Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 111,526 (bp)   Positions: 454
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.016
.994
1.0
.992
1.0
.001
.005
.001
.003
.001
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.023
.3
.066
.004
.003
.747
.04
.062
.046
.014
.031
.154
.111
.6
.055
.004
.004
.029
.043
.199
.034
.035
.139
.043
.004
.001
.0
.244
.016
.001
.0
.002
.002
.0
.0
.001
.0
.0
.018
.064
.966
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.978
.11
.006
.007
.005
.047
.054
.006
.003
.002
.003
.013
.398
.004
.968
.005
.0
.029
.0
.0
.012
.028
.002
.037
.008
.012
.036
.018
.149
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.075
.028
.003
--
.016
.192
.001
--
--
--
.001
--
--
.001
.005
.0
.026
.014
.003
.001
.023
.0
.002
.001
.001
.001
.015
.006
.01
.053
.207
.011
.062
.025
.024
.013
.06
.008
.045
.001
.288
.001
.998
.001
.0
.004
.0
.002
.0
.007
.001
.002
--
--
.021
.018
.004
.999
1.0
.998
.999
.999
1.0
1.0
.999
.999
.999
1.0
.93
1.0
1.0
.987
.069
.711
.011
.043
.017
--
--
--
--
.008
.014
.125
.05
.104
.031
.0
.03
--
.521
.97
.179
.125
.486
.005
.044
.039
.004
.024
.146
.003
.02
.083
.001
.008
.006
.005
.02
.002
.007
.186
.033
.301
.006
.009
.147
.008
.027
.453
.54
.575
.213
.116
.006
.012
.017
.1
.173
.008
.005
.012
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.011
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.663
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.32
.301
.094
.568
.084
.017
.032
.034
.007
.01
--
--
--
--
--
.046
.055
.149
.017
.022
.094
.069
.008
.01
.358
.542
.413
.258
.001
.006
.003
.022
.005
.025
.001
.002
.007
.002
.034
.002
.144
.009
.0
.0
.003
.005
.001
.0
.0
.002
.124
.669
.0
.015
.02
.017
.298
.098
.002
.007
.008
--
--
--
--
--
--
.006
.0
.03
.546
.109
.024
.016
.004
.004
.086
--
.116
.077
.019
.001
.108
.0
.007
.043
.672
.006
.005
.002
.001
.018
.518
.013
.017
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
Gabra5
G
A
C
A
G
C
A
C
C
C
A
C
T
A
G
A
G
T
T
G
C
A
A
A
7
T
G
G
C
G
A
G
A
G
G
T
G
G
C
A
C
A
A
A
C
C
T
A
T
A
C
C
G
A
A
G
C
G
C
A
G
G
C
A
C
C
C
T
A
C
T
A
G
C
A
A
G
G
A
A
C
G
T
C
T
G
A
G
C
A
T
C
A
A
C
T
3
A
T
A
T
G
C
T
A
T
T
T
A
3
4
C
7
G
C
G
C
C
T
A
A
T
A
G
T
A
T
T
T
T
A
A
T
A
C
T
C
T
T
T
A
C
G
T
T
C
G
T
2
10
A
T
C
C
A
G
C
A
A
T
C
3
G
T
G
G
C
C
C
G
G
A
G
T
G
C
G
G
A
T
T
A
6
T
G
C
A
T
T
A
G
A
A
G
G
T
G
C
A
2
A
C
T
G
T
T
G
T
C
G
C
G
A
A
G
5
A
C
C
G
A
G
G
A
G
T
G
T
T
G
G
A
A
G
G
G
G
G
G
T
G
C
T
A
T
A
G
G
C
T
G
C
G
A
A
G
A
T
T
C
C
G
A
C
T
A
A
T
G
G
C
T
T
A
A
A
C
G
T
A
9
T
G
T
A
C
T
C
T
T
T
T
C
C
T
A
C
G
T
C
5
G
C
C
G
T
T
C
T
C
T
T
A
G
A
C
C
G
G
2
C
T
T
9
G
T
C
T
A
C
C
G
T
C
A
C
G
A
T
A
G
G
A
A
A
G
G
T
A
G
A
T
A
T
G
T
C
3
G
T
A
T
A
A
A
C
T
C
T
G
20
C
C
T
G
G
A
C
A
C
G
6
T
C
G
T
G
G
A
A
3
T
T
T
G
A
T
T
C
C
A
A
T
G
C
T
G
T
A
A
C
G
G
T
G
T
A
C
T
C
C
C
C
2
A
T
C
T
G
T
C
A
C
G
C
T
T
C
G
G
G
A
A
A
A
6
C
G
T
C
A
A
C
A
  113,844,467
  113,845,030
  113,845,244
  113,845,307
  113,845,471
  113,845,601
  113,845,613
  113,845,632
  113,845,695
  113,845,843
  113,845,873
  113,846,479
  113,846,947
  113,846,972
  113,847,043
  113,847,497
  113,847,947
  113,848,463
  113,848,668
  113,848,703
  113,848,724
  113,848,782
  113,848,903
  113,848,938
  113,849,002
  113,849,180
  113,849,398
  113,849,512
  113,849,602
  113,849,755
  113,849,760
  113,850,015
  113,850,128
  113,850,558
  113,850,805
  113,850,814
  113,850,857
  113,850,894
  113,851,161
