Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 160,282 (bp)   Positions: 377
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.018
.194
.069
.845
--
--
--
--
--
.006
--
--
--
.042
.354
.092
.022
.003
.004
.009
.023
.0
.0
.029
1.0
.323
.038
.009
.163
.005
.013
.013
.009
.133
.035
.002
.986
.0
.002
.0
.001
.0
.995
.003
.017
.089
.019
.01
.012
.002
.06
.031
.067
.326
.043
--
.001
.087
.068
.001
.0
.04
.021
.005
.014
.001
.001
.002
.287
.273
.039
.021
.038
.008
.039
.007
.023
.057
.001
--
--
--
--
--
--
--
.019
.087
.032
.004
1.0
.008
--
--
--
--
--
.0
.0
.015
.075
.055
.043
.004
.004
.053
.012
.006
.001
.139
.141
.162
.007
.008
--
--
.026
.051
.008
.021
.112
.004
.005
.227
.017
.001
.016
.09
.498
.002
.026
.716
.0
.028
.01
.3
.009
--
--
--
.019
.018
.011
.059
--
--
.013
.087
.019
.205
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.002
--
.028
.091
.004
.306
--
--
--
--
--
--
--
.0
.007
.003
.0
.002
.066
.072
.034
.018
.338
.003
.005
.026
--
--
--
--
.04
.028
.021
.013
.99
.009
.013
.012
--
.001
.003
.002
--
.001
.011
.004
.0
.0
.097
.02
.001
.002
.004
.08
.025
.006
.06
.0
.0
.0
.0
.027
.992
.99
.005
.005
.169
.662
--
.0
.01
.154
.007
.001
.015
.081
.103
.101
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.009
.095
.0
.0
.002
.037
.096
.005
.005
.01
.01
.001
.004
1.0
.063
.127
.014
.001
.017
.001
.029
.0
.0
.043
--
--
--
--
--
--
--
.053
.052
.076
.042
.054
.044
--
.046
.071
.001
.004
.002
.125
.002
.025
.15
.14
.042
.027
.018
.0
.055
.015
.511
.018
.027
.0
.0
.148
.006
.012
.987
.173
.001
.117
.011
.002
.004
.009
.0
.002
.011
.047
.02
.013
.006
.018
.054
.024
.223
.212
.099
.003
.064
.01
.003
.227
.372
.066
.03
.0
.023
.003
.001
.0
.0
.004
.0
.019
.0
.0
.0
.002
.0
.0
.004
.001
.002
.008
.001
.003
.0
.001
.01
.023
.005
.181
.112
.059
.069
.008
.001
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
4
C
T
G
A
4
G
C
A
3
2
T
T
G
T
C
C
G
T
T
G
C
T
A
G
T
C
A
A
C
T
G
G
C
A
C
T
G
C
G
C
G
A
T
A
G
A
T
G
11
A
A
T
A
C
T
C
T
A
C
T
A
A
C
T
A
A
T
4
T
4
A
T
C
2
C
G
T
G
8
C
C
10
2
T
T
T
A
6
C
A
G
G
T
A
A
G
8
G
2
2
G
T
C
C
T
G
T
G
T
T
C
A
C
A
T
G
C
G
C
A
C
G
T
G
T
A
G
C
T
G
G
A
G
G
C
3
T
A
T
T
T
G
2
4
G
C
C
A
G
A
T
G
A
T
A
C
A
A
G
C
A
T
G
T
T
T
T
T
T
T
T
T
C
T
7
T
C
C
T
A
G
T
T
T
A
G
G
G
A
A
C
C
C
C
4
2
C
A
C
3
C
G
A
T
T
G
T
G
T
A
T
G
C
G
2
2
4
2
T
T
A
T
T
C
T
2
A
G
T
C
A
G
T
T
T
4
A
2
2
A
9
G
6
3
G
T
G
T
T
T
A
C
A
A
3
G
A
G
G
G
A
C
A
A
T
G
A
T
T
T
G
C
C
C
G
A
T
G
A
C
A
2
C
G
T
T
C
T
G
C
C
C
5
G
G
C
C
17
T
A
A
A
T
T
T
2
G
A
C
T
T
T
C
T
G
C
C
A
C
G
T
A
A
G
6
8
2
C
A
T
G
A
C
A
G
C
T
C
C
C
G
T
G
T
A
G
C
C
G
G
C
A
A
A
T
G
C
T
A
T
G
T
T
4
T
A
T
A
A
C
C
T
G
T
G
  46,050,337
  46,050,704
  46,050,730
  46,050,743
  46,051,026
  46,051,187
  46,051,263
  46,051,383
  46,051,474
  46,051,600
  46,051,993
  46,051,994
  46,052,065
  46,052,412
