Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 312,866 (bp)   Positions: 498
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.028
.0
.001
.002
.052
.292
.096
.322
.119
.179
.19
.033
.011
.148
.138
.058
.066
.157
.003
.007
.007
.0
.0
.001
.0
.292
.162
.189
.081
.001
.0
.001
.018
.005
.005
.0
.001
.06
.002
.001
.083
.001
.004
.003
.003
.023
.025
.084
.058
.031
.292
.258
.01
.005
.001
.002
.0
.637
.926
.9
.003
.0
.001
.002
.0
.003
.002
.253
.277
.021
.026
--
--
--
--
--
--
.067
.167
.055
.016
.125
.048
--
.001
.002
.012
.002
--
.056
.069
.171
.041
.002
.001
.002
.003
.008
.008
.008
.001
.001
.005
.107
.001
--
.055
.181
.007
.182
.001
.001
.001
.001
.002
.001
.001
.005
.088
--
.074
.022
.063
.002
.007
.009
.077
.749
.005
.017
.05
.011
.005
.441
.001
.001
.872
.032
.425
.001
.858
.0
.001
.039
--
.03
--
.001
.013
--
.002
.071
.652
.51
.452
.013
.001
.002
.0
.233
.002
.005
.003
.008
.208
.028
.002
.009
.0
.025
.065
.055
.01
.0
.015
.104
--
.054
--
--
--
--
--
--
--
.004
.004
.0
.01
.005
.013
.0
.002
.0
.001
.064
.359
.03
.0
.0
.0
.011
.003
.001
.0
.002
.0
.002
.001
.01
.036
.02
.006
.0
.008
.002
.001
.0
.006
.004
.005
.009
.031
.001
.015
.181
.068
.0
.063
.935
.006
.023
.03
.007
.439
.0
.0
.0
.271
.001
--
.02
.015
.039
.004
.005
.007
.042
.029
.057
.377
.154
.166
.024
.009
.046
.084
.941
.062
.017
.0
.001
.001
.012
.026
.038
.038
.011
.002
.004
--
--
--
--
--
--
.195
.01
.022
.004
.0
.002
.005
.012
.005
.0
.001
.005
.005
.0
.001
.043
.0
.0
.0
.0
.008
.003
.026
.594
.001
.001
.0
.108
.079
.34
.036
.0
.002
.0
.003
.012
.001
.0
.062
.335
.033
.024
.005
.001
.13
.013
.428
.018
.014
.001
.001
.001
.008
.001
.001
.001
.006
.003
.095
.012
.892
.595
--
.995
--
--
.066
.01
.008
--
--
--
.121
.224
--
--
.009
.004
.012
.391
.761
.789
.004
--
.382
.077
.027
.018
.047
.064
.073
--
.168
.005
.012
--
.001
.275
.322
.004
.006
.338
.33
.003
.015
.136
.135
.755
.0
.07
.018
.47
.287
.002
.003
.001
.0
.0
.001
.002
.013
.035
.03
--
--
.001
.043
.009
.003
.0
.0
.065
.004
.954
.711
.0
.354
.975
.896
--
--
--
.044
.082
.001
.195
.025
.037
.02
.026
.175
.181
.002
.294
.014
.013
.042
.008
.0
.045
.002
.001
.001
.003
.002
.018
.485
.107
.83
--
--
.06
.018
.002
.009
.115
.228
.0
.0
.17
.0
.063
.004
.015
.136
.007
.0
.0
.01
.022
.276
.046
.0
.01
.006
.012
.701
.276
.065
.025
.009
.02
.549
.042
.002
.002
.308
.132
.057
.001
.177
.224
.012
.003
.081
.0
.015
.335
.054
.293
.015
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
Dnah11
T
G
C
T
3
A
G
G
A
A
A
G
A
G
C
T
G
T
A
T
T
T
T
G
A
T
G
A
G
G
A
G
A
A
T
G
A
C
T
C
A
G
T
C
C
G
C
C
T
G
A
C
C
T
7
G
2
A
A
T
G
5
C
T
C
G
C
C
C
C
C
T
T
C
C
T
G
G
A
2
C
T
G
C
C
C
A
C
T
G
C
6
G
47
G
G
G
A
A
A
A
C
3
T
2
G
2
C
2
A
G
C
G
A
G
G
A
G
T
2
G
2
G
20
T
T
2
T
T
T
C
T
C
G
G
A
C
T
A
A
C
T
A
A
192
A
C
G
G
C
T
T
T
A
A
T
C
T
C
G
G
T
T
T
G
T
G
G
G
C
A
C
A
C
G
T
A
A
A
30
C
T
A
T
A
T
G
A
6
C
T
A
T
T
6
A
A
G
G
C
T
T
T
A
C
A
T
C
C
T
