Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 118,940 (bp)   Positions: 413
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
--
.008
.005
.105
.058
.482
.294
.999
.002
.006
.182
.172
.292
.189
.089
.075
.003
.137
.06
.199
.002
.018
.109
.018
.016
.031
.001
.001
.0
.016
.914
.004
.264
.964
1.0
.343
.114
.0
.006
.011
.004
.013
.378
.0
.031
.002
.002
.07
.013
.012
.388
.398
.97
.074
.004
.006
.002
.952
.017
.794
--
--
--
--
.0
.001
.001
.001
.001
.992
.101
.008
.515
.11
.001
.031
.031
.02
.039
--
--
.135
.0
.873
.901
.003
.0
.001
.0
.017
.03
.023
.035
.004
.051
.002
.025
.076
.47
.007
.022
.069
--
.003
.336
.001
.092
.079
.005
.0
.001
.036
.0
.007
.0
.008
.008
.725
--
.056
.026
.021
.241
.0
.026
.003
.0
.015
.004
.04
.179
.024
.0
.006
.003
.019
.0
.158
.342
.181
.041
.003
--
--
.004
.011
.036
.002
.0
.003
.009
.001
.025
.013
.009
.026
.004
.002
.536
.603
.059
.001
.002
.0
.001
.008
.001
.0
.007
.004
.003
.019
.016
.005
.658
.072
.057
.165
.019
.01
--
--
--
.055
.142
.983
.008
.001
.19
.051
.0
.0
.018
.078
.105
.395
.001
.226
.449
.004
.009
.0
--
--
--
--
--
--
.002
.001
.443
.109
.008
.005
.0
.034
.012
.152
--
.98
.975
.007
.286
.0
.0
.075
.006
.001
.0
.001
.003
.076
.243
.182
.015
.027
.012
.002
.0
.0
.085
.119
.065
.156
.033
.003
.001
.002
.124
.511
.002
--
.161
.014
.027
.023
.493
.301
.026
.012
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.043
.012
.017
.067
.126
.051
.192
.231
.057
.098
.305
.317
.404
.624
.621
.293
.256
.316
.117
.161
.053
.013
.013
.099
.061
.064
.02
.639
.264
.218
.264
.034
.089
.121
.003
.045
.005
.003
.012
.075
.017
.002
.043
.029
.018
.013
.099
.221
.218
.022
.002
.131
.161
.063
.058
.051
.035
.089
.292
.085
.018
.54
.056
.29
.639
.01
.009
.018
.018
.0
.02
.025
.006
.001
.192
.213
.006
.004
.002
.031
.002
.069
.027
.337
.016
.54
.002
.177
.021
.008
.014
.068
.043
.026
.796
.026
.02
.0
.001
.003
.091
.055
.11
.017
.001
.023
.006
.999
.005
.008
.002
.001
.006
.025
.018
.106
.12
.0
.119
.002
.005
.051
.001
.175
--
--
.535
.005
.012
.0
.005
.001
.048
.04
.0
.007
.001
.982
.858
.798
.749
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
Scn1a
4
A
T
T
G
C
G
2
A
T
A
12
G
C
T
C
A
G
G
G
C
A
C
A
C
A
T
G
A
A
A
A
T
T
A
A
C
G
G
T
T
T
A
A
G
C
T
C
C
C
T
T
C
C
2
T
2
C
C
C
G
A
G
A
C
G
G
T
C
C
C
C
G
6
C
8
8
6
T
A
A
C
A
T
G
G
G
A
T
T
C
T
T
T
C
G
T
C
A
G
C
G
2
G
C
C
A
A
T
A
A
A
C
C
T
6
4
T
C
T
T
C
A
G
G
C
T
T
G
T
T
G
T
T
T
A
A
G
A
2
6
6
G
A
G
A
T
C
T
G
G
A
T
A
A
G
G
T
6
4
A
4
G
C
T
2
T
C
G
T
C
C
A
T
C
T
G
G
A
A
C
6
C
3
C
G
A
C
C
G
T
C
T
G
A
T
G
A
G
A
A
G
G
A
T
2
6
4
G
G
C
T
G
A
G
C
A
16
T
C
T
A
A
G
C
G
C
A
C
A
C
T
A
A
T
C
G
G
T
T
G
G
T
G
G
C
T
C
11
A
C
76
C
G
A
C
C
G
A
A
A
C
G
T
G
2
T
G
A
T
T
G
G
C
A
T
A
C
G
7
T
G
A
G
C
T
A
T
A
C
A
T
A
A
A
G
A
A
T
A
C
T
G
C
A
G
T
T
C
C
A
T
T
A
C
G
C
G
C
A
T
T
G
A
A
T
T
G
A
9
C
A
T
C
T
T
G
T
C
C
G
C
G
G
T
T
T
T
C
A
T
C
G
G
15
T
T
T
C
G
A
T
C
G
T
G
A
2
T
A
G
C
C
T
G
T
G
T
3
G
T
C
G
C
C
T
C
C
3
2
G
C
A
A
T
A
2
10
C
G
C
T
C
A
G
G
A
T
C
A
G
T
A
  59,022,602
  59,023,117
  59,023,295
  59,023,427
  59,024,449
  59,024,566
  59,024,650
  59,025,272
