Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 82,421 (bp)   Positions: 401
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.002
.0
--
.02
.028
.027
.619
.002
.004
.002
.069
.031
.123
.019
.002
.083
.0
.153
.0
.006
.004
.112
--
.05
.21
.386
--
--
--
--
.001
.001
.003
.04
.001
.005
.013
.203
.196
.014
.005
.006
.136
.038
.156
.081
.0
.027
.052
.015
.001
.885
.063
.108
.24
.352
.222
.024
.034
.001
.082
.001
.029
.01
.001
.001
.0
.003
.013
.036
.0
.001
.03
.08
.092
.234
.332
.368
.011
.006
.008
.0
.005
.0
.001
.003
.082
.1
.001
.024
.068
.002
.0
.001
.0
.002
.0
.006
.001
.0
.115
.533
.003
.002
.002
.001
--
.001
.004
.012
.007
.01
.04
.026
.01
.014
.056
.019
.003
.079
.227
.074
.353
.394
.115
.096
.004
.017
.054
.141
.018
.214
.055
.003
.002
.331
.228
.0
.038
.009
.038
.067
.098
.048
.033
.001
.001
.032
.048
.003
.003
.022
.048
.082
.14
.112
.017
.048
.003
.108
.001
.001
.005
.03
.0
.084
.507
.001
.03
.12
.003
.017
.062
.102
.28
.001
.142
.761
.384
.007
.005
.02
.076
.088
.042
.038
.002
.087
.995
.427
1.0
.145
.163
.169
.307
.174
.25
.059
.015
.012
.022
.102
.024
.021
.262
.086
.118
.13
.173
.188
.281
.345
.004
.011
.012
.012
.089
.013
.002
.514
.179
.453
.716
.043
.094
.003
.021
.023
.023
.132
.105
.013
.049
.14
.076
.004
.308
.729
.047
.051
.067
.088
.061
.027
.149
.619
.006
.006
.012
.014
.008
.142
.002
.001
.069
.014
.006
--
--
.013
.012
.026
.019
.005
.007
.094
.014
.001
.011
.202
.214
--
--
--
.696
.215
.029
.03
.034
.072
.093
.094
.008
.01
.02
.057
.012
--
--
.001
.08
.0
.043
.013
.06
--
--
--
--
--
--
--
--
.719
--
--
--
.047
.018
.003
.001
.002
--
.363
.165
.017
.002
.001
.533
.917
.825
.43
.076
.146
.574
.041
.03
.075
.023
--
--
--
--
--
.029
.064
.002
.082
.1
.007
.109
.002
.0
.061
.0
.009
--
.002
.007
.071
.108
.005
.073
.07
.0
.013
.012
.006
.062
.106
.071
.001
.001
.001
.121
.003
.005
.008
.037
.131
.419
.128
.007
.038
.117
--
--
--
--
.045
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.027
.008
.007
.0
.001
.009
.001
.023
.007
.002
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Cxcl11
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Cxcl10
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
Art3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
T
A
C
C
C
C
T
A
T
2
A
2
A
T
T
T
A
T
C
A
C
A
T
A
C
3
T
T
A
C
C
G
T
A
A
T
C
G
T
2
C
T
G
A
C
C
G
A
G
A
C
C
T
G
G
G
T
T
G
A
A
G
T
A
G
A
T
C
G
T
T
G
C
G
T
G
A
A
T
G
G
C
T
T
T
C
A
T
C
G
T
G
C
T
C
T
A
C
C
G
A
A
G
G
T
G
G
A
C
T
T
A
T
G
2
C
G
T
T
T
C
T
T
C
C
T
T
A
A
A
A
C
T
T
C
C
G
A
C
C
A
A
C
A
G
A
A
C
A
A
T
A
T
G
G
A
G
A
G
T
A
G
A
C
G
G
C
G
C
A
T
C
T
G
A
A
A
A
T
G
C
A
A
G
C
T
G
G
C
A
G
A
C
T
A
A
C
A
A
G
A
T
T
C
G
G
G
A
C
G
G
G
T
A
G
C
5
T
A
G
G
C
G
A
G
G
G
T
C
A
T
G
T
C
G
A
10
C
A
2
64
A
C
T
T
A
A
A
C
A
G
A
C
C
A
C
T
G
T
G
T
G
G
A
A
A
4
A
T
A
C
4
A
T
G
T
C
T
G
G
G
C
A
G
A
C
T
A
T
G
A
T
C
A
C
T
G
A
18
G
C
T
C
2
2
2
T
G
C
A
T
C
G
A
T
A
A
G
C
G
T
C
G
C
C
A
A
A
A
C
A
4
2
G
A
A
A
T
G
C
G
G
A
C
10
G
C
A
A
G
T
T
A
G
T
A
A
G
T
T
G
A
T
A
T
T
A
A
C
3
G
C
A
4
A
G
A
2
A
T
4
A
G
A
A
G
T
T
C
T
T
C
T
G
