Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 93,561 (bp)   Positions: 488
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.002
.026
.013
--
.172
--
--
--
--
--
.695
.063
.004
--
--
.444
.145
.017
.01
.045
.103
.163
.019
.013
--
--
--
--
--
--
.0
.002
.019
.0
.423
.0
--
.025
.023
.073
.015
.062
.021
.001
.001
.263
.084
.017
.016
.002
.008
.027
.093
.037
--
.081
.033
.045
.009
.105
--
--
.002
.004
.032
.001
.004
.004
.002
.002
.013
--
.088
.049
.165
.376
.641
--
.001
--
.014
.016
.5
--
--
.125
.005
--
.933
.504
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.017
--
.106
.108
.686
.677
.473
--
.001
.006
.0
--
.004
.002
.008
.009
.015
.006
.008
.012
.017
.022
.405
.317
.138
--
.003
.011
--
--
--
--
--
--
--
.023
.052
.001
.003
.001
.001
--
--
--
--
--
.021
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
--
.08
.004
.006
.039
.013
.098
.124
.13
.137
--
.005
.008
.015
.001
.043
.02
.019
.009
.006
.0
.965
.012
.011
.011
.0
.0
.038
--
--
.001
--
.059
.006
.008
.03
.002
.005
.0
.001
.0
.0
.01
.01
.001
.002
.001
.003
.001
.0
.001
.002
.0
.003
.002
.001
.025
.002
.001
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.037
.009
.016
.121
.083
.124
.206
.009
.097
.047
.155
.154
.275
.482
.426
.153
.013
.012
.016
.002
.006
.022
.039
.013
.047
.94
.125
.19
.001
.01
.1
.028
.052
.218
.023
.291
.06
.093
.052
.011
.062
.013
.009
.004
.002
.005
.011
.0
.002
.0
.005
.0
.004
.027
.917
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.158
.132
.432
.226
.008
.006
.087
.076
.022
.014
.491
.523
.537
.067
.022
.015
.004
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.042
.015
.319
.046
.025
.023
--
--
--
--
--
--
--
--
.017
.001
--
--
--
--
--
--
.03
.148
.07
.218
.122
.053
.045
.178
.007
.005
.024
.017
.858
.021
.026
.037
.029
.265
.099
.177
.092
.005
.066
.064
.002
.084
.018
.002
.015
.015
.373
.53
.113
.012
.6
.012
.066
.005
.037
.009
.003
--
--
--
--
--
--
.011
.013
.007
.056
.049
.067
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.012
.047
.001
.147
.03
.036
.006
.0
.725
.013
.001
.002
.001
.001
.008
.002
.015
.001
.016
.074
.469
.535
.464
.016
.174
--
--
--
--
--
--
.463
.011
.106
.097
.089
.334
.416
.498
.152
.134
.379
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.008
.698
.0
.008
.003
.0
.021
.016
.004
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
Abca17
A
G
C
A
A
G
T
T
G
G
C
3
C
A
G
C
G
C
T
C
G
C
T
G
G
G
T
T
A
C
T
A
G
G
G
A
A
A
G
G
G
C
T
C
A
A
C
C
G
C
T
C
T
G
G
C
C
A
G
T
C
G
4
2
G
A
T
C
G
A
A
T
T
T
A
C
C
A
2
3
C
G
4
C
2
G
C
G
A
T
4
C
G
G
A
A
2
2
2
4
2
A
4
T
A
G
2
A
T
4
G
G
C
T
C
G
2
A
4
6
G
C
A
A
C
G
T
T
G
C
C
A
T
T
A
A
A
A
C
G
G
A
A
C
T
G
8
9
8
8
A
T
G
T
C
T
T
A
C
T
C
T
T
A
A
A
C
T
A
C
G
