Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 48,865 (bp)   Positions: 336
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.996
.187
.007
.0
.019
--
--
.005
.089
.009
.003
.268
.013
.153
.058
.15
.129
.104
.005
.025
.006
.0
.0
.004
.03
.001
.002
.008
.001
.31
.011
.001
.029
.002
.001
.02
.008
.013
.011
.085
.069
--
.005
.341
.336
.099
.089
.186
.03
.007
.018
.879
.971
.078
.011
.03
.018
.027
.029
.086
.007
.008
.03
.017
.003
.045
.249
.11
.012
.016
.02
.076
.008
.057
.039
.054
.105
.026
.952
.007
.085
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.879
.003
.004
.011
.06
.032
.003
.005
.004
.254
.37
.372
.435
.277
.264
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.163
.289
.407
.088
.027
.182
.004
.004
.017
.001
.046
.196
.005
.017
.254
.063
.003
.01
.005
.057
.002
.985
.981
.0
.004
.003
.001
.001
.003
.0
.0
.003
.0
.001
.002
.023
.001
.002
.007
.068
.0
.0
.0
.0
.001
.005
.001
.0
.001
.0
.0
.569
--
--
--
.002
.011
.193
.383
.481
.006
.029
.268
.115
.008
.004
.198
.054
.272
.073
.023
.014
.007
.012
.168
.659
.438
.006
.002
.007
.051
.081
.025
--
--
--
--
.001
.003
.014
.396
.222
.136
.016
.438
.009
.067
--
--
.001
.013
.139
.635
.0
.007
.027
.137
.491
.001
.0
.0
.011
.002
.089
.584
.842
.747
.032
.001
.001
.001
.046
.038
.069
.191
.143
.129
.815
.189
.0
.0
.011
.002
.002
--
.01
.122
.15
.08
.0
.109
.015
.178
.002
.001
.0
.0
.0
.002
.002
--
--
--
.079
.009
.032
.001
.254
.022
.001
.009
.0
.002
.0
.0
.001
.001
.001
.001
.0
.059
.001
.006
.001
.03
.333
.008
.124
.0
.008
.003
.002
.001
.0
.002
.0
.031
.004
.036
.002
1.0
.023
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
2
A
C
G
14
2
C
C
A
C
A
G
G
C
T
G
G
A
G
C
G
T
T
C
T
T
T
G
A
G
A
G
C
A
A
G
C
T
C
T
T
C
T
T
G
T
G
T
G
G
T
G
C
T
A
A
G
G
G
A
C
A
T
C
A
A
G
G
C
A
A
T
C
G
G
C
G
T
G
C
G
G
T
A
G
A
A
T
A
T
T
G
G
C
C
A
A
T
A
C
G
8
6
G
T
A
T
G
C
C
G
C
C
C
G
T
T
A
G
G
T
C
T
C
T
G
T
A
T
A
T
C
A
G
G
2
G
C
4
8
C
A
A
C
A
40
G
T
T
C
C
T
A
G
C
G
C
T
2
C
A
A
A
G
A
2
G
G
T
G
A
4
T
G
G
G
G
5
T
C
A
T
A
A
T
C
G
A
T
T
4
A
G
T
C
A
A
A
T
G
T
A
T
T
T
G
T
G
A
A
3
T
G
A
C
C
T
G
A
A
T
T
C
C
G
2
G
A
G
T
A
G
T
T
16
C
G
C
T
T
C
A
4
A
T
C
A
T
T
2
A
T
T
C
C
6
2
A
36
A
A
G
T
6
4
C
A
T
A
T
A
G
A
A
G
C
T
T
G
G
G
A
G
G
G
G
T
A
T
G
T
C
23
C
C
G
T
A
A
C
C
A
4
T
T
C
2
T
2
G
A
G
C
10
G
C
G
T
18
A
A
A
G
G
C
T
T
A
C
C
G
C
G
C
  8,495,343
  8,495,512
  8,496,476
  8,496,762
  8,496,847
  8,497,147
  8,497,216
  8,497,301
  8,497,747
  8,497,862
  8,497,889
  8,498,041
  8,498,222
  8,498,388
  8,498,440
  8,498,800
  8,498,890
  8,498,891
  8,498,892
  8,499,017
  8,499,206
  8,499,256
  8,499,354
  8,499,558
  8,499,640
  8,499,681
  8,499,695
  8,499,742
  8,499,793
  8,499,849
  8,500,210
  8,500,247
  8,500,356
  8,500,365
  8,500,641
  8,500,683
  8,500,943
  8,500,981
  8,501,077
  8,501,445
  8,501,552
  8,501,621
  8,501,639
  8,501,721
  8,501,806
  8,501,807
  8,502,048
  8,502,088
  8,502,192
  8,502,343
  8,502,384
  8,502,408
  8,502,864
  8,502,930
  8,503,217
  8,503,424
  8,503,592
  8,503,769
  8,503,799
  8,503,845
  8,503,898
  8,503,913
  8,503,914
  8,503,975
  8,504,108
  8,504,136
  8,504,320
  8,504,362
  8,504,389
  8,504,496
  8,504,517
  8,504,518
  8,504,523
  8,504,612
  8,504,637
  8,504,717
  8,504,877
  8,505,026
  8,505,120
  8,505,421
  8,505,511
  8,505,549
  8,505,566
  8,505,854
  8,506,009
  8,506,117
  8,506,121
  8,506,333
  8,506,403
  8,506,469
  8,506,555
  8,507,127
  8,507,145
  8,507,336
  8,507,957
  8,508,062
  8,508,083
  8,508,322
  8,508,377
  8,508,413
  8,508,434
  8,509,421
  8,509,667
  8,510,360
  8,510,362
  8,510,393
  8,510,418
  8,510,991