G
5
3
T
T
A
A
G
G
14
T
C
C
A
A
G
C
T
G
C
T
C
C
A
C
G
C
G
A
T
C
T
C
A
A
T
T
T
T
A
T
C
T
C
A
G
C
A
A
C
A
A
3
T
A
C
T
G
T
T
T
T
G
C
2
T
A
T
T
4
T
T
G
T
A
G
A
G
T
G
T
C
C
T
T
A
C
T
T
C
C
A
T
G
G
C
G
T
C
A
T
G
T
C
G
A
10
G
4
A
C
C
T
G
T
T
A
T
C
C
A
C
C
G
C
A
C
T
T
A
8
T
T
4
A
T
T
2
26
T
C
T
C
2
T
10
A
4
2
T
C
3
C
G
G
C
G
G
A
2
C
3
43
A
A
C
T
2
5
C
C
A
C
A
2
3
A
A
A
54
C
T
T
T
A
2
T
A
T
T
8
C
4
C
A
C
A
T
T
T
G
T
C
G
G
G
G
T
G
G
G
A
C
G
6
A
A
G
C
3
C
T
A
C
G
A
8
T
T
6
T
T
A
G
A
A
G
G
C
T
G
A
G
C
C
A
G
T
T
C
A
3
T
2
T
A
A
G
A
T
A
G
T
2
A
C
A
G
T
A
A
A
A
T
A
C
C
8
6
G
A
T
T
C
C
A
G
C
  154,699,415
  154,699,758
  154,700,098
  154,700,635
  154,700,952
  154,701,105
  154,701,177
  154,701,242
  154,701,489
  154,701,802
  154,701,874
  154,701,875
  154,702,533
  154,702,569
  154,702,668
  154,702,785
  154,702,996
  154,703,063
  154,703,364
  154,703,406
  154,703,413
  154,703,419
  154,703,500
  154,703,578
  154,703,588
  154,703,596
  154,703,673
  154,704,374
  154,704,609
  154,704,932
  154,705,081
  154,705,086
  154,705,091
  154,705,099
  154,705,157
  154,705,174
  154,705,179
  154,705,185
  154,705,203
  154,705,350
  154,705,421
  154,705,457
  154,705,468
  154,705,477
  154,705,505
  154,705,519
  154,705,523
  154,705,524
  154,705,684
  154,705,690
  154,705,711
  154,705,850
  154,705,903
  154,706,018
  154,706,147
  154,706,188
  154,706,234
  154,706,675
  154,706,920
  154,707,003
  154,707,021
  154,707,133
  154,707,165
  154,707,193
  154,707,199
  154,707,201
  154,707,519
  154,707,521
  154,707,716
  154,707,718
  154,707,831
  154,707,944
  154,708,427
  154,708,447
  154,708,455
  154,708,480
  154,708,559
  154,709,185
  154,709,251
  154,709,323
  154,710,077
  154,710,205
  154,710,382
  154,710,851
  154,711,698
  154,713,057
  154,713,282
  154,713,301
  154,713,307
  154,713,602
  154,714,365
  154,714,596
  154,721,110
  154,721,176
  154,722,271
  154,722,272
  154,722,280
  154,722,312
  154,722,315
  154,722,316
  154,722,317
  154,722,321
  154,722,323
  154,726,590
  154,726,717
  154,727,548
  154,729,276
  154,731,109
  154,737,253
  154,739,721
  154,740,042
  154,740,070
  154,740,074
  154,740,075
  154,740,080
  154,740,082
  154,740,092
  154,740,094
  154,740,096
  154,747,721
  154,749,498
  154,750,616
  154,762,084
  154,764,034
  154,765,287
  154,765,383
  154,765,402
  154,766,060
  154,766,430
  154,766,932
  154,768,799
  154,768,999
  154,770,655
  154,770,825
  154,771,857
  154,772,658
  154,773,147
  154,773,536
  154,773,640
  154,773,654
  154,773,784
  154,774,268
  154,774,679
  154,774,684
  154,774,844
  154,775,093
  154,775,633
  154,775,709
  154,776,195
  154,776,269
  154,776,708
  154,777,078
  154,777,244
  154,777,282
  154,777,284
  154,777,324
  154,777,626
  154,777,790
  154,777,824
  154,777,827
  154,778,140
  154,778,429
  154,778,467
  154,778,963