G
G
G
T
T
C
5
G
G
T
T
A
G
C
T
A
T
C
G
A
G
G
A
A
C
G
C
G
G
G
G
C
3
A
T
C
T
T
G
T
G
T
T
C
A
C
G
G
C
G
C
T
C
T
2
A
A
A
C
C
G
T
G
C
G
C
A
G
G
11
C
G
2
T
A
C
C
T
12
G
G
C
T
G
C
A
C
C
T
3
T
T
A
G
C
G
A
G
C
G
T
A
G
G
T
G
A
T
A
G
G
T
T
T
C
T
G
A
C
T
C
T
T
C
G
C
T
C
G
C
T
A
G
A
3
T
T
T
G
C
T
A
A
G
A
2
C
C
T
4
C
C
C
C
T
C
A
A
G
T
T
A
A
C
T
G
C
G
A
G
G
C
C
A
A
10
G
G
T
A
A
T
C
A
G
T
G
T
T
G
C
C
A
G
G
C
C
C
G
2
C
C
G
C
G
A
G
A
A
20
A
A
A
A
C
C
A
A
G
A
C
A
T
T
G
C
3
2
G
G
G
C
T
A
C
T
T
T
T
T
T
2
C
G
G
G
G
C
G
C
G
G
C
G
T
G
A
G
T
C
A
G
A
T
A
G
6
2
A
A
C
C
G
C
A
T
C
A
3
C
A
G
T
C
A
C
C
A
A
2
2
A
2
A
A
5
A
C
C
G
G
C
C
A
A
3
A
C
A
C
T
C
G
T
C
T
G
  13,447,539
  13,449,076
  13,449,467
  13,450,035
  13,450,579
  13,451,782
  13,452,829
  13,453,268
  13,455,824
  13,456,585
  13,457,029
  13,457,131
  13,457,248
  13,457,730
  13,457,739
  13,457,984
  13,459,615
  13,460,043
  13,460,231
  13,460,663
  13,460,906
  13,460,969
  13,461,185
  13,461,735
  13,461,885
  13,462,067
  13,462,208
  13,462,214
  13,462,444
  13,462,459
  13,462,600
  13,462,799
  13,463,161
  13,463,179
  13,463,403
  13,463,549
  13,463,770
  13,463,904
  13,463,912
  13,464,161
  13,464,204
  13,464,229
  13,464,397
  13,464,768
  13,465,000
  13,465,560
  13,465,950
  13,466,239
  13,466,711
  13,466,757
  13,467,016
  13,467,515
  13,467,774
  13,468,090
  13,469,229
  13,469,552
  13,470,806
  13,470,818
  13,470,991
  13,471,105
  13,471,124
  13,471,160
  13,471,249
  13,471,251
  13,471,284
  13,471,372
  13,471,667
  13,471,762
  13,472,017
  13,472,660
  13,474,329
  13,474,534
  13,475,724
  13,476,688
  13,477,200
  13,477,663
  13,477,689
  13,477,870
  13,478,256
  13,479,502
  13,479,832
  13,479,873
  13,480,101
  13,481,831
  13,482,152
  13,482,522
  13,483,911
  13,484,787
  13,486,257
  13,486,841
  13,487,650
  13,487,658
  13,487,751
  13,487,771
  13,487,787
  13,487,801
  13,487,860
  13,487,879
  13,487,905
  13,487,916
  13,487,951
  13,487,981
  13,487,985
  13,488,392
  13,488,535
  13,489,099
  13,489,890
  13,490,652
  13,490,868
  13,491,025
  13,491,028
  13,491,040
  13,491,403
  13,492,056
  13,492,214
  13,492,269
  13,492,964
  13,493,174
  13,493,441
  13,493,591
  13,493,682
  13,493,907
  13,494,985
  13,495,486
  13,495,704
  13,495,708
  13,495,709
  13,495,789
  13,496,507
  13,496,592
  13,497,429
  13,497,848
  13,498,493
  13,498,538
  13,498,594
  13,498,595
  13,498,596
  13,498,690
  13,498,702
  13,498,879
  13,499,198
  13,499,733
  13,499,944
  13,500,441
  13,500,963
  13,500,968
  13,503,017
  13,503,018
  13,503,019
  13,503,039
  13,503,163
  13,504,367
  13,505,016
  13,505,018
  13,505,071
  13,505,072
  13,505,086
