Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 183,223 (bp)   Positions: 599
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.005
.001
.047
.003
.087
.098
.986
.002
.018
.013
.001
--
--
--
--
.003
.004
.029
.116
--
--
--
--
.002
.002
.146
.011
.016
.015
.356
--
.0
.132
.004
.005
.025
.019
.004
.004
.003
.017
.037
.001
.042
.0
.001
.0
.095
.003
.0
.104
.093
.03
.004
.019
.031
.005
.197
.004
.519
.0
.001
.007
.889
.908
.941
--
--
--
--
--
--
--
.159
.34
.126
.056
.007
.005
.018
.002
.002
.01
.165
.192
.041
.0
.0
--
.009
.004
.033
.015
.004
.009
.004
.183
.0
.014
.0
.0
.035
.0
.0
.007
.008
.005
.002
.002
.001
.001
.005
.004
.069
.01
.104
.003
.019
.032
.015
.001
.001
.005
.048
.019
.006
.005
.0
.162
.033
.037
.089
.0
.15
--
.001
.009
.154
.007
.057
.049
.01
.027
.128
.001
.103
.159
.114
--
--
--
.391
.215
--
--
.019
.022
.003
.0
.021
.026
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.001
.005
.002
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.002
.001
.002
.0
.001
.001
.195
.002
.002
.002
.001
.068
.0
.0
.406
.0
.0
.001
--
.039
.011
.013
.005
.006
.014
.014
.004
.008
.109
.414
.295
.001
.128
.424
.575
--
--
--
--
.0
.007
.001
.411
.165
.011
.02
.019
.011
.005
.029
.079
.189
.017
.079
.0
.299
.034
.001
.008
.001
.001
.028
--
--
--
.087
.912
.283
.001
.232
.158
.044
--
.001
.0
.001
.002
.001
.0
.0
.001
.006
.0
.0
.0
.0
.007
.066
.006
.005
.004
.009
.018
.019
.099
.001
.037
.388
.069
.015
.001
.0
.016
.0
.0
.001
.185
.006
.016
.001
.006
.001
.0
.0
.019
.003
.0
.005
.002
.002
.005
.091
.997
.005
.0
.0
.0
.0
.006
.003
.157
.097
.075
--
.07
.034
.033
.017
.013
.038
.003
.002
.809
.354
1.0
.585
.006
.07
.001
.002
.004
.001
.534
.494
.082
.018
.088
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.003
.003
.039
.023
.069
.01
.005
.039
.024
.026
.023
.324
.0
.004
.001
.0
.0
.013
.001
.021
.003
.002
--
--
--
.073
.07
.002
.013
.007
.002
.008
.001
.007
.012
.006
.003
.337
.363
.359
.111
.087
.035
.025
.0
.006
.007
.008
.013
.216
.011
.305
.003
.002
.033
.047
.047
.01
.009
.011
.075
.249
.152
.001
.006
.017
.007
.004
.003
.01
.016
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.08
.012
.093
.287
.323
.097
.034
.007
.0
.033
.001
.004
--
.018
.013
.043
.019
.001
.943
.013
.023
.017
.016
.015
.006
.01
.0
.003
.025
.023
.08
.816
.002
.004
.009
.001
.003
.215
.0
.281
.0
.001
.031
.005
.006
.001
--
.014
.328
.055
.013
.017
.02
.563
.702
.0
.037
.024
.039
.009
.162
.001
.009
.07
.294
.89
1.0
1.0
.521
.121
--
.027
.002
.001
.29
.04
--
.001
--
.038
.084
.019
.166
.061
.054
.056
.009
.025
.162
.093
.108
.144
.029
.275
.134
.083
.046
.197
.222
.085
.001
.001
.0
