Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 1,239,778 (bp)   Positions: 383
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.137
.204
.197
.263
.209
.0
.605
--
.157
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.006
.073
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.087
--
--
--
--
.0
.001
.0
.023
.004
.001
--
--
.36
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.031
--
--
--
.03
--
--
--
--
.045
--
--
.083
.055
.025
.024
.174
--
--
--
.017
--
--
--
--
--
--
.004
.001
.027
--
--
--
.019
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.937
--
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.013
.01
.002
.006
.001
.009
.769
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.156
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.0
.0
.0
.0
.009
.008
.001
--
.182
.035
--
--
--
--
--
--
.338
.388
.562
.505
.01
.009
.007
.004
.004
.004
.867
.017
--
.038
--
--
.017
--
.211
.005
.004
.004
.541
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.166
.745
.714
.03
.001
.002
.011
.078
--
.019
--
--
.055
.0
.041
.019
.018
.975
--
.008
--
.062
.01
--
--
--
.089
.001
.0
.001
.073
.073
.103
.105
.042
.043
.04
.071
.064
.106
.161
.671
.006
.007
.032
.043
.0
--
--
--
--
--
--
--
.065
.003
.115
.016
.0
.009
.0
.018
.257
.308
.0
.005
.016
.004
--
.127
.129
--
.002
.037
--
.0
.004
--
--
--
--
--
.081
.007
.032
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.023
--
.018
--
--
--
--
.006
.03
--
.358
--
.167
--
.028
.0
.001
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
Galntl6
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
2
G
3
G
G
A
2
C
G
A
T
C
A
T
T
C
T
C
C
A
T
T
C
G
T
2
C
C
A
A
2
A
A
C
G
T
4
T
A
A
C
C
C
C
C
T
A
C
T
2
C
G
T
G
T
A
T
G
T
T
A
T
G
C
C
T
C
G
C
G
T
G
A
A
A
A
A
A
G
T
2
C
T
2
A
G
3
T
A
T
A
A
G
G
2
C
T
C
2
T
A
A
A
G
A
A
A
C
C
T
A
A
T
2
2
C
T
T
A
C
T
A
C
2
T
A
2
T
C
C
T
G
19
2
T
T
A
G
C
G
C
A
C
T
C
A
G
G
T
T
G
A
T
G
G
C
T
T
C
T
C
T
T
G
C
T
C
2
T
G
G
G
A
A
C
C
T
G
T
A
A
A
C
C
A
C
2
C
A
C
C
C
T
A
C
A
T
T
A
G
C
T
C
G
C
A
T
C
T
A
T
T
G
G
G
G
C
G
C
A
T
G
G
T
A
2
T
T
T
2
A
G
G
G
T
C
G
G
T
4
G
2
C
4
4
T
A
A
2
T
3
2
T
C
G
A
A
2
C
G
C
A
2
G
C
2
G
G
2
C
C
C
C
A
A
A
A
A
A
G
G
3
T
T
4
T
C
C
C
C
C
G
T
A
G
T
2
C
A
A
A
A
A
G
T
G
G
C
3
T
2
C
6
T
A
G
C
A
T
4
2
2
C
A
C
T
G
A
T
T
G
C
C
4
4
2
C
T
T
A
T
C
G
C
G
C
T
T
G
C
G
C
T
C
C
G
G
G
A
C
A
C
C
A
A
C
4
C
G
G
G
C
A
2
C
2
C
G
2
4
A
A
2
  34,386,219
  34,386,227
  34,386,231
  34,386,235
  34,386,253
  34,398,216
  34,399,162
  34,402,796
  34,403,143
  34,403,268
  34,407,151
  34,407,155
  34,407,211
  34,407,340
  34,407,383
  34,407,468
  34,407,493
  34,407,502
  34,407,503
  34,407,510
  34,407,514
  34,407,523
  34,407,528
  34,416,718
  34,420,251
  34,437,921
  34,447,992
  34,456,712
  34,456,760
  34,458,392
  34,458,445
  34,458,447
  34,458,486
  34,458,507
  34,458,705
  34,473,952
  34,481,997
  34,492,074
