Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 312,866 (bp)   Positions: 598
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.033
.0
.005
--
.057
.103
.13
.129
.167
.055
.016
.125
.048
.004
--
.001
.002
.012
.002
--
.056
.081
.743
.0
.001
.006
.0
.003
.049
.003
.001
.058
.0
.073
.001
.002
.008
.378
1.0
.997
.722
.039
.01
.002
.171
.033
.139
.002
.001
.002
.003
.008
.008
.008
.001
.001
.086
--
.463
.155
.024
.02
.001
.006
.092
.002
.0
.001
.004
.008
.382
.03
--
.993
.993
.055
.125
.091
.047
.007
.007
.182
.001
.001
.001
.001
.002
.001
.001
.005
.737
--
.074
.528
.007
.022
.098
.237
.063
.002
.007
.009
.007
.077
.749
.005
.05
.011
.005
.144
.441
.001
.007
.001
.068
.063
.006
.023
.03
.007
.439
.0
.0
.271
.001
--
--
.015
.004
.005
.007
.042
.029
.057
.377
.154
.024
.009
.084
.062
.017
.0
.001
.001
.012
.026
.038
.038
.011
.002
.004
--
--
--
--
--
--
--
.195
.01
.022
.004
.0
.002
.005
.012
.005
.0
.001
.005
.005
.001
.0
.043
.0
.0
.0
.0
.008
--
.01
.003
.026
.594
.001
.001
.0
.108
.079
.34
.036
.0
.002
.0
.003
.012
.001
.0
.062
.335
.033
.024
.005
.001
.13
.013
.428
.018
.014
.001
.001
.001
.008
.001
.001
.001
.006
.095
.012
.892
.595
--
.995
.995
--
--
--
.01
.008
--
.125
--
--
.034
.004
--
--
--
.009
--
--
.003
.002
.003
.002
.0
.0
.001
.002
.032
.076
--
.0
.455
.089
.001
.0
.0
.001
.0
.006
.137
.012
.002
--
--
.001
.0
.004
.012
.114
.062
.003
.075
.009
.004
.012
.0
.029
.391
.0
.0
.003
.004
.0
.998
.003
.0
.001
.009
.005
.322
.0
.0
.001
.008
.03
.023
.0
.006
.004
.001
.185
.133
.001
.003
.003
.007
.002
.002
.001
.001
.063
.001
.003
.006
.026
.022
.002
.023
.0
.072
.004
.092
.592
--
--
.079
.165
.026
.1
.008
.003
.026
.0
.001
.77
.001
.03
.0
.0
.0
.002
.0
.007
.983
.995
.0
.003
.01
.001
.001
.0
.044
.001
.0
.177
.011
.0
.0
.001
.0
.0
.015
.0
.0
.001
.011
.0
.044
.001
.002
.002
.001
.586
.0
.001
.0
.004
.001
.001
.0
.007
.019
.062
.006
.112
.145
.074
.077
.081
.753
.059
.045
.002
.01
.062
.243
.0
.001
.005
.44
.614
.004
.0
.005
.136
.656
.378
.001
.0
.002
.313
.382
.077
.027
.018
.047
.064
.073
--
--
.001
.011
.0
.001
.034
.001
.068
.071
.066
.169
.026
.048
.023
.303
.018
.037
--
.471
.013
.0
.0
.008
.001
.012
.0
.214
.053
.525
--
.001
.001
.275
.322
.0
.0
.869
.0
.866
.007
.965
.866
.0
.006
.003
.111
.021
.056
.011
.006
.028
.03
.014
.046
.031
.003
.11
.04
.011
.001
.0
.002
.0
.003
.0
.011
.012
.003
.005
.003
.006
.218
.0
.002
.102
.001
.005
.697
.982
.0
.0
.0
.003
.022
.413
.298
.216
.982
.002
.005
.002
.0
.0
.013
.276
.114
.138
--
.005
.001
.0
.0
.003
.003
.003
.003
.004
.001
.055
.003
.031
.0
.0
.13
.001
.013
.005
.049
.001
.018
.266
.002
.006
--
.33
.045
.002
.135
.755
.0
.07
.018
.47
.287
.002
.008
.003
.001
.0
.0
.001
.002
.013
.035
.03
--
--
.001
.043
.009
.06
.0
.0
.013
.065
.004
.841
