Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 107,882 (bp)   Positions: 370
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.167
.009
.001
.002
.99
.168
.011
.009
.011
.013
.007
.017
.049
--
--
.194
.005
.006
.001
.214
--
--
--
--
.312
.023
.066
.231
.165
.011
.0
--
--
.025
.551
.46
.643
.008
.002
.615
--
--
.134
.32
--
--
.008
.0
.002
.0
.081
.024
.115
.344
.025
.118
.996
.997
--
--
--
--
--
--
--
.016
.004
.007
.003
.356
.166
.01
.025
.05
.008
.005
.016
.025
.087
.121
.001
.001
.001
.002
.2
.052
.101
.021
.047
.001
.045
.019
--
--
--
--
.007
.0
.001
.002
.001
.022
.022
.022
.021
.032
.133
.007
.034
.003
.169
.086
.036
.219
.011
.05
.006
.034
.03
.038
.04
.011
.993
.027
.0
.014
.022
.055
.005
--
.001
.0
.0
.0
.0
.128
.116
.047
.008
.332
.987
.01
.003
.003
--
--
--
1.0
.99
.132
.005
.866
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.154
.093
.321
.348
.204
--
--
.941
--
--
.061
.202
--
.011
.001
.406
.003
.45
--
.049
.444
.002
.001
.029
.468
.695
.019
.021
.714
.899
.001
.003
.005
.002
.171
.049
.001
.006
.02
.034
.019
.001
.003
.005
.051
.044
.007
.02
.002
--
--
--
--
--
.08
.083
.128
.187
.11
.0
--
--
--
--
--
--
--
.016
.328
.004
.027
.052
.062
--
.044
.3
.223
.031
.017
.022
.546
.126
.024
.003
.018
.038
--
--
--
--
.437
.457
.034
.15
.344
.004
.301
--
--
--
.007
.002
.001
.012
.103
.0
.0
.001
.332
.075
.082
.153
.035
.006
--
--
--
--
--
--
--
.002
.002
.034
.005
.087
.103
.131
.011
.0
.049
1.0
.02
.001
--
--
--
.03
.113
--
--
.078
.143
.731
.006
.0
.001
--
.023
.097
.276
.129
.072
.002
.003
.003
.249
.0
--
--
--
--
--
.072
.001
--
--
.003
.004
.067
--
--
--
--
.052
.008
.237
.063
.331
.161
.037
.001
.0
.001
.151
.035
.047
.001
.132
.079
.086
.831
.011
.008
.023
.079
.07
.001
.002
.003
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
A
T
G
A
A
C
C
T
T
G
C
C
G
A
C
A
A
C
G
A
T
C
G
T
G
C
T
T
C
A
T
C
17
T
G
C
G
A
G
T
A
G
A
A
G
G
T
C
T
A
G
G
A
C
A
C
4
2
T
G
2
A
A
2
T
G
A
A
T
A
G
C
G
G
6
C
G
6
G
G
T
G
T
T
A
C
C
T
A
T
G
A
G
G
A
A
T
A
C
A
A
C
A
A
T
A
G
C
G
T
G
T
G
2
C
T
G
C
G
A
G
G
A
G
G
C
A
C
A
T
T
G
G
A
C
T
A
T
C
C
A
C
A
A
C
T
T
C
A
T
G
A
4
2
2
A
A
T
8
A
2
A
A
2
2
A
C
G
T
G
C
3
G
T
G
G
2
T
T
T
A
C
12
T
14
A
G
C
T
G
T
A
C
18
G
C
A
T
C
C
C
A
T
G
C
G
8
T
T
3
5
T
G
A
T
C
C
A
G
T
T
T
T
A
T
G
C
2
C
G
T
A
G
G
A
G
G
A
T
G
G
G
C
C
G
C
T
G
C
T
A
C
T
G
11
C
3
2
T
18
G
T
G
G
T
T
A
A
G
C
T
C
T
C
G
C
T
C
A
2
C
G
G
A
2
C
G
C
C
A
A
A
C
G
A
2
A
T
C
C
G
C
G
C
G
A
G
G
T
G
C
G
T
G
T
T
T
T
T
T
4
T
C
4
3
C
G
A
C
C
A
2
T
C
8
2
G
A
A
C
C
C
A
C
T
T
T
T
G
T
G
2
T
5
C
G
A
G
A
2
4
A
T
C
C
T
5
T
T
C
  5,894,323
  5,894,515
  5,894,562
  5,895,383
  5,895,641
  5,896,052
  5,896,129
  5,896,147