G
3
T
T
C
  17,059,636
  17,059,699
  17,059,736
  17,059,884
  17,060,284
  17,060,409
  17,060,413
  17,060,637
  17,060,836
  17,061,612
  17,061,982
  17,062,118
  17,062,157
  17,062,190
  17,062,219
  17,063,037
  17,063,612
  17,063,672
  17,064,165
  17,064,596
  17,064,629
  17,065,401
  17,066,132
  17,066,918
  17,067,338
  17,067,369
  17,067,481
  17,067,539
  17,067,542
  17,067,546
  17,067,627
  17,068,224
  17,068,280
  17,068,308
  17,069,093
  17,069,244
  17,069,987
  17,070,238
  17,072,557
  17,072,791
  17,072,840
  17,074,039
  17,074,041
  17,074,120
  17,074,266
  17,074,269
  17,074,295
  17,074,337
  17,074,377
  17,074,511
  17,074,570
  17,074,581
  17,074,738
  17,074,840
  17,074,889
  17,074,912
  17,074,937
  17,074,952
  17,074,988
  17,075,033
  17,075,044
  17,075,098
  17,075,176
  17,075,247
  17,075,266
  17,075,337
  17,075,338
  17,075,366
  17,075,375
  17,075,405
  17,075,419
  17,075,493
  17,075,583
  17,075,644
  17,075,699
  17,075,724
  17,075,735
  17,075,739
  17,075,782
  17,075,855
  17,075,888
  17,075,891
  17,075,942
  17,076,045
  17,076,058
  17,076,060
  17,076,132
  17,076,193
  17,076,201
  17,076,294
  17,076,307
  17,076,445
  17,076,565
  17,076,703
  17,076,707
  17,076,708
  17,076,732
  17,076,738
  17,076,951
  17,076,953
  17,076,965
  17,077,037
  17,077,465
  17,077,659
  17,077,819
  17,077,839
  17,078,038
  17,078,298
  17,078,450
  17,078,512
  17,078,531
  17,078,598
  17,078,712
  17,078,759
  17,078,861
  17,078,864
  17,078,904
  17,078,939
  17,078,965
  17,079,019
  17,079,091
  17,079,113
  17,079,175
  17,079,198
  17,079,202
  17,079,252
  17,079,293
  17,079,386
  17,079,459
  17,079,568
  17,079,647
  17,079,675
  17,079,777
  17,079,902
  17,080,630
  17,081,148
  17,081,521
  17,081,523
  17,081,976
  17,082,222
  17,082,226
  17,082,252
  17,082,431
  17,082,489
  17,082,535
  17,082,871
  17,083,172
  17,083,699
  17,083,704
  17,083,732
  17,084,157
  17,084,167
  17,084,172
  17,084,241
  17,084,274
  17,084,293
  17,084,305
  17,084,450
  17,084,497
  17,084,539
  17,084,612
  17,084,822
  17,084,923
  17,084,952
  17,085,056
  17,085,062
  17,085,106
  17,085,407
  17,085,830
  17,085,884
  17,085,885
  17,086,028
  17,086,053
  17,086,649
  17,086,770
  17,086,943
  17,087,626
  17,088,057
  17,088,123
  17,088,146
  17,088,292
  17,088,293
  17,088,325
  17,088,407
  17,088,505
  17,088,550
  17,088,610
  17,088,698
  17,088,772
  17,088,925
  17,089,105
  17,089,566
  17,089,685
  17,089,758
  17,089,929
  17,090,013
  17,090,024
  17,090,033
  17,090,162
  17,090,191
  17,090,308
  17,090,368
  17,090,416
  17,090,496
  17,090,566
  17,090,656
  17,090,734
  17,090,743
  17,090,791
  17,090,794
  17,090,810
  17,090,820
  17,090,825
  17,090,887
  17,090,892
  17,090,967
  17,090,992
  17,091,059
  17,091,232
  17,091,446
  17,091,543
  17,091,605
  17,091,628
  17,091,674
  17,091,805
  17,091,851
  17,091,965
  17,091,988
  17,092,026
  17,092,049
  17,092,066
  17,092,091
