Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 348,807 (bp)   Positions: 601
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102552925
LOC102552925
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
Tiam1
A
C
A
A
A
C
A
A
T
A
G
G
T
C
C
T
C
T
G
-
C
2
2
13
T
A
A
T
C
C
A
T
G
-
C
C
2
T
-
G
24
A
T
A
G
A
-
T
C
G
G
C
T
-
G
C
C
G
-
G
-
G
A
C
6
C
C
C
C
-
C
A
A
A
T
C
C
C
C
A
A
T
C
G
G
A
A
A
-
-
-
T
C
T
A
A
C
G
C
T
T
A
C
A
A
G
A
G
G
A
G
G
C
C
G
C
G
A
A
G
T
T
-
2
A
G
A
G
3
T
C
C
A
T
T
T
C
T
G
T
A
T
C
-
C
2
G
-
-
C
C
T
G
T
T
C
T
G
7
G
G
T
A
T
C
T
A
A
G
T
T
T
T
A
A
C
A
G
A
T
-
G
3
G
A
14
2
G
G
G
G
C
T
G
G
T
-
-
A
A
G
A
T
A
A
-
A
A
A
C
A
C
G
T
C
T
T
A
C
A
C
A
9
A
A
C
4
C
G
A
A
G
T
C
17
C
T
T
T
T
A
T
C
A
C
A
G
A
T
C
G
T
A
-
G
C
A
2
A
C
T
G
-
A
T
T
G
C
-
G
A
A
A
G
T
C
G
T
A
C
A
T
10
T
G
C
A
C
A
A
A
A
T
T
A
G
A
C
A
13
T
A
G
G
A
T
G
G
-
T
T
G
A
T
G
A
-
G
T
C
2
C
-
C
T
12
A
T
2
A
T
A
T
C
C
A
C
G
T
G
A
G
C
C
G
G
C
T
G
G
G
-
-
T
8
C
A
C
C
C
G
A
A
G
C
C
T
G
A
C
C
A
T
T
A
T
A
A
A
A
A
G
G
C
G
15
T
C
T
T
C
G
T
G
A
A
C
-
-
-
6
12
G
C
C
C
T
-
G
-
A
G
T
C
T
G
G
C
A
-
C
C
G
-
G
C
A
G
A
C
A
-
G
A
C
A
G
2
T
T
2
3
A
G
3
C
A
A
A
G
C
C
G
A
A
T
-
G
G
T
T
2
C
G
C
A
C
A
C
T
C
C
C
A
T
C
G
-
C
A
C
G
G
G
-
G
G
5
A
G
-
A
G
C
T
T
5
-
G
A
A
A
G
A
C
A
T
T
2
C
G
2
G
6
C
C
T
C
G
A
A
T
A
G
T
A
T
3
G
C
G
C
G
A
A
C
A
C
T
G
T
T
A
A
C
-
-
2
G
A
C
G
A
T
G
A
A
2
C
4
-
2
T
G
T
G
-
C
T
C
4
-
C
A
-
G
A
G
C
C
G
A
G
C
C
-
G
A
T
C
T
T
A
A
G
G
A
-
G
A
G
  29,031,799
  29,034,281
  29,034,285
  29,034,458
  29,034,605
  29,034,714
  29,034,768
  29,035,034
  29,035,041
  29,035,171
  29,036,697
  29,036,887
  29,036,942
  29,037,039
  29,037,085
  29,038,369
  29,039,406
  29,039,761
  29,041,436
  29,041,475
  29,041,973
  29,042,088
  29,042,500
  29,042,503
  29,044,575
  29,045,574
  29,046,414
  29,047,066
  29,047,581
  29,047,710
  29,048,531
  29,048,861
  29,048,944
  29,050,555
  29,051,624
  29,052,549
  29,053,424
  29,054,594
  29,054,669
  29,054,692
  29,058,565
  29,059,151
  29,059,852
  29,060,303
  29,060,504
  29,060,907
  29,061,512
  29,062,193
  29,062,317
  29,062,438
  29,062,470
  29,062,565
  29,062,576
  29,062,613
  29,062,687
  29,062,706
  29,062,743
  29,062,751
  29,062,891
  29,063,076
  29,063,760
  29,063,967
  29,064,220
  29,064,221
  29,064,596
  29,065,825
  29,068,804
  29,069,924
  29,070,583
  29,070,755
  29,072,410
  29,074,088
  29,075,191
  29,075,258
  29,075,968
  29,077,101
  29,077,125
  29,077,401
  29,077,522
  29,077,542
  29,077,653
  29,077,744
  29,077,790
  29,077,864
  29,078,586
  29,078,728
  29,078,822
  29,079,746
  29,079,923
  29,080,016
  29,080,158
