Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 156,787 (bp)   Positions: 275
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
SHRSP/A3NCrl (2019) 
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
Tbcd
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Znf750
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
B3gntl1
T
C
G
T
T
-
T
-
T
T
119
T
C
-
T
C
C
C
A
-
A
A
T
22
A
C
C
A
A
C
G
A
A
A
C
A
T
A
C
C
G
T
A
C
C
C
C
C
C
C
C
A
A
C
C
G
A
A
-
A
C
C
A
T
T
-
C
G
4
A
G
A
T
C
2
A
2
-
A
A
A
A
7
-
C
2
T
G
T
A
G
T
A
G
G
-
T
4
2
A
G
T
T
C
C
C
T
T
G
T
T
G
C
-
G
T
C
T
A
A
A
G
G
T
G
-
A
T
C
C
A
C
G
T
G
T
A
C
G
T
C
C
A
T
-
-
-
5
G
T
-
-
-
T
-
A
T
-
T
A
C
4
G
T
G
-
A
G
C
8
-
G
-
A
T
A
-
-
C
T
A
T
C
A
A
C
C
A
A
G
A
C
G
G
T
G
C
A
A
A
-
-
G
T
A
T
T
-
G
G
C
C
G
-
T
-
G
G
G
-
C
A
C
T
-
-
C
A
A
G
-
G
6
-
T
T
G
G
A
C
A
C
T
C
C
T
56
G
A
2
-
T
C
A
C
A
T
G
-
G
G
4
C
G
-
A
T
C
C
C
T
C
G
-
A
  106,717,912
  106,718,737
  106,719,900
  106,720,509
  106,721,624
  106,722,207
  106,722,558
  106,722,560
  106,722,566
  106,722,574
  106,723,057
  106,724,060
  106,724,556
  106,725,165
  106,725,177
  106,726,262
  106,726,883
  106,726,937
  106,727,912
  106,728,007
  106,728,200
  106,728,466
  106,728,690
  106,729,137
  106,729,579
  106,729,801
  106,730,860
  106,731,115
  106,731,302
  106,732,152
  106,732,616
  106,732,631
  106,732,783
  106,733,902
  106,735,226
  106,735,355
  106,735,976
  106,736,476
  106,736,722
  106,737,761
  106,737,950
  106,738,012
  106,738,269
  106,738,562
  106,738,567
  106,738,572
  106,738,587
  106,738,597
  106,738,607
  106,738,612
  106,739,423
  106,739,613
  106,739,642
  106,740,752
  106,742,964
  106,743,065
  106,743,534
  106,744,464
  106,745,230
  106,746,945
  106,747,223
  106,747,643
  106,747,860
  106,748,142
  106,748,973
  106,749,396
  106,749,642
  106,749,687
  106,751,042
  106,751,697
  106,752,232
  106,752,838
  106,752,855
  106,753,248
  106,753,253
  106,754,075
  106,754,308
  106,757,618
  106,759,713
  106,760,291
  106,760,349
  106,760,547
  106,761,397
  106,761,411
  106,761,673
  106,762,024
  106,762,530
  106,763,238
  106,763,927
  106,764,022
  106,764,710
  106,765,381
  106,765,683
  106,765,734
  106,766,285
  106,766,923
  106,766,940
  106,767,080
  106,767,085
  106,767,441
  106,767,574
  106,768,574
  106,768,787
  106,769,003
  106,769,004
  106,769,015
  106,770,003
  106,771,041
  106,771,378
  106,771,458
  106,771,782
  106,772,310
  106,772,996
  106,773,215
  106,773,692
  106,777,160
  106,777,739
  106,779,359
  106,779,488
  106,780,898
  106,780,902
  106,783,782
  106,788,521
  106,789,255
  106,789,733
  106,790,225
  106,790,351
