Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 84,949 (bp)   Positions: 345
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
2
-
C
A
C
C
A
G
3
A
-
T
T
T
T
T
T
C
A
G
C
T
A
C
C
C
10
T
A
C
C
C
C
C
C
4
G
T
G
A
G
T
A
T
C
C
G
-
T
2
A
C
C
C
A
C
A
C
C
A
A
A
-
A
G
8
C
C
T
G
6
G
T
-
2
C
C
A
C
-
T
G
126
2
G
G
3
A
A
A
C
T
-
2
G
T
G
A
C
C
G
G
G
T
A
G
G
G
G
C
84
A
A
G
C
A
C
T
G
G
C
C
T
G
G
A
-
G
-
-
G
T
-
G
G
C
C
A
A
-
T
C
C
C
T
G
-
G
T
A
-
G
A
-
C
C
A
A
-
A
G
A
C
A
G
A
T
A
9
-
-
A
C
C
G
C
C
T
A
C
A
C
2
T
C
G
T
G
4
A
C
G
C
A
T
T
-
T
T
T
-
2
C
T
T
-
T
-
T
C
A
C
A
T
G
A
G
3
T
T
T
C
C
G
-
G
G
-
G
C
G
-
A
C
A
T
T
G
G
-
T
G
A
G
A
C
A
G
C
A
C
T
A
C
2
C
G
4
13
C
G
T
-
A
G
G
C
C
T
C
G
-
C
-
A
-
T
G
C
G
T
T
156
C
T
C
11
C
95
C
T
T
T
T
C
4
A
G
T
A
-
A
T
T
T
C
T
G
T
T
A
C
C
A
C
-
G
A
14
A
T
-
C
2
-
-
-
-
C
A
-
134
T
T
G
G
T
A
C
G
T
-
C
A
  20,830,514
  20,832,779
  20,832,967
  20,832,969
  20,833,006
  20,833,354
  20,833,640
  20,833,862
  20,833,875
  20,833,998
  20,834,141
  20,836,596
  20,836,604
  20,836,608
  20,836,616
  20,836,620
  20,836,630
  20,836,638
  20,836,856
  20,837,510
  20,837,578
  20,837,872
  20,838,761
  20,839,523
  20,839,715
  20,839,823
  20,839,867
  20,840,044
  20,840,599
  20,840,856
  20,841,049
  20,841,050
  20,841,051
  20,841,052
  20,841,053
  20,842,727
  20,842,819
  20,842,982
  20,843,185
  20,843,464
  20,843,477
  20,843,545
  20,843,650
  20,843,724
  20,844,467
  20,844,529
  20,844,720
  20,844,857
  20,845,209
  20,845,378
  20,845,487
  20,845,536
  20,845,669
  20,845,888
  20,846,127
  20,847,427
  20,847,436
  20,847,509
  20,847,881
  20,847,934
  20,848,164
  20,848,201
  20,848,514
  20,848,604
  20,848,617
  20,848,652
  20,848,675
  20,848,707
  20,848,865
  20,849,073
  20,849,571
  20,849,625
  20,850,586
  20,850,882
  20,850,888
  20,850,889
  20,850,896
  20,850,992
  20,851,200
  20,851,438
  20,851,836
  20,851,968
  20,852,048
  20,852,061
  20,852,409
  20,852,920
  20,852,985
  20,852,988
  20,853,200
  20,853,236
  20,853,330
  20,853,438
  20,853,475
  20,853,536
  20,853,554
  20,853,581
  20,853,674
  20,853,681
  20,853,767
  20,853,812
  20,853,857
  20,853,873
  20,853,896
  20,853,909
  20,853,916
  20,853,980
  20,854,135
  20,854,306
  20,854,344
  20,854,383
  20,854,537
  20,855,204
  20,855,486
  20,855,567
  20,855,619
  20,856,053
  20,856,081
  20,856,389
  20,856,392
  20,856,758
  20,856,909
  20,857,496
  20,857,518
  20,857,925
  20,858,108
  20,858,279
  20,858,458
  20,858,478
  20,858,775
  20,858,861
  20,858,862
  20,859,165
  20,859,263
  20,859,577
  20,860,318
  20,860,857
  20,861,507
  20,861,560
  20,861,622
  20,865,330
  20,865,563
  20,865,721
  20,865,736
  20,866,026
  20,866,117
  20,866,516
  20,866,519
  20,866,530
  20,866,536
  20,866,636
  20,866,759
  20,866,944
  20,867,516
  20,867,966
  20,868,047
  20,868,448
  20,868,453
  20,868,488
  20,868,591
  20,868,772
  20,868,785
  20,868,808
  20,868,925
  20,869,354
  20,869,386
  20,869,859
  20,870,126
  20,870,182
  20,870,521
  20,870,528
