Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 84,949 (bp)   Positions: 519
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
LOC108351425
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
Txnrd1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
A
A
G
G
2
19
A
G
G
-
T
T
T
T
T
T
C
A
G
-
C
T
A
C
C
10
T
A
C
C
4
G
T
G
A
G
C
T
A
G
T
C
G
-
T
2
A
G
C
C
C
A
C
A
C
C
C
A
A
A
-
A
G
8
C
C
T
G
6
G
T
-
2
C
C
A
C
-
T
G
126
2
G
G
3
A
A
A
C
T
-
2
G
T
G
A
C
C
G
G
G
T
A
G
G
G
G
C
84
A
A
G
C
A
C
T
G
G
C
C
T
G
G
A
-
G
-
-
G
T
-
13
G
C
C
A
A
-
T
C
C
C
T
G
-
G
T
A
-
G
A
-
C
A
-
T
A
G
T
G
G
4
A
C
G
C
A
T
T
-
T
T
T
-
2
C
T
T
-
T
C
-
T
C
A
C
A
T
G
A
G
3
T
T
T
C
C
G
-
G
G
-
G
C
G
-
A
44
G
G
T
C
G
G
C
G
C
2
G
C
-
T
G
A
G
G
A
C
A
G
C
A
C
T
A
C
C
G
4
13
G
C
G
C
A
C
G
G
C
-
-
-
A
-
A
-
C
T
A
-
C
A
G
A
T
A
T
T
C
T
A
A
A
C
T
G
C
T
C
T
T
C
A
-
-
-
-
-
-
G
C
101
A
C
C
T
T
C
A
C
G
T
T
A
T
G
G
T
C
58
C
T
G
C
C
C
T
C
T
G
T
G
-
-
C
-
A
C
A
C
G
C
C
T
G
C
G
-
C
C
-
T
C
A
T
G
G
A
C
A
-
G
T
C
A
A
C
T
C
C
T
C
8
G
G
G
A
T
C
C
A
C
G
T
A
G
T
A
-
A
T
G
A
G
C
T
C
A
-
A
G
T
T
C
G
T
C
G
G
C
A
T
G
-
-
-
C
C
A
G
7
19
C
T
T
A
A
C
A
10
T
10
-
A
-
19
C
T
A
G
A
A
111
T
G
G
G
C
G
G
G
G
A
A
A
A
C
A
C
T
C
A
T
G
A
A
G
C
G
G
47
T
T
G
T
T
C
C
T
-
8
4
-
C
T
-
6
-
C
G
C
T
C
T
-
T
C
A
A
A
G
C
C
A
G
T
G
A
G
4
T
-
T
C
23
A
C
T
G
G
G
T
G
C
-
C
A
  20,830,070
  20,830,331
  20,830,514
  20,830,628
  20,831,427
  20,832,231
  20,832,779
  20,834,061
  20,834,141
  20,834,467
  20,834,475
  20,836,596
  20,836,604
  20,836,608
  20,836,616
  20,836,620
  20,836,630
  20,836,638
  20,836,856
  20,837,510
  20,837,578
  20,837,772
  20,837,872
  20,838,761
  20,839,523
  20,839,715
  20,839,867
  20,840,044
  20,840,599
  20,840,856
  20,841,331
  20,842,727
  20,842,819
  20,842,982
  20,843,185
  20,843,464
  20,843,477
  20,843,545
  20,843,612
  20,843,650
  20,843,724
  20,844,316
  20,844,467
  20,844,720
  20,844,857
  20,845,209
  20,845,378
  20,845,487
  20,845,536
  20,845,591
  20,845,669
  20,845,888
  20,846,127
  20,847,427
  20,847,436
  20,847,509
  20,847,652
  20,847,881
  20,847,934
  20,848,164
  20,848,201
  20,848,514
  20,848,604
  20,848,617
  20,848,652
  20,848,675
  20,848,707
  20,848,865
  20,849,073
  20,849,571
  20,849,625
  20,850,089
  20,850,882
  20,850,888
  20,850,889
  20,850,896
  20,850,992
  20,851,200
  20,851,438
  20,851,836
  20,851,968
  20,852,048
  20,852,061
  20,852,409
  20,852,920
  20,852,985
  20,852,988
  20,853,200
  20,853,236
  20,853,330
  20,853,438
  20,853,475
  20,853,536
  20,853,554
  20,853,581
  20,853,674
  20,853,681
  20,853,767
  20,853,812
  20,853,857
  20,853,873
  20,853,896
  20,853,909
  20,853,916
  20,853,980
  20,854,135
  20,854,306
  20,854,344
  20,854,383
  20,854,537
  20,855,204
  20,855,486
  20,855,567
  20,855,619
  20,856,053
  20,856,081
  20,856,389
  20,856,392
  20,856,758
  20,856,909
  20,857,496
  20,857,518
  20,857,925
  20,858,108
  20,858,279
  20,858,458
  20,858,478
  20,858,775
  20,858,861
  20,858,862
  20,859,165
  20,859,263
  20,859,577
  20,859,738