  113,851,305
  113,851,527
  113,851,790
  113,852,353
  113,852,432
  113,852,438
  113,852,463
  113,852,750
  113,852,927
  113,853,009
  113,853,017
  113,853,152
  113,853,258
  113,853,355
  113,853,746
  113,854,339
  113,854,427
  113,854,430
  113,854,602
  113,854,604
  113,854,725
  113,854,799
  113,854,863
  113,854,910
  113,854,976
  113,855,070
  113,855,081
  113,855,086
  113,855,112
  113,855,358
  113,855,400
  113,855,588
  113,855,971
  113,856,079
  113,856,101
  113,856,675
  113,857,010
  113,857,327
  113,857,442
  113,857,481
  113,857,649
  113,857,702
  113,857,880
  113,857,977
  113,858,131
  113,858,174
  113,858,228
  113,859,362
  113,859,393
  113,859,669
  113,865,576
  113,865,676
  113,865,965
  113,865,981
  113,866,057
  113,866,130
  113,866,391
  113,866,694
  113,866,758
  113,866,892
  113,867,047
  113,867,266
  113,867,338
  113,868,483
  113,868,681
  113,868,734
  113,868,795
  113,869,482
  113,869,483
  113,869,811
  113,869,813
  113,870,423
  113,870,517
  113,870,565
  113,871,288
  113,872,100
  113,872,135
  113,872,623
  113,873,119
  113,873,550
  113,873,666
  113,873,960
  113,874,123
  113,874,143
  113,874,285
  113,874,710
  113,874,919
  113,874,930
  113,875,222
  113,875,340
  113,875,392
  113,875,478
  113,875,597
  113,875,704
  113,875,931
  113,875,972
  113,875,991
  113,876,051
  113,876,310
  113,876,326
  113,876,615
  113,876,647
  113,876,777
  113,876,785
  113,877,510
  113,877,576
  113,877,783
  113,878,137
  113,878,687
  113,878,717
  113,878,725
  113,879,098
  113,879,332
  113,879,743
  113,880,398
  113,880,986
  113,881,034
  113,881,514
  113,881,559
  113,881,604
  113,881,669
  113,881,692
  113,881,749
  113,881,960
  113,882,144
  113,882,700
  113,883,185
  113,883,288
  113,883,374
  113,883,391
  113,883,550
  113,883,686
  113,884,087
  113,884,122
  113,884,241
  113,884,247
  113,885,464
  113,885,771
  113,886,706
  113,887,576
  113,887,967
  113,888,383
  113,888,485
  113,888,868
  113,889,410
  113,889,517
  113,892,191
  113,892,445
  113,893,169
  113,893,561
  113,893,571
  113,893,611
  113,893,954
  113,894,014
  113,894,036
  113,894,075
  113,894,080
  113,894,088
  113,894,096
  113,894,122
  113,894,142
  113,894,145
  113,895,898
  113,896,277
  113,896,330
  113,896,602
  113,896,986
  113,897,195
  113,897,285
  113,897,350
  113,897,411
  113,897,469
  113,897,578
  113,898,093
  113,898,116
  113,898,538
  113,898,733
  113,898,976
  113,899,251
  113,899,334
  113,899,588
  113,900,263
  113,900,412
  113,901,767
  113,903,692
  113,904,073
  113,904,138
  113,904,692
  113,905,028
  113,905,540
  113,905,932
  113,906,083
  113,906,213
  113,906,282
  113,906,450
  113,906,454
  113,906,466
  113,906,490
  113,906,494
  113,906,514
  113,906,633
  113,906,865
  113,906,872
  113,906,941
  113,906,979
  113,907,011
  113,907,078
  113,907,389
  113,907,805
  113,908,272
  113,908,654
  113,908,694
  113,909,022
  113,909,807
  113,910,130
  113,910,290
  113,911,184
  113,911,452
  113,911,507
  113,911,552
  113,912,203
  113,912,347
  113,912,663
  113,912,909
  113,912,960
  113,913,109
  113,913,212
  113,913,288
  113,913,475
  113,913,513
  113,913,520
  113,913,587
  113,914,232
  113,914,447
  113,914,625
  113,914,858
  113,914,942
  113,915,052
  113,915,164
  113,915,301
  113,916,117
  113,916,276
  113,916,392