  20,870,581
  20,870,682
  20,870,954
  20,870,965
  20,871,112
  20,871,134
  20,871,207
  20,871,328
  20,871,547
  20,871,910
  20,871,967
  20,872,085
  20,872,086
  20,872,297
  20,872,835
  20,874,051
  20,874,086
  20,874,267
  20,875,387
  20,876,795
  20,877,218
  20,877,243
  20,877,353
  20,877,370
  20,877,390
  20,877,395
  20,877,396
  20,877,413
  20,877,416
  20,877,420
  20,877,424
  20,877,429
  20,877,505
  20,877,508
  20,877,510
  20,877,512
  20,877,536
  20,877,656
  20,877,851
  20,877,860
  20,877,925
  20,877,986
  20,878,269
  20,878,422
  20,878,543
  20,878,712
  20,878,728
  20,878,801
  20,878,803
  20,878,866
  20,878,928
  20,879,064
  20,879,132
  20,879,141
  20,879,147
  20,879,156
  20,879,294
  20,879,415
  20,879,423
  20,879,477
  20,879,497
  20,879,499
  20,879,974
  20,880,232
  20,880,332
  20,880,384
  20,880,699
  20,881,351
  20,881,570
  20,881,779
  20,882,154
  20,882,175
  20,882,208
  20,882,213
  20,882,313
  20,882,315
  20,882,334
  20,882,336
  20,882,346
  20,882,468
  20,882,471
  20,882,484
  20,882,513
  20,882,549
  20,882,575
  20,882,613
  20,882,620
  20,882,651
  20,882,770
  20,882,844
  20,882,885
  20,882,886
  20,882,947
  20,883,099
  20,883,116
  20,883,200
  20,883,891
  20,884,064
  20,884,500
  20,885,128
  20,886,853
  20,887,079
  20,887,408
  20,887,570
  20,887,726
  20,888,803
  20,888,957
  20,889,894
  20,890,357
  20,890,763
  20,890,973
  20,890,974
  20,890,977
  20,891,187
  20,891,548
  20,891,576
  20,891,605
  20,891,979
  20,891,987
  20,892,000
  20,892,001
  20,892,059
  20,892,061
  20,892,063
  20,892,065
  20,892,094
  20,895,259
  20,895,971
  20,897,564
  20,897,718
  20,897,780
  20,897,835
  20,897,901
  20,897,980
  20,897,981
  20,898,020
  20,898,071
  20,898,150
  20,898,173
  20,898,304
  20,899,052
  20,899,178
  20,899,255
  20,899,282
  20,899,376
  20,899,460
  20,900,386
  20,901,216
  20,901,505
  20,901,865
  20,903,647
  20,904,296
  20,905,425
  20,906,686
  20,906,939
  20,907,463
  20,907,712
  20,907,737
  20,907,741
  20,908,572
  20,908,643
  20,908,817
  20,909,855
  20,909,877
  20,909,988
  20,910,783
  20,911,402
  20,911,795
  20,911,847
  20,911,855
  20,913,283
  20,913,305
  20,914,779
  20,914,780
  20,914,879
G/-
-
A
T
G
G
G
G
A
-
G
2
-/A
-/A
A/-
A/-
A
A/G
A
G
A
T
C
G
T
G
T
-
C
C
G/-
-/G
G/-
G/-
G/-
T
-
A
G
T
G
A
G
G
C
T
T
A
2
A
-
-
T
A
A
G
G
G
A
G
-
T
C
2
G
-
-
-
T
C
T
-
A
C
2
-
A
G
T
T
4
-/G
G/T
-
-
A
A
-
G
G
C
T
G
T
-
T
-/C
T
C
T
G
A
A
T
G
G
A
A
A
A
T
-
G
C
A
-/T
C
T
C
C
A
T/-
-/T
C
A
A
C
C
A
T
T
T
G
2
A
A
T
A
G
T
G
G/-
T/-
G
A
A
T
C
A
C
G
8
T
C
G
A
G
C
G
4
G
T
T
T
G
A
C
C
G
-
2
3
G
T
T
C
T
T
A/-
G
T
C
T
-
C
A
A
G
A
-
G
G
A
T
G
C
A
T
A
G
G
4
-
A
A
-
5
C
2
G
T
T
A
T
C
A
G
-
-
C
C
C
T
A
A
T
T
A
G
A
A/-
A
4
T
T
C
C
C/-
A
T
9
A
A
T
A
G
G
G
A
T
G
T
A
C
A
-
T
A
-
-
-
T
C
A
G
T
A
T
T
C
T
A
4
T
25
G
3
G
A
G
-/C
C/-
-/C
-
T
C
A
-
-/T
-
T/-
A/-
-/A
A/-
A/-
-/T
-
-
A
C
G
T
C
A/-
A/-
-/C
T/-
T/-
T/-
G
C
G
T
A
G/-
T
-/2
C
G
-
G
C
A
T
-
12
2
2
6
T
G
7
134/-
C/-
C/-
A
A
C
G
-
A
A
G
G
C