Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 62,045 (bp)   Positions: 495
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.002
.0
.0
.0
.019
.017
.01
.001
.019
.133
.003
.025
.027
.009
.0
.0
.004
.002
.0
.0
.01
.001
.001
.0
.0
.016
.005
.008
.463
.008
.015
.002
.021
.001
.01
.273
.093
.991
.989
.012
.089
.036
.008
.023
.002
.004
.002
.004
.003
.222
.006
.0
.427
.001
.0
.0
.001
.007
.004
.002
.01
.004
.024
.101
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.019
.005
.016
.055
--
--
.0
.0
.005
.001
.002
.001
.245
.538
.002
.015
.001
.01
.01
.012
.012
.011
.033
.018
--
--
.114
.083
.016
.0
.168
.653
.039
.001
.006
.001
.004
.003
.001
.0
.0
.002
.0
.466
.006
.04
.287
--
--
--
.032
.003
.38
.007
.003
.008
.03
.032
.004
.079
.009
.0
.001
.015
.001
.007
.189
.008
.005
.01
.016
.093
.075
--
--
--
--
.013
.034
.109
.0
.0
.002
.024
.798
.045
.371
.015
.015
.054
.001
.003
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
--
--
--
--
.001
.372
.036
.024
--
.007
.079
.004
.013
--
--
--
.027
.0
.008
.001
.004
.003
.042
.052
.03
.012
.213
.004
.001
.264
.275
.098
.237
.148
.123
.019
.039
.096
.14
.008
--
--
--
.004
.003
.002
.008
.001
.002
.113
.046
.696
.121
.004
.001
.045
.002
--
.032
.034
.002
.003
.002
.101
.024
.0
--
.153
.019
.632
.019
.014
.06
.002
.144
.089
.064
--
--
--
--
.117
.051
.081
.023
.034
.002
.003
.003
.08
.233
--
.002
--
--
--
.036
.01
.755
.005
.002
--
--
.0
.001
.015
.001
.002
.001
.0
.013
.001
.684
.001
.947
.015
.004
.053
.006
.021
.163
.013
--
--
.0
.007
.016
.004
.01
.011
.465
.374
.203
.173
.142
.097
--
--
--
.009
.006
.007
.068
.018
.002
.003
.003
.0
.0
.0
.003
.012
.806
.0
.22
.001
.007
.0
.999
1.0
.002
.001
.004
.002
.156
.021
.002
.0
.015
.008
.0
.224
.0
.005
.031
.001
.006
.026
.001
.011
.007
.219
.008
.008
.001
.003
.007
.009
.004
.002
.001
.001
.112
.004
.011
.036
.039
--
--
--
.0
.0
.0
.001
.005
.026
.009
.001
.001
.003
.61
.0
.032
.142
.266
.001
.081
.091
.066
.003
.059
.026
.0
.02
.083
.0
.004
.323
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.071
.004
.003
.002
.89
.001
.001
.049
.0
.003
.025
.004
.02
.122
.004
.008
.026
.009
.006
.003
.007
.048
.012
.014
.005
.095
.207
.0
.005
.2
.0
.002
.0
.025
.001
.008
.065
.001
.002
.005
.003
.109
1.0
.982
.56
.004
.021
.004
.026
.134
.202
.038
.008
--
.005
.055
.058
.064
.169
.216
.995
.004
.011
.986
.009
.004
.006
.998
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Adam22
Adam22
Adam22
Adam22
Adam22
Adam22
Adam22
Adam22
Adam22
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
T
T
T
T
C
A
G
A
T
A
T
C
C
A
A
A
G
G
G
A
C
G
G
G
C
A
C
A
A
G
T
T
A
2
G
C
C
T
G
A
A
A
3
A
G
A
C
C
C
C
C
G
A
C
T
A
G
T
C
T
A
T
G
T
16
2
6
6
2
6
2
C
12
C
T
2
G
G
G
G
T
T
G
T
G
T
T
G
C
C
G
T
A
C
T
C
C
G
C
T
C
G
G
T
C
T
T
A
A
C
T
C
T
A
