Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 225,187 (bp)   Positions: 658
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC120101534
LOC120101534
LOC120101534
LOC120101534
LOC120101534
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
Ttll11
G
G
G
C
-
12
31
C
-
-
G
G
G
G
G
C
G
C
C
T
A
A
A
A
C
G
T
A
C
G
A
A
T
T
13
C
G
C
T
-
T
87
C
G
T
G
G
T
C
T
A
-
A
C
A
G
G
A
2
C
T
C
G
C
G
T
C
G
G
T
G
A
T
T
-
G
T
T
A
2
A
6
82
T
G
G
C
G
A
T
T
60
T
A
G
G
A
G
C
T
C
T
A
A
A
C
A
T
A
T
G
G
T
A
A
A
G
T
G
G
C
A
A
13
G
8
G
G
A
-
G
A
C
G
T
A
4
A
T
C
C
C
3
T
G
G
G
C
19
T
A
A
3
T
-
G
C
C
G
C
T
A
A
G
G
G
A
A
G
2
C
G
T
-
G
C
A
T
A
-
T
C
2
3
16
C
C
T
G
T
T
T
-
A
T
T
C
A
A
A
A
A
A
A
A
C
G
G
C
C
T
A
C
A
G
-
T
5
A
G
C
G
4
T
A
G
G
221
A
T
2
A
C
G
G
A
G
C
C
A
T
C
G
C
C
G
T
C
-
-
A
C
G
G
-
-
A
C
C
A
A
C
T
-
-
A
T
C
T
A
T
C
-
T
T
T
C
G
A
T
T
T
C
A
A
A
A
A
T
A
C
A
C
30
A
T
G
C
A
T
G
T
G
G
A
T
A
C
T
A
-
G
T
C
-
G
2
G
T
C
T
A
T
T
T
G
A
C
C
A
C
A
A
C
G
C
G
C
C
C
A
G
A
A
C
G
G
A
A
A
T
A
A
C
T
T
G
T
T
G
T
G
A
C
A
A
A
T
A
A
C
12
A
T
T
C
C
G
-
C
-
A
-
G
T
C
T
G
G
-
T
A
C
A
A
G
T
A
C
C
C
A
A
C
C
T
A
A
C
-
G
G
T
C
-
T
T
C
T
T
T
T
T
C
C
-
T
C
T
A
-
C
C
G
C
C
G
T
-
-
T
G
C
G
G
C
A
C
A
T
A
G
-
G
T
G
A
G
A
A
G
-
18
-
A
A
G
T
G
-
T
G
C
A
A
G
2
18
2
-
A
C
G
G
A
C
T
T
G
2
7
C
T
112
A
T
2
C
-
A
C
-
T
G
G
C
C
A
A
T
-
T
T
T
C
C
C
3
G
-
G
T
G
A
C
A
A
C
C
A
A
T
T
T
T
A
A
-
A
C
T
T
A
T
C
T
A
T
C
G
A
C
G
T
-
C
T
C
T
C
A
G
A
C
A
T
A
T
T
T
C
C
T
G
A
A
T
G
C
C
C
2
12
G
A
C
A
G
T
G
T
T
G
A
C
A
A
C
T
G
T
C
T
A
G
G
A
G
-
2
C
C
C
C
A
T
-
A
A
T
C
A
G
C
A
G
T
G
T
G
T
G
A
T
G
C
C
T
C
G
T
C
G
A
T
C
C
-
T
T
G
C
C
A
G
T
T
G
  19,111,180
  19,111,413
  19,111,523
  19,112,181
  19,113,114
  19,113,193
  19,113,247
  19,113,361
  19,113,567
  19,113,702
  19,116,688
  19,116,690
  19,116,692
  19,116,694
  19,116,696
  19,118,526
  19,119,131
  19,119,137
  19,120,517
  19,120,974
  19,121,529
  19,122,927
  19,122,935
  19,122,937
  19,124,181
  19,124,586
  19,126,673
  19,127,567
  19,127,864
  19,127,975
  19,128,231
  19,128,376
  19,128,545
  19,129,086
  19,129,420
  19,129,852
  19,130,345
  19,130,951
  19,131,046
  19,131,334
  19,131,598
  19,131,888
  19,132,030
  19,133,223
  19,133,271
  19,133,493
  19,133,857
  19,134,074
  19,134,200
  19,134,203
  19,134,230
  19,134,252
  19,135,124
  19,136,082
  19,136,154
  19,137,972
  19,138,127
  19,139,120
  19,140,819
  19,142,702
  19,142,766
  19,142,917
  19,143,138
  19,143,200
  19,143,847
  19,143,962
  19,144,009
  19,144,168
  19,144,381
  19,144,838
  19,145,725
  19,145,974
  19,146,382
  19,147,042
  19,148,334
  19,148,364
  19,148,441
  19,148,697
  19,148,698
  19,148,714
  19,148,715
  19,148,725
  19,148,736
  19,148,767
  19,148,776
  19,148,778
  19,148,781
  19,148,796
  19,148,805
  19,148,815
  19,148,817
  19,148,901
  19,148,915
  19,148,920
  19,148,926
  19,148,994
  19,149,048
  19,149,515
  19,149,708
  19,149,986