  154,779,287
  154,779,356
  154,779,423
  154,779,585
  154,779,802
  154,779,843
  154,780,230
  154,780,251
  154,780,330
  154,780,409
  154,780,569
  154,780,767
  154,781,472
  154,781,654
  154,781,866
  154,781,961
  154,782,126
  154,782,206
  154,782,221
  154,782,231
  154,782,241
  154,782,263
  154,782,390
  154,782,408
  154,782,419
  154,783,170
  154,783,242
  154,783,386
  154,783,412
  154,783,588
  154,783,646
  154,783,653
  154,783,732
  154,783,816
  154,784,216
  154,784,479
  154,784,838
  154,784,849
  154,785,242
  154,785,254
  154,785,946
  154,786,004
  154,786,519
  154,786,884
  154,788,082
  154,789,604
  154,790,643
  154,790,782
  154,790,784
  154,792,769
  154,792,901
  154,792,994
  154,793,009
  154,793,021
  154,793,708
  154,797,534
  154,797,880
  154,798,224
  154,798,384
  154,800,624
  154,800,669
  154,801,344
  154,801,770
  154,801,836
  154,803,762
  154,806,164
  154,806,547
  154,806,989
  154,807,151
  154,807,531
  154,809,616
  154,810,229
  154,810,603
  154,810,899
  154,810,952
  154,811,699
  154,812,067
  154,813,814
  154,814,682
  154,815,866
  154,816,118
  154,817,516
  154,818,334
  154,818,538
  154,819,494
  154,819,496
  154,819,575
  154,819,600
  154,819,714
  154,819,754
  154,819,767
  154,819,822
  154,820,020
  154,820,635
  154,821,172
  154,821,605
  154,821,664
  154,821,878
  154,821,953
  154,822,265
  154,822,339
  154,822,381
  154,823,250
  154,823,251
  154,823,722
  154,824,254
  154,824,593
  154,824,900
  154,824,980
  154,824,995
  154,825,010
  154,825,024
  154,825,125
  154,825,681
  154,825,906
  154,825,941
  154,826,017
  154,826,101
  154,826,572
  154,826,635
  154,826,642
  154,826,687
  154,826,730
  154,826,731
  154,826,956
  154,827,014
  154,828,061
  154,828,718
  154,828,885
  154,829,124
  154,829,168
  154,829,277
  154,829,310
  154,829,523
  154,830,459
  154,830,483
  154,831,023
  154,831,308
  154,831,506
  154,831,668
  154,831,768
  154,831,778
  154,831,969
  154,832,043
  154,832,426
  154,832,531
  154,832,700
  154,832,767
  154,832,799
  154,832,840
  154,832,844
  154,833,011
  154,833,045
  154,833,163
  154,833,261
  154,833,334
  154,833,612
  154,833,716
  154,833,892
  154,834,023
  154,834,047
  154,834,130
  154,834,359
  154,834,473
  154,834,481
  154,834,547
  154,834,558
  154,834,571
  154,834,581
  154,835,254
  154,835,322
  154,835,367
  154,835,390
  154,836,323
  154,837,042
  154,837,276
  154,838,101
  154,838,475
  154,838,856
  154,839,010
  154,839,090
  154,839,220
  154,839,604
  154,839,774
  154,842,621
  154,844,263
  154,848,080
  154,859,679
  154,859,741
  154,862,996
  154,863,023
  154,864,029
  154,865,452
  154,865,465
  154,865,467
  154,878,973
  154,879,925
  154,896,099
  154,896,105
  154,896,107
  154,896,111
  154,896,121
  154,896,126
  154,896,129
  154,896,281
  154,901,817