  34,492,125
  34,493,778
  34,494,170
  34,509,126
  34,509,132
  34,509,154
  34,509,174
  34,509,223
  34,509,234
  34,516,141
  34,525,501
  34,541,177
  34,558,171
  34,560,670
  34,560,983
  34,561,027
  34,561,419
  34,561,457
  34,561,478
  34,561,480
  34,561,497
  34,561,514
  34,561,562
  34,562,079
  34,562,082
  34,562,106
  34,562,109
  34,563,348
  34,564,005
  34,566,598
  34,566,748
  34,566,750
  34,567,206
  34,569,907
  34,578,782
  34,578,787
  34,578,792
  34,578,797
  34,581,788
  34,586,478
  34,588,513
  34,607,690
  34,609,269
  34,611,330
  34,621,288
  34,629,328
  34,635,198
  34,635,199
  34,635,201
  34,635,272
  34,642,085
  34,642,095
  34,642,151
  34,642,157
  34,642,172
  34,642,211
  34,646,719
  34,651,995
  34,652,014
  34,655,798
  34,655,799
  34,656,520
  34,659,694
  34,673,553
  34,673,568
  34,673,572
  34,673,580
  34,673,584
  34,678,365
  34,678,376
  34,678,380
  34,678,558
  34,678,570
  34,678,597
  34,684,939
  34,684,940
  34,688,691
  34,699,692
  34,699,900
  34,723,395
  34,723,396
  34,723,432
  34,747,105
  34,747,107
  34,751,274
  34,771,106
  34,774,027
  34,776,552
  34,795,774
  34,820,089
  34,829,297
  34,829,305
  34,829,317
  34,831,334
  34,841,951
  34,857,780
  34,862,036
  34,862,147
  34,862,158
  34,865,495
  34,865,498
  34,884,737
  34,885,745
  34,885,761
  34,885,791
  34,885,801
  34,885,810
  34,885,865
  34,886,095
  34,886,097
  34,886,185
  34,886,231
  34,886,460
  34,906,186
  34,910,312
  34,910,404
  34,910,432
  34,910,461
  34,910,467
  34,912,434
  34,912,822
  34,912,832
  34,912,969
  34,912,984
  34,914,634
  34,917,640
  34,917,682
  34,917,697
  34,917,703
  34,917,710
  34,917,715
  34,917,728
  34,917,734
  34,919,268
  34,927,210
  34,927,241
  34,927,289
  34,927,347
  34,927,348
  34,927,350
  34,927,504
  34,927,528
  34,927,555
  34,927,786
  34,927,875
  34,927,880
  34,927,895
  34,930,756
  34,933,009
  34,934,374
  34,934,414
  34,934,416
  34,937,962
  34,937,980
  34,937,988
  34,938,002
  34,938,006
  34,938,013
  34,938,014
  34,938,023
  34,960,482
  34,960,550
  34,960,864
  34,966,465
  34,975,208
  34,990,025
  34,990,028
  34,990,035
  34,994,481
  34,999,591
  34,999,621
  34,999,635
  34,999,648
  35,000,386
  35,000,389
  35,000,439
  35,000,447
  35,000,451
  35,000,454
  35,002,717
  35,002,734
  35,005,496
  35,007,225
  35,008,634
  35,008,635
  35,012,270
  35,017,554
  35,018,857
  35,049,647
  35,049,648
  35,049,652
  35,060,014
  35,072,682
  35,072,726
  35,072,746
  35,072,749
  35,075,122
  35,075,137
  35,075,162
  35,075,226
  35,075,268
  35,079,139
  35,079,174
  35,079,834
  35,094,903
  35,121,142
  35,121,327
  35,128,884
  35,133,065
  35,141,469
  35,154,204
  35,167,970
  35,172,995
  35,173,048
  35,174,751
  35,183,057
  35,192,784
  35,192,787
  35,193,921
  35,205,048
  35,206,971