  13,505,296
  13,505,331
  13,505,711
  13,505,917
  13,505,919
  13,506,300
  13,506,820
  13,507,281
  13,507,451
  13,507,908
  13,509,067
  13,509,436
  13,509,438
  13,509,797
  13,509,801
  13,509,802
  13,509,807
  13,510,078
  13,511,066
  13,511,193
  13,511,450
  13,511,466
  13,511,600
  13,511,927
  13,511,945
  13,512,042
  13,512,111
  13,512,146
  13,512,279
  13,512,326
  13,512,408
  13,512,621
  13,512,635
  13,512,860
  13,513,118
  13,513,671
  13,513,823
  13,514,276
  13,514,502
  13,514,715
  13,514,788
  13,514,789
  13,514,842
  13,515,480
  13,515,532
  13,515,725
  13,515,793
  13,515,806
  13,515,809
  13,515,882
  13,515,883
  13,515,938
  13,515,973
  13,515,988
  13,515,993
  13,516,006
  13,516,038
  13,516,118
  13,516,127
  13,516,134
  13,516,137
  13,516,166
  13,516,222
  13,516,325
  13,516,424
  13,516,468
  13,516,479
  13,516,670
  13,516,673
  13,516,720
  13,516,761
  13,516,769
  13,516,919
  13,516,925
  13,516,930
  13,516,975
  13,516,976
  13,516,984
  13,517,024
  13,517,230
  13,517,285
  13,517,303
  13,517,333
  13,517,351
  13,517,372
  13,517,380
  13,517,407
  13,517,508
  13,517,519
  13,517,532
  13,517,608
  13,517,611
  13,517,622
  13,517,674
  13,517,687
  13,517,762
  13,517,763
  13,517,923
  13,517,936
  13,518,010
  13,518,030
  13,518,040
  13,518,059
  13,518,061
  13,518,128
  13,518,287
  13,518,350
  13,518,530
  13,518,550
  13,518,716
  13,518,805
  13,518,823
  13,518,937
  13,518,950
  13,519,086
  13,519,282
  13,519,297
  13,519,356
  13,519,602
  13,519,787
  13,519,867
  13,519,889
  13,520,070
  13,520,150
  13,520,307
  13,520,387
  13,520,449
  13,520,546
  13,520,550
  13,520,561
  13,520,569
  13,520,589
  13,520,878
  13,520,906
  13,521,014
  13,521,023
  13,521,143
  13,521,144
  13,521,181
  13,521,257
  13,521,260
  13,521,267
  13,521,634
  13,521,878
  13,521,898
  13,521,912
  13,521,973
  13,522,071
  13,522,157
  13,522,253
  13,522,353
  13,522,455
  13,522,651
  13,522,720
  13,522,750
  13,523,185
  13,523,376
  13,523,379
  13,523,409
  13,523,412
  13,523,628
  13,523,704
  13,523,754
  13,523,819
  13,523,828
  13,523,843
  13,523,846
  13,523,878
  13,523,890
  13,524,097
  13,524,114
  13,524,224
  13,524,378
  13,524,522
  13,524,554
  13,524,620
  13,524,645
  13,524,652
  13,524,662
  13,524,693
  13,524,698
  13,524,718
  13,524,781
  13,524,811
  13,524,846
  13,524,871
  13,525,064
  13,525,085
  13,525,136
  13,525,277
  13,525,357
  13,525,372
  13,525,612
  13,525,639
  13,525,653
  13,525,765
  13,525,791
  13,525,947
  13,525,997
  13,526,001
  13,526,053
  13,526,096
  13,526,122
  13,526,144
  13,526,163
  13,526,285
  13,526,442
