Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 48,865 (bp)   Positions: 327
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.996
.0
.0
.002
.0
--
--
.008
.089
.009
.048
.268
.013
.153
.15
.129
.104
.005
.025
.006
.0
.004
.001
.002
.008
.31
.011
.001
.002
.001
.008
.013
.011
.085
.069
--
.005
.002
.341
.336
.099
.052
.089
.186
.03
.007
.018
.879
.078
.011
.03
.018
.027
.029
.086
.007
.008
.03
.017
.003
.045
.249
.11
.012
.016
.02
.076
.008
.057
.039
.026
.064
.952
.007
.085
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.0
.079
.879
.003
.003
.011
.059
.06
.04
.032
.003
.005
.003
.089
.001
.005
.023
.072
.585
.582
.063
.227
.007
.001
.107
.058
.053
.109
.37
.378
.277
.001
.015
.131
.147
.264
.024
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.163
.289
.407
.029
.11
.027
.182
.004
.017
.001
.1
.046
.107
.157
.196
.017
.166
.025
.029
.003
.01
.036
.005
.009
.011
.017
.027
.029
.031
.0
.001
.001
.99
.001
.007
.002
.077
.002
.068
.024
.005
.005
.029
.981
.003
.002
.001
.007
.001
.06
.007
.076
.115
.023
.014
.007
.168
.605
.438
.006
.002
.007
.051
.081
.025
--
--
--
.001
.013
.222
.058
.007
.635
.007
.011
.0
.0
.002
.0
.987
.453
.086
.004
.018
.016
.0
.874
.032
.001
.004
.05
.0
.049
.042
.101
.083
.038
.034
.181
.001
.021
.815
.189
.0
.0
.011
.002
.002
--
--
.01
.122
.15
.08
.0
.008
.109
.001
.0
.0
.0
.022
.001
.014
.003
.006
--
.009
.032
.001
.003
.001
.009
.002
.0
.001
.058
.057
.011
.001
.006
.509
.001
.064
.005
.333
.005
.0
.0
.001
.008
.002
.0
.0
.002
.0
.031
.004
.008
.002
.002
.004
.037
1.0
.007
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
G
C
T
38
14
2
G
C
A
G
A
G
G
T
G
G
A
G
C
T
T
T
T
T
A
G
A
C
A
G
C
T
C
T
T
T
A
T
T
G
G
T
G
T
G
G
T
C
T
A
A
G
G
G
A
C
A
T
C
A
A
G
G
C
A
A
T
C
G
G
C
T
G
C
G
G
T
A
A
A
A
T
A
G
T
C
G
A
G
C
C
A
C
A
T
A
G
A
A
C
G
A
T
A
A
C
A
T
T
T
2
T
8
G
T
C
G
T
G
A
C
G
T
T
T
C
G
T
G
T
A
G
G
C
A
G
G
G
G
T
G
T
C
T
G
C
G
T
A
G
G
G
2
T
C
G
C
8
C
A
C
A
G
T
G
T
T
C
T
A
A
3
A
G
G
T
C
T
2
C
C
A
T
T
A
G
C
A
T
5
T
G
A
G
A
C
A
C
G
C
A
T
A
A
G
T
A
T
G
G
C
G
G
A
C
T
A
A
A
T
T
C
C
G
2
G
G
T
C
T
T
2
T
A
C
C
7
C
G
8
G
A
C
A
A
C
8
A
A
G
A
G
T
C
G
G
4
G
5
G
G
T
A
G
A
A
G
C
A
T
T
C
G
G
A
C
G
T
A
T
G
4
22
7
A
C
C
T
A
A
C
A
4
T
G
C
3
2
G
10
C
C
C
G
T
T
24
C
A
C
A
G
T
T
T
A
C
C
4
2
C
T
G
G
G
T
  8,495,512
  8,495,810
  8,495,819
  8,495,998
  8,497,199
  8,497,216
  8,497,301
  8,497,340
  8,497,862
  8,497,889
  8,498,053
  8,498,222
  8,498,388
  8,498,440
  8,498,890
  8,498,891
  8,498,892
  8,499,017
  8,499,206
  8,499,256
  8,499,558
  8,499,640
  8,499,695
  8,499,742
  8,499,793
  8,500,210
  8,500,247
  8,500,356
  8,500,641
  8,500,683
  8,500,981
  8,501,077
  8,501,445
  8,501,552
  8,501,621
  8,501,639
  8,501,720
  8,501,772
  8,501,806
  8,501,807
  8,502,048
  8,502,050
  8,502,088
  8,502,192
  8,502,343
  8,502,384
  8,502,408
  8,502,864
  8,503,217
  8,503,424
  8,503,592
  8,503,769
  8,503,799
  8,503,845
  8,503,898
  8,503,913
  8,503,914
  8,503,975
  8,504,108
  8,504,136
  8,504,320
  8,504,362
  8,504,389
  8,504,496
  8,504,517
  8,504,518
  8,504,523
  8,504,612
  8,504,637
  8,504,717
  8,505,120
  8,505,363
  8,505,421
  8,505,511
  8,505,549
  8,505,566
  8,505,854
  8,506,009
  8,506,117
  8,506,137
  8,506,333
  8,506,403
  8,506,469
  8,506,555
  8,506,560
  8,507,127
  8,507,191
  8,507,336
  8,507,904
  8,507,957
  8,508,083
  8,508,244
  8,508,322
  8,508,361
  8,508,377
  8,508,413
  8,508,434
  8,508,447
  8,508,524
  8,508,601
  8,508,608
  8,508,661
  8,508,902
  8,508,957
