Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 128,718 (bp)   Positions: 288
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.002
.001
.001
.007
.03
.002
.147
.106
.152
.131
.002
.03
.0
.0
.002
.02
.009
.014
.023
.05
.002
.018
.503
.92
.827
--
--
--
--
--
--
--
.016
.006
.012
.002
--
--
.006
.025
--
--
.001
.021
.013
.0
.012
.051
.0
.002
.002
--
--
--
--
--
.01
.014
.01
.124
.155
.033
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.104
.023
.033
.026
.012
--
--
.057
.04
.013
.063
.013
.061
.002
.066
.061
.003
.021
.006
.006
.046
.008
.078
.003
.002
.008
.069
.403
.045
.022
.001
.0
--
--
--
--
--
.0
.0
.006
--
.095
.001
.0
.003
.037
.014
.007
.022
.036
.588
.03
.006
--
.008
.488
.603
.696
.008
.003
.982
.005
.249
.696
.337
.004
.124
.96
--
.0
.002
.08
.009
.0
.002
.016
.067
.04
.17
.346
.005
.004
.0
.025
.01
.114
.002
.018
.122
--
--
--
--
--
.288
.315
.094
.063
.005
.008
.007
.002
.0
.698
.011
.004
.762
.007
.054
.001
.001
.014
.0
.004
.001
.003
.001
.003
.005
.086
.005
.84
.164
.0
.001
.136
.768
.011
.451
.001
.016
.003
.0
--
--
.028
.049
.009
.003
.032
.028
.997
.001
.019
.017
.061
.054
.222
.016
.039
.144
.989
.0
.008
.005
.06
.0
--
--
.09
.044
.013
.016
.026
.171
.226
.956
.0
.004
.001
.0
.049
.061
.059
.013
.0
.03
.0
.055
.013
.0
.006
.99
.021
.007
.01
.359
.416
.0
.0
--
.0
.009
.012
.033
.007
.019
.106
.001
.011
.886
.078
.598
.001
.002
.001
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
Sptlc3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
T
A
T
A
2
A
T
T
G
T
G
C
C
C
T
C
C
T
T
C
C
G
G
T
G
C
T
A
A
G
G
T
C
C
C
T
T
T
C
C
A
2
G
A
C
C
G
A
15
A
C
G
5
4
G
C
T
G
G
T
T
10
8
T
A
C
A
G
A
G
T
G
A
G
G
T
T
T
2
C
T
A
T
3
A
G
G
T
T
T
A
A
T
C
G
C
A
T
C
A
T
C
A
12
A
A
G
2
4
G
A
A
A
C
A
C
G
C
C
A
T
G
C
2
A
A
G
G
A
G
G
G
A
G
10
T
8
T
A
G
T
A
C
A
T
6
A
C
7
16
T
G
A
G
A
G
T
A
C
T
2
G
C
8
4
A
G
A
T
A
A
T
T
C
G
C
C
G
C
C
C
2
C
C
T
T
T
A
A
10
G
A
C
G
T
G
T
C
A
A
G
T
G
G
A
G
A
T
G
6
G
T
A
G
T
A
G
6
T
T
2
2
C
T
C
T
A
9
A
T
T
A
G
G
G
G
C
A
C
C
A
C
G
T
37
A
A
T
T
T
A
C
A
G
C
C
T
A
9
69
T
T
T
14
3
C
T
C
A
G
G
A
G
T
A
T
C
G
G
T
G
T
T
A
G
T
C
  139,023,925
  139,025,295
  139,025,433
  139,025,892
  139,026,519
  139,027,815
  139,029,168
  139,030,038
  139,030,040
  139,030,288
  139,030,477
  139,030,761
  139,030,820
  139,030,872
  139,031,037
  139,031,156
  139,031,265
  139,031,439
  139,031,446
  139,031,456
  139,031,485
  139,031,514
  139,031,601
  139,031,610
  139,031,655
  139,031,798
  139,031,885
  139,031,929
  139,032,151
  139,032,390
  139,038,402
  139,038,406
  139,038,465
  139,038,500
  139,038,651
  139,039,329
  139,040,036
  139,040,176
  139,040,419
  139,040,457
  139,040,800
  139,040,813
  139,041,037
  139,044,026
  139,044,030
  139,044,758
  139,044,830
  139,044,917
  139,045,042
  139,045,140
  139,045,353
  139,045,793
  139,045,796
  139,045,825
  139,045,826
  139,045,925
  139,046,081
  139,046,109
  139,046,110
  139,046,268
  139,046,272
  139,046,307
  139,046,498
  139,046,500
  139,046,582
  139,046,604
  139,046,816
  139,046,849
  139,047,187
  139,047,196
  139,047,484
  139,047,560
  139,047,816
  139,047,871
  139,048,066
  139,048,091
  139,048,329
  139,048,349
  139,048,449
  139,048,462
  139,048,660
  139,054,082
  139,054,570
  139,054,650
  139,054,706
  139,054,708
  139,054,952
  139,055,494
  139,055,611
  139,056,081
  139,056,084
  139,056,272