C
A
C
A
G
2
G
C
T
G
T
C
G
G
T
G
T
A
C
A
C
T
T
A
C
A
C
T
A
C
A
T
T
C
A
T
A
G
3
C
C
C
T
A
G
G
A
4
T
A
G
3
A
A
A
T
A
C
A
C
C
C
A
C
A
T
T
T
C
A
T
28
C
8
G
T
T
T
T
G
T
G
A
G
C
A
G
2
2
4
C
A
A
A
A
C
T
T
G
A
T
G
4
A
2
6
6
T
C
G
A
T
G
C
A
C
C
T
A
A
T
G
T
A
T
C
A
A
A
T
G
A
C
A
G
C
C
C
A
G
T
T
A
T
G
A
T
A
2
2
G
3
T
T
G
T
A
A
T
A
T
G
G
G
A
8
A
C
G
2
G
8
A
2
A
G
C
A
T
C
T
T
A
15
A
G
2
C
C
G
G
G
A
G
C
A
A
C
16
G
A
C
G
A
G
C
G
C
2
C
T
T
G
2
C
3
A
6
C
G
C
12
4
C
G
G
A
C
T
A
G
T
G
T
C
C
A
C
T
C
G
13
T
T
C
C
T
T
G
4
T
A
A
C
A
G
T
G
G
A
A
A
A
4
G
G
G
C
G
A
C
A
T
C
G
C
G
C
A
T
2
2
T
T
C
T
C
G
G
C
G
8
6
T
A
A
T
T
T
T
T
C
T
T
T
G
G
C
T
C
G
G
G
G
C
A
A
G
A
C
T
G
G
C
C
G
T
C
A
A
G
A
G
6
22
A
G
C
A
A
4
T
A
T
G
C
G
A
C
C
A
C
A
G
G
T
T
2
A
A
T
A
A
A
C
A
G
2
A
T
10
8
C
G
G
T
C
C
T
G
  22,632,992
  22,632,998
  22,633,003
  22,633,019
  22,633,166
  22,633,397
  22,633,855
  22,633,898
  22,634,280
  22,634,672
  22,636,092
  22,636,195
  22,636,203
  22,636,207
  22,636,221
  22,636,224
  22,636,229
  22,636,232
  22,636,241
  22,636,242
  22,636,290
  22,636,297
  22,636,300
  22,636,317
  22,636,327
  22,636,338
  22,636,345
  22,636,346
  22,636,354
  22,636,372
  22,636,373
  22,645,012
  22,645,354
  22,646,562
  22,647,648
  22,649,187
  22,649,202
  22,651,923
  22,651,924
  22,652,711
  22,653,575
  22,653,801
  22,656,015
  22,656,112
  22,656,890
  22,656,986
  22,657,344
  22,657,503
  22,657,762
  22,658,173
  22,665,735
  22,666,009
  22,666,182
  22,666,216
  22,666,762
  22,666,971
  22,667,599
  22,667,774
  22,667,942
  22,668,289
  22,668,330
  22,668,465
  22,668,545
  22,668,692
  22,668,969
  22,669,074
  22,669,076
  22,669,080
  22,669,118
  22,669,197
  22,669,203
  22,669,275
  22,669,599
  22,669,629
  22,669,657
  22,669,722
  22,669,793
  22,669,902
  22,669,906
  22,669,908
  22,669,910
  22,669,911
  22,669,912
  22,669,914
  22,669,916
  22,669,918
  22,669,920
  22,670,428
  22,670,456
  22,670,552
  22,670,568
  22,671,209
  22,671,293
  22,671,657
  22,671,998
  22,672,181
  22,672,607
  22,672,761
  22,672,952
  22,673,001
  22,673,734
  22,673,742
  22,674,580
  22,674,585
  22,674,813
  22,674,837
  22,675,009
  22,675,010
  22,675,026
  22,675,031
  22,675,041
  22,675,112
  22,675,144
  22,675,225
  22,675,309
  22,675,410
  22,676,295
  22,676,389
  22,676,471
  22,676,625
  22,676,933
  22,677,013
  22,677,512
  22,677,517
  22,677,684
  22,677,874
  22,677,899
  22,678,344
  22,678,692
  22,678,818
  22,679,121
  22,679,156
  22,679,249
  22,679,328
  22,679,497
  22,679,542
  22,679,635
  22,679,678
  22,679,869
  22,680,113
  22,680,240
  22,680,719
  22,681,193
  22,681,802
  22,682,152
  22,682,153
  22,682,379
  22,682,532
  22,682,570
  22,682,712
  22,682,751
  22,683,359
  22,683,492