  19,150,445
  19,150,561
  19,150,623
  19,150,677
  19,150,822
  19,151,360
  19,151,401
  19,151,404
  19,152,450
  19,152,505
  19,153,399
  19,153,931
  19,154,251
  19,156,904
  19,157,106
  19,157,625
  19,157,983
  19,158,321
  19,158,452
  19,158,580
  19,159,767
  19,160,106
  19,160,194
  19,160,890
  19,161,022
  19,161,675
  19,161,813
  19,163,344
  19,163,417
  19,163,486
  19,163,603
  19,163,721
  19,163,905
  19,163,934
  19,164,580
  19,165,227
  19,165,424
  19,165,441
  19,165,567
  19,166,459
  19,166,572
  19,166,616
  19,166,837
  19,166,907
  19,166,949
  19,167,056
  19,167,372
  19,167,527
  19,167,622
  19,167,787
  19,167,788
  19,168,012
  19,168,058
  19,168,103
  19,168,133
  19,168,170
  19,168,230
  19,168,631
  19,168,650
  19,168,705
  19,168,897
  19,168,960
  19,169,040
  19,169,133
  19,169,135
  19,169,159
  19,169,242
  19,169,343
  19,169,416
  19,169,481
  19,169,603
  19,169,871
  19,170,051
  19,170,136
  19,170,410
  19,170,570
  19,170,877
  19,170,973
  19,171,215
  19,171,241
  19,171,383
  19,171,708
  19,171,900
  19,171,913
  19,171,960
  19,172,167
  19,172,283
  19,172,475
  19,172,503
  19,173,423
  19,173,460
  19,173,487
  19,176,348
  19,177,484
  19,177,502
  19,177,557
  19,178,647
  19,179,380
  19,179,382
  19,179,384
  19,179,386
  19,179,388
  19,179,390
  19,179,392
  19,179,394
  19,180,341
  19,180,817
  19,180,942
  19,181,002
  19,181,006
  19,181,441
  19,181,660
  19,181,984
  19,182,096
  19,182,114
  19,182,160
  19,182,258
  19,182,697
  19,182,999
  19,183,067
  19,183,830
  19,184,418
  19,184,626
  19,184,912
  19,184,979
  19,185,023
  19,186,364
  19,186,901
  19,187,049
  19,187,099
  19,187,180
  19,187,755
  19,187,983
  19,188,554
  19,188,778
  19,189,190
  19,189,366
  19,189,778
  19,190,433
  19,190,849
  19,190,895
  19,191,807
  19,191,954
  19,192,596
  19,193,315
  19,194,933
  19,195,208
  19,195,729
  19,195,847
  19,195,931
  19,196,420
  19,196,737
  19,198,647
  19,200,030
  19,200,113
  19,200,201
  19,200,273
  19,200,276
  19,200,288
  19,201,774
  19,202,085
  19,202,524
  19,203,358
  19,203,851
  19,204,277
  19,204,723
  19,204,740
  19,204,943
  19,205,094
  19,206,048
  19,206,579
  19,208,308
  19,208,536
  19,208,704
  19,208,857
  19,209,452
  19,210,254
  19,210,281
  19,210,421
  19,211,796
  19,212,538
  19,213,566
  19,214,091
  19,215,151
  19,218,586
  19,218,917
  19,219,288
  19,219,290
  19,220,595
  19,220,863
  19,221,023
  19,221,120
  19,221,254
  19,221,367
  19,221,447
  19,221,771
  19,222,573
  19,224,157
  19,224,201
  19,224,816
  19,224,874
  19,224,985
  19,225,020
  19,225,299
  19,225,599
  19,225,671
  19,225,844
  19,226,626
  19,226,768
  19,226,772
  19,226,787
  19,227,349
  19,227,404
  19,229,367
  19,229,669
  19,229,885
  19,230,504
  19,230,506
  19,231,510
  19,231,590
  19,233,211
  19,233,521
  19,233,624
