Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 348,807 (bp)   Positions: 672
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102552925
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
A
A
A
G
G
C
15
G
T
C
-
G
A
T
-
-
-
G
G
G
C
-
T
T
G
-
-
G
T
A
-
G
A
G
2
C
C
G
C
-
A
G
40
A
A
A
C
G
T
T
C
C
16
G
C
A
G
-
C
G
G
C
G
A
C
C
A
G
T
-
G
C
A
A
C
T
-
G
T
G
A
G
G
A
G
G
2
2
G
G
A
T
T
T
C
G
T
G
T
A
T
C
-
G
T
C
2
G
-
-
C
C
T
G
T
T
C
T
G
7
G
G
T
A
T
C
T
A
T
T
T
A
A
C
T
A
G
A
T
-
3
G
A
14
2
T
C
C
T
G
G
C
-
-
A
T
-
A
C
T
G
G
A
T
A
C
T
A
A
C
A
A
A
A
T
C
C
C
A
C
T
C
C
T
A
T
A
A
A
9
A
G
C
G
A
A
T
C
T
G
G
C
T
C
T
T
C
A
T
A
A
T
G
C
A
C
7
A
T
C
C
-
C
C
T
A
-
C
G
G
C
C
C
T
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
A
C
A
C
G
T
G
A
G
C
C
G
C
G
G
A
A
G
T
-
A
A
T
C
C
C
T
C
A
G
C
A
C
T
C
C
A
G
G
A
A
T
A
C
G
G
G
G
G
G
G
C
T
A
T
T
-
G
A
T
G
G
G
G
G
G
7
C
C
-
T
12
A
T
C
2
A
A
G
T
A
T
C
C
A
C
C
A
C
G
C
T
G
A
A
C
A
T
-
A
A
A
G
C
A
G
C
T
A
C
G
-
A
C
T
G
G
G
C
2
G
G
G
A
C
C
8
G
G
2
T
G
C
G
C
A
T
-
T
C
T
T
T
C
C
C
C
-
C
G
A
C
3
T
C
C
A
A
C
T
C
T
T
A
A
C
-
G
3
13
A
A
G
G
C
C
A
G
C
T
A
G
A
T
5
A
T
T
A
A
T
G
C
C
T
T
G
C
T
A
C
T
T
C
A
G
A
A
A
A
T
T
G
C
G
-
T
C
A
T
A
G
A
2
C
-
-
A
T
T
T
T
A
A
A
-
C
G
G
A
C
3
8
G
T
G
G
C
A
G
G
T
-
G
G
-
A
A
T
T
T
T
C
T
C
G
C
T
T
A
8
A
G
A
C
T
2
C
2
G
39
T
A
T
A
A
A
G
G
A
-
G
C
G
T
A
A
A
A
C
G
A
G
G
G
T
C
A
-
A
C
-
A
C
A
T
G
A
T
T
G
G
G
C
C
A
C
G
-
G
A
-
G
-
T
C
A
G
4
G
T
T
-
-
G
C
A
G
A
A
A
C
T
C
G
C
T
G
T
T
2
G
C
-
4
6
C
G
C
C
A
A
G
T
G
G
A
C
T
2
-
2
T
-
-
T
C
-
C
T
A
C
G
A
G
C
C
G
8
C
A
C
G
T
-
T
T
C
T
G
A
A
C
A
-
G
G
-
G
A
A
G
  29,034,285
  29,034,768
  29,035,034
  29,036,482
  29,039,952
  29,042,264
  29,042,467
  29,042,500
  29,044,575
  29,044,758
  29,044,901
  29,046,888
  29,048,531
  29,048,861
  29,053,447
  29,054,671
  29,054,675
  29,054,677
  29,054,682
  29,054,692
  29,054,789
  29,055,339
  29,055,344
  29,055,348
  29,058,193
  29,058,681
  29,058,702
  29,059,422
  29,059,852
  29,060,303
  29,062,891
  29,064,050
  29,064,220
  29,064,598
  29,065,227
  29,065,726
  29,068,804
  29,069,396
  29,069,924
  29,070,755
  29,074,088
  29,074,241
  29,074,760
  29,075,191
  29,075,258
  29,075,956
  29,076,120
  29,076,263
  29,076,464
  29,078,854
  29,078,947
  29,079,890
  29,080,119
  29,080,224
  29,081,319
  29,082,415
  29,082,729
  29,082,736
  29,082,933
  29,082,961
  29,083,585
  29,084,214
  29,084,713
  29,086,116
  29,086,618
  29,086,796
  29,086,855
  29,086,943
  29,087,169
  29,087,177
  29,087,498
  29,087,535
  29,087,585
  29,087,601
  29,087,767
  29,087,769
  29,087,924
  29,088,015
  29,088,235
  29,088,318
  29,088,710
  29,088,732
  29,088,865
  29,088,920
  29,089,384
  29,089,582
  29,089,605
  29,089,621
  29,090,241
  29,090,378
  29,091,025
  29,091,648
  29,091,713
  29,091,943
  29,092,573
  29,093,516
  29,093,920
  29,093,962
  29,093,971
  29,094,080
  29,094,221
  29,094,311
  29,094,378
  29,094,998
  29,095,000
