Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 162,636 (bp)   Positions: 591
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.019
.567
.017
.001
--
.042
.068
--
--
.027
.005
.013
.004
.005
.0
.005
--
--
.488
.059
.031
--
--
.027
.056
.152
.417
.013
.008
.001
.001
.01
.425
.004
.003
.002
.103
.005
.002
.003
--
--
.007
.001
.0
.104
.116
.002
--
.887
.0
.041
.014
.034
.001
.359
--
--
--
.016
.001
--
--
.192
.002
--
.008
--
--
--
.001
.183
.061
.061
.069
.0
.0
.0
.147
.026
--
--
.006
.018
--
--
--
--
--
--
.02
.007
.062
.013
.005
.001
.008
.085
.043
.009
.005
.002
.004
.718
.0
.016
.002
.038
.013
.096
.078
.004
.005
.093
.055
.001
.003
.017
.036
.068
.066
.031
.017
.086
.017
.003
.004
.483
.433
.501
.694
.727
.22
.008
.007
.017
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.063
.219
.228
.282
.136
.059
.019
.323
.021
.056
.138
.0
.001
.276
.165
.152
.042
.001
.002
.305
.288
.086
.01
.001
.001
.008
.011
.028
.005
.051
.014
.015
.146
.009
.0
.036
.016
--
.002
.007
.016
.004
.004
.21
.01
.027
.165
.031
.028
.571
.567
.308
.299
.121
.404
.466
.44
.001
.001
.0
.0
.0
.001
.019
.036
.001
.058
.01
.0
.812
.006
.001
.001
.004
.0
.003
.019
.429
.025
.927
.002
.918
.117
.437
.0
.0
.01
.12
.104
.048
.155
.316
.018
.959
.001
.147
.129
.067
.061
.052
.045
.014
.015
.067
.078
.025
.013
.069
.082
.02
.041
.004
.001
.002
.225
.003
.136
.001
.008
.0
.0
.0
.0
.003
1.0
.0
.0
.0
.0
.207
.001
.0
.001
.0
.0
.001
.0
.019
.001
.224
.018
.003
.013
.011
.001
.002
.001
.001
.017
.519
.002
.86
.0
.001
.007
--
--
--
.033
.005
.009
.162
.704
.502
.012
.026
.028
.001
.001
.001
.0
.034
.005
.001
.042
.017
.003
.027
.124
.363
.329
.008
.003
.0
.001
.013
.135
.229
.709
.283
.285
.112
.356
.412
.451
.049
.029
.022
.02
.006
.002
.193
.3
.156
.228
.353
.016
.016
.194
.005
.075
.174
.288
.031
.09
.023
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.039
.025
.019
.093
.055
.157
.117
.102
.092
.996
1.0
.998
.001
.0
.002
.121
.018
.008
.016
.003
.24
.22
.215
.023
.001
.006
.002
.003
.08
.11
.001
.005
.001
.005
.067
.485
.715
.002
.006
.02
--
.0
.025
.001
.001
.003
.024
.009
1.0
.009
.005
.005
.009
.004
.078
.097
1.0
.0
.001
.026
.396
.002
.005
.001
.004
.148
1.0
.005
.037
.01
.001
.001
.007
.01
.751
.507
.134
.119
--
--
.02
.28
--
--
--
.024
.01
.249
.007
.252
.007
.812
--
.128
.001
.002
.355
.001
.007
.014
.0
.112
.152
.158
.012
--
.05
.009
.001
.011
.051
.013
.025
.027
.002
.023
.008
.033
.011
--
--
--
--
--
--
--
--
.043
.0
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
Lrrk2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Hmgb1-ps3
Hmgb1-ps3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
A
T
36
T
C
A
6
C
C
10
8
C
2
2
G
A
G