  8,511,536
  8,512,018
  8,512,126
  8,512,348
  8,512,774
  8,513,799
  8,513,832
  8,513,851
  8,514,004
  8,514,100
  8,514,736
  8,515,384
  8,516,619
  8,516,623
  8,517,097
  8,517,187
  8,517,322
  8,517,510
  8,517,768
  8,518,229
  8,518,422
  8,518,816
  8,518,852
  8,519,008
  8,519,343
  8,519,504
  8,519,656
  8,519,955
  8,520,292
  8,520,550
  8,520,580
  8,520,630
  8,520,647
  8,520,657
  8,520,697
  8,521,044
  8,521,394
  8,521,488
  8,521,513
  8,521,724
  8,522,078
  8,522,327
  8,522,707
  8,522,848
  8,523,760
  8,523,777
  8,524,350
  8,524,546
  8,524,662
  8,524,674
  8,524,798
  8,525,114
  8,525,487
  8,525,520
  8,526,187
  10,604,246
  10,606,716
  10,607,531
  10,607,541
  10,607,638
  10,607,644
  10,607,831
  10,608,041
  10,608,072
  10,609,367
  10,609,571
  10,609,811
  10,609,819
  10,609,829
  10,610,051
  10,610,567
  10,610,884
  10,610,977
  10,610,978
  10,611,527
  10,611,566
  10,611,731
  10,611,774
  10,611,836
  10,612,106
  10,612,413
  10,612,742
  10,613,180
  10,613,309
  10,613,333
  10,613,442
  10,613,464
  10,613,809
  10,613,963
  10,614,045
  10,614,428
  10,614,444
  10,615,035
  10,615,552
  10,615,632
  10,615,663
  10,615,791
  10,615,914
  10,616,028
  10,616,125
  10,616,259
  10,616,275
  10,616,714
  10,616,773
  10,616,901
  10,617,224
  10,617,310
  10,617,579
  10,617,581
  10,617,658
  10,617,726
  10,617,791
  10,617,839
  10,617,888
  10,617,891
  10,617,893
  10,617,897
  10,617,898
  10,618,625
  10,618,628
  10,618,648
  10,618,671
  10,618,690
  10,618,692
  10,618,697
  10,619,098
  10,619,268
  10,619,307
  10,619,609
  10,619,657
  10,619,966
  10,620,277
  10,620,623
  10,620,934
  10,621,208
  10,621,973
  10,622,522
  10,622,981
  10,623,193
  10,623,288
  10,623,460
  10,623,668
  10,623,670
  10,623,672
  10,623,710
  10,623,815
  10,623,866
  10,623,926
  10,624,587
  10,624,921
  10,624,932
  10,627,482
  10,627,501
  10,627,563
  10,627,663
  10,627,887
  10,628,596
  10,629,886
  10,629,888
  10,630,214
  10,630,296
  10,630,361
  10,631,022
  10,631,471
  10,631,563
  10,631,789
  10,631,872
  10,632,308
  10,633,529
  10,633,530
  10,634,700
  10,634,960
  10,635,043
  10,635,605
  10,636,272
  10,636,764
  10,637,172
  10,637,341
  10,637,412
  10,637,653
  10,637,763
  10,637,986
  10,638,382
  10,638,604
  10,639,915
  10,639,966
  10,640,101
  10,640,104
  10,640,134
  10,640,465
  10,640,783
  10,641,606
  10,641,636
  10,641,871
  10,641,904
  10,641,969
  10,642,038
  10,642,238
  10,642,299
  10,642,346
  10,642,352
  10,642,696
  10,642,878
  10,642,880
  10,642,882
  10,642,938
  10,642,994
  10,643,241
  10,643,681
  10,643,704
  10,644,038
  10,644,553
  10,644,591
  10,644,840
  10,645,184
  10,645,284
  10,645,523
  10,645,602
  10,645,702
  10,646,323
  10,646,551
  10,646,887
  10,647,159
  10,647,211
  10,647,229
  10,648,620
  10,649,786
  10,650,580
T
T
-
G
T
A
-
-
T
T
G
T
G
A
A
T
C
A
C
G
A
T
A
C
C
T
C
G
G
A
G
A
18
A
T
T
T
-
T
C
T
C
A
T
A
G
A
C
2
C
3
A
C
28
T
A
T
C
A
A
A
G
T
-
C
T
G
G
A
T
T
G
G
C
G
C
T
T
A
C
A
-
C
A
G
T
A
G
G
A
G
C
A
A
C
-
T
G
G
C
T
A
A
8/-
6/-
A
C
G
G
T
2
T
A
T
T
T
-
G
A
G
2
A
C
A
A
T
C
A
2
G
A
G
-
G
G
T
A
-
A
G
-
-
G
2
G
-
C
-
A
C
C
A
G
2
G
T
A
A
A
-
-
A
G
G
T
A
G
-
3
T
C
A
G
-
C
A
3
A
A
-
G
T
2
G
G
G
C
T
A
G
C
C
-
G
A
2
A
G
G
7
C
A
C
G
C
C
G
A
C
A
T
G
-
2
A
C
A
T
A
A
3
4
A
-
A
T
3
-
2
2
C
C
15/13
A
2
C
-
A
A
T
C
2
A
G
-
G
13
A
13
3
C
-
G
C
A
T
3
-
-
G
-
G
G
A
T/2
6/-
4/-
5
11
A
G
C
2
A
G
G
7
A
13
C
82
A
A
G
A
A
A
A
C
C
G
C
5
2
23/-
C/5
T
C
C
G
G
T
T
C
-
G
C
2
-
G
-
T
T
A
2
10/-
-
G
A
C
-
G
T
G
A
A
T
C
C
2
T
T
A
3
C
T