  154,910,244
  154,910,245
  154,918,142
  154,919,203
  154,921,232
  154,921,355
  154,929,394
  154,935,851
  154,936,039
  154,940,262
  154,943,664
  154,951,635
  154,956,297
  154,958,792
  154,959,840
  154,960,326
  154,960,401
  154,961,156
  154,961,494
  154,961,644
  154,966,070
  154,973,927
  154,973,980
  154,974,906
  154,974,993
  154,975,684
  154,979,118
  154,979,197
  154,979,861
  154,984,013
  154,985,397
  154,985,497
  154,985,704
  154,986,434
  154,987,113
  154,988,178
  154,988,509
  154,988,510
  154,989,607
  154,989,759
  154,990,010
  154,990,073
  154,990,163
  154,990,929
  154,990,947
  154,991,207
  154,991,371
  154,991,419
  154,991,503
  154,991,796
  154,991,805
  154,991,832
  154,992,106
  154,992,154
  154,992,170
  154,992,177
  154,992,179
  154,992,604
  154,992,661
  154,992,976
  154,994,304
  154,994,337
  154,994,384
  154,994,579
  154,994,587
  154,994,779
  154,994,951
  154,994,984
  154,994,988
  154,994,992
  154,995,041
  154,995,062
  154,995,091
  154,995,267
  154,995,320
  154,995,331
  154,995,969
  154,996,029
  154,996,425
  154,996,509
  154,997,190
  154,997,207
  154,997,620
  154,998,105
  154,998,896
  154,998,897
  154,999,015
  154,999,030
  154,999,254
  154,999,873
  155,000,282
  155,000,989
  155,001,004
  155,001,241
  155,001,246
  155,001,828
  155,001,887
  155,002,147
  155,002,456
  155,002,806
  155,002,908
  155,003,290
  155,003,348
  155,003,863
  155,003,905
  155,004,117
  155,005,324
  155,005,657
  155,005,998
  155,006,139
  155,007,025
  155,007,224
  155,007,244
  155,007,332
  155,008,073
  155,008,295
  155,008,670
  155,009,901
  155,009,903
  155,010,076
  155,010,351
  155,010,696
  155,010,813
  155,011,030
  155,011,092
  155,011,125
  155,011,149
  155,011,157
A
A
A
C
-
C
A
T
G
G
G
T
T
A
T
C
2
C
G
C
C
2
C
C
-
C
A
T
A
A
G
A
G
G
C
A
G
T
2
T
G
A
G
T
G
T
T
A
C
A
C
A
A
C
-
A
-
G
G
C
A
-
A
C
T
A
T
T
A
T
T
C
T/13
T
T
-
A
11
-
-
-
G
T
15
C/G
T
2
T
C
A
T
-
-
47/-
-
A
-
G
G
G
G
-
-
3
2/-
G/-
2/-
5/CA
2/-
10
-
A
A
T
T
2
C
-
C
2/-
9
2/-
A
-
C
5
-
C
C
C
T
C
T
A
A
G
T
C
G
11
21
A
G
2
-
G
A
A
A
A
G
C
C
2
T
C
T
A
T
A
A
C
C
C
A
C
2
A
A
T
12
7
G
T
A
2
G
-
G
30/-
T
C
T
A
G
G
C
5
-
T
C
G
C
G
-
G
G
7
7
T
C
4
3
G
T
T
C
T
3
C
2
5/-
3/-
C
C
-
A/C
C
A
-
A
T
T
A/-
C
C
C/T
C
2
16
13/9
T
28
G
T
A
2
4
G
C
T
2
G
7
2
T/3
C
G
15
63
G
A
C
T
G
A
T
G
C
4
G
G
-
C
G
T
2
A
C
C
G
C
G/-
C/-
-
3
G
C
-
-
C
C
A
G
2
A
G
T
T/2
A
C
T
T
C
C
-
A
C
C
A
T
G
A
A
T
T
T
A
T
C
C
A
-
T
A
G
-
A
-
G
T
A
C
C
C
C
G
C
T
T
G
T
T
A
T
T
2
G
C
C
8/6
G
C
4/-
G
C
T/3
2/-
-
T/3
T
G
2
2/-
C
-
A/3
4/-
2/-
3
5
-
2
T
-
A
-
A
9
2/-
C/3
3/-
-
2
A/63
3
C
-
-
4/5
3
-
A
G
-
-
-
C
2
-
T
T/3
A
C
G
-
2
T
2
C
-
5
-
2
G
T
C
A
A
5
A
A
A
A
C
A
T
C
2
A
T
4
T
A
-
G
T
A
T
-
T
A
G
T
4
2
-
C
C
-
A
G
G
A
2
T
A
A
A
A
A
-
A
T
A
G
T
C
C
T
G
-
G
-
2
-
T
A
G
C
G
A
-
-
G
T
G
A
C
G
-
G
G
2
G
T
T
8/-
6/-
T
G
G
C
G
A
T
C
A