Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 89,079 (bp)   Positions: 391
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
GK/FarMcwi (2019) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
Tgfbr2
G
C
C
-
A
4
G
C
-
G
T
T
C
A
A
2
4
C
G
A
G
T
2
C
-
C
2
-
-
G
A
G
12
18
G
T
A
T
G
C
A
T
G
G
-
C
C
T
C
T
A
A
C
A
A
T
G
-
T
C
T
A
-
C
C
C
A
G
C
G
C
A
G
19
G
C
T
T
G
-
T
C
G
T
T
A
T
G
A
A
T
C
G
-
G
A
T
G
T
-
T
-
T
C
T
A
G
G
2
T
C
4
2
A
4
T
-
3
G
G
G
T
C
T
8
T
A
G
C
G
T
C
T
G
C
A
A
T
C
A
G
G
G
C
T
-
T
A
G
T
A
C
A
C
C
A
T
G
G
11
-
A
A
T
A
C
G
C
A
C
C
T
T
G
-
G
-
G
A
A
A
A
7
2
G
A
C
G
T
C
C
G
G
G
T
-
2
A
G
A
T
A
A
T
A
-
A
G
11
A
-
C
C
C
C
-
G
C
A
A
-
4
T
C
T
A
G
C
-
T
G
T
-
C
-
10
G
G
T
T
T
A
A
C
G
C
C
G
C
C
C
C
C
G
T
G
C
G
G
T
G
A
A
A
T
C
-
G
G
G
A
G
T
C
C
C
G
A
C
-
A
G
A
G
G
T
A
C
G
T
G
G
T
52
A
A
A
A
T
G
G
-
C
G
G
G
G
A
T
T
T
T
C
C
-
T
A
G
G
-
A
G
-
2
-
-
G
C
G
5
A
G
C
C
G
C
C
T
G
G
G
A
G
C
G
C
T
C
G
G
T
G
A
A
17
C
-
A
A
A
T
G
2
15
C
C
G
T
G
A
G
C
T
G
A
T
C
T
A
C
T
T
G
-
-
G
G
G
A
A
C
  115,795,184
  115,795,190
  115,795,900
  115,795,912
  115,796,041
  115,796,447
  115,797,896
  115,799,618
  115,799,683
  115,799,701
  115,799,814
  115,800,458
  115,800,772
  115,801,141
  115,801,143
  115,801,171
  115,801,177
  115,802,546
  115,802,747
  115,804,310
  115,805,316
  115,805,608
  115,805,950
  115,807,333
  115,807,370
  115,807,418
  115,807,529
  115,807,572
  115,807,605
  115,807,631
  115,807,992
  115,808,407
  115,808,798
  115,809,180
  115,809,415
  115,809,660
  115,809,668
  115,809,745
  115,809,910
  115,811,041
  115,811,097
  115,811,226
  115,811,720
  115,811,721
  115,812,774
  115,813,049
  115,813,468
  115,813,657
  115,814,150
  115,814,414
  115,815,377
  115,815,385
  115,815,395
  115,815,414
  115,815,442
  115,815,466
  115,815,467
  115,815,470
  115,815,592
  115,815,599
  115,815,742
  115,815,771
  115,815,806
  115,815,811
  115,815,815
  115,815,819
  115,816,463
  115,817,060
  115,817,676
  115,818,053
  115,818,250
  115,818,320
  115,818,433
  115,818,449
  115,818,969
  115,819,355
  115,819,375
  115,819,594
  115,819,693
  115,819,763
  115,819,898
  115,820,279
  115,820,281
  115,820,696
  115,820,842
  115,821,466
  115,821,740
  115,821,943
  115,822,000
  115,822,296
  115,823,194
  115,823,298
  115,823,314
  115,823,321
  115,823,409
  115,823,523
  115,823,597
  115,824,699
  115,824,711
  115,825,321
  115,825,408
  115,825,501
  115,825,733
  115,825,863
  115,826,180
  115,826,354
  115,826,382
  115,826,563
  115,826,570
  115,826,586
  115,826,631
  115,826,696
  115,826,709
  115,826,770
  115,826,815
  115,827,127
  115,827,167
  115,827,169
  115,827,276
  115,827,383
  115,827,736
  115,827,842
  115,827,897
  115,828,156
  115,828,318
  115,828,614
  115,828,666
  115,828,881
  115,829,022
  115,829,291
  115,829,327
  115,829,616
  115,829,750
  115,829,797
  115,829,811
  115,829,852
  115,830,725
  115,830,753
  115,832,151
  115,832,201
  115,832,329
  115,832,331
  115,832,484
  115,832,575
  115,832,690
  115,832,748
  115,832,944
  115,833,118
  115,833,246
  115,833,431
  115,833,663
  115,833,678
  115,833,682
  115,833,713
  115,833,817
  115,834,271
  115,834,830
  115,834,840
  115,834,914
  115,834,946
  115,836,500
  115,836,680
  115,837,260
  115,837,571
  115,837,873
  115,838,851
  115,839,107
  115,839,195
  115,839,232
  115,839,233
  115,839,280
  115,839,391
  115,839,755
  115,839,768
  115,839,920
  115,840,941
  115,840,955
  115,840,969
  115,841,476
  115,841,547
  115,841,581
  115,841,841
  115,841,845
  115,841,858
  115,841,864
  115,841,879
  115,841,898
  115,842,028
  115,842,096