T
C
T
4
C
A
G
T
A
C
C
A
T
C
A
T
T
T
C
T
G
G
G
T
A
C
C
A
G
T
T
C
2
T
A
G
A
T
T
2
C
A
T
A
A
G
A
C
5
3
3
G
G
A
G
T
C
G
C
G
C
C
T
C
C
A
T
T
T
A
G
A
C
C
G
A
A
T
G
A
T
T
G
G
T
T
A
T
G
T
A
C
A
T
A
G
T
A
C
C
T
G
T
G
G
C
T
T
C
4
11
10
8
A
A
A
2
A
T
T
G
C
T
8
G
T
6
4
T
C
T
C
T
T
T
C
T
115
A
T
A
C
T
T
C
T
T
T
A
G
G
G
C
T
C
G
T
T
A
T
A
T
A
G
G
C
T
C
T
C
T
C
T
C
T
T
A
T
G
C
G
G
T
T
3
T
C
T
G
T
2
C
A
A
6
T
C
T
A
A
T
C
A
T
A
A
A
C
G
A
C
A
T
T
G
T
G
G
T
A
C
C
G
G
T
T
T
3
G
C
A
G
T
T
C
C
A
G
T
C
A
2
C
A
C
A
T
G
C
C
G
G
G
C
T
A
A
C
C
A
T
A
C
C
T
T
G
T
T
A
C
A
G
C
T
C
G
A
G
A
T
T
C
C
4
2
G
A
G
A
A
3
C
T
G
T
T
C
C
T
A
G
A
A
T
T
T
A
T
T
C
G
G
A
T
A
A
C
T
T
T
T
11
T
T
G
A
G
G
T
A
G
C
T
T
C
T
G
T
5
C
G
C
A
T
T
T
T
C
T
T
G
A
C
C
C
C
G
G
C
A
C
T
C
T
A
C
3
T
T
C
T
C
T
C
C
C
A
T
T
T
C
T
T
C
G
A
A
A
G
T
9
C
G
G
T
A
A
C
C
3
G
T
A
T
T
C
T
C
T
G
2
A
A
C
C
T
T
T
C
A
G
T
T
C
G
A
G
A
G
G
G
A
G
A
T
C
G
G
A
C
G
T
C
C
G
T
3
G
G
T
T
G
T
C
T
A
C
7
C
T
G
46
G
C
A
G
A
C
T
G
T
A
T
C
C
A
A
T
T
12
A
5
T
G
8
A
T
A
C
G
C
T
C
C
C
A
8
6
T
A
C
T
T
C
T
G
T
C
A
G
T
A
C
G
C
C
T
A
A
A
T
C
G
20
C
T
C
T
G
T
G
C
4
8
T
C
T
A
8
3
T
G
C
A
32
30
C
C
T
T
C
T
G
T
T
A
T
C
T
C
T
G
2
G
C
G
2
G
A
G
C
  132,532,311
  132,532,385
  132,535,110
  132,535,708
  132,535,737
  132,540,149
  132,540,893
  132,543,511
  132,543,636
  132,544,655
  132,545,558
  132,545,776
  132,545,863
  132,546,890
  132,548,589
  132,548,916
  132,549,432
  132,549,440
  132,550,346
  132,550,405
  132,551,191
  132,551,332
  132,551,333
  132,552,226
  132,552,398
  132,553,731
  132,553,801
  132,553,946
  132,554,119
  132,554,791
  132,554,792
  132,554,823
  132,554,919
  132,555,265
  132,555,417
  132,555,853
  132,555,991
  132,556,399
  132,556,654
  132,556,751
  132,556,939
  132,557,080
  132,557,163
  132,557,245
  132,557,883
  132,558,874
  132,558,879
  132,563,300
  132,563,730
  132,564,171
  132,565,413
  132,566,415
  132,566,418
  132,566,514
  132,566,829
  132,566,866
  132,567,089
  132,567,118
  132,567,253
  132,567,606
  132,567,943
  132,569,321
  132,570,275
  132,570,840
  132,575,260
  132,576,505
  132,577,748
  132,577,802
  132,577,882
  132,578,188
  132,578,464
  132,578,618
  132,579,126
  132,579,370
  132,579,423
  132,579,897
  132,580,056
  132,580,066
  132,580,158
  132,581,661
  132,582,216
  132,582,237
  132,582,344
  132,582,362
  132,582,552
  132,583,018
  132,583,204
  132,583,226
  132,583,391
  132,584,200
  132,584,605
  132,584,797
  132,585,255
  132,585,466
  132,586,020
  132,586,960
  132,587,665
  132,587,881
  132,587,894
  132,588,058
  132,588,211
  132,588,351
  132,588,354
  132,588,643
  132,588,918
  132,589,149
  132,589,295
  132,589,326