  29,080,219
  29,080,368
  29,080,373
  29,080,381
  29,080,454
  29,080,754
  29,081,062
  29,081,269
  29,081,354
  29,081,661
  29,081,930
  29,082,395
  29,082,407
  29,082,415
  29,082,691
  29,083,045
  29,083,081
  29,083,107
  29,083,350
  29,083,585
  29,083,711
  29,084,214
  29,084,259
  29,084,713
  29,084,916
  29,085,034
  29,086,116
  29,086,855
  29,086,943
  29,087,159
  29,087,169
  29,087,177
  29,087,183
  29,087,585
  29,087,588
  29,087,601
  29,087,631
  29,087,690
  29,087,737
  29,087,746
  29,087,887
  29,091,025
  29,091,648
  29,091,713
  29,091,943
  29,092,573
  29,093,920
  29,093,962
  29,093,971
  29,094,080
  29,094,221
  29,094,311
  29,094,378
  29,095,121
  29,095,243
  29,095,249
  29,095,487
  29,095,530
  29,095,848
  29,096,072
  29,096,250
  29,096,257
  29,096,445
  29,096,509
  29,096,645
  29,096,793
  29,096,917
  29,097,282
  29,097,362
  29,097,696
  29,097,901
  29,098,053
  29,098,246
  29,098,362
  29,098,373
  29,098,598
  29,098,781
  29,098,852
  29,099,529
  29,099,552
  29,099,614
  29,100,602
  29,100,980
  29,101,586
  29,102,010
  29,104,550
  29,104,622
  29,105,682
  29,105,916
  29,106,488
  29,106,560
  29,108,728
  29,110,729
  29,111,368
  29,112,382
  29,112,444
  29,112,918
  29,115,287
  29,116,530
  29,117,459
  29,118,387
  29,118,699
  29,118,768
  29,119,776
  29,119,901
  29,120,104
  29,121,775
  29,121,861
  29,122,230
  29,124,782
  29,125,243
  29,125,602
  29,125,606
  29,125,920
  29,126,014
  29,126,165
  29,126,941
  29,127,255
  29,127,664
  29,128,245
  29,129,533
  29,130,056
  29,130,562
  29,131,320
  29,131,461
  29,132,094
  29,133,343
  29,133,505
  29,135,034
  29,135,284
  29,135,947
  29,136,604
  29,136,674
  29,136,899
  29,136,997
  29,137,155
  29,137,420
  29,137,491
  29,137,542
  29,137,560
  29,137,622
  29,138,114
  29,138,430
  29,138,758
  29,139,025
  29,139,205
  29,141,018
  29,141,124
  29,141,476
  29,142,440
  29,142,658
  29,143,316
  29,143,487
  29,143,754
  29,144,794
  29,145,074
  29,145,209
  29,145,811
  29,146,120
  29,146,465
  29,147,885
  29,148,013
  29,148,817
  29,148,894
  29,149,863
  29,150,351
  29,151,249
  29,152,240
  29,152,340
  29,152,400
  29,152,722
  29,152,767
  29,152,936
  29,153,207
  29,153,214
  29,153,522
  29,153,555
  29,153,558
  29,153,842
  29,154,211
  29,155,748
  29,156,305
  29,156,371
  29,156,953
  29,157,639
  29,157,669
  29,157,830
  29,158,592
  29,160,985
  29,161,866
  29,162,873
  29,163,050
  29,164,121
  29,164,274
  29,166,574
  29,168,394
  29,168,851
  29,170,743
  29,172,205
  29,176,423
  29,176,567
