Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 231,684 (bp)   Positions: 419
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.001
.506
--
.0
.005
.035
.004
.005
.001
.014
.0
.947
.012
.0
.0
.002
--
--
.026
.001
.002
.002
.011
.085
.69
--
--
--
--
.001
.005
.001
.065
.044
.007
.001
.001
.101
.129
.002
.004
.117
.13
.002
.002
.003
.005
.008
--
--
.023
.049
.017
.744
.985
.017
.01
.005
--
.001
.0
.004
.019
.907
--
--
.002
.026
.053
.029
.002
.013
.002
.0
.001
.001
.003
--
.002
.006
.004
.096
.0
.057
.0
.004
.007
.158
.158
.19
.213
.038
.004
.003
.005
.008
.0
.003
.008
.007
--
--
--
--
.003
.05
.036
--
.001
.011
.029
.023
.025
.004
.001
.002
.001
.003
.974
.004
.0
.0
.059
.001
.037
.001
.007
.011
.0
.0
.047
.002
--
.01
--
.971
.164
.003
.001
.06
.0
.0
.0
.083
.021
.002
.001
.008
.005
.028
.003
.147
.063
.047
--
.35
.001
.067
.262
.054
.085
.001
.864
.002
.169
.016
.005
.108
.013
.03
--
.011
.001
.009
.027
.015
.001
.247
.082
.078
.226
.991
.02
.004
.005
.014
.084
.015
.004
.098
.007
.001
.001
.402
--
.002
.008
.193
.049
--
.002
.04
--
--
.04
.002
.003
.006
.026
.001
.05
.002
.002
.004
.164
.045
.046
--
.018
.014
.239
.578
.208
.013
.006
.018
.014
.028
.007
.002
.018
.266
.142
.006
.031
.623
.008
.0
.007
.236
.008
.011
.004
.001
.991
.007
.001
.025
.039
.959
.327
.988
.005
--
.0
.002
.165
.166
.043
.119
.0
.058
.035
.389
.013
.065
.244
.28
.031
.003
--
.015
.046
.006
.001
.013
.112
.003
.008
--
.415
.002
.132
.082
.145
.008
.001
.45
.09
.0
.001
.004
.001
.016
.002
--
--
.006
.105
.24
.006
.43
.632
.588
--
--
--
.991
.001
.035
.058
.002
.094
.002
--
--
--
--
--
.994
--
.004
.033
.001
.001
.98
.99
.036
.002
.002
.001
.587
.575
.0
.0
.166
--
--
.011
.003
.004
.005
.0
.001
.003
.026
.007
.089
.094
.001
.0
.035
.018
.011
.036
.015
.003
.033
.0
.009
.244
.279
.018
.0
.001
.001
.005
.209
.203
.456
.996
.0
.001
.004
.018
.11
--
.001
.009
.0
.056
.925
.0
1.0
.998
.0
.003
.241
.004
--
.008
.002
.001
.004
.004
.003
.143
.012
--
.0
.003
.003
.004
.04
.214
.053
.007
.033
--
.01
.021
.064
.068
.069
.068
.047
.039
.027
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
T
T
T
G
A
A
A
G
T
T
G
8
A
T
G
2
G
A
T
C
G
T
C
3
T
T
6
G
T
T
A
G
G
A
G
T
T
G
C
A
T
G
G
T
G
C
T
T
C
A
G
6
T
G
G
A
C
T
G
G
2
A
C
2
T
A
C
C
C
15
C
G
G
T
C
T
A
C
2
T
C
A
A
T
2
A
2
12
10
8
T
T
T
C
C
G
G
C
T
C
C
C
T
A
2
A
T
A
A
A
A
G
C
T
T
G
C
A
7
G
A
T
G
C
7
A
T
2
T
A
C
A
C
T
A
T
C
A
C
T
G
C
2
G
T
C
C
G
C
A
T
C
A
T
T
G
A
8
A
A
T
C
C
C
A
G
T
C
C
T
G
C
G
C
A
A
G
18
16
G
T
C
C
C
G
C
C
G
C
C
G
A
A
G
T
T
A
C
C
C
G
A
T
C
C
C
C
G
C
T
A
G
G
T
C
G
T
A
A
T
T
T
C
G
A
C
C
T
T
G
G
T
G
A
C
A
4
G
G
T
A
T
A
C
C
C
G
A
A
T
C
A
4
C
T
C
G
G
4
7
G
T
C
T
A
T
A
G
C
8
G
G
G
G
C
G
G
A
22
G
C
G
A
A
T
G
A
G
C
T
12
T
T
C
C
A
C
A
A
C
C
A
C
A
T
A
6
A
C
G
G
G
A
T
T
2
54
4
A
A
G
T
G
G
2
T
T
T
A
C
C
G
C
T
A
G
C
G
C
A
A
T
T
T
C
T
3
6
G
C
T
T
A
C
G
G
A
T
C
2
G
C
G
G
T
A
4
A
T
T
G
3
2
G
2
A
G
A
A
G
G
T
A
G
G
G
C
T
2
G
G
T
C
C
C
T
C
A
G
T
A
A
3
G
T
C
G
A
T
10
G
G
G
G
G
G
G
  10,307,070
  10,308,354
  10,310,519
  10,310,777
  10,311,723
  10,311,935
  10,313,025
  10,314,156
  10,315,169
  10,315,323
  10,316,006
  10,317,036
  10,317,865