  113,917,142
  113,917,226
  113,917,378
  113,917,481
  113,917,520
  113,917,535
  113,917,655
  113,917,694
  113,917,713
  113,917,753
  113,917,779
  113,917,795
  113,917,861
  113,917,916
  113,918,039
  113,918,126
  113,918,540
  113,918,567
  113,918,792
  113,918,882
  113,919,118
  113,919,124
  113,919,325
  113,919,682
  113,919,701
  113,919,737
  113,919,793
  113,919,799
  113,919,824
  113,919,826
  113,920,133
  113,920,227
  113,920,280
  113,920,438
  113,920,529
  113,920,723
  113,920,870
  113,920,943
  113,920,982
  113,920,992
  113,921,094
  113,921,151
  113,921,165
  113,921,245
  113,921,309
  113,921,339
  113,921,554
  113,921,565
  113,921,650
  113,921,684
  113,921,865
  113,921,902
  113,922,245
  113,922,461
  113,922,597
  113,922,670
  113,922,794
  113,922,802
  113,922,932
  113,923,070
  113,923,307
  113,923,357
  113,923,822
  113,924,266
  113,924,267
  113,924,268
  113,924,276
  113,924,415
  113,924,419
  113,924,422
  113,924,429
  113,924,434
  113,924,477
  113,924,671
  113,924,688
  113,924,751
  113,924,762
  113,925,211
  113,925,340
  113,925,412
  113,925,453
  113,925,623
  113,925,641
  113,925,648
  113,925,902
  113,925,983
  113,926,189
  113,926,610
  113,926,660
  113,926,759
  113,927,440
  113,927,540
  113,927,814
  113,927,867
  113,927,887
  113,928,002
  113,928,017
  113,928,054
  113,928,112
  113,928,189
  113,928,202
  113,928,310
  113,928,356
  113,928,366
  113,928,400
  113,928,530
  113,929,059
  113,929,125
  113,929,526
  113,929,610
  113,929,620
  113,929,830
  113,929,988
  113,930,133
  113,931,949
  113,934,220
  113,934,325
  113,934,386
  113,934,516
  113,934,587
  113,935,036
  113,935,921
  113,936,260
  113,937,067
  113,937,503
  113,937,857
  113,938,586
  113,938,720
  113,938,910
  113,939,246
  113,939,339
  113,939,631
  113,939,672
  113,939,971
  113,940,022
  113,940,154
  113,940,160
  113,940,161
  113,940,221
  113,940,225
  113,940,237
  113,940,253
  113,940,254
  113,940,255
  113,940,886
  113,940,932
  113,941,128
  113,941,933
  113,942,360
  113,942,841
  113,943,114
  113,943,884
  113,944,686
  113,945,404
  113,945,605
  113,945,649
  113,946,128
  113,947,016
  113,948,454
  113,948,586
  113,948,661
  113,949,039
  113,949,482
  113,950,122
  113,950,423
  113,950,575
  113,950,783
  113,951,148
  113,951,270
  113,953,031
  113,955,424
  113,955,482
A
A/G
C/T
A/G
G/T
A
G
T
T
A
G
2
A
G
2
T
A
C
G
A
T
G
G
C
7/-
C
A
A
T
C
T
A
C
-
A
G
A
A
C/G
C
5
G
C
G
T
T
C
G
3/TA
G
T
T
A
C
G
A
G
-
-
G
A
A
2
G
T
A
G
C
G
2
A
5
C
T
G
G
A
A
G
G
A
A
A
T
C
T
-
C
C/T
3
C
G
C
G
T
G
-
G
C
G
C
T
T
G
A/G
T/C
T/-
7
A/-
-
-
G
-
A
-
T
G
A
C
G
G
C
G
A
C
G
C
C
G
C
T
G
A
G
T
-
T
G
C
G
G
T
G/A
C
C
T
2
C
-
10/-
T
G
T
T
C
A
-
G
G
A
T
-
A
C
4
A
T
G
A
A
A
G
2
C
T
T
A
A
G
A
C
G
-
2
2
G
-
C
A
C
A
C
T
C
T
A
A
A
2
-
2
A
C
T
G
C
C
C
A
A
T
A
G
-
A
-
G
T
T
C
2
A
A
G
A
C
T
C
G
A
A
-
G
G/T
G/A
G/A
A
A
2
C
T
T
C
T
C
T
A
C
T
T/A
G/A
T
A
G
G
T
G
4
G
T
A
T
G
2
-
G
G
G
T
9
A
-
2
G
G
C
G
A
C
T
-
A
A
-
-
T
C
T
2
C
C
C
T
G
G
T
G
A
T/C
T
-
T
T
T
A
T/C
T/C
C/T
T/G
C/T
T/A
T/2
C
A
G
T
3
A
A
-
T
G
C
-
A
2
A
C
G
T
A
A
T/A
C/T
G
-
T
G
2
2
A
A
-
2
T
A
C
C
G
C
A/G
T/C
A/T
C
A
T/C
C/T
-
A
G
-
C
C
G
G
T
G
T
C
T
-
T
T
C
C
A
G
T
T
A
A
-
T/C
A
C
A
A
C
?
G
-
C
A
C
A
G
C
T/A
C/T
3
G
C
C
C
T
A
A
C
-
G
T
A
A
G
A
G
-
C/T
T/2
C/2
C/T
C/T
C/T
2/-
3
3
A
2
T
5
T
G
G
A
T
4
G
T
2
C
A
G
G
G
T
-
T
A
C
T
G
T
T
G