  29,177,651
  29,178,018
  29,182,493
  29,182,720
  29,183,509
  29,183,893
  29,183,929
  29,186,021
  29,186,774
  29,187,078
  29,187,316
  29,189,949
  29,192,360
  29,193,412
  29,193,419
  29,194,939
  29,199,933
  29,206,640
  29,207,000
  29,207,220
  29,207,557
  29,207,810
  29,209,217
  29,209,561
  29,213,092
  29,214,077
  29,214,363
  29,216,740
  29,216,749
  29,216,827
  29,217,826
  29,217,854
  29,218,751
  29,219,310
  29,219,767
  29,220,030
  29,220,350
  29,220,485
  29,220,665
  29,220,681
  29,220,954
  29,220,978
  29,221,023
  29,221,358
  29,221,642
  29,221,815
  29,222,071
  29,222,197
  29,222,471
  29,223,076
  29,223,673
  29,223,678
  29,224,092
  29,224,392
  29,224,417
  29,224,452
  29,224,954
  29,224,961
  29,224,962
  29,225,371
  29,225,376
  29,225,377
  29,225,876
  29,226,521
  29,226,553
  29,226,654
  29,227,240
  29,227,289
  29,227,472
  29,227,804
  29,227,879
  29,227,905
  29,228,062
  29,228,082
  29,228,084
  29,228,917
  29,229,260
  29,229,744
  29,230,510
  29,231,072
  29,231,620
  29,232,274
  29,232,561
  29,233,204
  29,233,248
  29,233,264
  29,233,606
  29,233,809
  29,233,945
  29,234,104
  29,234,224
  29,234,325
  29,234,781
  29,234,879
  29,235,702
  29,235,890
  29,235,951
  29,236,216
  29,237,041
  29,238,623
  29,238,775
  29,239,032
  29,240,132
  29,240,147
  29,240,334
  29,240,523
  29,240,543
  29,240,576
  29,240,641
  29,240,674
  29,240,761
  29,240,783
  29,240,839
  29,241,024
  29,241,582
  29,241,739
  29,242,782
  29,242,805
  29,242,901
  29,244,242
  29,244,589
  29,245,249
  29,245,252
  29,245,372
  29,245,731
  29,246,009
  29,247,101
  29,247,255
  29,247,567
  29,248,897
  29,249,227
  29,249,372
  29,252,269
  29,252,288
  29,252,866
  29,252,891
  29,253,750
  29,254,824
  29,254,983
  29,255,137
  29,258,863
  29,259,424
  29,260,952
  29,261,289
  29,261,656
  29,261,723
  29,263,576
  29,265,018
  29,268,005
  29,268,826
  29,270,627
  29,272,187
  29,272,362
  29,274,119
  29,275,623
  29,278,154
  29,278,478
  29,279,173
  29,282,632
  29,282,731
  29,283,454
  29,283,507
  29,284,918
  29,285,069
  29,285,299
  29,285,523
  29,285,548
  29,291,541
  29,294,063
  29,294,066
  29,294,068
  29,296,183
  29,304,983
  29,307,312
  29,310,993
  29,311,518
  29,312,127
  29,313,760
  29,315,019
  29,315,453
  29,316,087
  29,318,742
  29,319,393
  29,319,473
  29,319,572
  29,320,185
  29,320,349
  29,320,418
  29,320,667
  29,320,750
  29,321,162
  29,321,397
  29,321,439
  29,321,631
  29,322,101
  29,322,241
  29,322,362
  29,322,681
  29,322,840
  29,323,951
  29,324,655
  29,325,671