  10,318,273
  10,318,393
  10,318,394
  10,318,400
  10,319,991
  10,319,992
  10,320,711
  10,321,253
  10,321,385
  10,321,439
  10,321,518
  10,321,553
  10,322,018
  10,322,053
  10,323,124
  10,323,409
  10,323,723
  10,324,536
  10,324,541
  10,324,543
  10,325,949
  10,326,010
  10,326,203
  10,326,701
  10,326,707
  10,326,729
  10,326,732
  10,327,192
  10,327,597
  10,328,203
  10,328,204
  10,328,669
  10,328,960
  10,330,863
  10,331,371
  10,332,263
  10,334,583
  10,334,591
  10,337,211
  10,337,428
  10,337,514
  10,338,237
  10,338,340
  10,339,614
  10,339,877
  10,339,887
  10,340,821
  10,341,080
  10,341,395
  10,342,066
  10,342,282
  10,343,595
  10,345,489
  10,345,490
  10,346,393
  10,346,536
  10,346,607
  10,346,875
  10,347,011
  10,347,561
  10,347,768
  10,349,718
  10,349,762
  10,350,267
  10,350,281
  10,350,982
  10,351,949
  10,352,003
  10,352,005
  10,352,099
  10,352,696
  10,353,157
  10,353,256
  10,353,839
  10,353,870
  10,353,906
  10,353,945
  10,353,947
  10,353,949
  10,354,292
  10,354,965
  10,355,067
  10,355,208
  10,355,355
  10,356,443
  10,356,565
  10,356,630
  10,356,640
  10,356,660
  10,356,665
  10,356,786
  10,356,890
  10,356,920
  10,357,053
  10,357,054
  10,357,213
  10,358,313
  10,358,393
  10,358,411
  10,358,412
  10,358,563
  10,359,354
  10,359,616
  10,359,649
  10,360,095
  10,360,262
  10,360,501
  10,360,582
  10,361,447
  10,361,516
  10,361,719
  10,361,763
  10,362,649
  10,363,269
  10,363,491
  10,363,605
  10,364,195
  10,364,196
  10,364,422
  10,364,527
  10,366,418
  10,366,469
  10,366,695
  10,367,016
  10,367,300
  10,367,471
  10,367,620
  10,368,714
  10,368,721
  10,368,764
  10,368,842
  10,368,977
  10,370,286
  10,370,296
  10,370,478
  10,370,581
  10,370,594
  10,370,609
  10,370,673
  10,370,783
  10,371,726
  10,371,727
  10,371,985
  10,372,624
  10,372,839
  10,372,901
  10,373,015
  10,373,108
  10,373,355
  10,374,214
  10,374,372
  10,374,717
  10,374,846
  10,374,892
  10,374,972
  10,375,023
  10,375,147
  10,375,302
  10,375,647
  10,375,767
  10,375,871
  10,376,054
  10,376,585
  10,377,069
  10,377,614
  10,378,307
  10,378,684
  10,378,686
  10,378,732
  10,379,367
  10,379,816
  10,379,896
  10,380,053
  10,380,269
  10,380,576
  10,380,964
  10,381,968
  10,382,030
  10,382,258
  10,382,968
  10,383,199
  10,383,673
  10,384,545
  10,384,568
  10,386,622
  10,387,029
  10,387,380
  10,387,635
  10,387,729
  10,387,804
  10,391,088
  10,391,545
  10,391,996
  10,392,316
  10,392,325
  10,392,401
  10,392,484
  10,392,494
  10,392,536
  10,392,592
  10,392,593
  10,393,945
  10,394,884
  10,395,391
  10,396,139
  10,396,347
  10,396,558
  10,396,625
  10,396,813
  10,396,824
  10,397,414
  10,398,794
  10,399,554
  10,399,834
  10,399,929
  10,401,278
  10,401,409
  10,401,440
  10,402,324
  10,403,349
  10,403,713
  10,403,811
  10,404,261
  10,405,007
  10,405,723
  10,405,757
  10,406,477
  10,406,485
  10,406,669
  10,406,671
  10,406,675
  10,406,679
  10,406,788
  10,407,036
  10,407,273
  10,407,564
  10,411,640
  10,412,010
  10,412,045
  10,412,227