  17,092,156
  17,092,187
  17,092,235
  17,092,249
  17,092,261
  17,092,309
  17,092,445
  17,092,521
  17,092,528
  17,092,566
  17,092,570
  17,092,727
  17,092,734
  17,092,785
  17,092,821
  17,092,856
  17,092,886
  17,092,893
  17,093,050
  17,093,053
  17,093,097
  17,093,467
  17,093,474
  17,093,666
  17,093,764
  17,093,785
  17,094,213
  17,094,309
  17,094,452
  17,094,743
  17,094,775
  17,094,776
  17,094,849
  17,094,911
  17,094,943
  17,095,001
  17,095,188
  17,095,298
  17,095,440
  17,095,441
  17,095,581
  17,095,584
  17,095,587
  17,095,704
  17,096,010
  17,096,071
  17,096,121
  17,096,173
  17,096,445
  17,096,453
  17,096,454
  17,096,540
  17,096,614
  17,096,637
  17,096,712
  17,096,743
  17,096,911
  17,097,008
  17,097,014
  17,097,125
  17,097,239
  17,097,978
  17,098,212
  17,098,600
  17,099,019
  17,099,110
  17,099,406
  17,099,456
  17,099,513
  17,099,583
  17,099,662
  17,099,908
  17,101,493
  17,101,718
  17,101,722
  17,101,725
  17,102,436
  17,103,378
  17,103,590
  17,103,591
  17,103,732
  17,106,895
  17,107,181
  17,107,583
  17,107,752
  17,108,274
  17,109,050
  17,110,255
  17,110,461
  17,110,468
  17,111,927
  17,112,708
  17,112,865
  17,113,007
  17,113,068
  17,114,786
  17,115,282
  17,115,295
  17,116,640
  17,116,979
  17,117,454
  17,117,969
  17,118,059
  17,119,851
  17,120,116
  17,121,582
  17,121,816
  17,121,845
  17,122,589
  17,123,572
  17,123,644
  17,123,721
  17,124,074
  17,124,173
  17,124,363
  17,124,827
  17,124,835
  17,124,954
  17,125,106
  17,125,109
  17,125,128
  17,125,214
  17,125,226
  17,125,653
  17,125,951
  17,126,191
  17,126,248
  17,126,275
  17,126,312
  17,126,370
  17,126,869
  17,127,255
  17,127,694
  17,129,301
  17,129,973
  17,130,363
  17,131,441
  17,133,288
  17,133,669
  17,133,995
  17,134,787
  17,135,254
  17,135,684
  17,135,708
  17,135,856
  17,135,910
  17,136,009
  17,136,198
  17,136,744
  17,136,998
  17,137,046
  17,137,060
  17,137,062
  17,137,085
  17,137,088
  17,138,409
  17,138,410
  17,138,642
  17,139,451
  17,139,531
  17,139,786
  17,140,248
  17,140,281
  17,140,437
  17,140,623
  17,140,641
  17,140,653
  17,140,656
  17,141,158
A
-
-
5
T
4
T
T
C
G
C
-
3
-
G
C
C
C
G
C
T
G
2
-
C
C
T
-
A
5
A/-
T
T
A
C
G
G
C
G
A
C
-
G
C
2
T
T
T
A
G
C
G
T
G
C
A
A
T
C
C
C
G
G
T
A
C
A
G
C
T
A
C
C
A
T
A
G
2
G
G
C
A
A
T
C
C
C
T
2
C
T
A
C
13
T
G
T
A
G
T
T
T
G
G
A
A
C
C
A
G
T
C
-
G
C
A
-
T
A
C
C
C
A
-
A
T
T
G
C
G
G
G
G
T
G
C
G
G
-
G
T
A
G
G
T
C
A
G
T
G
G
G
C
G
C
T
A
G
A
G
2
C
G
A
T
T
A
A
T
A
T
G
C
G
C
A
G
T
2
C
C
A
G
G
G
A
T
A
A
A
T
G
14
C
T
C
G
G
T
G
G
-
G
C
C
T
A
A
A
T
T
T
C
A
C
C
A
T
-
C
G
A
A
T
C
G
A
A
A
C
T
C
C
A
2
G
T
G
-
A
G
-
-
G
T
G
C
-
G
-
T
2
C
G
A
T
G
T
-
A
C
A
C
A
A
G
C
G
-
G
C
T
T
-
A/3
G
2
A
7
C
A
-
A
G
2
A
2
T
-
C
C
A
G
G
A
G
T
A
A
G
-
A
G
C
3
-
-
-
A
A
T
G
G
A
A
T
2
G
G
T
A
A
-
T
A
T
A
G
-
C
G
G
G
-
-
-
G
G
C
C
T
A
T
A
T
G
10/-
T
T
G
G
-
C
A
G
C
C
G
G
A
C
-
A
T
A
3
C
G
C
-
T
-
A
T
G
-
G
A
5
-
2
T/-
-
15
3
5
3
G/2
T/-
-
T
-
A
T
-
A
A
-
-
G
-