions: 453
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.892
.915
.999
.995
.0
.0
.001
.001
.0
.002
.0
.725
.97
.123
.007
.011
.012
.073
--
.034
.002
.159
.004
.004
.0
.003
.01
.004
.001
.45
.023
.003
.005
.0
.001
.003
.002
.072
.034
.001
.003
.002
1.0
1.0
.691
.069
.003
.0
.026
.0
.004
.125
.019
.001
.998
.002
.004
.001
1.0
.035
.013
.003
.011
.0
.003
.05
.021
.0
.001
.007
.067
.004
.001
--
.12
.073
.059
.001
.037
.004
.129
.0
.007
.022
.017
.0
.001
.002
.24
.29
.0
.001
.019
.003
.0
.003
.971
.001
.002
.014
.005
.002
.0
.001
.001
.018
.144
.596
.016
.001
.003
.069
.005
.0
1.0
.017
.0
.014
.015
.0
.034
.001
.0
.0
.068
.189
.004
.0
.0
.001
.001
.083
.002
.0
.0
.004
.804
.046
.012
.719
.0
.0
.02
.0
.008
.001
.0
.001
.221
.0
.001
.001
.001
.708
.009
.003
.547
.001
.0
.001
.0
.0
.018
.003
.302
.001
.001
.006
.005
.001
.077
.156
.002
.002
.204
.25
1.0
.773
.064
.033
.05
.011
.119
.121
.38
1.0
.003
--
.006
.013
.137
.023
.824
.001
.02
.016
.033
.001
.0
.011
.028
.908
.002
.076
.0
.122
.029
.065
.001
.002
.002
.012
.008
.0
.0
.996
.938
.999
.308
.002
.034
.003
.321
.225
.006
.036
.086
.0
.004
.0
.001
.046
.046
.0
.099
.0
.001
.0
.008
.087
.006
.008
.009
.016
.24
.203
.04
.013
.063
.006
.006
.44
.0
.016
.205
.154
.068
.016
.0
.001
.024
.47
.069
.001
--
--
--
--
.001
--
.528
.05
.348
.158
.021
.001
.004
.045
.006
.013
.011
.001
.138
.0
.019
.221
.014
.001
.11
.006
.174
.0
.002
.048
.015
.072
.413
.0
.0
.014
.003
.0
.007
.496
.008
.008
.024
.009
.022
.792
.001
.237
.556
.007
.009
.005
.0
.001
.045
.015
.001
.022
.001
.931
.922
.001
.045
.002
.0
.012
.0
.08
.006
.014
.074
.057
.001
.001
.0
.0
.023
.277
.001
.005
.0
.233
.0
.085
.036
--
--
.004
.002
.012
.019
.003
.004
.0
.0
.015
.007
.107
.188
.114
.344
.059
.059
.04
.012
.026
.051
.003
.037
.072
.011
.028
.13
.005
.01
.0
.0
.007
.008
.047
.001
.004
.0
.059
.047
.013
.006
.007
.007
.005
.009
.003
.039
.007
.012
.01
.001
.0
.011
.0
.001
.495
.052
.0
.0
.0
.062
.383
.055
.051
.539
.022
.211
.008
--
--
--
--
.0
.053
.05
.162
.005
.006
.002
.001
.001
.0
.002
.0
.002
.861
--
--
--
.607
.479
.151
.013
.003
.0
.512
.001
.0
.0
.0
.001
.003
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
Adgrg6
G
C
C
A
A
G
A
C
G
A
C
T
G
5
A
A
G
A
C
3
C
20
C
A
C
T
G
A
A
A
2
T
G
A
C
C
8
T
T
G
T
G
G
C
A
G
T
C
2
C
C
T
G
C
C
G
T
A
G
T
A
G
C
G
T
C
A
C
A
A
T
C
G
C
A
T
C
A
T
G
T
T
C
A
C
G
A
T
G
T
A
C
T
C
C
G
C
C
G
3
C
G
C
A
G
T
A
C
C
G
C
G
A
A
G
G
A
2
A
C
T
G
T
C
G
G
C
T
T
T
T
A
A
C
A
A
A
C
6
A
A
T
T
C
A
A
C
T
C
A
G
C
G
G
