Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 92,941 (bp)   Positions: 229
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
RGSC 3.4  
.76
.782
.003
.014
.0
.001
.0
.111
.099
.0
.714
.0
.002
.004
.002
.002
.012
.001
.028
.096
.046
.393
.7
.007
.002
.276
.304
.0
.0
.072
.017
.002
.001
.006
.006
.001
.01
.001
.122
1.0
.0
.001
.023
.023
.01
.001
.442
.0
.0
1.0
.0
.0
.001
.0
.004
.002
.0
.0
.037
.002
.061
.052
.001
.136
.293
.0
.0
.0
.448
.005
.018
--
.503
.779
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.006
.0
.001
.04
1.0
.989
.0
.0
.0
.0
.022
1.0
.52
.002
.071
.0
.017
.0
.0
.0
.079
.0
.0
.0
.001
.0
.997
.0
.712
.966
.0
.0
.033
.001
.0
.99
.0
.003
.015
.017
.019
.0
.0
.003
.004
.0
.0
.001
.0
.005
.667
.003
.002
.005
.0
.01
.819
.305
.001
.0
.0
.014
.001
.001
.001
1.0
.063
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
.151
.004
.017
.007
.012
.007
.374
.001
.0
.626
.012
.009
.023
--
.056
.009
.002
--
.009
.001
--
.009
.003
.004
.096
.001
.998
.013
.004
.007
.007
.007
.116
.003
.011
.046
.002
.001
.001
.0
.085
.0
.002
.086
.0
.0
.981
.846
.001
.0
.001
.002
.255
.212
.025
.001
.001
.0
.002
.001
.003
.001
.859
.086
.001
.0
.003
.0
.0
.001
.374
.0
.992
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
Rpgrip1l
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
C
A
A
A
A
C
T
G
T
A
A
T
T
T
T
T
G
C
C
T
A
C
A
G
A
C
T
C
C
T
G
A
G
G
G
C
G
C
A
A
C
T
A
T
C
A
G
G
T
A
T
T
G
A
T
T
G
C
T
T
G
A
C
A
G
C
A
G
C
T
C
C
T
G
C
A
A
C
A
C
A
A
G
T
T
C
A
A
G
G
G
A
G
T
T
A
G
G
G
T
C
T
G
G
A
G
G
C
G
A
A
A
A
T
T
G
G
G
G
G
G
C
G
G
T
C
T
G
T
C
C
G
C
T
G
T
G
A
G
G
A
A
T
G
T
A
C
T
G
A
G
T
G
G
G
A
A
G
C
G
G
A
T
C
A
G
G
G
C
G
C
T
G
T
A
C
T
T
T
C
G
T
G
A
C
T
C
C
C
A
T
A
A
A
A
C
G
G
T
G
A
T
A
A
A
T
G
C
A
G
G
A
A
C
T
G
A
T
G
G
A
C
A
C
G
G
T
  16,860,148
  16,860,152
  16,860,436
  16,862,029
  16,864,020
  16,865,653
  16,866,140
  16,867,810
  16,867,811
  16,867,861
  16,868,760
  16,868,901
  16,868,926
  16,869,073
  16,869,604
  16,869,625
  16,869,919
  16,870,245
  16,870,296
  16,870,362
  16,870,460
  16,870,542
  16,870,663
  16,871,185
  16,871,219
  16,872,007
  16,872,124
  16,872,240
  16,872,836
  16,872,868
  16,873,657
  16,873,713
  16,874,060
  16,874,693
  16,874,821
  16,875,773
  16,876,023
  16,876,188
  16,876,333
  16,876,547
  16,877,662
  16,878,148
  16,878,190
  16,878,191
  16,878,345
  16,879,105
  16,879,278
  16,879,374
  16,879,551
  16,879,693
  16,880,288
  16,880,324
  16,880,928
  16,881,257
  16,881,265
  16,882,274
  16,882,552
  16,882,906
  16,883,191
  16,883,303
  16,883,425
  16,883,426
  16,883,882
  16,884,183