  8,508,959
  8,509,069
  8,509,247
  8,509,292
  8,509,860
  8,509,994
  8,510,008
  8,510,010
  8,510,184
  8,510,360
  8,510,369
  8,510,418
  8,510,454
  8,510,573
  8,510,651
  8,510,722
  8,510,991
  8,511,146
  8,511,426
  8,511,536
  8,511,622
  8,511,721
  8,512,126
  8,512,774
  8,513,779
  8,514,004
  8,514,100
  8,514,731
  8,514,956
  8,515,128
  8,515,323
  8,515,692
  8,515,751
  8,516,010
  8,516,421
  8,516,623
  8,517,097
  8,517,120
  8,517,129
  8,517,187
  8,517,322
  8,517,323
  8,517,718
  8,518,229
  8,518,852
  8,519,008
  8,519,146
  8,519,170
  8,519,276
  8,519,352
  8,519,909
  8,520,553
  8,520,580
  8,520,630
  8,520,657
  8,520,697
  8,521,394
  8,521,488
  8,521,513
  8,521,675
  8,521,759
  8,522,078
  8,522,327
  8,522,707
  8,523,760
  8,523,777
  8,524,294
  8,524,350
  8,524,431
  8,524,536
  8,524,546
  8,524,674
  8,524,886
  8,524,916
  8,524,931
  8,525,487
  8,525,520
  8,525,904
  8,526,187
  10,604,296
  10,604,297
  10,604,299
  10,604,301
  10,604,302
  10,604,304
  10,604,551
  10,604,711
  10,605,011
  10,605,146
  10,605,528
  10,605,599
  10,606,057
  10,606,464
  10,606,716
  10,607,361
  10,607,375
  10,607,464
  10,607,465
  10,607,502
  10,607,541
  10,609,367
  10,610,765
  10,610,977
  10,611,527
  10,613,180
  10,613,243
  10,613,328
  10,613,740
  10,616,125
  10,617,310
  10,617,579
  10,617,581
  10,617,726
  10,617,796
  10,617,839
  10,617,888
  10,617,891
  10,617,893
  10,617,897
  10,617,898
  10,618,625
  10,618,628
  10,618,648
  10,618,690
  10,618,692
  10,619,028
  10,619,307
  10,620,321
  10,622,524
  10,623,193
  10,623,460
  10,623,926
  10,624,049
  10,624,499
  10,624,587
  10,624,688
  10,624,988
  10,625,019
  10,625,200
  10,626,280
  10,626,666
  10,626,955
  10,627,354
  10,627,529
  10,627,563
  10,627,663
  10,628,324
  10,628,448
  10,628,632
  10,628,936
  10,629,626
  10,629,872
  10,629,881
  10,629,888
  10,629,968
  10,630,297
  10,630,585
  10,631,330
  10,631,471
  10,631,563
  10,631,789
  10,631,872
  10,632,308
  10,633,529
  10,633,530
  10,634,311
  10,634,700
  10,634,960
  10,635,044
  10,635,605
  10,636,272
  10,636,764
  10,636,991
  10,637,172
  10,637,763
  10,637,986
  10,638,382
  10,638,604
  10,639,757
  10,639,867
  10,639,902
  10,639,947
  10,639,958
  10,640,134
  10,640,783
  10,641,606
  10,641,636
  10,641,817
  10,641,969
  10,642,038
  10,642,299
  10,642,353
  10,642,408
  10,642,995
  10,642,996
  10,643,230
  10,643,241
  10,643,430
  10,643,559
  10,643,731
  10,643,866
  10,643,880
  10,644,553
  10,644,585
  10,645,013
  10,645,184
  10,645,192
  10,645,284
  10,645,602
  10,646,323
  10,646,327
  10,646,551
  10,646,887
  10,647,159
  10,647,211
  10,648,023
  10,648,025
  10,648,620
  10,648,654
  10,649,177
  10,649,786
  10,651,554
  10,651,944
T
C
T
C
38/-
14/-
-
A
T
G
T
G
A
A
C
A
C
G
A
T
C
C
C
G
G
G
A
18
T
T
-
T
C
T
C
A
C
G
A
G
A
A
C
2
C
3
A
C
T
A
T
C
A
A
A
G
T
-
C
T
G
G
A
T
T
G
G
C
G
C
A
T
C
A
-
C
A
G
T
G
G
G
A
G
2
C
T
A
G
C
T
T
G
T
G
C
T
A
G
G
A
A
G
C
C
G
T
G
C
C
-
-
C
-
C
C
T
A
2
A
G
T
A
G
G
C
2
A
C
-
G
C
C
A
T
G
A
A
A
A
C
C
A
A
A
A
T
A
A
G
T
A
A
-
C
-
A
G
-
G
G
-
C
A
G
A
C
C
G
2
2
G
-
G
T
A
C
A
A
-
A
T
G
2
7
C
2
5
47
A
-
G
A
T
T
G
2
T
T
A
T
C
C
G
G
A
G
2
C
A
5
T
A
A
C
A
A
3
A/3
4
A
-
A
T
3
-
8
C
C
T
C
A
-
11/13
11
T
A
-
7
A
-
C
C
A
3
G
T
8/-
G
G
2
G
T
C
T
-
G/3
4/-
-
-
T
A
C
2
A
G
G
7
A
9
13
C
82
A
A
G
T
A
C
C
G
C
-
-
-
4
4
T
C
G
G
T
C
-
C
G/-
T
3/-
2/-
G/2
10/-
T
A
T
A
C
C
-
T
T
-
G
A
C
A
C
2
T
T
4/-
2/-
C/3
T/3
A
C
A
C