  115,842,097
  115,842,143
  115,842,233
  115,842,534
  115,842,632
  115,842,676
  115,842,843
  115,843,202
  115,843,507
  115,843,813
  115,843,892
  115,844,052
  115,844,777
  115,845,307
  115,845,327
  115,845,336
  115,845,519
  115,845,723
  115,845,750
  115,845,938
  115,845,973
  115,846,171
  115,846,178
  115,846,190
  115,846,256
  115,846,387
  115,846,727
  115,846,744
  115,846,813
  115,847,061
  115,847,121
  115,847,218
  115,847,415
  115,847,439
  115,847,466
  115,847,506
  115,847,564
  115,847,773
  115,847,832
  115,847,902
  115,847,912
  115,847,944
  115,847,951
  115,848,006
  115,848,179
  115,848,352
  115,848,458
  115,848,623
  115,848,625
  115,848,646
  115,848,649
  115,848,663
  115,848,757
  115,848,832
  115,849,050
  115,849,056
  115,849,086
  115,849,088
  115,849,125
  115,849,298
  115,849,395
  115,849,428
  115,849,430
  115,849,432
  115,849,554
  115,849,632
  115,849,664
  115,849,680
  115,849,732
  115,849,811
  115,849,920
  115,850,061
  115,850,221
  115,850,332
  115,850,670
  115,850,691
  115,850,700
  115,850,932
  115,851,066
  115,851,243
  115,851,298
  115,851,302
  115,851,306
  115,851,317
  115,851,434
  115,851,524
  115,851,663
  115,851,730
  115,851,777
  115,851,851
  115,852,008
  115,852,013
  115,852,014
  115,852,018
  115,852,021
  115,852,023
  115,852,134
  115,852,149
  115,852,446
  115,852,554
  115,852,682
  115,852,701
  115,852,823
  115,852,828
  115,854,344
  115,854,515
  115,854,521
  115,854,527
  115,854,738
  115,855,521
  115,856,109
  115,856,718
  115,856,844
  115,857,150
  115,857,434
  115,857,436
  115,857,438
  115,857,440
  115,857,701
  115,858,023
  115,858,401
  115,858,402
  115,858,426
  115,858,496
  115,858,830
  115,858,906
  115,858,964
  115,859,011
  115,859,693
  115,860,565
  115,860,593
  115,860,791
  115,860,799
  115,860,802
  115,860,806
  115,860,817
  115,860,821
  115,861,194
  115,861,692
  115,862,019
  115,862,868
  115,862,935
  115,862,941
  115,863,083
  115,863,198
  115,863,433
  115,863,437
  115,863,982
  115,864,144
  115,864,315
  115,864,317
  115,864,405
  115,864,584
  115,864,707
  115,864,709
  115,864,887
  115,865,265
  115,865,549
  115,865,646
  115,865,671
  115,865,672
  115,865,700
  115,866,065
  115,866,228
  115,866,418
  115,866,540
  115,866,545
  115,866,616
  115,866,663
  115,866,739
  115,866,758
  115,867,075
  115,868,162
  115,868,170
  115,868,176
  115,868,246
  115,868,276
  115,868,351
  115,868,762
  115,869,686
  115,869,968
  115,869,975
  115,870,103
  115,870,902
  115,871,529
  115,871,638
  115,872,113
  115,872,750
  115,873,429
  115,873,746
  115,875,250
  115,875,284
  115,875,652
  115,875,721
  115,875,953
  115,875,954
  115,876,632
  115,877,731
  115,877,752
  115,879,317
  115,880,309
  115,881,949
T
A
T
2
C
-
T
A
12
A
C
A
T
T
T
-
-
T
A
T
C
C
-
T
G
A
-
2
2
A
C
A
-
-
A
C
G
C
T
T
G
G
-
C/-
C
T
T
C
T
C
C
G
T
T
G
-/C
C
T
C
T
C
C
2
G
G
G
G
C
A
A
G
G
C
-
C
G
G
C
A
2
C
T
A
C
A
G
A
A
C
G
G
T
A
10
A
G
C
A
C
A
C
G
C
T
C
G
C
-
-
A
T
-
-
G
-
C
10
-
A
C
A
C
T
T/G
-
C
G
A
T/G
A
C
G
C
A
A
G
G
C
T
T
C/-
-/C
A
T
G
2
C
G/-
A
C
G
G
G
T
T
G
C
A
C
-
4
-
G
C
G
T
-
A
G
T
G
A
C
C
34
C
5
A
-
T
G
-
-
2/-
T
T
A
A
C
A
T
C
A
A
C
5
-
G
A
G
C
G
T
G
C
G
-
A/-
-
G
2
T/-
T/-
T
T
4
A
T
G
T
2
-
C
A
C
C
A
G/-
7
A
A
C
6
A
10
-
T
C
G
C
A
G
G
T
A
T
T
C
T
T
-/T
T/-
T/-
A
C
A
T
A
A
C
T
G
G
G
C
T
G
A
A
A
G
A
C
T
T
T
A
G
A
G
G
A
G
A
A
C
G
T
C
C
A
A
C
-
-/G
G
G
C
C
A
A
12
T
-/A
A/-
A
A
T
-
-
G
G
T
T
14
C
G
A
A
T
T
A
2
-
2
2
A
T
A
-
G
A
G
T
C
T
G
A
A
A
A
T
A
T
A
-/A
-
T
C
A
C
C
G
G
-
T/-
11
G
C
G
A
A
-
-
G
T
A
G/C
A
G
A
T
C
A
G
C
T
-
G
T
C
C
A
5
G
A
A/-
G/-
G
G
T