.711
--
--
.008
.053
.83
--
--
--
--
.001
.013
.004
.154
.162
.044
.025
.042
.177
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
A
A
C
G
3
T
G
A
2
C
T
G
C
C
C
C
A
C
T
G
C
16
5
T
26
C
T
G
C
A
T
T
A
A
C
T
C
C
T
11
T
T
A
G
G
46
C
G
G
G
A
A
A
A
C
3
6
C
A
T
G
2
C
6
G
A
C
G
A
C
C
A
6
2
T
C
G
C
2
4
A
G
C
G
A
G
G
A
G
T
C
G
2
T
G
G
A
5
20
T
T
2
C
T
T
T
T
C
G
C
G
C
T
A
T
C
C
C
A
C
G
G
A
T
C
G
T
A
T
T
T
T
A
T
C
T
A
G
A
C
A
A
3
T
A
C
T
G
T
T
T
T
G
C
T
2
T
A
T
T
4
T
T
G
T
A
G
A
G
T
G
C
G
C
T
T
A
C
T
A
C
T
C
C
A
T
G
G
C
G
T
C
A
T
G
T
C
G
A
10
G
4
A
C
C
T
G
T
T
A
T
C
C
A
C
C
G
A
C
T
T
A
10
8
T
T
G
A
T
T
2
A
C
A
C
T
26
6
A
C
4
4
G
T
T
T
C
A
C
C
A
G
G
C
G
C
T
A
C
A
A
A
G
T
T
2
G
19
A
C
10
G
G
4
2
T
10
C
G
A
T
T
T
A
A
A
C
C
T
A
C
G
G
T
T
T
G
T
G
T
A
A
T
G
T
T
A
8
A
C
T
G
A
G
A
C
C
A
A
A
G
G
10
C
T
C
G
G
T
G
C
T
27
2
T
T
A
A
G
C
C
G
T
A
C
C
T
A
T
T
A
G
C
T
G
G
T
G
A
G
C
A
C
G
T
C
G
T
C
T
A
T
C
T
C
A
A
T
G
C
G
G
T
T
T
T
A
T
3
T
11
A
C
T
G
G
A
A
A
A
2
10
T
T
C
A
C
G
A
T
2
A
G
3
C
G
G
C
G
G
4
A
G
G
C
T
T
G
A
G
T
C
T
G
C
8
G
G
G
C
G
G
C
T
G
3
T
G
A
G
43
A
C
A
C
A
G
A
T
A
4
C
A
C
A
T
G
T
C
C
C
G
T
C
A
A
G
T
G
G
A
C
T
A
T
C
T
A
T
T
G
A
G
A
G
G
G
G
T
C
G
T
A
A
T
A
A
C
4
A
A
G
T
C
T
T
T
A
T
T
G
A
G
C
T
C
G
T
C
C
G
G
A
C
4
A
2
A
G
C
107
C
C
A
C
C
T
A
A
2
3
A
A
A
54
C
T
T
T
T
A
2
T
A
T
T
8
C
4
C
A
G
A
T
G
T
T
A
T
G
T
G
A
A
G
C
4
4
C
2
G
2
A
A
A
A
8
T
  154,702,533
  154,705,179
  154,707,473
  154,709,185
  154,709,249
  154,709,272
  154,709,279
  154,709,280
  154,709,323
  154,710,077
  154,710,205
  154,710,382
  154,710,851
  154,710,895
  154,711,698
  154,713,057
  154,713,282
  154,713,301
  154,713,307
  154,713,602
  154,714,365
  154,714,586
  154,714,939
  154,715,151
  154,715,159
  154,715,277
  154,716,126
  154,716,156
  154,716,409
  154,716,645
  154,717,184
  154,717,729
  154,717,891
  154,718,416
  154,718,649
  154,718,750
  154,718,990
  154,719,107
  154,719,202
  154,719,412
  154,719,746
  154,719,957
  154,720,037
  154,720,596
  154,721,110
  154,721,177
  154,721,841
  154,722,271
  154,722,272
  154,722,280
  154,722,312
  154,722,315
  154,722,316
  154,722,317
  154,722,321
  154,722,323
  154,723,054
  154,723,457
  154,723,750
  154,724,034
  154,725,463
  154,725,611
  154,725,658
  154,726,591
  154,726,758
  154,726,837
  154,727,524
  154,727,548
  154,727,559
  154,727,676
  154,727,788
  154,728,925
  154,729,272
  154,730,453
  154,730,454
  154,731,109
  154,733,990
  154,737,250
  154,739,024
  154,739,052
  154,739,721
  154,740,042
  154,740,070
  154,740,074
  154,740,075
  154,740,080
  154,740,082
  154,740,092
  154,740,094
  154,740,096
  154,742,767
  154,749,498
  154,750,616
  154,755,798
  154,756,044
  154,762,084
  154,762,121
  154,762,271
  154,764,034
  154,765,287
