Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 312,866 (bp)   Positions: 420
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.028
.001
.002
.052
.292
.096
.322
.119
.179
.19
.033
.011
.148
.138
.058
.066
.157
.003
.007
.007
.0
.0
.001
.0
.292
.092
.162
.081
.0
.321
.057
.103
.13
.129
.167
.026
.055
--
.25
.001
.002
--
.056
.002
.0
.073
.001
.996
1.0
.722
.01
.0
.002
.003
.519
.463
.291
.499
.068
.092
.028
.0
.382
.01
.005
.03
.009
.976
.009
.055
.644
.125
--
.482
.053
.195
.08
.182
.225
.359
.759
.092
.505
.232
.647
.586
.564
.104
.021
.236
.014
.024
.027
.022
.037
.528
.01
.014
.978
.024
.023
.026
.051
.011
--
--
--
.08
.022
.002
.077
.749
.005
.017
.05
.011
.005
.441
.001
.001
.872
.032
.425
.001
.858
.0
.001
.039
--
.03
--
.001
.013
--
.002
.071
.652
.51
.452
.013
.001
.002
.0
.233
.002
.005
.003
.008
.208
.028
.002
.009
.0
.025
.055
.01
.0
.015
.104
--
.054
--
--
--
--
--
--
.004
.004
.0
.01
.005
.013
.0
.002
.0
.001
.064
.0
.0
.011
.003
.001
.0
.002
.0
.001
.01
.02
.006
.0
.002
.001
.0
.004
.005
.009
.001
.015
.181
.068
.0
.063
.006
.03
.007
.439
.0
.0
.0
.271
.001
.02
.039
.005
.007
.057
.377
.154
.166
.024
.009
.046
.084
.941
.017
.0
.001
.012
.026
.039
.011
.002
.004
--
--
.195
.01
.022
.004
.0
.002
.005
.012
.005
.0
.001
.005
.0
.001
.043
.0
.0
.0
.0
.008
.003
.026
.594
.001
.001
.0
.108
.079
.34
.036
.0
.002
.0
.003
.012
.001
.0
.033
.024
.005
.001
.13
.013
.428
.018
.014
.001
.001
.001
.008
.001
.001
.001
.006
.003
.095
.012
.892
.595
--
--
--
.01
.008
--
.224
--
.012
.001
.047
.064
.073
.001
--
.001
.275
.322
.004
.006
.006
--
--
.015
.371
.136
.004
.135
.755
.07
.018
.47
.002
.001
.0
.0
.001
.002
.013
.035
.03
--
.043
.009
.003
.0
.0
.065
.004
.954
.711
.0
.354
.975
.896
--
--
--
.044
.082
.001
.195
.025
.026
.175
.181
.002
.014
.013
.042
.0
.045
.003
.002
.018
.485
--
--
.06
.018
.002
.009
.115
.228
.0
.0
.17
.0
.063
.004
.015
.136
.007
.0
.0
.01
.022
.276
.046
.0
.01
.006
.012
.701
.276
.065
.025
.009
.02
.549
.042
.002
.002
.308
.132
.057
.001
.012
.003
.081
.0
.015
.335
.054
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
T
G
T
3
A
G
G
A
A
A
G
A
G
C
T
G
T
A
T
T
T
T
G
A
T
G
C
A
G
A
C
3
T
G
A
2
A
C
C
C
C
T
G
C
C
A
A
C
C
T
T
A
C
G
G
C
A
G
A
T
G
G
T
C
A
T
A
4
T
G
C
C
G
T
C
G
T
A
G
A
T
G
G
T
C
A
G
T
C
A
T
C
T
C
G
T
T
A
G
2
G
A
A
T
A
A
C
T
T
G
T
T
T
T
C
T
C
G
G
A
C
T
A
A
C
T
A
A
192
A
C
G
G
C
T
T
T
A
A
T
C
T
C
G
G
T
T
T
G
T
G
G
G
C
A
A
C
G
T
A
A
A
C
T
A
T
A
T
G
A
6
C
T
A
T
T
6
A
A
T
T
T
A
C
A
T
C
T
G
3
T
T
A
G
G
T
C
C
A
G
C
T
G
C
C
A
C
G
C
G
A
T
C
C
A
T
T
T
C
T
C
A
G
C
A
A
A
A
T
A
C
G
T
T
T
T
A
T
T
4
T
T
G
T
A
G
A
G
G
T
C
C
T
T
A
C
T
T
C
C
A
T
G
G
C
G
T
C
A
T
G
T
C
G
G
4
A
C
C
T
G
T
T
A
T
C
C
A
C
C
G
C
A
C
T
T
A
T
T
A
T
T
C
T
10
A
C
G
G
G
43
A
A
C
T
A
2
2
C
A
G
C
G
A
2
A
A
A
C
T
T
A
2
T
A
T
T
C
C
A
C
A
T
T
T
G
T
C
G
G
G
G
T
G
G
G
A
C
G
A
G
C
3
T
A
C
A
8
T
T
A
G
G
G
C
T
G
A
G
C
C
A
G
T
T
C
A
3
T
2
T
A
A
G
A
T
A
G
T
2
A
C
A
G
T
A
A
A
A
T
A
C
C
G
A
T
T
C
C
A
  154,699,415
  154,699,758
  154,700,635
  154,700,952
  154,701,105
  154,701,177
  154,701,242
  154,701,489
  154,701,802
  154,701,874
  154,701,875
  154,702,533
  154,702,569
  154,702,668
  154,702,785
  154,702,996
  154,703,063
  154,703,364
  154,703,406
  154,703,413
  154,703,419
  154,703,500
  154,703,578
