Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 210,232 (bp)   Positions: 313
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.039
--
.462
.506
.107
.026
.012
.111
.024
.684
.094
.001
.01
.015
.011
.003
.049
.628
.136
.973
.002
.033
.061
.002
--
--
--
--
--
--
.102
.246
.006
.011
.03
.005
.14
.005
.006
.007
.113
.123
.134
.002
.032
.067
.039
.006
.033
--
--
--
--
--
--
--
.047
.011
.016
.802
.795
.001
.001
.07
.012
.004
.155
.0
--
.006
.062
.134
.062
.064
.43
.475
.189
--
--
--
--
.052
.001
.044
.152
.067
.005
.203
.004
.997
.998
.007
.04
.0
.001
.015
.021
.091
.538
.001
.011
1.0
.783
.237
.0
.104
.003
.318
.493
.0
.327
.486
.062
.0
.022
.275
.0
.006
.045
.005
.003
1.0
.25
.022
.0
.182
.087
.079
.047
.019
.002
.002
.003
.001
.006
.0
.0
.004
.002
.234
.051
.016
.001
.068
.056
.148
.042
.995
.011
.016
.918
1.0
.054
.09
.641
.001
.071
.119
.001
.001
.0
.003
.009
.004
.072
.0
.52
.52
.459
.005
.002
.0
.662
.0
.0
.006
.01
.156
.0
1.0
.001
.0
.041
.01
.033
.021
.108
--
.107
--
.003
.054
.134
.0
.0
.0
.001
.001
.001
.044
.01
.004
.006
.005
.003
.001
.002
.002
.003
.002
.003
.001
.006
.003
.001
.001
.001
.002
.002
.223
.097
.001
.09
.045
.031
.05
.003
.012
.008
.268
.138
.005
.054
.225
.05
.082
.126
.303
.014
--
.026
.002
.671
.012
.011
.361
.007
.007
.006
.001
.004
.001
.106
.006
.037
--
.708
.156
.125
.901
.0
.059
.083
.007
.0
.003
.167
.579
.001
.001
.0
.014
.047
.001
.012
.005
.001
.0
.0
.065
--
.234
.231
--
.007
.001
.025
.003
--
--
--
.039
.002
.1
.28
.986
.02
.042
--
.031
.025
.0
.463
.974
.492
.906
.878
.026
.059
.1
.028
.08
.303
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Runx2
Supt3h
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
T
3
T
C
T
T
G
T
3
6
G
C
A
T
C
T
C
T
T
C
4
A
A
5
10
2
6
12
A
C
T
G
C
G
C
T
A
3
A
A
11
T
G
A
T
T
G
C
T
G
T
A
T
C
G
C
G
14
13
A
C
G
T
G
A
C
A
G
T
G
2
T
G
C
C
T
G
16
12
T
A
G
G
T
A
2
10
C
C
A
C
G
C
T
T
3
4
T
G
3
3
T
C
T
C
G
A
C
T
2
4
C
G
T
A
T
C
T
C
A
C
T
2
T
4
2
C
A
G
A
2
6
T
G
T
T
T
C
C
C
C
8
G
G
C
A
A
T
T
T
G
T
A
A
8
8
T
C
T
G
T
T
A
C
T
T
T
20
18
T
G
C
T
T
2
G
C
A
A
T
6
4
10
8
T
C
A
G
T
A
G
A
T
12
10
A
G
G
T
C
T
T
A
T
T
T
G
2
A
C
G
G
G
C
A
A
T
G
T
A
T
T
C
6
2
C
G
T
A
G
2
C
C
G
C
C
8
T
G
G
T
C
T
C
G
T
A
C
G
G
G
T
C
G
T
T
T
T
T
3
4
18
T
4
G
G
T
A
C
6
T
C
A
C
A
T
G
T
G
C
T
T
2
C
C
4
2
G
T
C
G
C
10
G
T
T
G
G
6
G
5
4
T
8
6
T
G
C
A
T
C
  17,476,300
  17,491,149
  17,491,302
  17,491,310
  17,491,536
  17,491,780
  17,491,939
  17,492,193
  17,492,521
  17,492,883
  17,493,456
  17,493,933
  17,494,034
  17,494,612
  17,494,615
  17,494,688
  17,494,727
  17,494,855
  17,494,934
  17,494,946
  17,495,094
  17,495,577
  17,495,631
  17,496,738
  17,497,563
  17,497,565
  17,497,573
  17,497,604
  17,497,610
  17,497,630
  17,497,655
  17,498,029
  17,498,970
  17,499,047
  17,500,096
  17,500,681
  17,500,896
  17,501,024
  17,501,050
  17,501,058
  17,501,078
  17,501,082
  17,501,100
  17,501,910
  17,502,083
  17,502,110
  17,502,124
  17,502,132
  17,502,682
  17,502,832
  17,503,135
  17,503,440
  17,503,822
  17,504,118
  17,505,397
  17,505,805
  17,506,448
  17,506,587
  17,507,977
  17,509,977
  17,509,978
  17,510,496
  17,510,790
  17,512,330
  17,512,668
  17,513,430
  17,513,965
  17,514,299
  17,514,618
  17,515,268
  17,515,526
  17,515,536
  17,515,960
  17,515,961
  17,516,364
  17,517,117
  17,517,198
  17,517,631
  17,517,923
  17,518,322
  17,518,326
  17,518,492
  17,523,013
  17,523,155
  17,523,791
  17,524,032
  17,524,575
  17,524,693
  17,524,975
  17,525,818
  17,525,819
  17,526,814
  17,526,844
  17,527,002
  17,527,367