  16,884,215
  16,884,344
  16,884,602
  16,884,676
  16,884,881
  16,885,034
  16,885,281
  16,885,379
  16,885,577
  16,885,822
  16,886,145
  16,886,807
  16,886,817
  16,886,869
  16,887,423
  16,887,645
  16,887,745
  16,887,821
  16,887,916
  16,888,447
  16,888,847
  16,888,914
  16,889,099
  16,889,140
  16,889,146
  16,889,163
  16,889,692
  16,890,080
  16,890,415
  16,891,204
  16,891,443
  16,892,148
  16,892,389
  16,892,491
  16,892,677
  16,892,690
  16,892,909
  16,893,649
  16,894,063
  16,894,069
  16,894,088
  16,894,274
  16,894,793
  16,895,422
  16,897,206
  16,897,575
  16,897,738
  16,897,748
  16,898,293
  16,899,200
  16,899,461
  16,899,955
  16,900,065
  16,900,535
  16,900,651
  16,900,659
  16,900,749
  16,901,395
  16,901,409
  16,901,514
  16,902,249
  16,902,262
  16,902,296
  16,903,826
  16,903,842
  16,903,877
  16,904,308
  16,904,919
  16,904,960
  16,905,023
  16,905,084
  16,905,274
  16,908,201
  16,908,250
  16,908,516
  16,909,096
  16,909,257
  16,909,313
  16,909,811
  16,909,816
  16,909,883
  16,910,716
  16,911,712
  16,912,005
  16,912,395
  16,912,499
  16,912,500
  16,913,436
  16,913,510
  16,913,523
  16,915,052
  16,915,190
  16,915,724
  16,915,921
  16,916,001
  16,916,590
  16,917,113
  16,917,309
  16,917,674
  16,918,379
  16,918,667
  16,918,880
  16,919,636
  16,919,639
  16,920,083
  16,920,411
  16,921,292
  16,922,216
  16,922,287
  16,922,997
  16,923,926
  16,924,051
  16,925,750
  16,925,812
  16,925,914
  16,925,921
  16,926,194
  16,926,644
  16,927,538
  16,928,116
  16,928,589
  16,928,613
  16,928,651
  16,928,652
  16,929,287
  16,930,050
  16,930,188
  16,930,552
  16,931,040
  16,932,016
  16,932,406
  16,932,808
  16,933,565
  16,933,932
  16,933,996
  16,934,216
  16,934,249
  16,934,250
  16,934,280
  16,935,041
  16,936,380
  16,936,412
  16,936,985
  16,937,180
  16,937,931
  16,937,939
  16,938,918
  16,939,044
  16,940,084
  16,940,941
  16,941,490
  16,942,023
  16,942,261
  16,942,553
  16,943,081
  16,943,257
  16,944,048
  16,944,728
  16,945,310
  16,945,326
  16,945,327
  16,945,715
  16,945,874
  16,948,587
  16,950,492
A
A
T
G
G
G
G
T
C
A
G
C
G
C
C
A
G
G
A
T
T
G
G
A
C
T
C
T
C
A
T
C
A
C
A
A
T
A
A
G
G
T
T
C
G
C
T
T
A
T
C
G
C
C
A
G
C
G
T
T
A
G
A
T
A
G
T
G
G
A
T
A
T
A
C
A
T
G
G
G
C
T
G
G
A
C
C
A
G
G
A
A
C
G
A
C
C
T
A
A
A
C
T
C
A
A
G
A
A
T
G/A
G
T
C
G
A
C
A
G/A
G/A
C
A
C
T
A
C
A
T
C
A
C
G
T
A
T
C
A
C
A
G
A
A
C
G
A
A
A
T
T
C
A
G
C
C
A
A
C
C
G
A
T
A
A
G
G
A
A/G
A
A
A
T
C
G
C
A
C
G
T
C
A
C
T
A
C
T
C
T
G
A
A
T
G
C
G
G
G
G
T
A
T
C
A
G
C
G
T
G
C
A
T
G
T
A
T
G
T
C
C
C
G
A
T
G
T
G
T
T
T
C