  154,703,588
  154,703,596
  154,703,673
  154,704,145
  154,704,374
  154,704,932
  154,705,179
  154,708,160
  154,709,249
  154,709,272
  154,709,279
  154,709,280
  154,709,323
  154,709,953
  154,710,077
  154,711,698
  154,712,975
  154,713,057
  154,713,307
  154,713,602
  154,714,365
  154,717,676
  154,717,891
  154,718,416
  154,718,649
  154,719,084
  154,719,202
  154,719,746
  154,720,037
  154,720,427
  154,720,596
  154,722,724
  154,723,138
  154,723,750
  154,724,769
  154,725,371
  154,726,437
  154,726,758
  154,727,074
  154,727,285
  154,727,788
  154,728,081
  154,728,141
  154,728,925
  154,729,493
  154,729,526
  154,730,894
  154,731,109
  154,733,314
  154,733,990
  154,735,173
  154,736,141
  154,737,932
  154,738,484
  154,739,071
  154,740,042
  154,740,846
  154,742,165
  154,743,147
  154,743,565
  154,744,014
  154,745,405
  154,746,120
  154,746,880
  154,746,881
  154,748,547
  154,750,589
  154,750,893
  154,751,001
  154,752,495
  154,754,708
  154,754,806
  154,754,863
  154,755,798
  154,756,086
  154,756,841
  154,757,550
  154,758,953
  154,758,957
  154,758,980
  154,759,209
  154,759,260
  154,760,198
  154,760,219
  154,760,279
  154,761,286
  154,762,084
  154,765,287
  154,766,060
  154,766,430
  154,766,932
  154,768,799
  154,768,999
  154,770,655
  154,770,825
  154,771,857
  154,772,658
  154,773,147
  154,773,536
  154,773,640
  154,773,654
  154,773,784
  154,774,268
  154,774,679
  154,774,684
  154,774,844
  154,775,093
  154,775,633
  154,775,709
  154,776,195
  154,776,269
  154,776,708
  154,777,078
  154,777,244
  154,777,282
  154,777,284
  154,777,324
  154,777,626
  154,777,790
  154,777,824
  154,777,827
  154,778,140
  154,778,429
  154,778,467
  154,778,963
  154,779,287
  154,779,356
  154,779,423
  154,779,585
  154,779,802
  154,779,843
  154,780,230
  154,780,330
  154,780,409
  154,780,569
  154,780,767
  154,781,472
  154,781,654
  154,781,866
  154,782,126
  154,782,206
  154,782,221
  154,782,231
  154,782,241
  154,782,263
  154,782,390
  154,782,408
  154,782,419
  154,783,170
  154,783,242
  154,783,386
  154,783,412
  154,783,588
  154,783,646
  154,783,653
  154,783,732
  154,784,838
  154,784,849
  154,785,242
  154,785,254
  154,785,946
  154,786,004
  154,786,519
  154,786,884
  154,789,604
  154,790,643
  154,790,784
  154,792,769
  154,792,901
  154,793,009
  154,793,021
  154,793,708
  154,797,880
  154,798,224
  154,798,384
  154,800,669
  154,801,344
  154,801,770
  154,801,836
  154,803,762
  154,806,164
  154,806,989
  154,807,531
  154,809,616
  154,810,229
  154,810,603
  154,810,899
  154,810,952
  154,811,699
  154,812,067
  154,814,682
  154,816,118
  154,818,334
  154,818,538
  154,819,575
  154,819,600
  154,819,714
  154,819,754
  154,819,767
  154,819,822
  154,820,020
  154,820,635
  154,821,172
  154,821,664
  154,821,878
  154,822,265
  154,822,339
  154,822,381
  154,823,244
  154,823,722
  154,824,254
  154,824,593
  154,824,900
  154,825,125
  154,825,681
  154,825,906
  154,825,941
  154,826,017
  154,826,101
  154,826,572
  154,826,635
  154,826,642
  154,826,687
  154,826,730
  154,826,731
  154,827,014
  154,828,061
  154,828,718
  154,828,885
  154,829,124
  154,829,168
  154,829,277
  154,829,310