C
T
G
G
G
A
G
A
C
C
G
G
G
C
C
C
C
T
C
A
A
T
G
T
C
C
A
G
A
A
C
A
T
A
T
C
T
T
A
2
A
C
A
C
C
C
C
C
G
A
A
A
118
A
A
T
3
T
T
A
G
A
G
T
C
A
G
G
T
T
6
T
T
G
A
10
8
C
A
G
A
C
T
G
T
T
A
G
G
A
G
T
C
3
C
C
G
C
T
C
A
T
C
A
A
A
T
A
G
C
T
A
C
G
G
T
A
A
T
C
A
T
G
C
C
A
A
A
G
T
T
C
A
C
8
6
4
C
A
C
G
A
4
G
G
G
T
G
T
G
G
G
G
C
G
A
C
T
G
A
G
G
C
T
T
C
C
T
T
T
A
T
G
C
C
A
C
C
C
A
T
G
C
C
A
G
C
G
A
G
A
G
G
G
G
C
C
A
A
A
G
A
A
A
T
A
T
A
C
14
C
T
A
G
A
A
C
A
T
A
G
20
A
A
T
A
T
C
C
C
T
C
C
A
A
A
C
T
C
C
C
4
G
G
C
T
A
C
G
G
C
T
2
T
T
A
A
C
T
T
A
2
2
G
A
T
C
C
A
C
A
G
C
A
C
G
T
C
20
18
10
T
G
G
A
T
A
A
A
C
G
T
G
A
G
A
C
G
C
  10,212,546
  10,212,547
  10,212,550
  10,212,565
  10,212,950
  10,213,545
  10,214,252
  10,214,671
  10,215,826
  10,215,999
  10,216,552
  10,217,369
  10,217,495
  10,218,170
  10,218,367
  10,218,592
  10,219,265
  10,220,689
  10,221,328
  10,222,227
  10,222,479
  10,223,539
  10,223,828
  10,223,862
  10,223,869
  10,224,351
  10,224,415
  10,224,877
  10,225,368
  10,225,492
  10,225,641
  10,225,754
  10,226,185
  10,226,228
  10,226,236
  10,226,587
  10,226,608
  10,226,960
  10,226,963
  10,227,517
  10,228,123
  10,229,027
  10,229,182
  10,229,261
  10,229,618
  10,229,644
  10,229,677
  10,229,781
  10,229,847
  10,229,893
  10,229,956
  10,230,411
  10,230,964
  10,231,182
  10,231,357
  10,231,561
  10,231,565
  10,231,638
  10,232,799
  10,233,335
  10,233,454
  10,233,552
  10,233,700
  10,233,710
  10,234,367
  10,234,799
  10,235,160
  10,235,223
  10,235,568
  10,235,763
  10,235,943
  10,236,030
  10,236,344
  10,236,698
  10,237,464
  10,237,851
  10,237,852
  10,238,788
  10,239,473
  10,239,483
  10,239,511
  10,239,959
  10,240,065
  10,240,224
  10,241,275
  10,241,286
  10,241,650
  10,241,748
  10,242,432
  10,242,600
  10,243,277
  10,243,533
  10,243,658
  10,243,749
  10,243,944
  10,244,016
  10,244,601
  10,244,822
  10,244,890
  10,244,970
  10,245,553
  10,246,179
  10,246,241
  10,246,572
  10,247,255
  10,248,304
  10,248,497
  10,248,525
  10,249,160
  10,249,187
  10,249,308
  10,249,452
  10,249,475
  10,250,220
  10,250,270
  10,250,695
  10,251,315
  10,251,347
  10,251,574
  10,252,328
  10,253,151
  10,253,390
  10,253,421
  10,253,805
  10,254,053
  10,254,188
  10,254,372
  10,254,376
  10,254,400
  10,254,410
  10,254,703
  10,254,706
  10,255,174
  10,255,216
  10,255,217
  10,255,452
  10,256,057
  10,256,439
  10,256,492
  10,256,754
  10,256,909
  10,256,953
  10,256,974
  10,257,206
  10,257,396