  20,860,318
  20,861,507
  20,861,560
  20,861,622
  20,865,330
  20,865,563
  20,865,721
  20,865,736
  20,866,026
  20,866,117
  20,866,516
  20,866,519
  20,866,530
  20,866,536
  20,866,636
  20,866,759
  20,866,944
  20,867,516
  20,867,966
  20,868,047
  20,868,453
  20,868,488
  20,868,725
  20,870,182
  20,870,521
  20,874,086
  20,874,267
  20,875,387
  20,876,206
  20,876,795
  20,877,218
  20,877,243
  20,877,353
  20,877,370
  20,877,390
  20,877,395
  20,877,396
  20,877,413
  20,877,416
  20,877,420
  20,877,424
  20,877,429
  20,877,505
  20,877,508
  20,877,510
  20,877,512
  20,877,536
  20,877,656
  20,877,660
  20,877,851
  20,877,860
  20,877,925
  20,877,986
  20,878,269
  20,878,422
  20,878,543
  20,878,712
  20,878,728
  20,878,801
  20,878,803
  20,878,866
  20,878,928
  20,879,064
  20,879,132
  20,879,141
  20,879,147
  20,879,156
  20,879,294
  20,879,415
  20,879,423
  20,879,477
  20,879,497
  20,879,499
  20,880,096
  20,880,232
  20,880,285
  20,880,397
  20,880,564
  20,880,699
  20,880,863
  20,881,085
  20,881,191
  20,881,249
  20,881,278
  20,881,416
  20,881,567
  20,881,779
  20,881,929
  20,882,154
  20,882,175
  20,882,208
  20,882,213
  20,882,310
  20,882,313
  20,882,315
  20,882,334
  20,882,336
  20,882,346
  20,882,468
  20,882,471
  20,882,484
  20,882,513
  20,882,549
  20,882,575
  20,882,620
  20,882,651
  20,882,770
  20,882,844
  20,882,873
  20,882,885
  20,882,886
  20,882,969
  20,883,030
  20,883,034
  20,883,269
  20,883,733
  20,886,091
  20,886,663
  20,886,664
  20,887,017
  20,887,216
  20,887,408
  20,887,515
  20,887,726
  20,887,897
  20,888,240
  20,888,803
  20,888,957
  20,889,481
  20,890,116
  20,890,357
  20,890,426
  20,890,481
  20,890,628
  20,890,675
  20,890,687
  20,890,735
  20,890,764
  20,890,794
  20,890,796
  20,890,837
  20,891,548
  20,891,576
  20,891,592
  20,891,605
  20,891,664
  20,891,668
  20,891,677
  20,891,739
  20,891,831
  20,891,832
  20,891,871
  20,891,881
  20,891,891
  20,891,905
  20,891,906
  20,891,910
  20,892,098
  20,892,223
  20,892,645
  20,892,879
  20,892,990
  20,893,143
  20,893,144
  20,893,155
  20,893,351
  20,893,395
  20,893,430
  20,893,454
  20,893,457
  20,893,463
  20,893,483
  20,893,510
  20,893,511
  20,893,566
  20,893,583
  20,893,658
  20,893,686
  20,893,735
  20,893,765
  20,893,766
  20,893,786
  20,893,841
  20,893,862
  20,893,864
  20,893,882
  20,893,973
  20,894,025
  20,894,063
  20,894,130
  20,894,192
  20,894,212
  20,894,363
  20,894,463
  20,894,490
  20,894,553
  20,894,554
  20,894,609
  20,894,648
  20,894,691
  20,894,740
  20,894,959
  20,895,202
  20,895,295
  20,895,329
  20,895,375
  20,895,381
  20,895,461
  20,895,592
  20,895,618
  20,895,619
  20,895,624
  20,895,784
  20,895,799
  20,895,810
  20,895,813
  20,895,825
  20,895,858
  20,895,887
  20,895,973
  20,896,052
  20,896,335
  20,896,450
  20,896,565
  20,896,611
  20,896,637
  20,896,710
  20,896,715
  20,896,865
  20,896,866
  20,896,872
  20,896,897
  20,896,927
  20,896,928
  20,896,944
