Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 167,335 (bp)   Positions: 317
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
GK/FarMcwi (2019) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
Zfat
A
T
A
C
G
G
-
G
G
G
G
G
G
T
A
C
G
A
T
-
T
G
A
C
T
A
T
-
A
G
T
A
T
T
T
A
T
G
T
G
C
-
C
T
23
G
G
C
C
A
A
G
G
G
C
C
C
A
T
-
C
T
C
C
A
G
A
C
T
T
C
T
G
-
-
C
A
-
A
T
T
C
G
G
-
A
T
-
A
T
A
-
C
A
-
4
C
C
G
C
C
C
C
A
G
G
C
A
T
T
T
A
C
G
G
A
A
T
T
C
A
C
A
C
G
A
A
T
C
T
T
A
C
C
C
G
A
C
G
G
A
T
T
-
C
T
T
T
C
A
C
G
C
T
A
A
-
A
G
A
A
C
C
4
C
A
G
T
A
A
-
A
-
T
G
A
T
G
A
A
C
A
T
A
C
G
G
-
C
G
C
C
T
A
A
-
A
-
T
T
C
C
G
C
T
A
A
133
C
T
C
T
80
T
6
G
C
72
G
A
A
T
A
A
G
C
C
T
T
A
-
C
G
A
G
G
A
A
A
-
T
T
T
T
A
G
G
T
T
A
C
C
T
T
C
C
T
A
A
G
T
A
C
A
T
T
C
G
5
T
T
G
-
C
G
G
A
G
T
G
G
G
C
A
A
2
-
A
A
T
A
A
G
G
A
G
G
A
C
-
G
C
A
A
T
G
G
C
T
4
T
A
T
A
-
A
C
  99,888,975
  99,890,641
  99,892,156
  99,893,060
  99,893,064
  99,893,076
  99,893,078
  99,893,080
  99,893,084
  99,893,086
  99,893,088
  99,893,090
  99,893,096
  99,894,667
  99,897,697
  99,900,293
  99,907,424
  99,909,711
  99,909,730
  99,909,736
  99,910,204
  99,910,473
  99,910,491
  99,910,842
  99,910,853
  99,910,877
  99,913,816
  99,914,044
  99,914,668
  99,914,845
  99,915,557
  99,915,752
  99,917,132
  99,917,169
  99,917,804
  99,917,927
  99,918,788
  99,920,106
  99,920,351
  99,920,392
  99,920,410
  99,920,564
  99,920,916
  99,922,708
  99,923,036
  99,923,722
  99,923,726
  99,924,647
  99,924,816
  99,925,623
  99,927,421
  99,927,987
  99,928,620
  99,928,825
  99,929,655
  99,929,747
  99,930,994
  99,931,273
  99,931,830
  99,932,324
  99,933,494
  99,934,344
  99,934,458
  99,935,701
  99,936,216
  99,939,473
  99,942,092
  99,943,502
  99,944,271
  99,945,113
  99,946,908
  99,953,162
  99,954,737
  99,956,532
  99,958,953
  99,958,977
  99,959,498
  99,960,281
  99,962,290
  99,963,992
  99,965,457
  99,966,142
  99,969,914
  99,973,402
  99,974,346
  99,975,260
  99,979,416
  99,982,693
  99,982,863
  99,985,910
  99,988,268
  99,988,463
  99,989,395
  99,991,002
  99,991,957
  99,992,597
  99,992,712
  99,992,958
  99,993,339
  99,993,863
  99,994,564
  99,995,019
  99,995,542
  99,996,243
  99,996,373
  99,997,003
  99,997,710
  99,998,253
  99,999,092
  99,999,811
  100,000,295
  100,002,153
  100,002,440
  100,002,826
  100,003,221
  100,005,442
  100,005,695
  100,005,940
  100,007,265
  100,007,362
  100,008,839
  100,009,839
  100,009,945
  100,010,393
  100,010,394
  100,012,237
  100,014,184
  100,014,192
  100,015,475
  100,015,921
  100,015,964
  100,015,984
  100,016,435
  100,017,624
  100,017,842
  100,018,159
  100,018,244
  100,018,248
  100,018,362
  100,018,388
  100,018,951
  100,019,652
  100,020,192
  100,020,379
  100,020,616
  100,021,707
  100,021,794
  100,022,170
  100,022,551
  100,022,625
  100,022,742
  100,022,758
  100,022,789
  100,023,102
  100,023,241
  100,023,826
  100,024,063