  22,683,659
  22,683,883
  22,683,946
  22,683,956
  22,684,002
  22,684,281
  22,684,397
  22,684,530
  22,684,879
  22,685,043
  22,685,841
  22,686,419
  22,687,065
  22,687,253
  22,688,378
  22,691,014
  22,691,235
  22,691,479
  22,691,537
  22,691,688
  22,692,361
  22,692,916
  22,693,052
  22,693,095
  22,693,421
  22,693,631
  22,693,632
  22,701,828
  22,702,205
  22,702,281
  22,702,442
  22,702,531
  22,702,549
  22,702,690
  22,702,973
  22,703,014
  22,706,009
  22,706,921
  22,707,363
  22,707,972
  22,707,973
  22,708,977
  22,709,969
  22,709,978
  22,710,423
  22,714,820
  22,717,106
  22,717,121
  22,717,152
  22,717,616
  22,717,639
  22,717,654
  22,717,970
  22,720,028
  22,720,187
  22,720,270
  22,720,278
  22,720,357
  22,720,420
  22,720,640
  22,720,802
  22,721,006
  22,721,011
  22,721,449
  22,721,471
  22,721,484
  22,721,506
  22,721,510
  22,721,561
  22,721,865
  22,721,961
  22,721,969
  22,722,012
  22,722,052
  22,722,135
  22,722,371
  22,722,487
  22,722,734
  22,722,742
  22,722,876
  22,722,884
  22,723,455
  22,723,629
  22,723,719
  22,723,723
  22,723,793
  22,723,991
  22,724,190
  22,724,239
  22,724,452
  22,724,504
  22,724,505
  22,724,662
  22,724,890
  22,725,080
  22,725,291
  22,725,430
  22,725,764
  22,726,120
  22,726,197
  22,726,493
  22,726,516
  22,726,946
  22,727,546
  22,728,640
  22,728,731
  22,728,958
  22,729,520
  22,730,621
  22,730,797
  22,731,023
  22,731,063
  22,731,211
  22,731,223
  22,732,912
  22,733,275
  22,733,930
  22,734,902
  22,736,815
  22,737,544
  22,737,871
  22,738,545
  22,743,410
  22,745,374
  22,746,597
  22,746,841
  22,746,891
  22,746,955
  22,747,601
  22,748,570
  22,749,177
  22,749,331
  22,749,795
  22,751,205
  22,754,395
  22,754,673
  22,755,125
  22,755,868
  22,757,530
  22,758,341
  22,761,148
  22,761,756
  22,761,882
  22,762,458
  22,762,713
  22,762,973
  22,763,683
  22,763,891
  22,763,908
  22,765,123
  22,765,378
  22,766,070
  22,766,707
  22,766,755
  22,767,189
  22,767,222
  22,769,257
  22,770,375
  22,770,990
  22,771,241
  22,772,716
  22,775,411
  22,784,403
  22,792,288
  22,792,292
  22,792,352
  22,792,696
  22,792,787
  22,792,795
  22,792,811
  22,792,817
  22,792,824
  22,792,838
  22,793,245
  22,793,311
  22,793,312
  22,794,398
  22,794,434
  22,794,435
  22,794,484
  22,797,881
  22,797,893
  22,797,962
  22,798,614
  22,800,108
  22,800,258
  22,800,309
  22,800,452
  22,800,658
  22,800,758
  22,800,993
  22,801,236
  22,801,315
  22,801,489
  22,801,590
  22,801,754
  22,801,780
  22,802,182
  22,802,222
  22,802,281
  22,802,672
  22,802,819
  22,803,076
  22,803,259
  22,803,320
  22,803,417
  22,803,421
  22,803,438
  22,803,658
  22,803,708
  22,804,145
  22,804,177