  59,025,371
  59,025,675
  59,025,787
  59,025,789
  59,025,870
  59,026,021
  59,026,119
  59,026,554
  59,026,874
  59,027,519
  59,027,754
  59,027,921
  59,027,937
  59,028,418
  59,031,911
  59,031,940
  59,032,272
  59,032,591
  59,032,682
  59,032,921
  59,033,251
  59,033,726
  59,035,006
  59,035,120
  59,036,085
  59,036,188
  59,036,341
  59,036,425
  59,036,444
  59,036,648
  59,036,710
  59,037,120
  59,037,470
  59,037,531
  59,037,774
  59,038,528
  59,038,603
  59,038,715
  59,038,903
  59,038,956
  59,039,229
  59,039,548
  59,039,894
  59,039,896
  59,040,091
  59,041,032
  59,041,287
  59,041,288
  59,041,473
  59,042,784
  59,042,802
  59,043,438
  59,043,468
  59,043,646
  59,043,757
  59,043,768
  59,043,821
  59,043,823
  59,044,611
  59,044,634
  59,044,725
  59,044,921
  59,045,179
  59,045,420
  59,045,567
  59,045,590
  59,045,993
  59,046,100
  59,046,646
  59,046,648
  59,046,766
  59,047,934
  59,048,118
  59,048,207
  59,048,343
  59,048,421
  59,048,477
  59,048,485
  59,048,914
  59,049,165
  59,049,177
  59,049,389
  59,049,525
  59,049,568
  59,049,594
  59,050,166
  59,050,230
  59,050,289
  59,050,469
  59,050,590
  59,050,847
  59,050,918
  59,051,330
  59,051,393
  59,051,637
  59,051,723
  59,051,910
  59,052,350
  59,052,371
  59,052,372
  59,053,399
  59,054,362
  59,054,384
  59,054,396
  59,054,615
  59,055,328
  59,056,058
  59,056,472
  59,056,474
  59,058,873
  59,058,875
  59,058,946
  59,058,949
  59,058,951
  59,060,061
  59,060,353
  59,061,227
  59,063,873
  59,063,877
  59,064,027
  59,064,648
  59,064,960
  59,065,147
  59,066,934
  59,067,168
  59,067,223
  59,067,539
  59,068,627
  59,068,712
  59,069,855
  59,069,892
  59,070,149
  59,070,834
  59,070,846
  59,071,815
  59,071,922
  59,071,966
  59,072,381
  59,072,465
  59,072,957
  59,073,104
  59,073,624
  59,073,662
  59,074,063
  59,074,548
  59,074,662
  59,074,841
  59,074,972
  59,077,367
  59,077,753
  59,078,220
  59,078,222
  59,078,782
  59,079,737
  59,079,952
  59,079,955
  59,080,292
  59,080,339
  59,080,870
  59,081,798
  59,081,821
  59,082,414
  59,083,266
  59,083,319
  59,083,432
  59,083,600
  59,084,168
  59,084,341
  59,084,460
  59,084,487
  59,084,544
  59,084,598
  59,084,946
  59,085,039
  59,085,096
  59,085,359
  59,085,416
  59,086,095
  59,086,203
  59,086,306
  59,086,553
  59,086,611
  59,087,136
  59,087,137
  59,087,396
  59,087,620
  59,087,656
  59,087,749
  59,088,145
  59,088,366
  59,088,592
  59,089,229
  59,089,768
  59,089,941
  59,090,215
  59,090,489
  59,092,053
  59,092,073
  59,092,080
  59,092,088
  59,092,096
  59,092,122
  59,092,336
  59,092,351
  59,092,513
  59,092,591
  59,092,909
  59,093,144
  59,093,427
  59,093,611
  59,093,669
  59,093,743
  59,093,764
  59,093,991
  59,094,028
  59,094,234
  59,094,289
  59,094,338
  59,094,498
  59,094,587
  59,094,656
  59,095,091
  59,095,295
  59,095,375
  59,095,402
  59,095,432
  59,095,477
  59,095,716
  59,095,881
  59,095,983
  59,096,040
  59,096,041
  59,096,195
  59,096,372
  59,096,404
  59,096,486