.176
.004
--
.049
.0
.003
.002
.008
--
--
.572
.002
.027
.001
.013
.025
.0
.852
.022
.0
.15
.068
.94
.994
.195
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
Adamts19
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
A
C
A
8
C
C
T
T
G
T
T
T
G
T
A
A
T
A
T
C
G
3
G
A
T
A
23
C
C
T
T
T
T
T
T
T
A
T
A
G
G
T
16
G
C
A
T
G
C
C
G
C
G
T
C
G
3
A
T
A
T
T
T
C
A
G
C
A
C
C
T
G
T
C
C
G
T
C
C
G
G
A
G
3
A
C
C
G
G
A
C
G
T
A
T
A
T
T
G
G
C
C
G
G
T
A
T
C
T
C
A
G
2
13
C
C
C
G
A
4
A
A
G
C
G
C
G
C
G
T
C
A
G
6
C
A
T
G
T
A
G
A
T
C
T
C
T
10
C
C
G
T
G
C
T
T
T
A
T
T
C
2
T
A
G
A
T
C
G
G
T
T
A
T
T
C
A
C
C
G
G
T
T
A
T
G
T
T
T
C
T
C
A
A
T
A
G
A
G
G
A
A
C
A
T
C
G
A
C
G
G
G
G
A
C
A
10
8
G
2
A
T
A
T
A
A
C
G
A
2
A
A
T
A
G
G
A
G
G
C
G
T
G
T
T
T
10
C
A
G
T
T
A
T
C
G
A
A
T
A
T
G
G
C
T
A
C
A
G
A
T
G
T
A
A
G
T
T
C
T
A
C
T
T
C
G
T
T
A
C
T
4
C
G
A
C
A
C
G
T
T
A
T
C
A
T
C
T
C
A
G
A
4
G
A
T
C
C
G
G
A
T
G
G
C
A
T
T
T
C
T
T
A
T
C
A
A
A
T
6
T
T
C
C
G
T
A
C
T
G
G
A
T
A
G
G
T
C
C
A
C
G
A
G
G
A
C
A
C
A
A
A
A
C
2
T
T
G
G
G
G
A
G
A
T
T
C
G
T
G
A
C
T
T
T
T
A
G
G
C
A
T
A
G
G
G
A
G
T
G
A
T
A
T
T
A
T
C
T
G
G
T
T
A
T
C
T
G
G
G
G
C
C
A
4
T
T
G
G
C
11
C
T
G
T
G
7
T
G
A
T
A
T
G
A
A
T
C
G
G
A
A
G
A
A
T
A
C
G
A
A
A
C
A
T
A
G
T
A
G
C
T
T
A
G
A
C
A
G
A
T
T
2
A
A
G
G
C
G
A
C
G
C
G
G
G
C
A
G
2
C
G
G
A
A
T
T
C
A
A
C
6
5
C
C
A
T
G
20
A
T
A
G
A
G
C
C
T
G
A
C
A
G
C
2
10
4
T
T
A
T
T
C
C
G
C
T
A
G
G
T
C
T
G
T
C
T
10
8
A
A
C
A
2
T
6
A
T
8
T
C
T
G
A
A
T
C
C
A
C
C
A
G
T
A
C
T
A
  53,154,648
  53,154,720
  53,154,790
  53,155,801
  53,157,464
  53,157,526
  53,157,779
  53,158,674
  53,159,281
  53,159,666
  53,160,316
  53,160,502
  53,160,644
  53,160,835
  53,161,262
  53,161,816
  53,162,046
  53,162,426
  53,162,446
  53,162,516
  53,162,597
  53,162,720
  53,162,756
  53,162,974
  53,163,123
  53,163,171
  53,163,968
  53,163,970
  53,164,515
  53,164,718
  53,165,176
  53,165,395
  53,166,142
  53,166,557
  53,166,766
  53,167,793
  53,168,043
  53,168,182
  53,169,127
  53,169,219
  53,169,389
  53,169,708
  53,170,164
  53,170,481
  53,170,568
  53,171,048
  53,171,382
  53,171,480
  53,172,425
  53,172,545
  53,173,034
  53,173,534
  53,173,730
  53,173,766
  53,174,076
  53,174,652
  53,174,971
  53,176,186
  53,176,213
  53,177,263
  53,180,048
  53,181,917
  53,182,071
  53,182,875
  53,183,093
  53,183,130
  53,183,231
  53,183,254
  53,183,267
  53,183,288
  53,183,298
  53,183,412
  53,183,532
  53,184,958
  53,185,391
  53,186,076
  53,189,477
  53,190,447
  53,192,505
  53,192,571
  53,193,428
  53,193,429
  53,194,783
  53,194,984
  53,194,988
  53,195,011
  53,195,983
  53,198,864
  53,199,305
  53,200,221
  53,201,372
