Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 140,106 (bp)   Positions: 251
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
BUF/N (2020) 
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
Tbl1xr1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
G
T
A
C
T
T
2
A
A
G
T
A
C
-
G
A
C
C
C
G
A
G
2
G
C
-
-
-
T
T
G
C
C
C
A
C
C
-
C
C
-
A
2
A
C
G
C
T
A
A
G
-
C
G
C
A
C
C
A
-
T
C
G
A
-
T
C
T
T
A
T
T
A
T
C
T
T
T
G
C
G
T
T
T
6
-
T
C
G
-
C
C
A
A
C
C
C
C
6
G
C
-
A
G
2
T
C
T
T
C
A
C
A
C
G
C
A
T
C
G
A
A
A
A
A
A
A
A
A
A
A
T
-
-
C
C
G
G
A
A
A
C
G
C
C
A
T
C
C
T
C
A
G
T
G
C
A
T
G
C
C
G
G
G
T
T
G
G
A
T
A
T
C
G
T
G
C
T
C
C
G
G
A
A
C
T
G
G
G
T
G
C
G
T
T
C
A
C
T
G
C
A
C
C
T
C
C
T
A
T
C
C
2
3
T
C
C
-
T
T
A
C
G
C
T
C
G
T
T
G
T
A
-
C
A
T
G
A
-
-
A
T
-
C
T
-
C
-
-
-
  104,793,328
  104,793,349
  104,793,458
  104,793,963
  104,794,100
  104,794,136
  104,795,063
  104,795,824
  104,796,530
  104,796,886
  104,797,586
  104,797,777
  104,798,794
  104,799,522
  104,799,744
  104,799,752
  104,799,879
  104,799,947
  104,800,508
  104,800,575
  104,801,260
  104,801,533
  104,801,726
  104,802,371
  104,803,143
  104,803,186
  104,803,969
  104,804,424
  104,804,690
  104,805,870
  104,807,334
  104,807,546
  104,808,059
  104,808,085
  104,808,163
  104,808,231
  104,809,768
  104,809,823
  104,810,371
  104,811,399
  104,811,560
  104,811,803
  104,812,013
  104,812,926
  104,813,231
  104,813,342
  104,813,379
  104,814,114
  104,814,155
  104,814,576
  104,815,188
  104,816,422
  104,817,229
  104,817,326
  104,817,477
  104,817,485
  104,817,507
  104,818,548
  104,820,845
  104,821,179
  104,821,214
  104,821,596
  104,821,715
  104,821,912
  104,822,028
  104,822,439
  104,823,441
  104,823,841
  104,824,312
  104,824,600
  104,825,108
  104,825,431
  104,825,741
  104,825,920
  104,825,933
  104,825,942
  104,826,389
  104,826,771
  104,827,848
  104,827,855
  104,828,374
  104,828,643
  104,829,355
  104,829,808
  104,830,111
  104,830,191
  104,831,392
  104,831,512
  104,831,973
  104,832,220
  104,832,346
  104,832,402
  104,833,052
  104,833,196
  104,833,420
  104,833,449
  104,834,030
  104,834,664
  104,835,346
  104,835,545
  104,835,654
  104,835,672
  104,835,971
  104,836,792
  104,837,354
  104,837,631
  104,837,636
  104,837,666
  104,837,722
  104,838,780
  104,839,923
  104,840,444
  104,840,937
  104,841,316
  104,842,045
  104,842,160
  104,843,390
  104,843,756
  104,844,418
  104,844,475
  104,844,598
  104,844,906
  104,844,911
  104,844,916
  104,844,921
  104,844,926
  104,844,931
  104,844,936
  104,844,941
  104,844,946
  104,844,951
  104,844,956
  104,845,158
  104,845,410
  104,845,500
  104,845,797
  104,846,447
  104,846,656
  104,846,934
  104,848,329
  104,849,881
  104,850,219
  104,850,588
  104,851,784
  104,852,479
  104,852,576
  104,852,645
  104,854,034
  104,854,092
  104,854,487
  104,854,912
  104,854,953
  104,855,674
  104,855,868
  104,856,003
  104,856,072
  104,856,142
  104,856,436
  104,856,546
  104,857,558
  104,858,453
  104,858,466
  104,859,721
  104,859,939
  104,860,115
  104,861,892
  104,862,243
  104,862,400
  104,863,401
  104,863,915
  104,864,333
  104,865,257
  104,865,523
  104,865,729
  104,866,646
  104,866,924
  104,867,114
  104,869,486
  104,869,897
  104,870,983
  104,871,444
  104,872,721
  104,875,478
  104,875,924
  104,877,379
  104,877,586
  104,878,182
  104,878,849
  104,879,012
  104,879,533
  104,879,746
  104,880,897
  104,882,084
  104,882,662
  104,882,845
  104,883,064
  104,883,198
  104,883,608
  104,885,954
  104,888,040
  104,888,258
  104,888,595
  104,888,678
  104,889,185
  104,889,472
  104,889,815
  104,890,298
  104,890,574
  104,890,845
  104,890,892
  104,891,103
  104,892,994
  104,893,002
  104,893,758
  104,894,552
  104,894,556
  104,894,913
  104,894,970
  104,898,195
  104,899,295
  104,899,459
  104,901,184
  104,901,190
  104,903,187
  104,903,419
  104,903,443
  104,903,713
  104,905,122
  104,905,167
  104,906,838
  104,907,266
  104,907,420
  104,907,678
  104,907,859
  104,907,888
  104,908,076
  104,909,702
  104,910,116
  104,912,720
  104,913,320
  104,914,481
  104,916,475
  104,916,855
  104,917,472
  104,920,892
  104,921,184
  104,921,925
  104,921,927
  104,922,286
  104,923,593
  104,924,010
G
A
C
G
T
A
C
-
G
C
A
C
T
T
6
C
G
T/-
A
T
A
T
A
-
A
T
G
3
10
G
-
C
T
A
T
G
G
T
4
A
T
3
G
-
C
G
T
T
C
G
G
A
3
-
A
G
G
T
T
C
2
-
T
A
G
T
T/G
A
C
T/-
G
C
C
-
-
T
C
G
C
A
T
A
C
A
C
-
A
G
T
A
C
T
-
T
-
G
G
A
T
-
A
T
T
G
A
-
A/-
T
C
G
T
G
T
G
T
-
T
C
C
T
C
-/G
-/G
G
G
G
G
G
G
G
A/G
A/G
A
A
4
T
-/G
C
A
G
G
T
G
C
A
A
T
-
T
T
C
T
G
C
C
A
T
G
C
C
T
T
A
A
C
A
-
A
A
C
C
-
C
T
T
C
A
G
C
T
T
C
A
G
T
T
-
A
A
A
C
T
T
A
C
A
G
G
-/T
A
A
T
T
T
G
A
T
G
C
-
G
-
T
-
-
A
G/-
T
34
C
A/-
C
T
A
G
C
T
A
C
C
C
A
G
A
T
T
-
A
T
A
C
G
A
2
T
C
T
A
G
T
A