  132,589,370
  132,589,727
  132,589,753
  132,589,785
  132,589,949
  132,590,095
  132,590,126
  132,590,155
  132,590,354
  132,590,359
  132,590,370
  132,590,374
  132,590,375
  132,590,853
  132,590,870
  132,591,216
  132,591,254
  132,591,284
  132,591,293
  132,591,330
  132,591,339
  132,591,354
  132,591,376
  132,591,378
  132,591,433
  132,591,467
  132,591,560
  132,592,192
  132,592,258
  132,592,352
  132,592,424
  132,592,439
  132,592,504
  132,592,508
  132,592,925
  132,592,988
  132,593,017
  132,593,035
  132,593,037
  132,593,224
  132,593,376
  132,593,471
  132,593,595
  132,593,601
  132,593,719
  132,593,740
  132,593,862
  132,593,921
  132,594,194
  132,594,425
  132,594,595
  132,594,794
  132,595,498
  132,595,507
  132,595,598
  132,595,746
  132,595,778
  132,595,815
  132,596,056
  132,596,091
  132,596,110
  132,596,216
  132,596,273
  132,596,280
  132,596,293
  132,596,297
  132,596,321
  132,596,378
  132,596,398
  132,596,443
  132,596,536
  132,596,752
  132,596,989
  132,597,182
  132,597,331
  132,598,014
  132,598,167
  132,598,203
  132,598,218
  132,598,284
  132,598,485
  132,598,491
  132,598,629
  132,598,673
  132,598,688
  132,598,814
  132,598,964
  132,598,987
  132,599,154
  132,599,155
  132,599,178
  132,599,184
  132,599,391
  132,599,558
  132,599,609
  132,599,926
  132,600,125
  132,600,150
  132,600,154
  132,600,155
  132,600,349
  132,600,386
  132,600,422
  132,600,435
  132,600,546
  132,600,727
  132,600,830
  132,600,888
  132,601,049
  132,601,070
  132,601,258
  132,601,408
  132,601,429
  132,601,449
  132,601,475
  132,601,874
  132,602,027
  132,602,051
  132,602,147
  132,602,344
  132,602,701
  132,602,879
  132,603,360
  132,603,516
  132,603,851
  132,603,920
  132,604,105
  132,604,181
  132,604,199
  132,604,214
  132,604,251
  132,604,307
  132,604,558
  132,604,847
  132,604,898
  132,604,927
  132,605,061
  132,605,080
  132,605,153
  132,605,156
  132,605,207
  132,605,208
  132,605,222
  132,605,277
  132,605,480
  132,605,490
  132,605,515
  132,605,580
  132,605,596
  132,605,600
  132,605,673
  132,605,686
  132,605,702
  132,606,140
  132,606,169
  132,606,181
  132,606,251
  132,606,421
  132,606,441
  132,606,442
  132,606,477
  132,606,480
  132,606,535
  132,606,613
  132,606,967
  132,607,017
  132,607,026
  132,607,403
  132,607,659
  132,607,783
  132,607,784
  132,607,827
  132,607,938
  132,607,939
  132,607,965
  132,608,076
  132,608,128
  132,608,304
  132,608,341
  132,608,354
  132,608,379
  132,608,408
  132,608,423
  132,608,523
  132,608,587
  132,608,809
  132,609,031
  132,609,495
  132,610,972
  132,611,588
  132,611,849