  154,765,383
  154,765,402
  154,765,403
  154,766,060
  154,766,430
  154,766,932
  154,768,999
  154,770,655
  154,770,825
  154,771,316
  154,771,857
  154,773,784
  154,792,993
  154,800,669
  154,801,836
  154,806,164
  154,806,989
  154,807,151
  154,807,531
  154,809,616
  154,810,229
  154,810,899
  154,810,952
  154,811,699
  154,812,067
  154,813,775
  154,813,814
  154,815,866
  154,817,516
  154,818,334
  154,818,538
  154,819,494
  154,819,496
  154,819,575
  154,819,600
  154,819,714
  154,819,767
  154,819,822
  154,820,635
  154,821,605
  154,821,664
  154,821,878
  154,821,953
  154,822,265
  154,822,339
  154,822,381
  154,823,250
  154,823,251
  154,823,722
  154,824,254
  154,824,593
  154,824,900
  154,824,980
  154,824,995
  154,824,997
  154,825,010
  154,825,024
  154,825,125
  154,825,681
  154,825,906
  154,825,941
  154,826,017
  154,826,101
  154,826,572
  154,826,635
  154,826,642
  154,826,687
  154,826,730
  154,826,731
  154,826,956
  154,827,014
  154,828,718
  154,828,751
  154,828,885
  154,829,124
  154,829,168
  154,829,277
  154,829,310
  154,829,523
  154,830,272
  154,830,304
  154,830,459
  154,830,483
  154,831,023
  154,831,308
  154,831,506
  154,831,668
  154,831,768
  154,831,778
  154,831,969
  154,832,043
  154,832,426
  154,832,531
  154,832,700
  154,832,767
  154,832,799
  154,832,840
  154,832,844
  154,833,011
  154,833,045
  154,833,163
  154,833,261
  154,833,334
  154,833,612
  154,833,716
  154,833,892
  154,834,023
  154,834,047
  154,834,130
  154,834,359
  154,834,473
  154,834,481
  154,834,547
  154,834,558
  154,834,571
  154,834,581
  154,835,254
  154,835,367
  154,835,390
  154,836,323
  154,837,042
  154,837,276
  154,838,100
  154,838,101
  154,838,475
  154,838,856
  154,838,972
  154,839,090
  154,839,220
  154,839,604
  154,839,767
  154,839,773
  154,839,776
  154,841,419
  154,841,578
  154,842,559
  154,842,621
  154,842,680
  154,843,230
  154,843,650
  154,843,755
  154,844,268
  154,844,593
  154,845,171
  154,845,296
  154,845,406
  154,845,565
  154,845,578
  154,845,739
  154,846,626
  154,848,356
  154,850,162
  154,850,784
  154,851,182
  154,852,711
  154,854,015
  154,855,211
  154,856,005
  154,856,239
  154,856,364
  154,856,988
  154,857,757
  154,858,016
  154,858,383
  154,859,679
  154,859,742
  154,860,450
  154,860,457
  154,860,477
  154,860,687
  154,862,638
  154,862,742
  154,862,770
  154,862,872
  154,862,996
  154,863,023
  154,864,029
  154,864,789
  154,865,218
  154,865,452
  154,866,044
  154,866,139
  154,866,612
  154,866,635
  154,866,639
  154,866,786
  154,867,106
  154,867,110
  154,867,132
  154,867,814
  154,867,881
  154,867,933
  154,867,964
  154,867,978
  154,868,021
  154,868,045
  154,868,048
