Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 403,642 (bp)   Positions: 653
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
Tnik
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
-
A
A
T
G
G
T
2
G
A
-
C
C
C
C
T
C
T
-
-
A
A
T
T
T
G
T
A
C
T
T
G
G
A
G
C
G
C
T
G
T
C
C
T
G
A
-
T
G
C
A
G
G
G
G
G
A
C
C
C
C
C
C
C
C
C
T
2
G
C
-
-
C
G
A
T
G
T
-
C
G
A
T
C
G
T
T
A
-
C
G
4
C
G
G
T
A
C
G
A
G
T
C
G
T
A
A
G
A
T
A
A
4
G
A
G
A
G
T
A
T
G
G
A
G
G
T
G
A
C
T
C
C
T
G
G
T
G
A
T
G
A
G
G
A
A
C
T
T
A
A
G
G
G
A
T
G
A
T
G
A
C
C
A
G
T
G
A
A
5
A
A
G
G
2
-
-
C
G
G
G
G
-
C
G
C
G
C
G
T
G
T
C
2
A
T
A
T
T
C
A
T
C
T
T
A
G
C
T
T
T
-
T
-
G
G
A
G
G
C
A
G
C
-
T
A
G
T
T
-
C
A
A
C
T
C
T
-
2
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
-
T
A
G
T
-
G
G
G
G
A
C
T
T
A
A
C
A
T
T
A
C
T
C
C
C
T
-
T
A
C
-
T
C
-
-
T
G
C
G
G
C
C
T
C
G
A
C
A
A
A
C
G
-
A
G
T
A
C
A
A
A
-
-
C
C
A
C
4
T
T
3
C
G
G
G
G
A
G
T
T
A
T
C
C
C
C
T
G
A
-
-
-
A
T
-
C
A
G
T
G
C
T
G
C
T
T
G
C
G
A
G
G
A
T
C
C
A
T
G
C
T
G
-
C
C
A
-
A
T
T
G
G
T
A
A
G
T
T
G
G
G
A
C
G
G
G
T
A
T
G
T
T
C
C
A
C
A
T
A
G
G
A
A
C
C
C
A
G
C
C
A
G
A
G
-
A
C
G
A
-
-
2
G
A
-
A
G
2
G
-
A
A
A
A
G
G
C
A
T
15
A
G
C
C
A
G
-
A
-
2
8
T
C
-
C
T
A
C
C
-
G
A
G
G
T
-
A
A
C
A
-
T
A
C
T
C
C
C
-
G
T
G
A
A
126
C
-
C
3
G
A
A
G
T
T
G
-
G
G
T
G
A
A
A
A
G
C
T
8
4
T
2
G
C
A
A
G
A
-
T
T
G
C
-
T
A
T
T
T
15
A
A
T
-
G
G
G
G
G
G
G
G
G
A
T
A
A
T
C
A
A
C
T
G
A
G
G
G
A
C
C
G
A
-
C
A
G
A
T
T
G
-
C
G
A
A
T
19
G
T
A
A
A
G
-
-
A
G
A
G
A
A
7
A
G
A
C
A
-
-
C
T
C
T
C
G
T
-
T
C
A
-
-
T
T
A
T
C
T
G
C
A
G
T
-
G
C
T
A
C
A
C
A
  111,184,903
  111,184,905
  111,185,947
  111,185,997
  111,186,068
  111,186,304
  111,187,161
  111,187,397
  111,187,398
  111,187,590
  111,188,194
  111,188,755
  111,189,008
  111,189,778
  111,192,357
  111,192,719
  111,193,402
  111,193,712
  111,194,212
  111,194,418
  111,194,538
  111,194,712
  111,194,719
  111,195,301
  111,195,424
  111,195,593
  111,196,067
  111,196,089
  111,196,494
  111,196,618
  111,196,715
  111,196,852
  111,197,716
  111,197,930
  111,198,117
  111,198,817
  111,199,421
  111,200,678
  111,201,230
  111,204,222
  111,204,726
  111,205,039
  111,205,138
  111,206,522
  111,206,848
  111,209,192
  111,209,414
  111,210,010
  111,210,107
  111,210,583
  111,211,699
  111,219,483
  111,219,485
  111,219,487
  111,219,489
  111,221,299
  111,222,382
  111,227,429
  111,231,311
  111,231,367
  111,231,369
  111,231,371
  111,231,373
  111,231,375
  111,231,377
  111,231,389
  111,241,728
  111,244,280
  111,248,140
  111,249,578
  111,265,119
  111,268,500
  111,268,551
  111,270,695
  111,274,906
  111,279,898
  111,286,146
  111,286,451
  111,296,822
  111,300,540
  111,300,556
  111,300,563
  111,300,606
  111,300,608
  111,300,701
  111,300,733
  111,300,738
  111,300,739
  111,301,114
  111,301,506
  111,303,252
  111,305,329
  111,305,721
  111,306,312
  111,306,901
  111,307,903
  111,308,142
  111,308,191
  111,308,218
  111,308,244
  111,308,472
  111,308,539
  111,308,575
  111,308,705
  111,308,724
  111,308,739
  111,308,783
  111,308,931
  111,308,940
  111,308,958
  111,309,132
  111,309,170
  111,309,235
  111,309,302
  111,309,441
  111,310,310
  111,310,734
  111,311,018
  111,312,274
  111,312,763
  111,312,993
  111,313,017
  111,313,019
  111,313,138
  111,313,252
  111,313,815
  111,314,209
  111,315,285
  111,315,651
  111,315,721
  111,315,759
  111,315,822
  111,315,826
  111,316,410
  111,316,510
  111,316,725
  111,317,859
  111,318,101
  111,318,198
  111,318,404
  111,318,429
  111,318,699
  111,319,068
  111,319,421
  111,319,948
  111,320,196
  111,320,350
  111,320,472