  5,896,158
  5,896,159
  5,896,180
  5,896,219
  5,896,544
  5,896,722
  5,897,042
  5,897,309
  5,897,576
  5,897,709
  5,898,403
  5,898,723
  5,898,926
  5,899,045
  5,899,088
  5,899,315
  5,899,704
  5,899,899
  5,900,081
  5,901,705
  5,902,285
  5,902,315
  5,903,119
  5,903,648
  5,903,651
  5,904,264
  5,904,834
  5,904,842
  5,905,059
  5,905,254
  5,905,638
  5,905,968
  5,906,680
  5,906,713
  5,907,467
  5,907,533
  5,907,856
  5,907,964
  5,908,185
  5,908,500
  5,908,601
  5,908,781
  5,909,019
  5,909,125
  5,909,264
  5,909,390
  5,909,533
  5,909,825
  5,910,322
  5,910,324
  5,910,537
  5,910,582
  5,910,766
  5,910,774
  5,910,786
  5,910,787
  5,910,819
  5,910,900
  5,911,036
  5,911,687
  5,911,689
  5,912,084
  5,912,140
  5,912,178
  5,912,185
  5,912,259
  5,912,276
  5,912,281
  5,912,289
  5,912,326
  5,912,335
  5,912,347
  5,912,831
  5,912,832
  5,912,833
  5,912,834
  5,912,909
  5,912,937
  5,912,954
  5,913,864
  5,914,248
  5,914,707
  5,914,803
  5,914,944
  5,915,606
  5,915,614
  5,915,617
  5,915,618
  5,915,819
  5,915,827
  5,915,834
  5,915,838
  5,915,846
  5,915,853
  5,915,860
  5,915,867
  5,915,871
  5,915,874
  5,915,932
  5,916,017
  5,916,375
  5,917,857
  5,918,300
  5,918,805
  5,918,980
  5,919,159
  5,919,206
  5,919,702
  5,920,147
  5,920,357
  5,920,363
  5,920,658
  5,920,724
  5,921,322
  5,922,137
  5,922,534
  5,922,713
  5,923,136
  5,923,421
  5,923,452
  5,924,292
  5,924,446
  5,925,343
  5,926,293
  5,926,430
  5,926,461
  5,926,612
  5,926,907
  5,927,235
  5,927,315
  5,927,384
  5,927,731
  5,928,121
  5,928,592
  5,928,801
  5,929,130
  5,929,286
  5,929,402
  5,929,583
  5,930,354
  5,930,467
  5,930,850
  5,931,218
  5,931,906
  5,932,194
  5,932,231
  5,932,299
  5,932,300
  5,932,310
  5,932,321
  5,932,696
  5,932,739
  5,932,756
  5,932,776
  5,932,815
  5,932,822
  5,932,910
  5,932,911
  5,933,055
  5,933,087
  5,933,140
  5,933,465
  5,933,641
  5,933,954
  5,933,956
  5,934,001
  5,934,297
  5,934,311
  5,934,497
  5,935,424
  5,935,557
  5,935,709
  5,935,724
  5,935,984
  5,937,109
  5,937,133
  5,937,180
  5,937,542
  5,937,871
  5,938,007
  5,938,330
  5,938,578
  5,938,937
  5,938,961
  5,939,928
  5,940,023
  5,940,351
  5,940,457
  5,940,481
  5,940,491
  5,940,669
  5,940,829
  5,941,003
  5,941,004
  5,941,049
  5,941,085
  5,941,656
  5,941,763
  5,941,777
  5,941,780
  5,941,784
  5,941,806
  5,941,813
  5,941,816
  5,942,416
  5,942,672
  5,942,944
  5,942,953
  5,943,538
  5,943,665
  5,943,980
  5,943,998
  5,944,055
  5,944,056
  5,944,057
  5,944,165
  5,944,754
  5,944,759
  5,944,999