  46,052,462
  46,053,066
  46,053,107
  46,053,311
  46,053,362
  46,053,838
  46,054,003
  46,055,192
  46,055,194
  46,055,199
  46,055,331
  46,055,936
  46,056,242
  46,056,629
  46,056,766
  46,056,933
  46,056,961
  46,057,094
  46,057,131
  46,057,304
  46,057,604
  46,057,795
  46,058,566
  46,058,650
  46,058,690
  46,058,785
  46,058,896
  46,059,036
  46,059,279
  46,059,585
  46,059,663
  46,059,738
  46,059,772
  46,059,787
  46,060,016
  46,060,141
  46,060,181
  46,060,404
  46,060,522
  46,060,910
  46,060,982
  46,061,007
  46,061,077
  46,061,131
  46,061,135
  46,061,387
  46,061,467
  46,061,534
  46,061,611
  46,061,751
  46,061,784
  46,061,862
  46,061,869
  46,061,881
  46,062,276
  46,062,280
  46,066,555
  46,066,564
  46,066,917
  46,067,313
  46,067,319
  46,067,743
  46,068,722
  46,069,518
  46,070,472
  46,072,060
  46,072,082
  46,072,085
  46,072,089
  46,072,097
  46,072,136
  46,072,472
  46,072,635
  46,074,468
  46,076,352
  46,077,008
  46,077,191
  46,079,335
  46,079,451
  46,079,457
  46,079,521
  46,081,159
  46,081,161
  46,083,507
  46,083,543
  46,085,476
  46,085,615
  46,085,914
  46,086,393
  46,086,444
  46,086,662
  46,086,983
  46,087,254
  46,087,836
  46,087,868
  46,088,041
  46,088,849
  46,089,249
  46,092,277
  46,092,283
  46,092,327
  46,092,333
  46,092,719
  46,094,259
  46,094,607
  46,094,706
  46,095,315
  46,095,796
  46,095,908
  46,095,935
  46,097,627
  46,098,362
  46,099,744
  46,099,890
  46,105,372
  46,106,576
  46,106,756
  46,107,105
  46,107,541
  46,107,797
  46,108,328
  46,109,067
  46,109,201
  46,110,320
  46,110,384
  46,111,603
  46,112,285
  46,112,286
  46,113,172
  46,113,225
  46,113,871
  46,113,889
  46,114,752
  46,115,144
  46,115,244
  46,116,096
  46,117,815
  46,117,865
  46,118,045
  46,118,071
  46,118,287
  46,118,429
  46,118,504
  46,118,507
  46,118,508
  46,118,761
  46,118,955
  46,119,201
  46,119,355
  46,119,555
  46,119,964
  46,121,080
  46,121,583
  46,121,584
  46,121,588
  46,121,592
  46,121,596
  46,121,600
  46,121,772
  46,122,135
  46,122,171
  46,122,212
  46,122,215
  46,122,221
  46,122,647
  46,122,718
  46,123,313
  46,123,503
  46,123,552
  46,123,820
  46,124,120
  46,124,524
  46,124,973
  46,125,007
  46,125,036
  46,125,046
  46,125,232
  46,125,234
  46,144,719
  46,145,415
  46,146,071
  46,150,106
  46,151,329
  46,151,331
  46,151,684
  46,153,618
  46,154,052
  46,154,055
  46,154,162
  46,154,713
  46,155,104
  46,155,228
  46,155,910
  46,156,688
  46,156,877
  46,156,959
  46,157,160
  46,157,163
  46,157,175
  46,160,505
  46,161,076
  46,162,318
  46,162,327
  46,163,280
  46,163,295
  46,163,322
  46,163,327
  46,163,352
  46,163,500
  46,163,502
  46,164,197
  46,165,922
  46,166,020
  46,167,891