  132,613,535
  132,613,711
  132,616,186
  132,617,251
  132,617,521
  132,617,523
  132,618,087
  132,618,935
  132,619,571
  132,620,126
  132,621,324
  132,621,657
  132,621,756
  132,622,261
  132,622,262
  132,622,827
  132,623,462
  132,623,492
  132,623,822
  132,624,079
  132,624,189
  132,624,206
  132,624,278
  132,624,330
  132,624,336
  132,624,371
  132,624,405
  132,624,410
  132,624,425
  132,624,441
  132,624,446
  132,624,482
  132,624,578
  132,624,658
  132,625,081
  132,625,082
  132,625,260
  132,625,370
  132,625,381
  132,625,432
  132,625,852
  132,625,927
  132,625,929
  132,626,026
  132,626,355
  132,626,356
  132,626,358
  132,626,724
  132,626,732
  132,626,785
  132,626,909
  132,627,150
  132,627,628
  132,627,817
  132,628,623
  132,628,844
  132,629,094
  132,629,125
  132,629,290
  132,629,306
  132,629,310
  132,629,434
  132,629,509
  132,629,702
  132,629,914
  132,629,918
  132,630,330
  132,630,340
  132,630,402
  132,630,452
  132,630,468
  132,630,575
  132,630,608
  132,630,642
  132,630,690
  132,630,700
  132,630,775
  132,630,776
  132,630,794
  132,630,845
  132,630,847
  132,630,858
  132,630,860
  132,630,897
  132,630,914
  132,630,950
  132,630,959
  132,630,990
  132,631,015
  132,631,037
  132,631,045
  132,631,056
  132,631,057
  132,631,058
  132,631,064
  132,631,176
  132,631,194
  132,631,200
  132,631,317
  132,631,446
  132,631,486
  132,631,515
  132,631,550
  132,631,562
  132,631,587
  132,631,595
  132,631,599
  132,631,638
  132,631,670
  132,631,677
  132,631,705
  132,632,632
  132,634,385
  132,636,501
  132,636,594
  132,636,597
  132,636,611
  132,636,618
  132,636,619
  132,636,632
  132,636,641
  132,636,651
  132,636,672
  132,636,686
  132,636,709
  132,636,806
  132,636,808
  132,636,842
  132,636,846
  132,636,867
  132,636,868
  132,637,148
  132,637,150
  132,637,424
  132,637,567
  132,637,642
  132,637,646
  132,637,753
  132,637,916
  132,637,933
  132,637,934
  132,638,091
  132,638,126
  132,638,137
  132,638,144
  132,638,194
  132,638,201
  132,638,230
  132,638,263
  132,638,291
  132,638,356
  132,638,447
  132,638,458
  132,638,501
  132,638,530
  132,638,547
  132,638,735
  132,638,761
  132,638,806
  132,638,812
  132,638,816
  132,638,841
  132,638,862
  132,638,893
  132,638,913
  132,638,915
  132,638,947
  132,639,018
  132,639,042
  132,639,046
  132,639,047
  132,639,050
  132,639,195
  132,639,226
  132,639,261
  132,639,332
  132,639,353
  132,639,422
  132,639,485
  132,639,502
  132,639,509
  132,639,549
  132,639,553
  132,639,800
  132,639,807
  132,639,821
  132,639,843
  132,639,868
  132,639,885
  132,639,889
  132,639,890