  111,320,783
  111,320,928
  111,320,994
  111,321,493
  111,323,088
  111,323,102
  111,323,742
  111,324,035
  111,324,152
  111,324,344
  111,325,154
  111,325,515
  111,325,759
  111,326,491
  111,327,795
  111,329,251
  111,329,292
  111,329,293
  111,329,407
  111,329,496
  111,330,964
  111,330,970
  111,332,538
  111,333,349
  111,333,511
  111,333,804
  111,334,949
  111,336,103
  111,336,682
  111,339,088
  111,339,692
  111,340,882
  111,342,045
  111,342,666
  111,344,332
  111,344,801
  111,345,905
  111,346,107
  111,346,226
  111,346,774
  111,346,832
  111,347,769
  111,347,874
  111,348,156
  111,348,252
  111,348,318
  111,348,422
  111,348,829
  111,349,261
  111,351,371
  111,351,507
  111,351,727
  111,353,333
  111,354,017
  111,354,203
  111,354,323
  111,354,946
  111,355,175
  111,355,309
  111,355,332
  111,355,976
  111,356,792
  111,356,967
  111,360,479
  111,361,498
  111,362,205
  111,363,482
  111,364,920
  111,371,099
  111,373,473
  111,374,143
  111,374,519
  111,375,293
  111,375,789
  111,375,962
  111,376,358
  111,377,220
  111,377,998
  111,380,255
  111,380,264
  111,380,265
  111,380,401
  111,380,434
  111,380,465
  111,380,472
  111,381,075
  111,381,754
  111,381,847
  111,382,016
  111,382,114
  111,382,127
  111,382,134
  111,382,136
  111,382,138
  111,382,140
  111,382,142
  111,382,144
  111,382,146
  111,382,148
  111,382,150
  111,382,152
  111,382,154
  111,382,156
  111,382,158
  111,382,160
  111,382,162
  111,382,164
  111,382,166
  111,382,168
  111,382,170
  111,382,726
  111,383,268
  111,383,270
  111,383,415
  111,384,059
  111,385,437
  111,385,704
  111,385,857
  111,387,316
  111,387,318
  111,387,514
  111,388,342
  111,392,176
  111,392,688
  111,393,386
  111,393,938
  111,394,809
  111,394,961
  111,396,487
  111,397,981
  111,398,196
  111,398,504
  111,398,576
  111,400,506
  111,400,761
  111,401,009
  111,402,709
  111,402,833
  111,407,166
  111,407,171
  111,407,532
  111,409,286
  111,412,430
  111,412,736
  111,413,592
  111,414,362
  111,415,738
  111,416,278
  111,416,787
  111,417,096
  111,417,212
  111,418,356
  111,418,435
  111,422,012
  111,422,685
  111,424,180
  111,424,821
  111,424,822
  111,425,119
  111,425,456
  111,425,995
  111,426,607
  111,426,891
  111,427,581
  111,427,994
  111,428,048
  111,428,049
  111,428,095
  111,428,324
  111,428,336
  111,428,434
  111,428,436
  111,428,956
  111,429,045
  111,429,270
  111,429,330
  111,429,563
  111,429,965
  111,430,060
  111,430,364
  111,430,370
  111,430,371
  111,430,727
  111,431,198
  111,431,400
  111,431,423
  111,431,435
  111,431,447
  111,431,590
  111,431,614
  111,431,896
  111,431,969
  111,432,518
  111,433,762
  111,433,802
  111,435,433
  111,435,649
  111,435,662
  111,435,947
  111,436,109
  111,436,196
  111,436,546
  111,436,610
  111,436,708
  111,436,761
  111,436,774
  111,436,855
  111,436,937
  111,437,204
  111,437,278
  111,437,304
  111,437,947
  111,438,565
  111,438,713
  111,438,714
  111,438,720
  111,438,868
  111,438,907
  111,438,931
  111,439,138
  111,439,312
  111,439,415
  111,439,677
  111,439,907
  111,439,909
  111,439,912
  111,439,917
  111,439,924
  111,439,970
  111,439,974
  111,439,983
  111,440,025
  111,440,151
  111,440,498
  111,441,099
  111,441,275
  111,441,540
  111,441,569
  111,441,772
  111,441,778
  111,442,193
  111,442,290
  111,442,366
  111,442,826
  111,443,274
  111,443,432
  111,443,433
  111,443,796
  111,443,976
  111,444,093
  111,444,526
  111,444,573
  111,444,758
  111,445,218
  111,445,464
  111,445,594
  111,445,681