  22,804,438
  22,804,625
  22,804,737
  22,804,850
  22,804,889
  22,805,083
  22,805,192
  22,805,355
  22,805,359
  22,805,372
  22,805,374
  22,805,389
  22,805,396
  22,805,405
  22,805,412
  22,805,419
  22,805,421
  22,805,817
  22,806,019
  22,806,314
  22,806,621
  22,806,622
  22,808,210
  22,808,308
  22,809,792
  22,810,596
  22,810,772
  22,811,289
  22,811,313
  22,811,725
  22,811,821
  22,812,630
  22,814,087
  22,815,418
  22,815,497
  22,816,614
  22,817,227
  22,818,995
  22,819,744
  22,820,063
  22,823,279
  22,824,397
  22,824,399
  22,824,546
  22,827,286
  22,874,505
  22,874,591
  22,874,793
  22,875,144
  22,875,477
  22,876,464
  22,876,511
  22,876,942
  22,877,300
  22,877,667
  22,877,793
  22,877,811
  22,877,922
  22,878,179
  22,878,422
  22,878,584
  22,894,600
  22,894,796
  22,895,448
  22,895,511
  22,895,515
  22,895,707
  22,895,892
  22,895,921
  22,896,058
  22,896,062
  22,896,216
  22,896,317
  22,896,380
  22,896,818
  22,896,921
  22,897,068
  22,897,079
  22,897,089
  22,897,227
  22,897,266
  22,899,689
  22,900,490
  22,901,342
  22,901,402
  22,903,470
  22,903,669
  22,906,468
  22,906,518
  22,907,608
  22,907,975
  22,910,152
  22,910,313
  22,910,682
  22,910,944
  22,911,084
  22,911,107
  22,911,146
  22,911,168
  22,911,362
  22,911,402
  22,911,425
  22,912,313
  22,913,632
  22,915,560
  22,915,898
  22,916,930
  22,917,413
  22,917,847
  22,917,848
  22,919,565
  22,919,606
  22,919,612
  22,921,007
  22,922,276
  22,923,633
  22,926,138
  22,928,082
  22,928,083
  22,928,177
  22,928,505
  22,928,507
  22,929,455
  22,930,235
  22,930,762
  22,931,497
  22,931,670
  22,932,466
  22,932,870
  22,935,475
-
-
-
-
-
2
AC/3
A
G
-
2
A
T
T
T
G
T
A
A
A
T
-
2
T
A
-
2
T
T
G
A
2
3
T
-
5
C/2
C/4
T/-
C
G
-
G
-
C
A
G
T
T
T
G
T
T
G
T
-
G
A
G
T
4/3
G
C
A
A
16/-
2/-
6/-
-
-
-
-
3
-
3
3
-
T
T
C
C
2
6
C
C
C
C
C
A
T
7/5
T
C
3
T
-
G
G
C
T
C
T
A
A
C
T
2
2
2
T
T
C
G
T/35
G
A
T
19
G
A
-
A
A
C
A
C
T
A
A
C
C
2
G
T
G
T
C
4
5
T
C
-
C
T
T
G
C
C
T
G
C
G
4
-
T
A
G
C
G
A
T
C
-
13
G
T
-
G
T
C
G
G
2
G
4/CA
13/11
T
G
T
G
-
C
-
9
G
A
-
C/9
-
T
C
G
G
G
A
4
A
G
G/-
T
G
C
-
-
-
7/10
23
G
T
C
T
C
G
C
G
G
A
-
-
-
-
6/-
C
T
A
G
C
A
T
G
T/A
T
G
G
C
C
A
C
5
2
T
G
T
G
G
A
T
7
C
A
T
T
T
G
A
C
C
2
C
A
A/3
-
G
-
-
-
-
2
T/A
C
C
C
G
C
-
C
T
2
T
5
-
G
G
2
-
A
-
G
2/-
-
C
T
G
C
T
7
2
C
-
G
T
-
T
G
A
3
A
G
A
T
2
3
5/14
-
A
-
G
T
G
C
T
C
G
-
T
A
C
G/12
2/-
T
-
3
6/-
T
T
-
-
-
T
C
C
G
T
G
G
A
-
C
C
A
T
G
T
C
T
A
-
C
G
T
A
-
C
A
-
A
G
G
9
G
A
C
-
T
-
G
G
G
-
4
C
A
G
2
2
A
T
C
2
A
2
9
CT/3
2
3
-
-
C
-
T
C
T
A
3
4
A
8/-
6/-
C
2
G
-
C
C
C
C
88
A
C
G
A
A
G
G
T
C
C
A
A
G
G
T
C
G
G
G
A
A
G
G
T
A
2
5
G
C
T
A
-
-
-
G/5
T
-
G
-
C
G
-
A
3
A
2
10
T
-
T
-
T
T
-
G
-
3/AT
T
A
2
2
T
2
5
2
2/-
-
-
10/-
-
17
A
2
C
T
T
-
A