  132,639,945
  132,639,956
  132,639,998
  132,640,039
  132,640,096
  132,640,135
  132,640,187
  132,640,211
  132,640,373
  132,640,811
  132,640,875
  132,642,486
  132,643,050
  132,643,326
  132,643,474
  132,643,503
  132,643,538
  132,643,540
  132,643,636
  132,643,719
  132,644,036
  132,644,221
  132,644,369
  132,644,404
  132,644,594
  132,646,674
  132,646,918
  132,646,920
  132,648,061
  132,648,619
  132,648,687
  132,650,282
  132,650,506
  132,650,517
  132,650,649
  132,651,895
  132,651,898
  132,653,138
  132,653,290
  132,653,857
  132,653,997
  132,654,262
  132,655,294
  132,655,378
  132,655,774
  132,656,036
  132,658,786
  132,658,796
  132,658,844
  132,659,070
  132,659,374
  132,659,425
  132,659,631
  132,660,470
  132,661,231
  132,661,243
  132,661,329
  132,662,241
  132,663,071
  132,663,138
  132,663,757
  132,664,743
  132,665,716
  132,665,777
  132,667,655
  132,668,301
  132,668,598
  132,669,905
  132,671,592
  132,671,780
  132,671,797
  132,672,131
  132,673,173
  132,674,404
  132,674,667
  132,674,669
  132,675,346
  132,676,232
  132,691,140
  132,691,172
  132,691,233
  132,691,377
  132,691,581
  132,691,612
  132,691,832
  132,691,955
  132,692,059
  132,692,174
  132,692,195
  132,692,406
  132,692,417
  132,692,801
  132,692,951
  132,692,965
  132,693,013
  132,693,049
  132,693,058
  132,693,082
  132,693,108
  132,693,151
  132,693,518
T
A
G
5
-
G
A
7
-
A
G
-
-
T
2/-
-
2
T
C
C
T
T/5
4/-
T
G
A
C
G
T
T
G
A
T
G
-
G
C
T
C
A
T
A
2
C
A
T
C
3/GC
G
2
T
-
4
G
A
131
29
33
-
5
G
C
10
G
4
T
3
-
-
-
A
-
G
A
-
T
C
T
A
T
T
C
T
T
G
C
13
15
G
A
G
T
T
T
2
C
C
T
16
C
-
T
A
C
C
T
G
A
C
2
T
G
C
-
6
C
G
G
T
C
A
C
A
C
-
3
A
-
-
-
10/-
8/-
C
C
C
-
G
C
C
A
T
G
-
7
G
6/-
-
C
T
C
A
C
C
C
T
G
-
2
C
C
G
C
C
A
C
C
C
T
C
T
A
A
C
T
C
-
C
C
C
-
A
G
A
A
T
C
T
C
A
C
T
C
T
C
C
G
C
A
T
A
T
9
C
-
A
T
C
A
C
-
2
G
G
6/-
G
T
C
G
G
C
A
G
C
G
2
3/5
17
A
G
T
C
C
A
A
G
A
A
G
G
2
T
A
A
C
C
C
-
2
T
G
A
C
C
G
T
G
A
2
T
7
-
33
G
T
G
C
A
T
T
C
A
A
A
C
G
G
T
T
T
C
G
G
G
C
C
T
C
C
G
T
G
A
T
C
T
T
T
9
2
G
C
T
G
4/-
-
A
2
T
G
-
-
CT/3
C
T
G
C
T
A
C
C
A
G
G
A
3
15
A/13
C
C
A
A
C
G
C
T
G
T
C
C
C
-
11/9
A
3
A
5
A
C
C
4
A
T
A
A
T
C
C
-
-
5
A
A
T
G
19
C
C
T
C
C
T
G
T
T
T
T
A
A
T
T
T
A
T
C
G
T
-
C
G
T
A/C
A
A
A
G
G
G
C
A
-
T
C
9
A
T
G
-
C
A
52
-
2
A
A
C
T
T
T
T
-
T
C
G
C
C
G
G
T
C
A
-
2
G
T
A
C
A
C
T
G
A
C
C
T
T
G
A
G
G/5
A
17
5
A
G
G
G
-
C
C
T
A
C
T
3
4
A
-
A
A
C
C
A
C
T
C
G
A
-
G
C
2
-
A
T
C
A
G
T
C
A
C
G
C
T
T
G
2
C
C
-
C
-
6
A
-
C
-
C
G
A
T
C
T
T
T
T
8/-
6/-
C
13
A
T/13
C
T
C
-
G
T
G
A
C
G
T
A
T
T
C
G
G
2
C
C/3
A
-
-
2
C/-
C
10
6
A
T
-
-
2
5
C
5
-
-
C
A
T
G
32/-
30/-
T
7
C
C
T
C
A
C
C
G
C
T
C
T
2
C
2/-
G/3
3
A
-
C
G
A
36