  10,257,450
  10,257,455
  10,257,482
  10,257,820
  10,258,014
  10,258,019
  10,258,244
  10,258,250
  10,258,292
  10,258,352
  10,258,451
  10,258,584
  10,258,737
  10,259,059
  10,259,211
  10,259,263
  10,259,337
  10,259,519
  10,259,530
  10,259,579
  10,259,679
  10,259,706
  10,259,823
  10,259,825
  10,259,862
  10,259,891
  10,260,007
  10,260,548
  10,260,692
  10,260,831
  10,260,911
  10,261,161
  10,261,209
  10,261,477
  10,261,546
  10,261,651
  10,261,719
  10,262,668
  10,262,669
  10,262,714
  10,262,800
  10,263,255
  10,263,329
  10,263,940
  10,263,976
  10,264,598
  10,265,207
  10,265,277
  10,265,471
  10,265,591
  10,265,592
  10,265,838
  10,266,097
  10,266,160
  10,266,234
  10,266,309
  10,267,026
  10,267,262
  10,267,953
  10,268,607
  10,269,454
  10,269,668
  10,269,839
  10,270,026
  10,270,208
  10,270,956
  10,271,157
  10,272,322
  10,272,390
  10,272,624
  10,273,021
  10,273,099
  10,273,221
  10,273,288
  10,273,791
  10,273,847
  10,273,986
  10,274,238
  10,274,253
  10,274,298
  10,274,487
  10,275,295
  10,275,331
  10,275,351
  10,275,360
  10,275,362
  10,275,411
  10,275,412
  10,275,528
  10,275,605
  10,275,625
  10,275,637
  10,275,638
  10,275,769
  10,276,191
  10,276,646
  10,279,232
  10,279,233
  10,279,258
  10,279,908
  10,280,020
  10,280,036
  10,280,410
  10,280,572
  10,280,794
  10,280,819
  10,280,889
  10,280,968
  10,280,999
  10,281,266
  10,281,294
  10,281,377
  10,281,605
  10,281,752
  10,281,839
  10,281,927
  10,282,203
  10,282,333
  10,282,908
  10,283,012
  10,283,046
  10,283,284
  10,283,290
  10,283,517
  10,284,073
  10,284,143
  10,284,290
  10,284,391
  10,284,506
  10,284,595
  10,284,669
  10,284,739
  10,284,828
  10,285,195
  10,285,633
  10,285,648
  10,285,657
  10,285,809
  10,285,990
  10,286,079
  10,286,097
  10,286,193
  10,286,206
  10,287,491
  10,287,534
  10,287,545
  10,288,079
  10,288,129
  10,288,560
  10,288,683
  10,289,085
  10,289,521
  10,289,773
  10,289,778
  10,289,876
  10,289,994
  10,290,125
  10,302,848
  10,303,299
  10,303,581
  10,303,636
  10,303,639
  10,304,025
  10,304,054
  10,305,934
  10,306,364
  10,306,775
  10,307,335
  10,307,869
  10,308,005
  10,308,618
  10,308,726
  10,309,082
  10,309,281
  10,309,350
  10,309,412
  10,309,428
  10,309,433
  10,309,966
  10,309,973
  10,310,544
  10,310,673
  10,310,736
  10,310,880
  10,310,949
  10,310,998
  10,311,073
  10,311,348
  10,311,539
  10,311,573
  10,311,654