  29,326,135
  29,326,311
  29,326,691
  29,326,746
  29,326,836
  29,327,020
  29,327,153
  29,327,618
  29,327,673
  29,327,711
  29,327,949
  29,328,141
  29,329,137
  29,329,665
  29,332,279
  29,332,324
  29,333,471
  29,334,534
  29,336,206
  29,336,980
  29,337,500
  29,338,487
  29,339,280
  29,339,556
  29,339,671
  29,339,907
  29,339,972
  29,340,023
  29,340,161
  29,340,490
  29,340,493
  29,340,565
  29,341,408
  29,341,638
  29,341,706
  29,341,806
  29,342,114
  29,342,117
  29,342,933
  29,343,381
  29,343,543
  29,343,747
  29,344,261
  29,344,537
  29,344,842
  29,344,973
  29,345,677
  29,345,725
  29,345,854
  29,346,426
  29,346,563
  29,346,890
  29,347,061
  29,347,063
  29,347,883
  29,347,914
  29,348,167
  29,348,673
  29,349,426
  29,349,515
  29,349,679
  29,349,848
  29,349,901
  29,350,311
  29,350,316
  29,350,319
  29,350,431
  29,350,437
  29,350,444
  29,351,754
  29,351,818
  29,352,221
  29,353,146
  29,353,266
  29,354,447
  29,355,449
  29,355,536
  29,356,782
  29,358,033
  29,359,691
  29,359,733
  29,360,118
  29,360,233
  29,360,401
  29,360,809
  29,362,861
  29,364,453
  29,365,555
  29,366,043
  29,366,308
  29,366,831
  29,367,635
  29,370,820
  29,370,832
  29,371,259
  29,371,572
  29,371,698
  29,372,861
  29,373,059
  29,373,094
  29,373,590
  29,374,453
  29,375,203
  29,375,292
  29,377,177
  29,379,346
  29,379,944
G
T
G
G
G
T
G
G
C
T
A
T
C
T
T
C
T
G
A
4
T
-
-
-
C
C
G
C
T
T
G
G
A
2
A
T
-
A
20
T
-
G
G
G
A
-
A
C
T
A
A
A
G
C
A
G
T
A
16
A
-/G
A
G
A
-
T
G
T
T
6
T
G
G
G
C
T
A
T
T
G
G
C
T
A
C
G
-
G
2
2
20
C
A
C
C
G
A
T
G
C
C
C
T
G
C
A
G
A
A
C
A
-
T
A
T
T
-
-
G
A
G
C
G
-
C
A
T
-
-
G
T
T
G
G
A
C
T
C
C
C
G
C
T
G
T
-
A
A
2
T
T
C
A
C
C
A
C
A
-
-
A
C
G
G
T
C
C
T
A
C
G
C
C
G
G
T
G
A
G
C
43
A
-
A
G
-
-
A
A
A
C
A
C
A
A
G
10
A
C
-
-
G
C
T
G
C
G
T
C
T
G
T
C
G
T
G
C
T
A
G
T
C
-
T
-
A
-
-
A
C
G
A
C
T
-
T
C
C
A
G
C
C
A
C
A
G
A
G
C
T
A
A
G
2
T
T
G
-
G
T
A
A
4
G
G
C
A
T
A
C
G
G
G
A
C
G
A
C
G
T
T
C
-
C
A
T
G
G
G
C
G
C
C
-
G
A
G
T
G
-
C
G
T
A
-
G
-
T
6
C
C
C
G
A
C
C
A
A
C
-
2/-
T
A
T
C
-
C
G
-
-
-
G
C
T
T
G
G
A
C
A
G
A
T
T
C
A
T
C
T
T
C
56
A
A
-
T
G
A
-
T
C
T
G
A
T
T
A
A
C
T
T
G
C
C
G
C
G
G
G
G
G
A
A
G
A
-
C
T
C
C
T
A
C
A
G
G
T
10
2
2
-
-
A
T
A
T
-
G
A
10
C
A
C
-
A
A
A
G
G
2
T
T
A
26
A
T
G
C
G
T
G
2
A
G
A
G
A
-
C
C
-
3/-
T
A
-
T
G
G
G
A
T
T
C
G
-
-
11
A
C
G
G
-
A
A
T
G
A
G
G
C
A
A
T
G
G
-
C
A
T
G
T
A
A
A
4
A
C
-
G
A
2
G
G/C
T
C
C
-
4
A
G
G
G
A
G
T
G
A
G
-
T
A
-
A
-
A
T
A
T
A
G
G
C
G
A
C
G
C
-
A
G
C
T
A
G
G
T
C
G
C
A
G
C
G
T
T
9
2
-
A
C
T
A
G
C
A
G
G
-
T
-
4
-
C
A
-
A
G
T
C
T
-
G
T
G
T
-
G
A
G
G
A
G
C
T
T
3
A
G
A
T
C
G
T
C
A
A
G
4
A
T
T