  154,868,064
  154,868,073
  154,868,303
  154,868,377
  154,868,428
  154,868,553
  154,868,560
  154,874,363
  154,874,522
  154,874,614
  154,875,071
  154,875,099
  154,875,302
  154,875,862
  154,875,899
  154,876,386
  154,878,207
  154,878,237
  154,878,240
  154,878,278
  154,878,280
  154,878,287
  154,878,547
  154,878,704
  154,878,852
  154,878,974
  154,879,303
  154,879,557
  154,879,925
  154,879,988
  154,880,134
  154,880,208
  154,880,279
  154,880,367
  154,881,041
  154,881,385
  154,881,886
  154,881,898
  154,882,181
  154,882,277
  154,882,604
  154,882,661
  154,882,675
  154,882,942
  154,883,311
  154,883,489
  154,883,625
  154,884,197
  154,884,328
  154,884,334
  154,884,514
  154,884,528
  154,884,530
  154,884,545
  154,884,546
  154,884,547
  154,884,563
  154,884,589
  154,884,719
  154,884,944
  154,884,958
  154,884,984
  154,884,993
  154,885,032
  154,885,048
  154,885,084
  154,885,691
  154,885,795
  154,885,796
  154,886,259
  154,886,419
  154,886,526
  154,887,014
  154,887,093
  154,887,252
  154,887,312
  154,887,322
  154,887,772
  154,887,996
  154,888,096
  154,888,115
  154,888,118
  154,888,252
  154,888,343
  154,889,201
  154,889,280
  154,889,590
  154,889,638
  154,890,097
  154,890,140
  154,890,163
  154,890,322
  154,890,326
  154,890,328
  154,891,402
  154,893,042
  154,893,356
  154,893,409
  154,893,551
  154,893,719
  154,893,888
  154,894,173
  154,894,203
  154,894,638
  154,894,756
  154,894,778
  154,895,434
  154,895,449
  154,895,507
  154,895,568
  154,895,586
  154,895,639
  154,895,747
  154,895,773
  154,895,783
  154,896,005
  154,896,099
  154,896,105
  154,896,107
  154,896,111
  154,896,121
  154,896,126
  154,896,129
  154,896,223
  154,896,281
  154,896,349
  154,896,442
  154,896,463
  154,896,751
  154,896,839
  154,897,046
  154,897,848
  154,898,168
  154,899,067
  154,899,641
  154,900,259
  154,900,545
  154,900,778
  154,901,811
  154,901,823
  154,901,835
  154,902,744
  154,904,217
  154,904,904
  154,905,821
  154,907,434
  154,909,460
  154,910,218
  154,910,245
  154,911,372
  154,913,921
  154,914,363
  154,914,631
  154,918,142
  154,919,203
  154,920,887
  154,921,232
  154,921,355
  154,921,773
  154,921,774
  154,921,928
  154,922,556
  154,922,861
  154,922,910
  154,923,047
  154,923,108
  154,923,152
  154,923,572
  154,923,633
  154,923,735
  154,923,771
  154,923,850
  154,923,868
  154,923,876
  154,923,883
  154,923,884
  154,923,893
  154,923,915
  154,923,933
  154,923,967
  154,924,244
  154,924,454
  154,924,475
  154,924,763
  154,924,851
  154,924,940
  154,925,003
  154,925,314
  154,925,331
  154,925,377
  154,925,427
  154,925,633
  154,925,668
  154,925,716
  154,925,718
  154,925,735