  20,896,951
  20,897,041
  20,897,124
  20,897,184
  20,897,346
  20,897,363
  20,897,718
  20,897,751
  20,897,761
  20,897,765
  20,897,824
  20,897,835
  20,897,901
  20,898,164
  20,898,173
  20,898,202
  20,898,204
  20,898,245
  20,898,304
  20,898,322
  20,898,469
  20,898,497
  20,898,573
  20,898,576
  20,898,595
  20,898,654
  20,898,684
  20,898,725
  20,898,732
  20,898,739
  20,898,769
  20,898,834
  20,898,881
  20,898,973
  20,898,995
  20,898,996
  20,899,021
  20,899,123
  20,899,137
  20,899,282
  20,899,370
  20,899,376
  20,899,437
  20,899,445
  20,899,598
  20,899,720
  20,899,770
  20,899,772
  20,899,820
  20,899,831
  20,900,102
  20,900,114
  20,900,392
  20,900,403
  20,900,408
  20,900,457
  20,900,558
  20,900,755
  20,900,782
  20,900,862
  20,900,877
  20,900,946
  20,901,317
  20,901,318
  20,901,505
  20,901,727
  20,902,581
  20,902,605
  20,902,606
  20,902,625
  20,902,656
  20,902,715
  20,902,841
  20,902,856
  20,902,985
  20,903,039
  20,903,123
  20,903,491
  20,903,536
  20,903,540
  20,903,647
  20,903,663
  20,903,710
  20,903,766
  20,903,808
  20,904,296
  20,904,418
  20,904,419
  20,904,997
  20,905,083
  20,905,154
  20,905,228
  20,905,229
  20,905,312
  20,905,344
  20,905,435
  20,905,476
  20,905,487
  20,906,284
  20,906,486
  20,906,686
  20,906,691
  20,907,039
  20,907,551
  20,907,575
  20,907,586
  20,907,590
  20,907,610
  20,907,619
  20,907,669
  20,907,710
  20,907,718
  20,908,034
  20,908,054
  20,908,087
  20,908,088
  20,908,252
  20,908,300
  20,908,331
  20,908,422
  20,908,643
  20,908,982
  20,909,146
  20,909,301
  20,909,344
  20,909,579
  20,909,659
  20,909,796
  20,909,988
  20,910,022
  20,910,049
  20,910,053
  20,910,057
  20,910,101
  20,910,149
  20,910,164
  20,910,172
  20,910,214
  20,910,342
  20,910,351
  20,910,430
  20,910,783
  20,911,402
  20,911,496
  20,911,795
  20,912,473
  20,913,020
  20,914,779
  20,914,780
  20,914,879
-
C
G/-
G
A
A
-
-
G
A
A
2
A/-
A/-
A/-
A/-
A
G/A
A
G
A
A
T
C
G
T
T
-
C
C
T
T
-
A
G
T
G
A
T
G
G
A
C
T
A
2
A
-
-
A
T
A
A
G
G
G
T
A
G
-
T
C
2
G
-
-
-
T
C
T
-
C
C
2
-
A
G
T
T
4
-/G
T
-
-
A
A
-
G
G
C
T
G
T
-
T
-/C
T
C
T
G
A
A
T
G
G
A
A
A
A
T
-
G
C
A
T/-
C
T
C
C
A
T
-/T
C
A
A
C
C
A
T
T
T
G
2
-
A
T
A
G
T
G
-/G
-/T
G
A
A
T
C
A
C
G
8
T
C
G
G
C
-/T
C
G
A
G
A
A
-
G
G
A
T
G
C
A
T
A
G
G
4
-
A
A
-
5
C
T
2
G
T
T
A
T
C
A
G
-
-
C
C
C
T
A
A
T
T
A
G
A
A/-
A
T
T
-
A
T
C
T
A
A
T
-/A
T
-
T
A
9
A
A
T
A
A
G
G
G
A
T
G
T
A
C
A
T
A
-
-
T
-
T
A
C
T
A
A
T
-/3
-/2
4
G
4
T
25
T
-
G
3
T
C
A
C
C
G
A
C
T
C
-/T
T
G
T
C
A
A
C
T
C
C
A
G
84
22
7
C
C
9
T
T
-
C
A
A
C
C
T
G
G
C
C
C
G
-
A
-/A
C
A
-
A/-
C
A
T
T
T
C
T
C
A
C
T
13
4
T
G
G
A
G
T
A
T
A
C
A
T
A
3
T
T/G
A
C
A
G
C
T
A
T
G
G
6
C
C
T
G
G
T
G
T
T
A
G
-
A
C
T
G
C
T
A
G
T
A
C
G
A
C
G
T
C
-/G
T/-
T
A
T
G
A
G
40
C
A
C
C
G
C
C
T
A
A
G
G
A
A
4
2
46
A
T
G/-
A
-
-
T
A
C
G
G
T
C
-
C
-
35
G
4
-
T
C
G
A
C
G
-
C
C
C
A
A
T
A
T
A
C
G
T
G
T
G
G
C
T
G
C
A
G
T
A
T
A
A
-
C/-
C
A
G
C
A
T
C
4
8/-
4/-
-/2
C/G
C/-
-/2
-
-/2
G/-
A
A
A
A
C
2
C
A
G
T
G
C
T
T
G
A
C/-
-/A
G
A
-
C
A
G
T
-
C
T
A
A
A
A
C
A
T
G
G
C