Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 124,515 (bp)   Positions: 334
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LEXF3/Stm (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
Tmprss15
A
-
A
T
G
T
A
T
T
T
A
T
T
C
A
A
G
-
T
G
A
C
T
C
G
G
G
A
-
2
A
G
T
-
T
-
A
A
A
A
A
A
2
G
G
A
T
-
C
T
G
G
A
C
G
-
G
G
A
C
A
A
A
G
G
-
A
T
A
G
T
T
G
G
A
C
T
A
G
G
T
C
T
C
T
T
T
A
T
A
A
G
C
A
C
T
G
T
T
G
C
A
A
G
G
A
T
T
-
A
C
-
A
G
G
C
A
C
4
G
C
G
T
C
T
G
C
G
T
G
T
T
T
T
G
A
C
T
T
G
C
C
G
C
G
G
-
A
T
C
G
T
T
G
G
C
G
G
-
-
-
T
G
-
T
C
19
C
G
T
C
T
A
-
G
T
T
A
A
G
C
G
A
C
A
T
G
A
C
G
G
C
A
T
G
C
T
A
T
A
A
T
G
C
A
T
C
A
C
G
3
A
G
G
C
C
C
C
C
C
A
A
C
T
C
-
T
T
A
T
C
T
G
T
C
A
C
C
C
G
-
-
A
G
G
A
C
G
G
A
A
C
T
-
A
-
A
A
A
A
G
C
G
T
3
T
A
G
T
G
T
A
C
T
T
T
G
T
T
G
T
C
C
G
G
A
A
G
G
T
C
A
A
C
C
A
T
C
-
C
-
-
T
T
C
A
110
C
A
C
-
-
T
C
T
-
T
G
-
7
-
G
C
C
T
3
-
-
A
-
-
C
-
G
  17,678,540
  17,678,976
  17,678,978
  17,679,530
  17,679,738
  17,680,313
  17,680,569
  17,684,397
  17,685,682
  17,688,013
  17,688,923
  17,689,294
  17,690,322
  17,690,652
  17,691,271
  17,691,420
  17,692,648
  17,692,932
  17,693,452
  17,694,039
  17,694,699
  17,696,688
  17,698,052
  17,698,249
  17,698,433
  17,698,671
  17,699,957
  17,700,438
  17,707,476
  17,707,537
  17,711,034
  17,711,084
  17,712,065
  17,715,160
  17,716,177
  17,717,327
  17,717,329
  17,717,331
  17,717,333
  17,717,335
  17,717,337
  17,717,339
  17,717,342
  17,719,502
  17,721,371
  17,723,586
  17,724,107
  17,724,673
  17,724,903
  17,726,087
  17,726,147
  17,726,624
  17,730,550
  17,730,660
  17,730,999
  17,731,308
  17,731,396
  17,731,851
  17,731,907
  17,733,119
  17,733,375
  17,734,118
  17,736,741
  17,736,777
  17,736,894
  17,737,667
  17,737,784
  17,737,853
  17,738,990
  17,740,189
  17,740,235
  17,740,317
  17,740,375
  17,740,444
  17,740,884
  17,741,332
  17,741,378
  17,741,427
  17,741,651
  17,742,005
  17,742,087
  17,742,298
  17,742,333
  17,742,647
  17,742,670
  17,742,736
  17,742,876
  17,742,943
  17,742,955
  17,743,155
  17,743,248
  17,743,304
  17,743,380
  17,743,424
  17,743,472
  17,743,563
  17,743,566
  17,743,708
  17,743,776
  17,743,779
  17,744,013
  17,744,058
  17,744,298
  17,744,381
  17,744,536
  17,744,839
  17,744,915
  17,745,259
  17,745,565
  17,745,724
  17,745,728
  17,745,952
  17,745,965
  17,746,159
  17,746,931
  17,746,932
  17,746,995
  17,747,194
  17,747,210
  17,747,482
  17,747,713
  17,748,045
  17,748,929
  17,748,936
  17,749,132
  17,749,432
  17,749,449
  17,749,811
  17,749,943
  17,750,461
  17,750,509
  17,750,585
  17,750,717
  17,750,777
  17,750,824
  17,751,140
  17,751,169
  17,751,193
  17,751,600
  17,751,809
  17,751,949
  17,752,561
  17,752,656
  17,752,670
  17,752,890
  17,752,896
  17,753,016
  17,753,216
  17,753,367
  17,754,087
  17,754,324
  17,754,363
  17,755,105
  17,755,245
  17,755,315
  17,755,757
  17,755,776
  17,755,779
  17,756,003
  17,756,103
