Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 155,504 (bp)   Positions: 228
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
RGSC 3.4  
.0
.02
.09
--
.035
.0
.011
.003
.0
.006
1.0
.995
.377
.0
.963
.105
.012
--
.001
.006
.003
.31
.004
.0
.001
--
--
.012
.0
--
--
--
--
.023
--
--
--
--
.0
.931
--
--
.003
.001
.001
.001
--
--
.002
.001
--
.03
1.0
.224
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.003
.979
.01
.0
.003
.002
.0
.0
.001
.0
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.029
.001
.004
--
.0
.003
.884
.002
.009
.001
.102
.004
.001
.002
.166
.238
.0
.005
.017
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
.013
.0
.005
.008
--
.0
.019
.0
.0
.002
.008
.027
.99
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.003
.001
.0
.002
.001
.661
.0
.001
.001
.06
.005
--
--
.0
.612
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.002
--
.0
.007
.009
.007
.001
.001
.009
.003
.0
.0
.0
.0
.001
.023
.002
--
.006
.009
--
--
.008
.004
.008
.024
.007
.004
.604
.014
--
--
--
.0
.0
.0
.005
.009
.133
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC100911055
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
Ros1
C
A
T
A
C
A
G
T
C
T
G
G
T
A
T
T
A
C
C
C
C
A
A
A
G
G
A
C
T
C
A
A
C
A
A
A
C
A
G
G
T
A
G
G
A
A
G
C
A
G
A
A
G
T
C
A
A
G
T
G
T
G
C
G
G
C
C
C
A
T
T
T
A
A
A
T
C
G
C
G
G
G
T
A
C
G
C
C
T
T
A
G
C
A
C
A
G
T
A
G
C
C
T
T
C
G
G
C
G
T
T
A
A
G
G
G
C
T
A
A
A
C
T
T
T
A
C
A
G
G
T
T
T
T
T
T
G
A
G
C
T
G
G
T
T
G
A
C
A
A
C
C
T
G
G
C
C
G
A
G
T
G
A
A
C
C
T
A
A
A
T
G
G
C
A
A
C
C
G
C
A
T
G
G
C
T
A
G
T
A
C
A
C
G
C
G
G
A
C
A
G
G
T
G
C
A
T
A
G
A
T
C
C
G
A
C
C
C
C
C
G
C
T
A
C
T
T
A
  30,755,305
  30,757,776
  30,762,575
  30,763,940
  30,769,077
  30,770,528
  30,772,944
  30,778,062
  30,780,938
  30,781,028
  30,781,453
  30,781,521
  30,782,021
  30,782,585
  30,784,973
  30,792,911
  30,793,600
  30,794,589
  30,795,574
  30,795,582
  30,795,586
  30,796,168
  30,796,387
  30,796,467
  30,796,475
  30,797,504
  30,797,532
  30,797,903
  30,798,092
  30,798,857
  30,798,982
  30,798,983
  30,798,986
  30,799,024
  30,801,374
  30,805,834
  30,808,060
  30,808,061
  30,809,675
  30,810,143
  30,812,444
  30,812,646
  30,815,288
  30,815,542
  30,815,783
  30,818,955
  30,819,593
  30,819,598
  30,821,414
  30,822,492
  30,823,437
  30,830,539
  30,830,917
  30,833,526
  30,836,135
  30,837,059
  30,837,079
  30,837,276
  30,837,277
  30,837,285
  30,838,304
  30,838,608
  30,840,914
  30,840,941
  30,841,084
  30,841,705
  30,841,864
  30,841,954
  30,842,711
  30,842,983
  30,843,469
  30,843,791
  30,844,707
  30,845,339
  30,845,665
  30,845,695
  30,846,319
  30,846,595
  30,847,200
  30,847,295
  30,847,600
  30,848,550
  30,848,849
  30,849,126
  30,849,533
  30,849,991