  19,234,995
  19,236,708
  19,236,859
  19,237,233
  19,237,307
  19,238,497
  19,238,621
  19,240,857
  19,242,047
  19,242,097
  19,242,693
  19,242,942
  19,243,088
  19,243,229
  19,243,921
  19,244,355
  19,245,625
  19,245,626
  19,245,638
  19,245,930
  19,245,932
  19,246,107
  19,246,234
  19,248,314
  19,249,390
  19,249,428
  19,252,320
  19,253,671
  19,254,361
  19,254,460
  19,254,875
  19,257,066
  19,257,533
  19,257,699
  19,257,953
  19,258,013
  19,258,406
  19,258,597
  19,259,017
  19,259,090
  19,259,211
  19,260,258
  19,260,277
  19,260,317
  19,260,387
  19,260,692
  19,260,843
  19,260,917
  19,261,097
  19,261,249
  19,261,264
  19,261,283
  19,261,286
  19,261,420
  19,261,591
  19,261,654
  19,261,994
  19,262,566
  19,262,672
  19,262,856
  19,263,668
  19,263,861
  19,264,005
  19,264,948
  19,265,117
  19,265,250
  19,265,482
  19,265,802
  19,265,811
  19,266,272
  19,266,735
  19,266,744
  19,266,890
  19,266,948
  19,269,203
  19,271,287
  19,272,896
  19,273,404
  19,273,430
  19,273,442
  19,282,415
  19,286,796
  19,286,826
  19,286,994
  19,286,997
  19,287,194
  19,287,719
  19,287,912
  19,288,557
  19,289,163
  19,289,222
  19,289,464
  19,289,758
  19,291,015
  19,292,777
  19,292,972
  19,293,307
  19,293,308
  19,293,330
  19,293,334
  19,293,474
  19,293,475
  19,293,477
  19,293,768
  19,293,966
  19,294,005
  19,294,073
  19,294,171
  19,294,198
  19,294,321
  19,294,506
  19,294,560
  19,294,561
  19,294,680
  19,294,862
  19,294,888
  19,294,889
  19,295,168
  19,295,267
  19,295,579
  19,295,791
  19,296,478
  19,296,496
  19,296,512
  19,296,703
  19,296,849
  19,297,020
  19,297,060
  19,297,307
  19,297,475
  19,297,479
  19,297,628
  19,297,771
  19,297,808
  19,297,811
  19,297,859
  19,297,925
  19,297,929
  19,297,971
  19,298,109
  19,298,157
  19,298,574
  19,298,575
  19,298,952
  19,299,345
  19,299,535
  19,299,559
  19,299,587
  19,299,643
  19,299,661
  19,299,686
  19,299,701
  19,300,311
  19,300,600
  19,300,603
  19,300,676
  19,300,790
  19,301,083
  19,301,100
  19,301,302
  19,301,306
  19,301,316
  19,301,325
  19,301,456
  19,301,485
  19,301,575
  19,301,601
  19,301,604
  19,301,660
  19,302,242
  19,302,437
  19,302,704
  19,302,832
  19,302,899
  19,302,911
  19,303,018
  19,303,121
  19,303,441
  19,303,457
  19,303,840
  19,303,918
  19,304,045
  19,304,065
  19,304,303
  19,304,761
  19,304,911
  19,304,933
  19,305,015
  19,305,016
  19,305,019
  19,305,020
  19,305,023
  19,305,028
  19,305,035
  19,305,138
  19,305,201
  19,305,390
  19,305,480
  19,305,643
  19,305,805
  19,305,816
  19,305,906
  19,305,930
  19,306,098
  19,306,143
  19,306,239
  19,306,309
  19,306,637
  19,306,733
  19,306,734
  19,307,157
  19,307,168
  19,307,206
  19,307,345
  19,307,372
  19,308,016
  19,308,104
  19,308,180
  19,308,297
  19,308,478
  19,308,542
  19,308,631
  19,308,918