  111,445,702
  111,445,862
  111,445,870
  111,445,932
  111,446,170
  111,446,301
  111,446,460
  111,446,822
  111,447,014
  111,447,632
  111,448,362
  111,448,550
  111,450,070
  111,450,137
  111,450,319
  111,451,797
  111,452,015
  111,452,492
  111,453,022
  111,453,024
  111,453,259
  111,453,416
  111,453,936
  111,454,030
  111,454,271
  111,454,418
  111,454,708
  111,454,904
  111,454,945
  111,455,067
  111,455,076
  111,455,301
  111,455,883
  111,456,979
  111,457,380
  111,457,396
  111,457,399
  111,457,406
  111,457,417
  111,457,451
  111,457,490
  111,457,537
  111,457,552
  111,457,555
  111,465,600
  111,465,635
  111,465,637
  111,465,639
  111,465,641
  111,465,992
  111,466,010
  111,466,175
  111,468,306
  111,469,921
  111,474,991
  111,475,688
  111,476,487
  111,476,563
  111,477,301
  111,477,877
  111,478,845
  111,479,486
  111,479,494
  111,479,619
  111,480,120
  111,480,123
  111,480,207
  111,480,513
  111,480,751
  111,481,064
  111,481,314
  111,482,511
  111,482,563
  111,482,703
  111,482,979
  111,483,654
  111,483,777
  111,484,731
  111,486,573
  111,492,325
  111,492,383
  111,492,754
  111,493,617
  111,493,852
  111,493,853
  111,493,876
  111,494,815
  111,495,720
  111,496,402
  111,497,123
  111,497,591
  111,497,758
  111,497,760
  111,498,326
  111,498,327
  111,498,472
  111,500,383
  111,500,824
  111,501,826
  111,502,412
  111,505,571
  111,505,790
  111,510,871
  111,510,921
  111,512,508
  111,512,755
  111,513,304
  111,513,546
  111,517,343
  111,519,515
  111,521,980
  111,522,030
  111,524,965
  111,525,090
  111,527,008
  111,529,414
  111,531,577
  111,531,860
  111,532,634
  111,533,020
  111,533,155
  111,534,209
  111,534,630
  111,534,635
  111,534,654
  111,534,666
  111,534,781
  111,534,903
  111,536,506
  111,536,804
  111,537,820
  111,538,066
  111,538,136
  111,538,633
  111,539,142
  111,539,616
  111,539,848
  111,540,978
  111,541,215
  111,541,706
  111,542,081
  111,542,526
  111,544,741
  111,546,438
  111,547,607
  111,548,652
  111,548,923
  111,550,866
  111,551,257
  111,551,296
  111,551,298
  111,551,300
  111,551,302
  111,551,304
  111,551,306
  111,551,308
  111,551,310
  111,552,033
  111,553,027
  111,553,965
  111,554,169
  111,554,171
  111,554,273
  111,554,502
  111,555,416
  111,556,297
  111,557,000
  111,557,267
  111,558,857
  111,559,088
  111,559,099
  111,559,103
  111,560,228
  111,560,504
  111,560,863
  111,561,512
  111,563,322
  111,563,471
  111,564,385
  111,564,515
  111,564,516
  111,565,150
  111,565,206
  111,565,570
  111,565,571
  111,565,572
  111,566,306
  111,567,027
  111,567,038
  111,567,823
  111,567,860
  111,567,903
  111,568,059
  111,568,117
  111,568,310
  111,568,486
  111,568,491
  111,568,521
  111,568,558
  111,568,598
  111,568,599
  111,568,797
  111,568,889
  111,568,971
  111,569,337
  111,569,458
  111,569,546
  111,569,570
  111,570,659
  111,571,173
  111,571,175
  111,571,176
  111,571,180
  111,571,182
  111,571,183
  111,571,451
  111,571,482
  111,571,933
  111,572,140
  111,572,411
  111,572,818
  111,573,444
  111,573,775
  111,573,842
  111,575,486
  111,575,502
  111,575,852
  111,576,460
  111,576,529
  111,577,165
  111,577,222
  111,577,470
  111,577,477
  111,578,852
  111,579,234
  111,579,688
  111,579,714
  111,580,028
  111,580,571
  111,580,582
  111,583,566
  111,583,692
  111,583,726
  111,584,483
  111,584,702
  111,585,622
  111,586,661
  111,587,176
T
G
C
C
C
A
C
-
T/-
G
A
T
T
T
T
C
T
C
T
G
G
G
C
C
G
A
C
C
T
C
C
A
A
T
A
T
A
G
-
A
C/-
T
T
A
A
G
T
C
A
T
G
T/-
T/-
-/T
T/-
T
G
T
?