  5,945,289
  5,945,542
  5,945,680
  5,945,697
  5,945,709
  5,945,749
  5,945,775
  5,945,787
  5,945,811
  5,946,781
  5,948,719
  5,948,999
  5,949,009
  5,949,011
  5,949,322
  5,949,398
  5,949,731
  5,949,848
  5,950,066
  5,950,099
  5,950,114
  5,950,161
  5,950,233
  5,950,368
  5,950,682
  5,951,054
  5,951,269
  5,951,392
  5,952,533
  5,952,739
  5,952,740
  5,954,083
  5,954,817
  5,954,896
  5,955,744
  5,955,835
  5,956,445
  5,956,654
  5,956,739
  5,957,363
  5,957,372
  5,957,570
  5,957,977
  5,958,010
  5,958,035
  5,958,390
  5,959,171
  5,959,281
  5,959,419
  5,959,422
  5,959,623
  5,959,742
  5,959,803
  5,959,814
  5,959,820
  5,959,838
  5,959,855
  5,959,859
  5,959,873
  5,959,893
  5,959,901
  5,960,034
  5,960,174
  5,960,288
  5,960,291
  5,960,307
  5,960,321
  5,960,336
  5,960,338
  5,960,342
  5,960,348
  5,960,980
  5,961,245
  5,961,340
  5,962,157
  5,962,614
  5,962,800
  5,962,854
  5,962,855
  5,963,078
  5,963,229
  5,963,367
  5,963,387
  5,963,492
  5,964,261
  5,964,535
  5,965,152
  5,965,478
  5,965,481
  5,965,502
  5,965,628
  5,967,530
  5,967,665
  5,967,964
  5,967,998
  5,968,360
  5,968,861
  5,968,862
  5,969,092
  5,969,244
  5,969,737
  5,969,744
  5,969,758
  5,969,760
  5,969,783
  5,970,773
  5,987,912
  5,989,266
  5,989,268
  5,989,824
  5,991,883
  5,992,751
  5,992,795
  5,992,823
  5,992,827
  5,992,835
  5,992,931
  5,992,979
  5,993,817
  5,995,026
  5,995,116
  5,995,196
  5,995,469
  5,996,273
  5,996,769
  5,996,770
  5,996,946
  5,997,420
  5,997,421
  5,997,503
  5,998,490
  5,998,534
  5,998,543
  5,998,796
  5,999,217
  5,999,224
  5,999,235
  5,999,242
  5,999,250
  6,000,088
  6,001,475
  6,001,483
  6,001,488
G
A
-
G
G
T
T
2
2
G/A
-
2
T
G
T
-
C
20
C
G
2
T
A
2
T
C/T
C
C
T
T
C
C/A
17/-
C
3
T
A
C
T
C
G
3
G
G
A
A
C
T
T/G
G
A
A
G
5
G
T
4/-
2/-
C
G/3
-
A/G
A/3
2/-
T/A
A
2
G
C
G
T
G
A
G/A
6/-
C/A
G/A
-
G/A
A
C
A
C
A
G
C/2
T
C
-
C
A
G
2
4/3
5
4
-
-
-
-
-
-
-
-
C
C
A
T
C
-
A
2
A
-
T
C
T
G
C
G
C
A
G
2
C
2
T
C/T
G
C/5
C
A
2
G
T
C
G
C
T
T
G
G
C
G
T
G
G
T
T
A
T
G
-
2/-
2/-
A/3
A/G
T/A
8/-
A/3
2/-
A/G
A/T
2/-
2/-
A/3
A
A
C
-
T
3/-
5
T/2
2
2
2/-
2
G
C
C
T
-
T/-
-
G
2
3
3
A
C
G
-
-
2
T
G
C
2
T
T
G
G
A
T
2
-
-
-
3/-
-
-
A
G
C
4
G
T
A
C
A
A
A
G
A
G/3
T
-
A
A
T/G
A/G
G/T
G/T
G
G/C
A
G
A
T
A
-
T
4/3
A
T
C
A
T
-
G
A
C
T
-
-
3/-
-
C
-
T
C
A
5
C
C
T
9
A
T
C
T
C
T
A
-
C
C/T
C
2/-
C/G
T/C
G/-
A/2
2/-
C/G
5
G/5
T
A/G
AG/-
A/G
C/T
G/2
A/-
2/-
AC/-
T/C
A
T
A
G
T
C/G
G/2
A/-
A
C
G
A
T
A
A
C
-
-
G
C
3
C
4/-
A
T
-
-
T
A
A/T
C/A
C/-
A/T
2/-
C
G
8/-
-
A
G
5
C/T
C/T
C/T
T
T
T/C
C
C
A
A
C
A
-
T/-
5/-
G
C
G
G/3
A/3
2/-
-
A/T
T/C
A/T
C/T
T/A
-
-
-
-