  29,095,121
  29,095,243
  29,095,249
  29,095,487
  29,095,530
  29,095,848
  29,096,072
  29,096,250
  29,096,257
  29,096,445
  29,096,509
  29,096,645
  29,096,793
  29,096,917
  29,097,282
  29,097,362
  29,097,696
  29,097,901
  29,098,053
  29,098,246
  29,098,362
  29,098,373
  29,098,598
  29,099,529
  29,099,614
  29,100,602
  29,100,980
  29,101,586
  29,102,010
  29,104,455
  29,104,550
  29,104,622
  29,105,682
  29,105,916
  29,106,488
  29,108,728
  29,110,729
  29,111,368
  29,112,382
  29,112,444
  29,112,721
  29,113,967
  29,118,387
  29,118,699
  29,118,768
  29,119,776
  29,119,890
  29,121,775
  29,121,819
  29,122,230
  29,122,636
  29,123,831
  29,123,977
  29,124,028
  29,124,064
  29,124,473
  29,125,050
  29,125,243
  29,125,602
  29,125,606
  29,125,622
  29,125,691
  29,125,920
  29,126,165
  29,126,692
  29,126,941
  29,127,255
  29,128,245
  29,128,607
  29,129,282
  29,129,533
  29,129,754
  29,129,833
  29,129,930
  29,130,319
  29,130,562
  29,130,576
  29,131,320
  29,131,647
  29,132,055
  29,132,094
  29,133,343
  29,135,034
  29,135,947
  29,136,604
  29,136,899
  29,137,147
  29,137,420
  29,137,491
  29,137,542
  29,137,560
  29,138,114
  29,138,765
  29,139,205
  29,139,948
  29,140,200
  29,140,720
  29,141,018
  29,141,090
  29,141,476
  29,142,658
  29,143,316
  29,143,487
  29,143,685
  29,144,794
  29,145,209
  29,145,811
  29,146,408
  29,147,038
  29,148,899
  29,151,603
  29,151,788
  29,152,240
  29,152,400
  29,152,520
  29,152,638
  29,152,767
  29,152,850
  29,153,055
  29,153,207
  29,153,290
  29,153,543
  29,153,555
  29,153,672
  29,153,842
  29,154,147
  29,154,169
  29,154,171
  29,154,253
  29,154,464
  29,155,272
  29,155,274
  29,155,276
  29,155,278
  29,155,280
  29,155,282
  29,155,284
  29,155,286
  29,155,288
  29,155,290
  29,155,292
  29,155,294
  29,155,296
  29,155,298
  29,155,300
  29,155,517
  29,155,709
  29,156,305
  29,157,639
  29,157,669
  29,157,830
  29,158,335
  29,158,592
  29,159,154
  29,160,144
  29,160,318
  29,160,694
  29,160,985
  29,161,778
  29,161,830
  29,161,866
  29,163,003
  29,163,591
  29,164,121
  29,164,573
  29,164,776
  29,164,864
  29,165,529
  29,165,554
  29,165,943
  29,166,087
  29,168,224
  29,168,903
  29,172,205
  29,175,480
  29,175,746
  29,176,423
  29,177,562
  29,177,651
  29,180,160
  29,182,025
  29,182,493
  29,182,626
  29,182,720
  29,183,509
  29,183,929
  29,186,774
  29,187,078
  29,188,948
  29,190,992
  29,190,994
  29,190,996
  29,190,998
  29,191,000
  29,193,419
  29,194,939
  29,197,943
  29,206,640
  29,207,557
  29,207,656
  29,208,218
  29,210,680
  29,211,003
  29,211,731
  29,214,363
  29,214,425
  29,214,427
  29,214,429
  29,214,431
  29,214,433
  29,214,435
  29,216,139
  29,216,480
  29,216,827
  29,217,826
  29,218,230
  29,219,310
  29,219,767
  29,220,030
  29,220,147
  29,220,350
  29,220,391
  29,220,485
  29,220,565
  29,220,665
  29,220,681