C/G
C/G
C/G
C/G
C/G
C/G
G/-
A
2/-
T
T
2
G
A
A
G
A
-/A
C/-
C
T
C
G
G
G
T
A
-/C
G
A
A
A
-
T
T
A
A
G
G
C
T
A
C
G
A
C
G
C
C
T
C
T
G
-
-
T
A
G
A
C
T
G
A/-
A/-
G
A
C
C
A
T
T
-/C
T/-
-/T
C
A
T
A
A
T
C
A
G
T
A
G
G
A
C
C
G
G
C
A
A
G
C
-/T
G
C
A
G
A
-
T
A
C
A
-/C
G
-
G
G
A
A
-
4
C
T
A
A
A
C
T
A
A
T
A
G
A
G
A
-
A
-
G
C
G
C
-
T
C
C
T
C
G
T
-
T
C
C
A
T
C
C
A
A
T
C
-
A
G
A
T
5
C
C
A
C
A
11
A
-
G
T
C
T
C
-/4
2/-
?
-/C
-/C
C/-
C/-
-/C
-/C
C/-
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
C
A
T
A
G
A
A
8
T
-/C
C/-
C
C
T
C
A
G
G
T
G
C
C
G
T/-
G
A
G
A
C
C
C
T
T
4
C
T
A
A
C
A
T
A
C
T
A
C
T
A
G
T
G
G
G
T
A
A
G
C
C
G
A/G
G
G
C
3
16
T
G
G
T
-
-
G
-
T
T
T
A
A
G
C
C
C
C
C
T
T
T
-
C
A
G
-/6
G
2
G
C
T
T
G
A
C
A
A
C
A
G
C
C
A
T
A
T
T
A
G
C
G
T
G
C
A
T
C
A
8
G
G
G
2
T
C
C
C
C
C
G
G
C
C
C
A
?
A
-
T
T
T
A
G
G
A
A
A
-
T
A
G
T
G
C
T
A
A
-
G
-/T
T/-
T
G
T
T
T/-
G
A
G
-
A
T
T
A
T
9
2
-
A
G
3
G
A
-
-/A
2
T/-
T/-
-/T
T/-
-/A
A
A
G
C
-
G
C
T
T
G
A
T
T
T
-
-
C
T
G
T
C
G
T
T
-/C
A
G
A
A
C
G
G
-
T/-
G/-
2
C
C
T
A
T
C/T
C/T
T
C
G
A
G
G
-
T
A
T/-
-
C
G
G
A
C
G
A
6
A
T
G
C
G
T
G
G/-
A
A/-
A
-
-
C
-
T/-
T
G
G
A
G
2
C
C
C
T
A
C
G
G
A
C
-
T
G
A
A
C/-
-/C
C/-
C/-
C
C
C
G/C
A
G
C
C/-
-/C
A/-
T
-
G
T
A
A
T
-
-
A
G
T
-/T
A
G
2
G
G
A
G
C
C
A
3
T
A
G
G
C
-
A
C
G
G
G
-
T
26
T
C
G
T
G
T
-
G
T
C
T
G
A
9
T
A
A
-
T
A
A
A
C
T
G
T
3
G
C
G
C
T
C
A
T
G
A
-
T
A
A
-
G
T
G
T
T