  46,169,461
  46,171,052
  46,171,740
  46,172,675
  46,173,317
  46,173,906
  46,174,298
  46,174,363
  46,174,664
  46,174,665
  46,174,711
  46,174,719
  46,174,747
  46,174,769
  46,174,826
  46,174,828
  46,174,830
  46,174,831
  46,174,837
  46,175,273
  46,175,328
  46,175,356
  46,175,357
  46,175,362
  46,176,698
  46,176,788
  46,176,815
  46,177,145
  46,177,689
  46,177,691
  46,178,254
  46,179,562
  46,182,753
  46,183,415
  46,183,602
  46,184,105
  46,184,113
  46,184,202
  46,184,340
  46,184,733
  46,184,754
  46,184,888
  46,185,124
  46,185,243
  46,185,947
  46,186,247
  46,186,305
  46,186,812
  46,187,453
  46,187,545
  46,187,594
  46,188,094
  46,188,140
  46,188,453
  46,188,460
  46,188,471
  46,189,020
  46,191,063
  46,191,887
  46,192,275
  46,194,222
  46,194,886
  46,195,369
  46,195,504
  46,195,817
  46,195,881
  46,196,079
  46,196,103
  46,196,110
  46,196,119
  46,196,432
  46,196,500
  46,196,660
  46,197,002
  46,197,329
  46,197,330
  46,197,703
  46,197,771
  46,198,014
  46,198,938
  46,199,050
  46,199,268
  46,200,069
  46,200,305
  46,200,660
  46,200,813
  46,202,405
  46,202,470
  46,202,801
  46,203,008
  46,203,062
  46,203,123
  46,203,364
  46,203,472
  46,203,518
  46,203,608
  46,203,814
  46,204,475
  46,204,515
  46,204,556
  46,204,562
  46,204,657
  46,204,793
  46,204,807
  46,204,845
  46,204,895
  46,204,928
  46,204,938
  46,204,953
  46,205,022
  46,205,141
  46,205,207
  46,205,222
  46,205,352
  46,205,414
  46,205,493
  46,205,514
  46,205,520
  46,205,836
  46,205,979
  46,206,022
  46,206,094
  46,206,142
  46,206,150
  46,206,166
  46,206,318
  46,206,349
  46,206,441
  46,206,500
  46,206,510
  46,206,516
  46,206,521
  46,206,538
  46,206,584
  46,206,585
  46,206,645
  46,206,657
  46,206,672
  46,206,865
  46,207,120
  46,207,175
  46,207,515
  46,207,816
  46,208,217
  46,208,290
  46,208,420
  46,208,457
  46,208,573
  46,209,539
C
-
T
C
2
C
-
T
T
G
-
2/-
C
C
A
C
-
T
A
2
C
A
G
G
G
A
G
G
-
G
T
C
A
T
G
G
T
A
A
T
A
T
A
G
C
G
A
G
C
3
-
G
G
C
G
T
2
T
2
2
T
C
G
-
T
C
2
G
5
-
3
-
G
T/C
T
-
T
A
C
A
-
T
T
-
-
C
5
C
T
-
T
G
-
-
C
A/T
A/T
A
-
G/A
-
-
A
C
A
T
C
C
G
A
C
C
T
G
T
G
7
2
T
A
T
G
T
A
G
A
C
G
A
T
C
A
A
C
2
C
-
-
3
G
2
5
T/G
C
-
-
A
T
T
T
A
AG/G
C
G/A
-
2
A/C
C/T
A/C
A/-
A
7
G
C
C
C
T/3
19/G
T/G
T/G
T/G
T/G
-
C
-
T/C
-
3/TC
A
G
C
G
A
7
C
C
A/G
A
G/5
G/A
A/2
G
T
T
T
2
4/-
2/-
C/-
G
C/2
3/-
C/-
A
G
C
2
4
C
T
2
2
2
A
T
3
2/-
-
-
2/-
3
C
C
C
-
A
2
2/-
3
A
C
CA/CT
C
A
A
7
T/5
4/-
A/G
2/-
2/-
A/-
9/-
G/-
-
-
G/T
A
-
A
A
A
G
T
G
G
3/-
-
G
A
A
A
3
G
G
G
C
T
G
C
C
C
-
T
T
G
A
-
A
A
T
T
2
-
-
A
C
C
3
G
C
T
T
T
-
A
A
T
T
-
C
G
2
13
C
C
G
-
T
G
-
C
C
C
T
C
T
T
T
G
T
A
2
C
G
A
-
-
-
T
C
C
A
T
T
3
A
A
C
T
T
T
A
C
A
C
G
A
T
T
-
C
T
G
G
C
C
C
T
C
G
C
A
C
C
-
C
-
C
G
G
-
T
C
A
C
A