  53,201,744
  53,204,417
  53,205,321
  53,206,108
  53,206,733
  53,206,778
  53,206,883
  53,206,919
  53,208,431
  53,208,442
  53,209,011
  53,209,105
  53,209,110
  53,209,169
  53,209,170
  53,209,196
  53,209,204
  53,209,535
  53,209,754
  53,209,830
  53,209,854
  53,209,899
  53,210,154
  53,210,172
  53,210,292
  53,210,721
  53,210,820
  53,210,931
  53,210,992
  53,211,374
  53,211,377
  53,212,038
  53,212,183
  53,212,858
  53,212,939
  53,213,557
  53,214,081
  53,215,015
  53,215,187
  53,215,560
  53,215,763
  53,215,791
  53,216,078
  53,216,811
  53,216,842
  53,217,336
  53,217,823
  53,218,077
  53,218,414
  53,218,872
  53,218,904
  53,218,907
  53,218,960
  53,220,104
  53,220,120
  53,220,198
  53,220,373
  53,221,006
  53,221,534
  53,221,603
  53,222,039
  53,222,274
  53,222,729
  53,222,738
  53,223,353
  53,223,514
  53,223,663
  53,224,321
  53,225,360
  53,226,033
  53,228,305
  53,228,885
  53,229,311
  53,229,712
  53,230,076
  53,230,308
  53,230,916
  53,231,814
  53,232,349
  53,232,940
  53,233,012
  53,233,171
  53,233,237
  53,233,271
  53,233,282
  53,233,365
  53,233,507
  53,233,562
  53,233,679
  53,233,744
  53,234,047
  53,234,072
  53,234,226
  53,235,262
  53,235,952
  53,236,564
  53,236,599
  53,237,077
  53,237,339
  53,237,402
  53,237,404
  53,237,941
  53,237,953
  53,240,680
  53,240,681
  53,240,718
  53,240,773
  53,241,535
  53,241,580
  53,241,806
  53,242,002
  53,242,041
  53,242,213
  53,242,242
  53,242,287
  53,242,332
  53,242,341
  53,242,389
  53,242,396
  53,242,464
  53,242,493
  53,243,723
  53,244,279
  53,245,094
  53,245,401
  53,245,427
  53,245,660
  53,245,662
  53,245,726
  53,245,729
  53,246,987
  53,247,982
  53,248,036
  53,248,192
  53,248,205
  53,248,336
  53,248,489
  53,248,491
  53,248,494
  53,248,496
  53,248,503
  53,248,718
  53,248,755
  53,248,794
  53,249,482
  53,249,696
  53,251,003
  53,252,852
  53,253,066
  53,253,157
  53,253,364
  53,253,548
  53,253,720
  53,254,143
  53,254,670
  53,254,807
  53,256,236
  53,256,573
  53,257,265
  53,257,488
  53,257,537
  53,257,926
  53,258,176
  53,258,428
  53,258,632
  53,258,841
  53,259,169
  53,259,345
  53,259,531
  53,259,575
  53,259,713
  53,260,069
  53,260,108
  53,260,132
  53,260,185
  53,260,260
  53,260,291
  53,260,384
  53,260,526
  53,260,586
  53,261,219
  53,261,421
  53,261,514
  53,262,147
  53,262,148
  53,262,249
  53,262,394
  53,262,402
  53,262,499
  53,262,714
  53,262,869
  53,263,070
  53,263,177
  53,263,268
  53,263,349
  53,263,491
  53,263,567
  53,263,722
  53,263,852
  53,263,954
  53,264,069
  53,264,136