  13,527,399
  13,527,424
  13,527,425
  13,527,543
  13,527,563
  13,527,692
  13,527,777
  13,527,928
  13,528,038
  13,528,044
  13,528,102
  13,528,429
  13,528,571
  13,528,580
  13,528,695
  13,528,726
  13,528,743
  13,528,788
  13,529,016
  13,529,145
  13,529,448
  13,529,567
  13,529,725
  13,530,075
  13,530,163
  13,530,203
  13,530,206
  13,530,243
  13,530,254
  13,530,256
  13,530,268
  13,530,331
  13,530,359
  13,530,488
  13,530,489
  13,530,950
  13,531,195
  13,531,315
  13,531,378
  13,531,503
  13,531,551
  13,531,640
  13,531,652
  13,531,667
  13,531,687
  13,531,695
  13,531,862
  13,532,054
  13,532,172
  13,532,682
  13,532,737
  13,533,063
  13,533,112
  13,533,158
  13,533,205
  13,533,322
  13,533,524
  13,533,564
  13,533,632
  13,533,705
  13,533,840
  13,533,942
  13,534,054
  13,534,154
  13,534,261
  13,534,292
  13,534,330
  13,534,334
  13,534,410
  13,534,451
  13,534,506
  13,534,535
  13,534,799
  13,535,035
  13,535,037
  13,535,108
  13,535,118
  13,535,123
  13,535,145
  13,535,232
  13,535,311
  13,535,359
  13,535,368
  13,535,393
  13,535,436
  13,535,504
  13,535,510
  13,535,582
  13,535,702
  13,535,739
  13,535,771
  13,535,775
  13,535,914
  13,535,921
  13,535,922
  13,535,926
  13,535,933
  13,535,936
  13,535,938
  13,535,940
  13,535,942
  13,535,964
  13,536,040
  13,536,225
  13,536,238
  13,536,539
  13,536,540
  13,536,547
  13,536,562
  13,536,573
  13,536,851
  13,537,078
  13,537,187
  13,537,395
  13,537,657
  13,537,737
  13,538,022
  13,538,189
  13,538,191
  13,538,268
  13,538,406
  13,538,611
  13,538,710
  13,538,820
G
A
4
G
G
C
C
G
A
4/3
C/G
-
T
T
T
T
C
T
C
T
T
-
C
A
A
G/A
T/C
T/G
A/-
2
T/G
G
A
A
A
G
C
G
A
A
A
T
G
T
G
G
T
5
A
A
C
-
A
A
G/2
T
T
G
A
C
C/-
C
-
-
3
G
A
T
C
G
G
-
C
3
G
C/2
C/A
G
-
-
T
A
-
T
-
7
C/2
G/A
C
C
-
T
G/2
G/A
A/G
G
2/-
2/-
2/-
4/-
2/-
A/G
-
C
G
A
-
G
3/TA
-
G/A
G/A
13
A
G
A
-
-
-
-
A
T
G
T
T
6
2
C
A
T
A
G
-
-
T
T
G
-
2
A
T
T
A/2
T
2
2
-
-
-
8/-
G
-
G/2
-/5
4
2
3
C
C/2
2
T
C
2
G
T
-
2
C
13
C/T
T
G/5
T
T
C
A
T
-
A
A
C
C
G
A
T
G
G
3
T
C
T
2
A
G
G
T
A
T
A
T
A
A
T
-
T
C
C/3
-
G
A
A
A
C
C
T
G
T
T
A
T
A
T
C
T
T/-
-
G
C
G
T
A
A
C
A
T
A
A
-
A
A
-
G
A
-
C
-
T
T
A
-
C
A
T
G
A
A
G
T
T
-
-
-
5
G
A
T
A
G
A
T
2
G
C
T
A
C
A
G
3
G
A
A
C
C
C
T
A
A
G
T
C
A
G
6
T/6
-
T
C
T
A
A
C
G
A
G
-
C
C
G
C
T
G
C
8
3
G
-
T
T
A
-
T
A
A
T
C
T
T
C
C
C
A
T
T
G
-
A
T
G/A
T
A
2
T
A
C
G
-
C
C
C
C
G
C
T
G
A
C
A
C
C
C
T
-
C
A
T
T
T
T
A
-
T
T
T
T
A
2
A
G
G
-
C
G
G
G
T
T
2
T
A
-
T
C
C
C
T
T
-
-
A
A
C
T
C
T
T
C
C
C
C
G
C
-
A
A
A
A
T
T
A
G
A
A
T
A
C
A
G
A
C
T
G
4
-
C
G
A
6/-
-
A/-
A/G
C/T
5/3
A
A
G
G
T
G
3/-
3
-
A
C
G
G
A
C/G
3
3
-
-
3
-
3
G
-
G
T
T
A
A
A
A
C
7
-
2
T
G
T
C
T
2
C
A
C
T