  59,096,745
  59,096,800
  59,096,834
  59,096,848
  59,096,930
  59,097,056
  59,097,488
  59,097,761
  59,098,246
  59,098,551
  59,098,657
  59,098,661
  59,098,823
  59,098,975
  59,099,145
  59,099,167
  59,099,363
  59,099,382
  59,099,468
  59,099,489
  59,099,529
  59,099,533
  59,099,536
  59,099,537
  59,099,583
  59,099,584
  59,099,643
  59,099,682
  59,099,777
  59,101,435
  59,101,481
  59,101,586
  59,101,611
  59,101,626
  59,101,826
  59,101,867
  59,101,921
  59,101,936
  59,102,012
  59,102,013
  59,102,016
  59,102,033
  59,102,034
  59,102,057
  59,102,069
  59,102,075
  59,102,097
  59,102,101
  59,102,246
  59,102,297
  59,102,298
  59,102,320
  59,102,364
  59,102,530
  59,102,562
  59,102,597
  59,102,620
  59,102,647
  59,102,668
  59,102,729
  59,102,751
  59,102,882
  59,102,895
  59,102,927
  59,102,939
  59,102,987
  59,102,993
  59,103,045
  59,103,080
  59,103,114
  59,103,333
  59,103,443
  59,103,569
  59,103,672
  59,103,751
  59,103,770
  59,103,851
  59,103,922
  59,103,934
  59,104,221
  59,104,240
  59,104,269
  59,104,336
  59,104,338
  59,104,551
  59,104,617
  59,104,646
  59,104,996
  59,105,693
  59,105,773
  59,105,836
  59,106,261
  59,106,646
  59,108,437
  59,108,810
  59,108,884
  59,108,903
  59,111,155
  59,111,455
  59,111,493
  59,113,271
  59,114,945
  59,115,006
  59,115,007
  59,116,230
  59,116,363
  59,116,368
  59,116,378
  59,116,750
  59,117,443
  59,117,487
  59,117,536
  59,118,011
  59,118,149
  59,118,238
  59,118,364
  59,119,061
  59,119,488
  59,119,912
  59,119,997
  59,120,116
  59,120,310
  59,120,462
  59,121,792
  59,122,438
  59,123,289
  59,123,583
  59,124,963
  59,125,018
  59,125,294
  59,125,322
  59,125,764
  59,126,241
  59,126,795
  59,126,886
  59,127,551
  59,127,996
  59,128,162
  59,128,205
  59,128,232
  59,128,304
  59,128,370
  59,128,391
  59,128,504
  59,128,734
  59,129,152
  59,129,256
  59,129,653
  59,129,937
  59,130,114
  59,130,339
  59,130,719
  59,131,167
  59,131,193
  59,131,572
  59,131,884
  59,132,552
  59,132,660
  59,132,831
  59,132,975
  59,133,597
  59,133,827
  59,134,204
  59,134,774
  59,134,905
  59,135,149
  59,135,380
  59,135,423
  59,135,440
-
G
A
-
A
T
A
-
2
C
T
-
11
T
C
2
13
2
A
2
T
G
2
C
T
G
C
A
T
T
13
G
2
C
G
2
T
C
T
C
-
A
T
G
A
T
C
T
T
T
A
A
T
T
2/-
T/-
-
T
A
12
A
G
A
G
2
T
A
C
T
T
G
A
T
-
T
-
8/-
6/-
C
G
G
T
G
C
A
A
A
G
C
A
T
C
A
C
T
A
G
A
3
A
T
A
-
A
5
T
T
C
T/66
T
2
2
-
T
C
6/-
4/-
2
73
2
2
2
G
A
5
A
C
-
T
-
C
A
G
C
C
2
G
A
-
-
-
-
A
8
A
3
-
T
C
3
T
G
-
-
C
A
A
C
6/-
4/-
G
4/-
A
A
G
-
-
T
-
A
2
T
G
-
T
C
A
A
9
G
2
-
T
-
5
C
2
T
T
3
C
A
C
A
2
C
A
-
T
G
C
C
A
G
G
2/-
-
-
T
A
G
-
A
G
A
T
-
-
9
36
100
C
G
A
G
T
T
G
G
T
G
C
G
C
A
A
T
C
2
22
2
-
3
2
A
G
G
T
-
13
G
76/-
G
4
T
G
T
T
G
C
C
A
A
C
A
-
3
A
G
A
C
A
A
T
T
G
G
T
10
-
C
A
C
A
T
3
4
C
4
T
2
17
G
T
G
A
G
G
C
G
T
C
A
G
T
11
C
G
A
T
C
A
G
T
T
-
T
A
G
G
C
A
2
T
3
A
-
A
-
-
T
G
A
T
C
C
A
C
T
T
A
T
A
G/4
A
G
2
10
A
2
C
G
2
T
15/-
3
C
21
A
-
G
G
T
2
C
6
G
-
C
G
A
A
T
A
A
G
A
C
-
A
-
T
A
T
A
2
T
T
-
-
A
G
G
G
2
4
-
-
T
A
T
C
A
C
T
A
T
C
T
G
22
2
G