  53,264,335
  53,264,747
  53,264,848
  53,264,886
  53,265,281
  53,265,290
  53,265,307
  53,265,403
  53,265,560
  53,265,609
  53,265,637
  53,265,874
  53,266,013
  53,266,089
  53,266,090
  53,266,104
  53,266,140
  53,266,221
  53,266,222
  53,266,259
  53,266,316
  53,266,458
  53,267,036
  53,267,540
  53,267,610
  53,267,687
  53,267,731
  53,267,928
  53,267,950
  53,268,017
  53,268,109
  53,268,331
  53,268,415
  53,268,650
  53,269,034
  53,269,164
  53,269,167
  53,269,523
  53,269,944
  53,270,365
  53,270,388
  53,270,497
  53,270,498
  53,270,621
  53,270,746
  53,270,756
  53,270,835
  53,270,838
  53,270,875
  53,270,876
  53,270,886
  53,270,893
  53,270,903
  53,271,044
  53,271,070
  53,271,071
  53,271,076
  53,271,406
  53,271,429
  53,271,480
  53,271,520
  53,271,547
  53,271,554
  53,271,727
  53,271,795
  53,271,970
  53,271,980
  53,272,337
  53,272,374
  53,272,383
  53,272,462
  53,272,547
  53,272,567
  53,272,658
  53,272,700
  53,272,771
  53,272,787
  53,272,841
  53,272,924
  53,273,112
  53,273,138
  53,273,151
  53,273,212
  53,273,258
  53,273,260
  53,273,299
  53,273,329
  53,273,383
  53,273,471
  53,273,546
  53,273,682
  53,273,689
  53,273,698
  53,273,794
  53,273,847
  53,273,903
  53,273,911
  53,273,912
  53,273,948
  53,273,953
  53,274,103
  53,274,109
  53,274,131
  53,274,144
  53,274,160
  53,274,253
  53,274,404
  53,274,466
  53,274,513
  53,274,643
  53,274,692
  53,274,700
  53,274,733
  53,274,930
  53,274,932
  53,274,992
  53,274,996
  53,275,001
  53,275,106
  53,275,145
  53,275,176
  53,275,233
  53,275,252
  53,275,363
  53,275,367
  53,275,375
  53,275,376
  53,275,383
  53,275,390
  53,275,478
  53,275,516
  53,275,579
  53,275,597
  53,275,601
  53,275,623
  53,275,665
  53,275,672
  53,275,727
  53,275,800
  53,275,807
  53,275,842
  53,275,843
  53,275,858
  53,275,894
  53,275,923
  53,276,045
  53,276,291
  53,276,364
  53,276,368
  53,276,428
  53,276,515
  53,276,516
  53,276,527
  53,276,596
  53,276,689
  53,276,936
  53,276,990
  53,277,205
  53,277,307
  53,277,308
  53,277,389
  53,277,433
  53,277,625
  53,277,657
  53,277,893
  53,278,129
  53,278,276
  53,278,301
  53,278,321
  53,278,457
  53,278,724
  53,278,729
  53,278,841
  53,278,842
  53,278,892
  53,278,926
  53,278,936
  53,279,954
  53,280,073
  53,280,188
  53,280,348
  53,280,697
  53,280,778
  53,281,981
  53,283,564
  53,283,913
  53,284,075
  53,284,381
  53,284,805
  53,284,971
  53,285,363
  53,285,513
  53,285,680
  53,285,687
  53,285,805
  53,285,883
  53,287,311
  53,288,285
  53,288,437
  53,289,199
  53,289,200
  53,289,201