  17,756,362
  17,756,414
  17,756,842
  17,756,896
  17,756,923
  17,757,215
  17,757,219
  17,757,325
  17,757,336
  17,757,504
  17,757,512
  17,757,623
  17,757,629
  17,757,776
  17,758,069
  17,758,352
  17,758,354
  17,758,758
  17,759,348
  17,759,479
  17,759,685
  17,759,800
  17,759,964
  17,760,264
  17,760,396
  17,760,409
  17,760,452
  17,760,594
  17,760,695
  17,760,792
  17,760,812
  17,760,834
  17,761,074
  17,761,098
  17,761,172
  17,761,215
  17,761,381
  17,761,453
  17,761,458
  17,761,760
  17,761,973
  17,762,103
  17,762,159
  17,762,223
  17,762,634
  17,762,675
  17,762,852
  17,762,878
  17,763,153
  17,763,160
  17,763,216
  17,763,328
  17,763,371
  17,763,570
  17,764,075
  17,764,429
  17,765,615
  17,766,497
  17,766,657
  17,766,658
  17,766,661
  17,767,485
  17,768,294
  17,768,843
  17,769,081
  17,769,325
  17,769,487
  17,769,627
  17,770,853
  17,771,387
  17,772,248
  17,774,098
  17,774,152
  17,774,446
  17,774,960
  17,775,144
  17,775,205
  17,777,684
  17,777,757
  17,778,230
  17,778,663
  17,778,666
  17,778,961
  17,779,241
  17,779,391
  17,779,453
  17,779,718
  17,779,725
  17,779,947
  17,781,171
  17,781,824
  17,782,049
  17,782,388
  17,783,052
  17,783,398
  17,786,883
  17,787,798
  17,788,022
  17,788,336
  17,788,703
  17,788,903
  17,789,117
  17,789,680
  17,789,952
  17,790,880
  17,790,966
  17,791,264
  17,791,401
  17,791,583
  17,791,793
  17,791,812
  17,793,142
  17,793,529
  17,793,601
  17,793,740
  17,793,789
  17,793,818
  17,794,038
  17,794,056
  17,794,071
  17,794,328
  17,794,580
  17,794,595
  17,794,816
  17,794,833
  17,794,849
  17,794,960
  17,794,962
  17,795,105
  17,795,249
  17,795,264
  17,795,381
  17,795,579
  17,795,703
  17,795,758
  17,795,878
  17,796,300
  17,796,390
  17,796,854
  17,796,925
  17,797,115
  17,797,313
  17,797,318
  17,797,440
  17,797,610
  17,797,920
  17,798,061
  17,798,234
  17,798,355
  17,798,367
  17,798,402
  17,798,896
  17,799,578
  17,799,732
  17,799,783
  17,799,879
  17,800,054
  17,800,092
  17,800,201
  17,800,214
  17,800,329
  17,800,376
  17,800,525
  17,800,780
  17,801,171
  17,801,197
  17,801,289
  17,801,327
  17,801,494
  17,801,546
  17,801,569
  17,801,876
  17,802,129
  17,802,245
G
A
C
C
A
C
G
A
C
G
T
C
C
A
A/G
-
A
A
A
A
C
-
C
T
T
A
A
G
A
-
C
T
C
4
G
-/2
C/-
C/-
-/C
C
C
C
-
A
A
G
C
5
A
C
A
A
C
A
A
T
A
-
C
T
C
C
T
C
A
A
G
A
-
A
C
C
A
A
G
T
C
G
C
C
G
T
G
T
C
C
C
T
C
G
G
C
T
G
A
C
T
C
C
A
T
T
G
A
A
G
C
A
A
G
T
4
-
A
A
T
G
A
-
A
G
A
C
A
C
A
A
A
G
A
-
C
C
C
C
G
T
C
G
A
T
A
T
T
A
T
G/A
G
G
A
A
C
C
-/A
A
T
A
C
2
8
A
C
A
2
C
T
-
T
C
-
G
-
-/C
A
A
G
-
-
C
A
T
A
G
T
C
C
A
G
T
A
A
A
T
C
T
A
C
G
C
G
G
G
A
T
-
C
T
C
T
A
-
G
T
A
T
T
G
T
T
T
C
G
T
G
T
A
G
C
G
A/-
T
C
A
C
T
C
T
A
T
A
C
C
-
A
T
G
T
A
A
T
C
G
-
G
-
G
C
T/-
T
G
A
-/T
T
C
-
C
C
-
A
C
C
G
-
G/C
C
C
C/-
C
C
A
C
T
G
A
C
C
G
A
A
C
G
G
G
T
T
G
-
T
A
-
T
A
G
A
T
G
-
G
T
T
T
T
A
T
-
G
-
A
C
-
A
T
T
-
A
-
A
C
G
A
A
-
A
A