  106,790,703
  106,790,756
  106,790,803
  106,790,913
  106,791,952
  106,792,007
  106,792,130
  106,794,050
  106,794,095
  106,794,700
  106,795,338
  106,795,755
  106,796,860
  106,797,193
  106,797,400
  106,797,673
  106,797,680
  106,799,988
  106,799,989
  106,800,013
  106,800,024
  106,800,037
  106,800,048
  106,800,059
  106,800,273
  106,801,456
  106,801,644
  106,801,731
  106,802,744
  106,803,090
  106,803,996
  106,805,952
  106,806,319
  106,806,551
  106,806,570
  106,806,856
  106,807,112
  106,807,438
  106,809,152
  106,809,964
  106,810,318
  106,811,017
  106,811,756
  106,813,615
  106,814,754
  106,815,113
  106,816,347
  106,817,978
  106,819,194
  106,819,617
  106,819,638
  106,819,711
  106,819,734
  106,819,784
  106,821,138
  106,821,313
  106,825,592
  106,827,398
  106,827,438
  106,827,722
  106,827,840
  106,828,518
  106,829,533
  106,830,091
  106,830,612
  106,830,619
  106,830,671
  106,830,771
  106,830,869
  106,830,874
  106,831,436
  106,836,149
  106,836,332
  106,836,781
  106,836,894
  106,837,761
  106,839,387
  106,839,814
  106,839,872
  106,840,805
  106,841,621
  106,841,982
  106,842,184
  106,842,239
  106,842,257
  106,842,286
  106,842,384
  106,842,568
  106,842,580
  106,842,653
  106,842,662
  106,843,189
  106,843,254
  106,843,900
  106,843,910
  106,843,978
  106,845,980
  106,846,008
  106,847,055
  106,847,640
  106,847,703
  106,851,022
  106,851,248
  106,851,561
  106,851,602
  106,851,960
  106,852,316
  106,852,396
  106,852,893
  106,855,925
  106,856,209
  106,856,527
  106,857,664
  106,859,308
  106,859,324
  106,859,716
  106,859,717
  106,859,719
  106,859,749
  106,859,765
  106,859,977
  106,860,171
  106,860,388
  106,861,077
  106,861,187
  106,861,774
  106,861,828
  106,862,153
  106,862,851
  106,863,427
  106,863,601
  106,863,603
  106,863,605
  106,863,607
  106,864,552
  106,864,645
  106,864,668
  106,864,880
  106,865,115
  106,865,992
  106,866,755
  106,867,138
  106,867,720
  106,868,164
  106,868,743
  106,869,906
  106,871,228
  106,872,686
C
T
A/-
-
C
G
C
T
-
-
-
C
T
T
A
T
T
T
C
32
C
G
C
-
G
G
T
G
T
T
A
G
G
G
-
G
C
G
T
T
A
C
G
?
G/-
-/G
G/A
G
G
G
T
G
G
T
T
T
G
G
G
-
T
T
G
-
G
A
T
A
-
-
A
G
A
-/T
-
-
-
T
-
-
G
G
-
2
T
-
G
C
C
G
A
G
G
A
A
G
C
-
-
G
A
C
C
T/-
T/-
T
A
-
A
C
C
A
G
A
A
A
T
C
G
C/-
-/C
A
A
C
A/-
A
C
C
T
T
G
G
A
A
A
C
G
T
A
C
A
-
C
C
5
C
-/2
5/-
T/-
-/C
-/16
T
2
C
G
T
A
10
C
G
-
-
A
C
T
-/4
G
A
T
-
8
A
A
G
C
G
-/5
11
A
C
G
A
T
C
G
A
G
G
C
A
-
T
A
T
A
A
T
C
C
G
G
G
A
C
-
C
A
6
A
C
A
T
A
A
-
G
T
A
-
C
-
G
G
C
T
26
T
G
G
C
2
A
-
A
-
-
A
A
G
A
G
G
C
A
T
C
-
A
G
-
G
A
T
G
G
G
C
C
2
C
C
-
T
A
A
G
C
G
T
T
G
T
A
T
G