  53,289,284
  53,289,634
  53,289,852
  53,291,593
  53,292,010
  53,292,256
  53,292,564
  53,293,910
  53,294,058
  53,294,140
  53,294,366
  53,295,251
  53,295,263
  53,295,791
  53,296,020
  53,296,414
  53,296,612
  53,296,882
  53,297,409
  53,297,830
  53,298,339
  53,298,937
  53,299,405
  53,299,611
  53,299,671
  53,299,919
  53,299,933
  53,299,963
  53,299,964
  53,300,245
  53,300,246
  53,300,411
  53,301,006
  53,301,008
  53,301,133
  53,301,390
  53,301,580
  53,302,804
  53,302,848
  53,303,046
  53,303,086
  53,303,292
  53,303,386
  53,303,387
  53,303,768
  53,303,849
  53,303,911
  53,304,384
  53,304,433
  53,304,837
  53,307,098
  53,307,450
  53,308,706
  53,310,423
  53,312,495
  53,313,200
  53,313,442
  53,313,729
  53,313,818
  53,314,047
  53,314,427
  53,314,428
  53,314,997
  53,315,402
  53,315,627
  53,315,647
  53,315,652
  53,315,731
  53,315,853
  53,316,088
  53,316,163
  53,316,175
  53,316,348
  53,316,376
  53,316,378
  53,316,464
  53,316,503
  53,316,654
  53,316,719
  53,319,281
  53,319,828
  53,320,360
  53,320,672
  53,321,348
  53,322,704
  53,324,505
  53,324,596
  53,324,918
  53,327,811
  53,328,376
  53,328,542
  53,329,358
  53,329,923
  53,330,182
  53,330,535
  53,330,878
  53,332,481
  53,332,934
  53,333,349
  53,334,541
  53,335,776
  53,336,692
  53,337,547
  53,337,696
C
T
T
G
-
5
T
C
C
A
G
C
C
A
C
G
G
-
T
C
T
A
-
A
2
C
-
23/-
T
T
A
C
-
C
C
G
C
G
C
G
C
A
A
-
13
A
C
C
T
5/3
T
14
T
A
C
-
A
-
C
11
-
C
C
T/7
T
2
G/39
31
31
7
63
2
7
-
2
G
6/5
C
23
T
2
6
G
G/-
3/-
G
3
G
T
T
-
A
A
C
-
C
G
C
C
2
A
T
T
A
A
G
T
C
A
C
T
G
A
-
-
T
T
T
-
C
4/-
A/C
G
T
G
A
T
T
T
2
C
T
3
A
-
T
G
G
T
C
G
A
G
C
T
C
T
C
-
T
2
27
2
A
T
G
7
G
2
C
G
2
-
C
G
T
G
C
4
A
T
G
C
G
G
A
T
G
T
T
A
A
-
C
G
-
A
G
C
C
T
C
T
5
T
A
C
A
G
T
2
C
G
G
G
C
G
T
G
T
T
T
A
GT/3
T
T
-
10/-
8/-
G/-
2/-
G
-
C
C
T
G
3
T
G
-
C
G
C
G
A
A
T
A
T
T
C
C
A
G
C
C
-
T
G
A
A
C
G
C
G
A
G
G
C
G
-
A
A
T
-
-
CA/4
A/2
A
G
C
A
-
T
T
A
A
C
G
A
G
T
A
TA/3
G
A
C
C
G
A
C
-
T
C
-
T
C
G
-
C
C
T
G
T
G
C
T
C
A
C
A
G
-
A
-
-
T
A
A
A
G
C
T
A
T
T
C
-
A
A
C
C
T
C
T
G
3
3
-
-
C
C
T
T
C
-
2
A
A
A
A
G
G
G
A
A
2
T
T
G
A
3
G
A
A
T
T
G
G
2
G
3
3
5
-
-
-
A
A
C
C
G
9
C
G
C
T
A
C
A
3
A
G
C
A
A
C
A
A
A
T
A
G
A
A
A
G
A
C
6
T
C
T
C
-
C
2
A
G
A
A
2
9
G
G
G
C
A
A
A
A
T
T
G
-
C
C
C
A
-
-
T
C
A
C
A
-
C
A
G
A
G
C
A
G
G
2
T
2
A
G
3
A
T
T
C
C
T
C
G
G
G
T
G
C
G
C
2
G
A
G
2
C
G
T
T
19
C
A
G
C
T/2
2/-
-
C
A
A
T
A
G
T
G/3
A
A
2
A
G
C
C
-
T
A
A
G
G
G
-
2
G
G
A
-
5/-
T
T
G
12
C
-
G
G
G
C
G
2
T
-
5
A
T
T
G
9
T
-
-
-
A
37
G
G
C
5
T
C
T
A
-
A
A
C
T
C
A
G
T
C
10/-
-
-
C
T
G
-
5/21
-
G
G
8/-
4
T
2
C
T
-
G
T
T
G
T
T
3
A
C
2
T
2
G