  30,851,686
  30,853,033
  30,855,547
  30,855,909
  30,856,715
  30,859,686
  30,859,967
  30,860,428
  30,861,170
  30,862,238
  30,862,433
  30,862,435
  30,862,521
  30,862,562
  30,863,301
  30,863,366
  30,864,829
  30,864,954
  30,865,021
  30,865,025
  30,865,138
  30,866,220
  30,866,486
  30,866,587
  30,866,668
  30,866,690
  30,868,182
  30,869,685
  30,870,384
  30,871,357
  30,873,873
  30,874,756
  30,874,924
  30,874,955
  30,874,967
  30,875,401
  30,875,443
  30,876,811
  30,877,530
  30,878,038
  30,878,885
  30,879,034
  30,880,341
  30,880,342
  30,880,716
  30,880,722
  30,881,160
  30,881,352
  30,881,354
  30,881,418
  30,881,421
  30,881,425
  30,881,443
  30,881,446
  30,881,451
  30,881,526
  30,882,281
  30,882,498
  30,882,694
  30,882,711
  30,882,788
  30,882,926
  30,882,940
  30,882,992
  30,883,001
  30,883,258
  30,883,279
  30,883,282
  30,883,521
  30,883,627
  30,883,976
  30,886,607
  30,886,920
  30,887,157
  30,887,259
  30,887,440
  30,887,781
  30,887,831
  30,888,022
  30,888,071
  30,888,078
  30,888,573
  30,888,974
  30,890,125
  30,890,133
  30,891,240
  30,891,298
  30,892,051
  30,892,436
  30,892,745
  30,892,780
  30,892,786
  30,892,788
  30,892,795
  30,892,805
  30,892,827
  30,892,828
  30,892,829
  30,893,698
  30,893,860
  30,894,717
  30,894,734
  30,895,244
  30,895,870
  30,896,120
  30,896,324
  30,897,474
  30,898,363
  30,898,662
  30,898,827
  30,899,085
  30,899,091
  30,899,514
  30,899,526
  30,899,632
  30,899,664
  30,899,764
  30,900,000
  30,900,015
  30,900,106
  30,900,141
  30,900,194
  30,900,449
  30,900,477
  30,901,751
  30,901,847
  30,902,042
  30,902,106
  30,902,514
  30,902,909
  30,903,118
  30,903,175
  30,904,707
  30,905,391
  30,906,998
  30,907,999
  30,908,012
  30,908,856
  30,908,963
  30,909,246
  30,909,267
  30,909,275
C/T
A/C
T/G
A/G
C/T
A/G
G/C
T/C
C/T
T/A
G/A
G/A
T/A
A/G
T/C
T/C
A/G
C/T
T
T
A
A/T
A/G
A/G
G/A
G/C
A/G
C/T
T/C
C/T
A/T
A/G
C/T
A/T
A/C
A/C
C/T
A/G
G/A
G/C
T/C
A/G
G/A
G/A
A/T
A/C
G/A
C/G
A/G
G/A
A/C
A/C
G/A
T/C
C/T
A/C
A/G
G/C
T/C
G/A
T/C
G/A
C/T
G/A
G/T
C/T
T
A
A/G
T/C
T/C
T/C
A/G
A/G
A/C
T/C
C/T
G/C
T
G/A
G/A
G/A
T/G
A/G
C/T
G/A
C/T
C/T
T/C
T/G
A/G
G/T
C/T
A/G
C/T
A/G
G/T
T/C
A/T
G/A
C/G
C/T
T/C
T/C
C/T
G/A
G/T
C/T
G/C
T/C
T/C
A/G
A/G
G/A
G/A
G/A
C/A
T/A
A/T
A/C
A/C
C/T
T/C
T/A
T/C
A/G
C/T
A/G
G/T
G/T
T/C
T/C
T/C
T/A
T/C
T/C
G/A
A/C
G/C
C/T
T/C
G/A
G/A
T/A
T/G
G/A
A/T
C/G
A/G
A/C
C/T
C/T
T/C
G/C
G/A
C/T
C/T
G/T
A/G
G/A
T/C
G/A
A/G
A/G
C/T
C/T
T/A
A/G
A/T
A/T
T/A
G/A
G/T
C/T
A/G
A/G
C/T
C/T
G/A
C/A
A/G
T/A
G/A
G/C
C/A
T/C
A/G
G/A
T/G
A/G
C/A
G
C/T
G/C
C/T
G/A
G/A
A/G
C/A
A/T
G/C
G/A
T/G
G/A
C/A
A/G
T/C
A/C
G/A
A/G
T/A
C/T
C/T
G/A
A/G
C/A
C/G
C/T
C/T
C/T
G/A
C/A
T/C
A/G
C/T
T/C
T/C
A/G