  29,220,954
  29,220,978
  29,221,023
  29,221,147
  29,221,239
  29,221,247
  29,221,358
  29,221,642
  29,221,815
  29,222,052
  29,222,071
  29,222,197
  29,222,276
  29,222,471
  29,227,150
  29,227,879
  29,228,068
  29,228,220
  29,230,791
  29,233,606
  29,233,945
  29,235,631
  29,235,890
  29,236,263
  29,242,175
  29,251,094
  29,251,264
  29,252,866
  29,254,147
  29,254,337
  29,255,137
  29,256,657
  29,257,131
  29,257,155
  29,257,158
  29,257,206
  29,257,399
  29,257,401
  29,257,403
  29,257,575
  29,258,046
  29,259,173
  29,259,424
  29,259,476
  29,259,880
  29,260,068
  29,261,639
  29,261,656
  29,261,723
  29,261,897
  29,261,929
  29,262,537
  29,262,865
  29,263,038
  29,263,067
  29,263,129
  29,263,361
  29,263,576
  29,263,860
  29,264,732
  29,264,965
  29,265,018
  29,265,437
  29,265,477
  29,265,581
  29,265,902
  29,266,703
  29,266,862
  29,266,989
  29,267,174
  29,267,731
  29,267,924
  29,267,929
  29,268,038
  29,268,046
  29,268,215
  29,268,222
  29,268,828
  29,268,843
  29,268,849
  29,268,861
  29,268,884
  29,269,051
  29,269,111
  29,269,409
  29,269,434
  29,269,448
  29,269,452
  29,269,457
  29,269,569
  29,269,702
  29,269,780
  29,269,838
  29,270,113
  29,270,122
  29,270,133
  29,270,338
  29,270,362
  29,270,450
  29,270,561
  29,270,821
  29,270,943
  29,271,841
  29,271,848
  29,271,865
  29,272,387
  29,272,540
  29,272,610
  29,273,064
  29,273,288
  29,273,325
  29,273,631
  29,273,773
  29,274,033
  29,274,229
  29,274,652
  29,274,802
  29,274,951
  29,275,623
  29,276,398
  29,276,674
  29,276,818
  29,277,828
  29,278,478
  29,278,702
  29,278,704
  29,279,163
  29,279,164
  29,279,176
  29,279,283
  29,279,488
  29,279,647
  29,279,664
  29,279,684
  29,279,884
  29,280,093
  29,280,139
  29,280,272
  29,280,435
  29,280,510
  29,280,721
  29,280,777
  29,280,782
  29,281,033
  29,281,094
  29,281,449
  29,281,766
  29,282,084
  29,282,269
  29,282,466
  29,282,548
  29,282,968
  29,283,034
  29,283,048
  29,283,059
  29,283,212
  29,283,311
  29,283,454
  29,283,507
  29,283,607
  29,283,644
  29,283,763
  29,283,777
  29,283,781
  29,283,814
  29,284,003
  29,284,029
  29,284,030
  29,284,090
  29,284,280
  29,284,786
  29,285,299
  29,285,523
  29,285,548
  29,285,665
  29,286,253
  29,286,255
  29,286,450
  29,286,492
  29,286,944
  29,286,946
  29,288,427
  29,288,733
  29,289,211
  29,290,048
  29,290,655
  29,291,541
  29,292,257
  29,292,501
  29,292,669
  29,292,915
  29,292,920
  29,293,300
  29,293,717
  29,294,063
  29,294,066
  29,294,068
  29,295,289
  29,295,374
  29,295,698
  29,295,889
  29,297,015
  29,298,621
  29,298,685
  29,298,727
  29,298,760
  29,298,840
  29,300,734
  29,301,015
  29,301,436
  29,301,766
  29,302,171
  29,302,256
  29,302,419
  29,302,431
  29,302,438
  29,302,633
  29,302,675
  29,302,846
  29,303,477
  29,303,529
  29,303,978
  29,304,918
  29,305,745
  29,306,988
  29,307,231
  29,307,312