  35,224,220
  35,227,865
  35,228,356
  35,232,884
  35,248,114
  35,248,117
  35,256,726
  35,266,440
  35,266,443
  35,270,262
  35,276,132
  35,276,134
  35,276,140
  35,276,142
  35,276,236
  35,276,238
  35,276,240
  35,276,296
  35,276,300
  35,276,311
  35,276,328
  35,284,417
  35,287,870
  35,287,872
  35,287,883
  35,287,884
  35,292,172
  35,296,108
  35,296,300
  35,296,309
  35,296,321
  35,296,326
  35,302,903
  35,311,155
  35,324,834
  35,327,433
  35,334,007
  35,342,907
  35,353,184
  35,353,191
  35,353,211
  35,353,215
  35,353,220
  35,353,221
  35,356,961
  35,357,919
  35,357,921
  35,362,517
  35,366,894
  35,369,643
  35,369,644
  35,373,543
  35,378,009
  35,408,842
  35,410,478
  35,426,666
  35,427,125
  35,446,197
  35,449,317
  35,456,766
  35,456,767
  35,456,769
  35,458,890
  35,461,175
  35,461,181
  35,471,851
  35,476,218
  35,476,304
  35,476,348
  35,476,355
  35,476,406
  35,476,417
  35,478,640
  35,478,692
  35,480,700
  35,487,990
  35,487,998
  35,488,010
  35,488,189
  35,492,137
  35,498,004
  35,498,136
  35,498,145
  35,515,486
  35,515,496
  35,515,570
  35,515,594
  35,515,603
  35,515,611
  35,516,169
  35,516,199
  35,516,230
  35,516,242
  35,516,267
  35,516,284
  35,516,324
  35,516,340
  35,516,372
  35,516,414
  35,516,426
  35,516,807
  35,527,030
  35,527,088
  35,527,177
  35,527,209
  35,527,276
  35,527,287
  35,534,130
  35,537,745
  35,543,216
  35,550,363
  35,550,393
  35,550,464
  35,550,508
  35,558,924
  35,559,760
  35,566,153
  35,582,180
  35,583,556
  35,591,388
  35,600,479
  35,602,456
  35,612,815
  35,617,327
2/-
G/A
3/-
G/-
G/2
A/5
2/-
5
G/A
A/G
T/C
C/T
A/G
T/A
T/C
C/T
T/C
C/T
C/T
A/G
T/G
T/C
C/T
3
T/7
-
2
C/G
A/T
A/G
-
A/T
A/G
C/A
T
3
4/-
T/C
A/G
A/T
C/G
-
-
T
-
-
2
C/G
T/-
2/-
C/T
T
T/C
G/A
T/C
A/C
T/C
G/T
T/C
T/A
A/G
T/C
G/A
C/T
C/T
T/3
-
T
T
A
T/C
5
A/2
A/2
A/2
A/2
A/5
A/G
G/T
TC/C
2/-
C/4
T/5
2/-
2
2
3/-
A
A/G
T/A
A/-
A/G
G/C
G/T
-
2
2
C/3
2/-
T/G
3
A/G
A/-
G/A
A/G
A/G
A/G
C/A
C/T
T/C
A/G
A/T
T/7
2/-
2/-
T
T/C
T/G
A/G
G
T/C
A/G
C/-
-
2
A/-
2/-
T/5
-
A
A
G/T
-
2/-
T/A
-
2
2
3
G/T
C/G
A/C
C/T
T/A
C/A
A/G
G/C
G/A
T/C
T/G
-
A/3
T/C
G/A
G/T
C/T
T/C
2
C/A
T/C
C/T
T/C
2
A
T
G
T
-
2
T
A
G/2
A/C
A/C
C/A
C/T
T/A
G/A
T/A
A/G
A/C
A/C
C/A
C/A
A/T
A
2/-
-
2
G
2
-
2
G
A
2
T/C
C
2
C
A
T/C
C/G
2
-
-
A/G
C/G
T/2
A/G
T/2
C
-
A
C
A
A
GT/T
G
8
T/G
12
12
T/3
G
-
A
A
C
2/-
A/C
G/T
G/A
G/A
T/C
C/T
G/2
G/C
T/C
-
G/3
-
-
4/-
-
2
-
11
2/-
3/TA
-
2/-
5
5
G/T
A/T
2
2/-
-
G/-
2
A/2
2/-
2
2
2/-
-
2
-
A
A
A
T
T
C
T
C
-
C
A
G/A
3/-
T/2
T/2
4/-
T/G
-
-
-
-
-
C
5
A/C
G/A
T/G
2/-
A
G
C
G
T
G
G/A
2
2
2
A
-
2
2/-
-
6/-
T/C
A/4
3
C/T
A/T
T/5
4/-
2/-
-
2
2
3
T/A
G/A
A/C
T/A
T/G
G/T
C/G
C/G
4/-
-
2/-
G
-
2
A/C
T/-
C/A
G/A
C/G
G/T
C/T
T/A
T/C
G/T
C/T
G/T
C/T
T/C
C/T
C/T
G/A
G/A
G/A
A/G
C/-
AG/T
C/T
C/A
A/C
A/G
C/G
4/-
-
G/-
G/A
G/T
C/T
A/G
2/-
4
2/-
2
G/-
2/-
-
5
3/5
2/-