  139,056,292
  139,056,307
  139,056,367
  139,056,840
  139,056,853
  139,057,044
  139,057,579
  139,057,784
  139,057,826
  139,058,474
  139,058,564
  139,059,028
  139,059,487
  139,059,561
  139,059,979
  139,060,043
  139,060,059
  139,060,081
  139,061,238
  139,061,958
  139,063,184
  139,063,437
  139,063,688
  139,063,787
  139,063,802
  139,063,993
  139,064,008
  139,064,236
  139,064,899
  139,065,124
  139,065,378
  139,066,175
  139,066,479
  139,066,481
  139,066,639
  139,067,018
  139,067,802
  139,067,816
  139,067,821
  139,067,894
  139,068,173
  139,070,357
  139,074,572
  139,074,731
  139,075,150
  139,075,555
  139,075,622
  139,075,699
  139,076,125
  139,076,187
  139,076,695
  139,077,905
  139,077,968
  139,078,816
  139,078,945
  139,081,117
  139,083,061
  139,083,200
  139,083,323
  139,083,951
  139,084,082
  139,084,239
  139,084,321
  139,084,912
  139,085,732
  139,086,681
  139,087,974
  139,088,252
  139,088,439
  139,088,474
  139,089,347
  139,090,657
  139,091,215
  139,091,219
  139,092,008
  139,092,178
  139,092,864
  139,092,922
  139,093,255
  139,093,583
  139,094,122
  139,094,724
  139,095,074
  139,095,238
  139,095,533
  139,095,566
  139,095,619
  139,095,647
  139,095,686
  139,095,717
  139,095,817
  139,095,847
  139,095,978
  139,096,028
  139,096,092
  139,096,095
  139,096,715
  139,097,300
  139,097,415
  139,097,815
  139,097,823
  139,098,802
  139,098,861
  139,099,180
  139,100,071
  139,100,626
  139,101,012
  139,101,278
  139,101,883
  139,102,271
  139,103,019
  139,103,603
  139,103,782
  139,104,656
  139,104,760
  139,105,185
  139,106,209
  139,106,721
  139,106,777
  139,106,800
  139,106,904
  139,107,672
  139,107,944
  139,111,969
  139,114,909
  139,115,482
  139,115,527
  139,115,855
  139,117,549
  139,117,552
  139,120,147
  139,120,600
  139,123,266
  139,123,268
  139,125,890
  139,126,180
  139,126,181
  139,126,277
  139,127,646
  139,127,790
  139,128,135
  139,128,761
  139,129,301
  139,129,359
  139,129,517
  139,130,597
  139,130,844
  139,131,388
  139,131,402
  139,133,374
  139,133,518
  139,134,788
  139,134,912
  139,134,914
  139,136,603
  139,136,606
  139,136,777
  139,137,161
  139,137,441
  139,137,615
  139,138,773
  139,138,790
  139,138,794
  139,139,312
  139,139,617
  139,139,860
  139,140,011
  139,140,266
  139,140,277
  139,140,421
  139,140,533
  139,140,675
  139,140,852
  139,140,971
  139,141,027
  139,141,030
  139,141,098
  139,141,104
  139,141,418
  139,141,682
  139,141,761
  139,142,298
  139,142,648
  139,142,649
  139,142,660
  139,142,712
  139,142,724
  139,142,971
  139,143,577
  139,144,143
  139,144,911
  139,144,945
  139,145,140
  139,145,582
  139,146,063
  139,149,192
T
G
C
2
2
2/-
G
11
C
GT/3
2
A
T
G
T
C
A
-
C
C
T
T
A
T
G
T
T
-
G
C
T
A
C
T
T
A
C
C
C
T
A
G
-
A
G
3
T
A
G
-
G
T
3
5/-
4/-
A
C/T
C
A
A
C
C
10/-
8/-
2
G
A
4
C
G
T
-
C
G
A
A
2
A
-
-
5
G
G
G
-
A/-
T
C
-
2
A
C
A/-
C
C/T
T
T
G
-
T
4
C
T
G
-
G
C
A
-
-
C
C
C
G
T
G
A
A
T
T
G
C
A
T
-
T
G
C
A
C
T
A
A
G
2
-
C
-
6
C
T
A
G
C/15
G
T/7
-
2
T
-
-
G
A
G
A
17
T
G
5
T
7/3
-
-
A
8/-
-
G
A
-
C
61/63
G
C
C
-
A
T
T
T
T
A
T
-
T
T
-
-
A
G
T
-
A
G
T
A
C
A
C
4
G
G
A
2
A
A
G
T
-
C
A
-
A
2
C
T
T/-
3
G/25
-
G
T/3
2/-
-
T
A
T
C
10
9/-
C
C
T/-
2
A
C
A
A
T
G
7
33
5
T
A
-
-
4
2
C
C
C
G
9
G
A
3
T
C
G
-
-
G
C
C
14/-
-
A
A
T
C
A
A
G
C
2
A/-
G
T
A
C
C
A
7
10
G
2
C
G