  19,309,075
  19,309,088
  19,309,094
  19,309,163
  19,309,197
  19,309,249
  19,309,445
  19,309,696
  19,309,837
  19,309,870
  19,310,103
  19,310,401
  19,310,475
  19,311,181
  19,311,532
  19,312,522
  19,312,858
  19,313,631
  19,313,764
  19,313,979
  19,314,586
  19,314,726
  19,314,727
  19,314,749
  19,314,779
  19,314,797
  19,314,968
  19,315,290
  19,315,549
  19,315,642
  19,315,699
  19,316,708
  19,316,732
  19,316,873
  19,316,924
  19,317,154
  19,317,157
  19,317,248
  19,317,298
  19,317,322
  19,317,438
  19,317,449
  19,317,452
  19,317,679
  19,317,756
  19,317,934
  19,317,958
  19,318,094
  19,318,183
  19,318,184
  19,318,191
  19,318,532
  19,318,687
  19,318,822
  19,318,840
  19,318,860
  19,319,900
  19,319,940
  19,319,951
  19,319,953
  19,319,954
  19,319,976
  19,319,997
  19,320,076
  19,320,120
  19,320,134
  19,320,692
  19,321,138
  19,321,533
  19,321,547
  19,321,613
  19,321,699
  19,321,716
  19,321,737
  19,321,833
  19,322,038
  19,322,096
  19,322,143
  19,322,234
  19,322,385
  19,322,409
  19,322,946
  19,323,055
  19,323,193
  19,323,380
  19,323,412
  19,323,478
  19,323,489
  19,323,490
  19,323,958
  19,324,200
  19,324,390
  19,324,830
  19,325,105
  19,325,250
  19,325,533
  19,325,894
  19,326,101
  19,326,917
  19,327,916
  19,329,016
  19,329,510
  19,329,513
  19,329,523
  19,329,691
  19,329,929
  19,330,450
  19,331,095
  19,331,325
  19,332,342
  19,332,580
  19,332,677
C
T
A
A
3
-
31/-
-
4
3
C/-
-/C
-/C
G/C
G/C
G
A
A
T
C
G
-/G
-/G
G/-
T
A
C
G/T
A
C
T
T
C
C
-
A
A
T
C
11
-
-
T
A
C
A
A
A
T
C
C/T
3
G
T
G
A
A
G
-
T
C
T
A
T
A
C
T
A
A
G
A
G
C
C
T
C
C
C/-
G/-
-
T/-
-
-
-/A
-/A
A/-
-/T
-/A
C/-
-/C
-/C
-
-/A
G/-
A/-
A
-/G
T
T
C
G
C
G
T
C
T
G
G
G
C
A
A
C
G
G
T
A
C
A
C
T
G
G
-
A
-
C
A
G
13
A
-
T
A
G
T
-
G
G
T
T
T
-
C
A
A
A
T
-
C
C
G
-
C
4
A
T
T
A
T
C
G
G
A
G/A
A
G
G
A
-
T
A
C
2
A
T
C
C
-
T
C
G
-
-
-
T
T
C
A
C
C
A
T
G
C
C
G
-/T
-/T
T
T
T
T
T
A/T
T
A
T
T/-
T/-
C
C
T
G
A
T
G
-
G
A
T
A
-
A
G
A
A
221/-
-/C
-/C
-
G
A
A
A
C
A
T
T
G
C
A
A
T
T
A
C
T
2
23
G
T
A
T
12
2
-/C
G/-
G
G
G
T
C
38
A
G
C
T
C
G
C
T
12
C
C
C
T
A
G
C
C
C
G/-
G
G
G
G/-
-/G
A
G
T
G
A
-
G
C
A
G
C
C
A
C
A
A
G
C
G
A
C
G
8
A
C
A
T
T
-
T
G
T
C
G
C
G
A
A
T
T
T
-
-
T
G/-
T
-/T
A
A
T
G
T
G
A
C
G
G
A
T
G
G
G
C
T
G
T
C
C
A
A
C
A
C
T
T
T
G
G
G
C
T
G
G
-
G
C
C
T
T
A/T
C
T
12
G
A
A
A
T
C
A
A
T
C
G
T
G
C
A
C
T
A
T
A
G
-
T
-
C
T
T
T
G
?
A
C
A
4
C
G
A
A
A
A
C
C
A/-
A/-
2
G
T
C
G
C
T
T
A
-
A
A
G
A
29
C
A
T
A
A
G
T
T
G
C
G
A
T
T
C
A
G
A
G
G
A
4
-
TA/A
T/G
T
A
G
A
A
C
A
T
G
G
C
-
-
-
2
C
A
C
A
C
T
G
C
A
-
-
A
C
-
-/C
G
-
T
2
G
T
10
A
C
A
T
T
G
G
A
5
C
C
C
G
-
A
-
A
4
A
C
A
G
T
G
C
A
T
G
C
A
C
C
C
G
G
10
T
T
C
C
C
C
T
G
-/G
C/-
T/-
C
G
T
A
C
A
T
C
T
A
T
G
A
G
T
G
C
C
-/G
G/-
C
T
T
A
A
G
G
A
A
T
A
G
-
-
T
G
G
C
-
A
C
C
C
A
G
G
G
T
T
C
A
C
-
C
C
A
A
G
A
10
-
T
T
G
-/G
G
C
G
C
G
A
T
G
A
G
G
A
C
A
C
A
C
A
G
C
T/C
T
T
C
A
C
C
T
A
T
C
A
T
2
C
-/C
-
G
T
G
C
C
G
A