  17,527,559
  17,528,227
  17,528,402
  17,528,772
  17,529,164
  17,529,179
  17,529,556
  17,529,601
  17,530,110
  17,531,006
  17,532,418
  17,532,477
  17,532,505
  17,532,593
  17,532,749
  17,533,426
  17,533,432
  17,533,733
  17,533,835
  17,533,965
  17,534,142
  17,534,752
  17,534,802
  17,534,857
  17,534,881
  17,535,131
  17,535,443
  17,535,719
  17,536,052
  17,536,439
  17,536,737
  17,537,021
  17,537,023
  17,537,171
  17,537,376
  17,537,555
  17,537,633
  17,537,636
  17,537,639
  17,537,917
  17,537,920
  17,538,017
  17,538,244
  17,538,253
  17,538,344
  17,538,395
  17,538,587
  17,538,832
  17,538,930
  17,538,955
  17,540,703
  17,540,763
  17,541,127
  17,541,279
  17,541,623
  17,542,257
  17,542,289
  17,542,573
  17,542,719
  17,543,063
  17,543,150
  17,543,330
  17,543,393
  17,543,916
  17,544,360
  17,544,669
  17,544,774
  17,544,829
  17,544,935
  17,545,534
  17,546,459
  17,547,125
  17,547,126
  17,547,128
  17,547,998
  17,548,000
  17,549,249
  17,550,994
  17,551,202
  17,551,425
  17,551,512
  17,552,852
  17,553,029
  17,553,346
  17,553,569
  17,555,287
  17,555,466
  17,557,550
  17,557,552
  17,559,627
  17,559,629
  17,559,802
  17,560,967
  17,561,149
  17,561,224
  17,561,750
  17,563,616
  17,564,551
  17,564,716
  17,564,931
  17,565,964
  17,565,966
  17,566,049
  17,566,265
  17,569,251
  17,569,258
  17,569,260
  17,569,263
  17,569,264
  17,569,266
  17,569,267
  17,569,270
  17,569,274
  17,569,278
  17,569,291
  17,569,296
  17,569,301
  17,569,309
  17,569,310
  17,569,315
  17,569,319
  17,569,320
  17,569,324
  17,569,325
  17,569,504
  17,570,188
  17,572,192
  17,572,223
  17,573,205
  17,575,874
  17,576,576
  17,580,087
  17,580,780
  17,581,341
  17,581,495
  17,581,537
  17,581,576
  17,582,503
  17,582,623
  17,582,654
  17,582,868
  17,582,976
  17,583,256
  17,583,897
  17,584,986
  17,585,935
  17,586,095
  17,587,655
  17,588,843
  17,589,193
  17,589,628
  17,589,663
  17,589,839
  17,590,550
  17,592,267
  17,592,995
  17,593,018
  17,593,348
  17,595,284
  17,596,621
  17,596,936
  17,598,495
  17,598,605
  17,600,193
  17,600,764
  17,601,300
  17,601,314
  17,601,419
  17,601,464
  17,601,890
  17,602,846
  17,604,031
  17,604,040
  17,604,198
  17,604,530
  17,605,156
  17,605,219
  17,605,799
  17,606,502
  17,606,918
  17,608,625
  17,611,515
  17,613,846
  17,613,954
  17,614,435
  17,615,632
  17,616,930
  17,616,996
  17,621,139
  17,622,082
  17,622,825
  17,625,184
  17,625,230
  17,626,138
  17,626,235
  17,626,416
  17,627,344
  17,631,630
  17,633,184
  17,636,905
  17,638,421
  17,639,398
  17,639,602
  17,640,057
  17,640,354
  17,643,209
  17,643,413
  17,643,724
  17,643,725
  17,644,261
  17,644,406
  17,644,407
  17,645,774
  17,646,052
  17,650,899
  17,651,562
  17,652,217
  17,655,052
T
2
C
-
G
T
C
C
A
C
-
-
A
T
A/-
C
T
G
G
2
C
T
-
G
-
-
-
-
-
-
T
T
A
A
-
-
4
C
C
-
C
C
-
2
C
2
C
C
A
-
G
4
C
3
C
G
A
A
T
14/-
13/-
G
A
C
G
2
G
T
3/4
T
-
3
2/-
T/-
A
T
T
C
A
16/-
-
C
G
T
A
C
-
-
10/-
T
A
G
7/5
A
26
4
TA/3
-
-
A
A
-
-
C
T
G
-
A
G
T
C
-
-
T
2
2
41
3
3
-
T
-
T
2
-
A
4/-
2/-
-
G
T
G
-
-
C
T
C
A
C
2
T
T
T
-
A
T
T
C
G
-
C
C
A
77
G
G
-
-
C
T
C
2
C
A
-
T
2
2
C
20/-
18/-
A
3
T
C
2
-
C
G
4
G
C
6/-
4/-
10/-
8/-
C
3
9/7
2
C
2
A
T
C
12/-
10/-
G
A
3
G
A
A
A
C
A
A
C
A
-
3
T
T
C
A
G
C
G
C
C
11
G
C
C
3
6/-
-
T
-
C
C
A
-
T
T
A
T
17
8/-
2
A
A
C
G
C
T
A
C
G
T
A
2
T
TG/3
T
4
-
C
3
C
C
-
-
-
C
-
G/2
T
C
G
T
-
9
T
G
T
G
C
A
A
12
A
C
5/7
2/-
A
T
-
2/-
A
13
T
A
T
-
G/5
A
C
A
A
-
T
5/-
4/-
C
8/-
6/-
4
A
C/2
-
C
C/2