  10,412,420
  10,413,612
  10,413,780
  10,413,988
  10,414,350
  10,414,351
  10,414,721
  10,414,969
  10,415,606
  10,416,618
  10,419,706
  10,421,399
  10,422,090
  10,422,375
  10,422,930
  10,424,530
  10,424,612
  10,425,953
  10,426,115
  10,426,184
  10,426,596
  10,428,107
  10,428,364
  10,428,452
  10,429,354
  10,429,687
  10,429,828
  10,429,877
  10,430,373
  10,430,704
  10,431,007
  10,431,203
  10,431,302
  10,431,728
  10,432,304
  10,432,583
  10,432,822
  10,433,102
  10,433,207
  10,433,377
  10,434,423
  10,435,087
  10,436,764
  10,437,277
  10,437,935
  10,438,303
  10,438,449
  10,438,956
  10,439,871
  10,440,152
  10,440,256
  10,440,266
  10,444,976
  10,446,276
  10,446,502
  10,474,225
  10,474,557
  10,474,660
  10,475,735
  10,475,861
  10,476,598
  10,476,666
  10,477,613
  10,477,646
  10,477,715
  10,477,721
  10,478,246
  10,478,780
  10,480,610
  10,481,664
  10,482,471
  10,484,220
  10,484,293
  10,484,432
  10,484,433
  10,484,457
  10,484,666
  10,484,834
  10,485,486
  10,485,975
  10,485,976
  10,485,994
  10,486,001
  10,486,272
  10,486,597
  10,486,608
  10,486,988
  10,487,815
  10,487,854
  10,488,604
  10,489,561
  10,490,167
  10,490,906
  10,491,946
  10,492,604
  10,492,711
  10,492,730
  10,494,688
  10,495,503
  10,496,440
  10,497,492
  10,497,812
  10,498,571
  10,498,762
  10,498,933
  10,499,222
  10,501,865
  10,502,951
  10,503,031
  10,503,032
  10,503,416
  10,503,546
  10,504,268
  10,504,385
  10,504,474
  10,504,689
  10,504,710
  10,504,778
  10,505,139
  10,507,058
  10,508,161
  10,508,162
  10,509,891
  10,510,640
  10,511,674
  10,512,296
  10,512,325
  10,514,273
  10,514,344
  10,515,015
  10,516,405
  10,517,274
  10,517,284
  10,517,420
  10,518,105
  10,518,141
  10,518,173
  10,520,263
  10,521,122
  10,522,474
  10,522,657
  10,522,666
  10,522,692
  10,522,693
  10,523,442
  10,524,022
  10,524,343
  10,525,221
  10,526,712
  10,528,917
  10,529,729
  10,530,314
  10,530,374
  10,531,317
  10,531,954
  10,532,920
  10,533,819
  10,536,339
  10,536,690
  10,537,257
  10,537,261
  10,537,263
  10,537,265
  10,537,275
  10,537,277
  10,537,279
5
G
-
3
C
A
C
3/5
G
A
A
-
T
-
G
2
11
2/-
G/-
3
C
A
C
C
T
-
-
C
6/-
T
C
23
-
A
A
10
T
2
G
T
14
T
C
13/17
T
C
G/3
5
T/2
C
2
G
A
-
G
A
A
9
T
T/C
2
A
-
G
T
2/-
T/-
3
T
T
T
-
T
A
3
C
T
C
G
A
-
5
T
C
C
C
-
3/7
-
12/-
10/-
8/-
A
C
5
G
T
A
A
T
2
A
T
2
C
G
2/-
A/-
14
C
C
G
C
A
7
C
C
A
T
4
-
A
G
C
A
A
-
A/13
C
2/-
T/-
A/21
T
A/3
C/2
G
T
-
T
G
T
C
A
-
-
T
C
T
T
A
T
T
-
T
G
C
C
A
A/15
-
G
G
C
T
2
G
G
A
G
G
T
-
A
G
A
T
G
G
A
18/-
16/-
C
C
G
T
CT/6
A
T
A
A
T
T
A
G
-
C
2
C
C
G
-
G
C
24
3
A
T
T
T
C
G
C
T
A
A
2
T
3
C
G
2
T/2
6/7
C
T
A
8
G
T
T/2
A
A
A
C
T
G
T
C
-
C
A
C
G
C
G
T
-
G
3
G
G
T/-
G
6
4/-
T
C
C/6
G/-
7
-
-
A
C
C/41
C
G
C
G
2
T
8/-
A
9
T
A
4
A
A
C
-
A
T
11/9
C
16
C
-
C
A
11
G
-
C
A
T
T
G
A
C
T
T
T
5
T
C
C
G
-
G
7/3
10
A
A
G
-
2
-
-
-
C
G
C
2
A
A
2/-
-
G
7/21
T
A
T
A
T
C
G
C
G
T
T
G
G
G
G
A
2
C
-
-
17/21
T
C
C
G
11
A
A
G
C
T
2/-
G/17
T
A
A
C
G
-
5
15
C
A
3/-
2/-
A
-
T
C
G
G
A
A
G
G
A
C
A
G
C
-
A
T
A
T
2
8
A
T
2
A
C
G
G
3/-
A
A
T
C
G
C
-
19
A
A
A
A
A
A