  154,829,523
  154,830,459
  154,830,483
  154,831,023
  154,831,308
  154,831,506
  154,831,668
  154,831,768
  154,831,778
  154,831,969
  154,832,043
  154,832,426
  154,832,531
  154,832,700
  154,832,767
  154,832,799
  154,832,840
  154,832,844
  154,833,163
  154,833,261
  154,833,334
  154,833,612
  154,833,716
  154,833,892
  154,834,023
  154,834,047
  154,834,130
  154,834,359
  154,834,473
  154,834,481
  154,834,547
  154,834,558
  154,834,571
  154,834,581
  154,835,254
  154,835,322
  154,835,367
  154,835,390
  154,836,323
  154,837,042
  154,837,276
  154,838,475
  154,838,856
  154,839,090
  154,839,220
  154,842,679
  154,848,080
  154,859,679
  154,864,029
  154,868,428
  154,896,121
  154,896,126
  154,896,129
  154,896,349
  154,918,142
  154,919,203
  154,921,232
  154,921,355
  154,929,394
  154,935,850
  154,935,851
  154,947,888
  154,950,383
  154,951,635
  154,953,109
  154,956,297
  154,956,533
  154,958,792
  154,959,840
  154,960,401
  154,961,156
  154,961,494
  154,966,070
  154,973,980
  154,974,906
  154,974,993
  154,975,684
  154,979,118
  154,979,197
  154,979,861
  154,984,013
  154,985,497
  154,986,434
  154,987,113
  154,988,178
  154,988,509
  154,988,510
  154,989,607
  154,989,759
  154,990,010
  154,990,073
  154,990,163
  154,990,929
  154,990,947
  154,991,207
  154,991,371
  154,991,419
  154,991,503
  154,991,796
  154,991,805
  154,991,832
  154,992,106
  154,992,154
  154,992,179
  154,992,604
  154,992,661
  154,992,976
  154,994,337
  154,994,384
  154,994,579
  154,994,779
  154,994,951
  154,995,041
  154,995,062
  154,995,091
  154,995,267
  154,995,969
  154,996,029
  154,996,425
  154,996,509
  154,997,190
  154,997,207
  154,997,620
  154,998,105
  154,998,896
  154,998,897
  154,999,015
  154,999,030
  154,999,254
  154,999,873
  155,000,282
  155,000,989
  155,001,004
  155,001,241
  155,001,246
  155,001,828
  155,001,887
  155,002,147
  155,002,456
  155,002,806
  155,002,908
  155,003,290
  155,003,348
  155,003,863
  155,003,905
  155,004,117
  155,005,324
  155,005,657
  155,005,998
  155,006,139
  155,007,025
  155,007,224
  155,007,244
  155,007,332
  155,008,073
  155,008,295
  155,008,670
  155,010,076
  155,010,351
  155,010,696
  155,010,813
  155,011,030
  155,011,092
  155,011,125
A
A
T/C
3/-
C
A
T
G
G
G
T
T
A
T
C
2
C
G
C
C
2
C
G/C
A/-
T/C
A
T
T
A
G
-
-
C
T
T
-
G
-
G
T
T
C
A
T
T
C
C
T
T
C
G
G
A
A
A
2
-
A
T
C
C
G/2
C
A
G
A
G
-
C
A
5
T
A
3
T
A
C
G
-
G
C
A
A
C
T
A/-
G/2
T/-
T
A/-
T/2
T
-
T
5
-
G
A/G
A
2/-
A
G
G
3
2
T
C/G
-
A
A
C
C
C
C
T
C
T
A
A
A/G
T
C
G
11
21
A
G
2
192/-
G
C/A
A
A
A
G
C
C
A/2
A/T
C
T
A
T
A
A
C
C
C
A
C
G/2
A
A
T
12
G
T
A
2
G
-
G
T
T/C
T
A
G
G
C
5
-
T
C
G
C
G
-
G
G
C
4
3
G
T
T
C
T
C
2
3/-
C
T/C
A/C
C
G/A
A
T
T
C
C
C/T
T/C
G/2
16
C/T
G
T
A
2
4
G
C
T
G
2
T/C
G
G
A
C
T
G
G/A
T
A/G
C
G
G
C
G
T
G/2
C
C
G
C
G
C
-
4/-
C
C
A
G
2
A
G
T
A
C
T
C/T
C
C
-
A
C
C
A
T
G
A
A
T
T
T
A
T
C
C
A
-
T
A
A
-
G
T
A
C
C
C
C
G
C
T
T
G
T
T
A
T
T
2
G
C
C
T/G
C
G
C
T/3
T
T/G
10/-
A/C
A
-
A
G/15
-
2
63
C/3
C
A/3
2/-
2/-
C/4
-
G/T
A
A
G
-
-
A/C
2
T
A
T/C
G
-
T/2
T
2
C
5
2
G
T
A/C
T/A
A
5
A
A
C/A
A
C
G/A
T
C
2
A
T
4
T
A
T
A
T
-
A
G
T
2
-
A
G
G
A
A
G/A
A
A
G/A
-
A
T
C/A
A/G
T
C
C
T
G
3/-
G
-
2
-
T
G/A
G
C
G
A
-
2/-
G
T
G
A
C
G
-
G
G
2
G
T
T
T
G
G
C
G
A
T