  154,925,830
  154,925,887
  154,926,041
  154,926,072
  154,926,212
  154,926,308
  154,926,340
  154,926,477
  154,926,523
  154,926,771
  154,926,837
  154,927,023
  154,927,118
  154,927,143
  154,927,212
  154,927,239
  154,927,314
  154,927,352
  154,927,699
  154,927,787
  154,927,821
  154,927,929
  154,928,457
  154,928,560
  154,928,563
  154,928,701
  154,928,899
  154,928,900
  154,928,903
  154,928,904
  154,929,148
  154,929,242
  154,929,329
  154,929,349
  154,929,394
  154,929,400
  154,929,412
  154,929,608
  154,930,504
  154,930,812
  154,931,028
  154,931,412
  154,931,885
  154,932,010
  154,932,012
  154,932,337
  154,932,535
  154,932,649
  154,932,860
  154,933,307
  154,935,850
  154,936,874
  154,940,262
  154,956,599
  154,956,832
  154,958,792
  154,959,840
  154,960,326
  154,960,401
  154,961,156
  154,961,494
  154,961,644
  154,966,070
  154,973,925
  154,973,927
  154,973,980
  154,974,906
  154,974,993
  154,975,684
  154,979,118
  154,979,197
  154,979,861
  154,984,013
  154,985,397
  154,985,497
  154,985,704
  154,986,434
  154,987,113
  154,988,263
  154,988,509
  154,988,510
  154,989,296
  154,989,607
  154,989,759
  154,989,803
  154,990,073
  154,991,371
  154,991,651
  154,994,587
  154,994,950
  154,995,331
  154,995,630
  154,995,735
  154,995,865
  154,995,871
  154,997,196
  154,997,257
  154,997,338
  155,000,990
  155,000,991
  155,004,354
  155,005,324
  155,007,025
  155,009,901
  155,010,813
T
G
T
9
-
C
T
T
-
-
G
T
5
T
C/G
T
2
T
C
A
T
-
-
C
-
T
G
C
A
G
C
C
C
C
T
C
T
G
C
-
G
C
G
A
-
-
T
-
A
-
G
G
G
G
-
-
-
-
-
C
A
-
T
-
C
13
T
-
T
T
A
G
6/-
2/-
-
C/2
A
15/17
-
-
A/10
-
A
A
T
T
2
C
-
C
6
9
2/-
G
15/17
A
5
-
-
C
T/5
2/-
C/7
C
C
C
C
T
A
T
A
9/21
T/2
C
C
16
T
28
G
T
A
3/4
G
C
T
A
2
13/17
7/19
C
G
15
63
G
A
C
G
A
G
4
G
G
-
C
G
T
2
A
C
C
G
C
-
-
8
-
3
G
C
-
-
C
C
A
G
2
A
G
T
4/3
A
T
A
T
C
C
-
A
C
-
T
C
A
T
G
A
A
T
T
T
A
T
C
C
A
-
T
A
G
-
A
-
G
T
A
C
C
C
C
G
C
T
T
G
T
T
A
T
2
G
C
C
10/-
-
G
C
5/3
G
C
T/3
-
G
5
9
T
C
-
-
G
T
-
-
A
-
2
C
T
-
T
T
G
-
A
T
A
T
3
C
T
G
G
G
A
C
G
-
2
-
G
C/2
10/-
5
3
-
-
C
-
T
A
3/5
C
C
C
G
2
G
-
T
C
G
T
A
A
C
C
6
T
C
A
C
G
C
C
C
C
A
G
-
T
T
T/2
A
G
A
G
T
A
-
G
G
T
A
-
T
C
15/13
A
A
A
A
A
C
-
-
C
C
G
G
A
T
A
A
C
G
T
G
C
G
C
C
3
7
T
A
A
A
C
A
G
T
G
C
T
A
G
T
T
A
T
A
G
C
G
2
A
G
G
C
A
T
A
C
A
2
C
C
G
C
-
-
-
3
2
G
A
A
G
G
T
C
-
-
C
C
5
C
T
T
G
C
-
C
A
-
2
T
-
A
-
A
-
9/5
15
A
A
C
C
A
G
T
5
A
A
T
2
-
G/A
G/A
A
A
T
C
T
C
A
-
C
T
C
2
-
2
T
A/63
C/3
C
A
-
C
G
-
A
T
T
G
C
C
G
T
T
T
A
C
T
G
G
A
A
A
A
G
T
A
T
C
A
-
G
C
C
T
G
T
T
T
-
C
A
C
T
A
C
G
G
2
G
G
T
-
G
G
T
C
T
C
C
C
T
12
C
A
4
T
T
C
T
9
C
T
2
A
T
C
T
-
G
-
T
A
T
-
T
T
3
T
?
G
T
G
-
-
-
C
2
-
T
T/-
T/-
A
C
G
-
2
T
2
C
-
5
-
2
G
A
C
A
A
A
5
G
A
T
-
4
3/9
-
A
-
-
-
-
-
C
2/-
-
G
G
-
-
C