  29,307,337
  29,309,899
  29,310,993
  29,311,110
  29,311,518
  29,312,127
  29,313,381
  29,313,760
  29,314,614
  29,318,742
  29,318,841
  29,319,540
  29,319,572
  29,320,202
  29,320,217
  29,320,231
  29,320,349
  29,320,418
  29,320,667
  29,321,194
  29,321,439
  29,321,824
  29,322,362
  29,322,605
  29,322,681
  29,323,216
  29,323,298
  29,323,848
  29,323,951
  29,324,945
  29,325,859
  29,326,082
  29,326,135
  29,326,311
  29,326,365
  29,326,746
  29,326,836
  29,326,927
  29,327,153
  29,327,588
  29,327,618
  29,327,711
  29,328,141
  29,328,419
  29,328,557
  29,328,568
  29,328,842
  29,328,946
  29,329,137
  29,329,334
  29,329,665
  29,332,172
  29,332,279
  29,333,471
  29,335,311
  29,336,570
  29,336,701
  29,336,980
  29,337,500
  29,338,230
  29,338,340
  29,338,517
  29,338,735
  29,340,161
  29,342,933
  29,343,948
  29,344,356
  29,345,569
  29,347,914
  29,348,167
  29,349,515
  29,350,381
  29,350,431
  29,350,437
  29,350,444
  29,353,146
  29,353,739
  29,354,447
  29,355,449
  29,356,782
  29,358,166
  29,358,272
  29,359,691
  29,360,093
  29,360,118
  29,360,233
  29,360,251
  29,360,711
  29,360,809
  29,362,633
  29,362,783
  29,362,861
  29,365,555
  29,366,308
  29,367,375
  29,368,340
  29,370,818
  29,371,259
  29,371,698
  29,371,706
  29,372,861
  29,373,027
  29,373,059
  29,373,094
  29,374,741
  29,375,203
  29,375,292
  29,376,661
  29,377,177
  29,377,349
  29,377,611
  29,377,919
  29,379,346
  29,379,944
G
G
G
A
C
T
-
A/-
C
T
2
T
G
G
2
10
A
-/A
T
T
T
A
-/A
A/-
A
2
8
A
G
G
16
A
G
-/C
-
T
G
T
T
6
G
A
-
G
G
G
A
A
C
A/-
T
T
-
A
T
C
A
T
T
A
A
T
T
-
T
T
G
A
C
G
T
G
C
T
T
G
A
A
C
C
G
A
T
G
C
A
-
-
A
A
G
G
A
C
T
A
C
C
C
G
C
T
G
-
?
T
-
A
A
2
T
T
C
A
C
C
A
C
A
-
-
A
C
G
G
T
C
C
C
C
C
G
G
T
C
G
A
G
C
43
-
A
G
-
-
C
-/T
A
C
A
A
T
A
2
-
C
T
G
T
A
C
A
G
C
T
A
C
G
G
T
T
C
G
T
G
T
T
T
C
T
G
T
T
C
G
C
T
G
C
-
-
A
-
A
C
G
C
-/T
C
C
A
T
C
T
G
C
A
C
C
G
G
C
A
T
T
T
-
G
A
T
-
4
T
A
G
G
C
T
C
C
T
G
T
C
A
-/C
C/-
C/-
-/C
-/C
C/-
C/-
C
C
C
C
C
C
C
C
-
T
G
G
A
C
C
G
G/A
T
T
C
T
-
A
T
G
A
C
18
G
G
C
T
T
T
A
-
C
A
T
G
T
C
T
T
G
A
A
G
G
C
G
T
C/-
-/C
-/C
C/-
C/-
-/T
T
T
C
G
A
A/-
-/A
A
G
C
-/C
?
?
-/C
-/C
-/C
-
-
T
A
-/C
-
C
G
T
-
T
-
A
-
G
C
T
T
G/-
-/A
-/A
G
G
A
T
C
A
G
G
T
G
C
T
-/G
G
G
A
T
G/-
A
T
C
G
T
A
2
-
T
C
T
A
T/AC
T
-
-/A
A
-
G
-
T
-
A
A
-
C
A
A
A
T
C
C
2
C
G
A
C
C
A
T
T
T
3
A/-
-
G
T
-
-/C
T/-
-/T
-
G
-/T
C
T
C
C
G
T
T
C
A
-
-
G
G
A
A
T
T
-
A
T
C
G
A
G
C
-
G
A
G
T
G
C
A
-/G
T
G
C
A
T
C
G
-
C
C
T
G
A
G
-
G
-/G
C
C
A
T
A
G
G/-
T
G
C
G
A
G
-
T
G
14
G
C
G
C
C
T
-/G
G
A
-
A
C
G
G
-
-
A
G
A
A
G
G
A
A
C
11
A
C
G
-
C
C
C
-
-/G
T
-
T
A
T
G
C
G
-
G
A
G
T
G
-
A
-
A
-
C
G
C
G
G
G
A
T
G
6
T
T
A
C
T
T
G
G
T
A
G
A
A
A
A
-
G
C
G
A
T
G
G
C
C
A
G
C
C
C
A
T
T
T
G
T
A
4
A
G
G
A
4
C/G
T
G
C
-
A
C
C
4
4
A
A
G
T
G
G
G
T
C
T
A
T
A
A
G
G
-
A
G
58
-
-
A
C
T
A
T
G
A
G
A
A
C
T
C
-
4
-
C
G
-/C
C
T
G
A/G
A
G
G
-
G
-
T
G
C
-
G
G
T
T
-/G
3
A
C
T
G
A
T
C
G/-
G
4
A
A
G
A
G
T
T