  10,311,904
  10,312,081
  10,312,717
  10,312,740
  10,312,858
  10,313,180
  10,313,257
  10,313,514
  10,313,546
  10,313,778
  10,314,151
  10,314,255
  10,314,391
  10,315,846
  10,317,593
  10,319,707
  10,319,855
  10,320,127
  10,320,567
  10,320,603
  10,320,655
  10,320,897
  10,321,019
  10,321,110
  10,321,211
  10,321,318
  10,321,343
  10,321,477
  10,321,692
  10,321,721
  10,321,728
  10,321,750
  10,321,808
  10,321,857
  10,322,012
  10,322,100
  10,322,266
  10,322,542
  10,322,552
  10,322,795
  10,322,864
  10,322,998
  10,323,049
  10,323,116
  10,323,228
  10,323,462
  10,324,025
  10,324,238
  10,324,472
  10,325,589
  10,325,838
  10,326,015
  10,327,306
  10,327,311
  10,330,510
  10,330,515
  10,330,517
  10,330,519
  10,330,563
  10,330,925
  10,331,033
  10,331,159
  10,331,192
  10,331,193
  10,331,340
  10,331,408
  10,331,567
  10,331,607
  10,331,830
  10,331,967
  10,332,050
  10,332,126
  10,332,138
  10,332,490
  10,332,676
  10,332,702
  10,332,911
  10,333,015
  10,333,723
  10,346,729
  10,348,302
  10,349,733
  10,349,809
  10,350,052
  10,350,110
  10,350,124
  10,350,790
  10,352,250
  10,352,251
  10,352,461
  10,352,546
  10,353,029
  10,353,106
  10,353,928
  10,355,132
  10,355,327
  10,357,246
  10,357,248
  10,357,256
  10,360,085
  10,360,377
  10,360,387
  10,360,429
  10,361,814
  10,361,836
  10,361,838
  10,364,129
  10,364,146
  10,364,525
  10,364,935
  10,365,473
  10,365,475
  10,365,533
  10,366,713
  10,367,124
  10,368,554
  10,368,902
A
T
3
2
C
5
G
A
T
C
A
A
A
-
C
G
T
5
T
-
T
-
G
-
T
G
T
T
C
G
-
C
A
T
G
T
-
C
C
A
C
A
A
T
-
G/67
C
T
-
T
T
G
2
T
T
A
C
G
A
C
G
A
T
T
G
G
G
T
-
G
2
T
A
T
C
C
T
2
C
A
C
C
T
C
A
T
T
C
A
2
G
T
G
T
T
A
T
A
A
-
G
T
T
G
A
3
C
2
T
A
T
T
2
A/9
9
C
G
-
G
G
13
C
C
T
T
A
G
A
C
-
C
G
C
T
G
G
G
T
-
G
G
C
C
T
G
G
A
G
A
G
3
T
A
A
G
C
C
3
A
G
A
G
G
G
A
A
C
T
T
A
5
2
T
G
G
C
A
C
A
G
G
A
C
G
G
G
C
T
C
T
-
C
T
2/-
4
A
-
T
T
G
2
2
A
G
G
G
-
G
T
3/4
-
C
G
G
A
G
A
C
G
2
A
A
C
C
-
C
C
A
G
10/-
8/-
T
G
A
G
T
C
A
C
A
T
A
A
G
A
C
T
-
T
T
T
T
C
3
C
C
T
T
G
G
3
G
A
T
G
G
T
A
-
C
C
3
C
2
-
C
A
T
T
T
G
G
A
A
A
T
G
T
-
6/-
4/-
T
G
39
T
G
-
T
T
A
A
3
C
A
A
A
-
T
A
G
T
C
A
G
A
A
A
C
C
2
G
C
C
C
T
G
C
T
T
T
T
T
T
C
C
A
T
C/3
T
A
T
A
C
A
C
A
A
-
A
C/-
C/-
C
G
2
A
G
C
T
G
G
2
T
G
-
A
A
G
T
-
G
A
T
A
-
C
-
T
G
C
G
G
31
T
T
C
4
T
G
G
G
T
T/9
C/7
C/5
T
-
A
A
T
G
T
T
A
A
T
C
-
-
11
T
T
T
C
C
G
-
-
3
T
13
T
2
T
G
T
A
G
T
G
-
-
T
20/-
18/-
10/-
15
G/3
G/3
17
C
2
C
G
T
A
13
G/3
A/5
G/2
C
C/5
C
A