  100,024,320
  100,024,355
  100,024,660
  100,024,867
  100,024,882
  100,025,014
  100,025,156
  100,025,349
  100,025,602
  100,025,668
  100,025,720
  100,026,005
  100,026,025
  100,026,464
  100,026,562
  100,027,161
  100,027,331
  100,027,413
  100,027,436
  100,027,437
  100,027,583
  100,027,818
  100,027,893
  100,028,038
  100,028,097
  100,028,177
  100,028,258
  100,028,439
  100,028,612
  100,028,615
  100,029,473
  100,029,570
  100,029,616
  100,029,647
  100,029,714
  100,029,992
  100,030,082
  100,030,086
  100,030,810
  100,030,817
  100,030,997
  100,031,004
  100,031,257
  100,031,310
  100,031,372
  100,031,937
  100,032,320
  100,032,808
  100,032,960
  100,033,232
  100,033,311
  100,033,318
  100,033,359
  100,033,372
  100,033,409
  100,033,446
  100,033,706
  100,033,866
  100,033,870
  100,033,874
  100,033,877
  100,033,948
  100,034,580
  100,034,650
  100,034,805
  100,035,057
  100,035,195
  100,035,987
  100,036,034
  100,036,057
  100,036,616
  100,037,216
  100,037,559
  100,037,599
  100,037,625
  100,037,706
  100,037,742
  100,038,101
  100,038,414
  100,038,548
  100,038,850
  100,038,936
  100,039,630
  100,040,263
  100,040,265
  100,040,267
  100,040,269
  100,040,437
  100,040,877
  100,041,551
  100,042,034
  100,042,142
  100,042,180
  100,042,594
  100,042,722
  100,042,736
  100,042,918
  100,042,941
  100,042,996
  100,043,470
  100,043,670
  100,043,744
  100,043,745
  100,043,828
  100,043,947
  100,044,359
  100,044,431
  100,044,703
  100,044,839
  100,044,859
  100,044,889
  100,045,344
  100,045,373
  100,045,578
  100,045,589
  100,045,607
  100,045,922
  100,046,098
  100,046,272
  100,046,349
  100,046,442
  100,047,146
  100,047,166
  100,047,187
  100,047,264
  100,047,794
  100,047,844
  100,047,850
  100,047,852
  100,047,913
  100,047,933
  100,047,959
  100,048,179
  100,048,368
  100,048,466
  100,048,573
  100,048,574
  100,048,678
  100,048,919
  100,048,971
  100,049,124
  100,049,125
  100,049,127
  100,049,138
  100,049,153
  100,049,244
  100,049,315
  100,049,664
  100,049,687
  100,050,182
  100,050,749
  100,051,749
  100,051,972
  100,052,498
  100,052,994
  100,053,030
  100,053,613
  100,053,630
  100,053,689
  100,053,773
G
C
G
G
C
C
C
C/-
-/C
-/C
?
C/-
-/A
C
G
T
A
T
C
C
C
-
G
T
C
G
C
G
A/G
T
C
G
C
C
C
G
C
A
C/A
A
G
A
T
C
-
-
A
T
G
G
-
T
T
A
-
A
T
G
G
4
T
C
A
A
G
A
G/-
T
-
A
-/T
C
A
C
9
T
T
5
-
C
C
A
A
A
T
G
C
-/6
C
C
C
2
T
T
C
-
T
A
T
T
G
A
T
G
C
-/A
G
T
C
C
G
G
-/T
A
T
T
T
C
C
T
G
T/-
G/-
T
A
G
G
C
T
C
G
-
T
T
T
T
G
T
A
A
G
C
G
2
T
A
C
C
T
T
T
C
T
C
T
G
4
G
A
G
G
A
T
-
T
T
A
C
-
G
10
G
A
C
A
C
A
A
-
G
T
T
C
T
T
A
A
C
G
A
T
T
C
G
G
G
G
4
C
C
T
T
A
G
C
G
G
133/-
-/G
C/-
G/-
?
80/-
G
-
A/-
-
-
A/-
T
G
G
G
T
A
A
T
C
C
G
A/G
G
A
C
A
T
G
G
C
3
A/-
A
A
A
C
A
C
G
A
G
T
A
C
C
T
T
C
G
G
A
C
G
T
C
C
C
G
A
-
A
C
A
3
T
A
A
G
A
C
A
A
A
T
A/G
A/G
-
15
G
-/C
G
G
G
A
A
G
T
T
G
T
2
T
T
G
G
A
A
C
G
C
-
A/-
G
A
G
G
C
G